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基于分子网络策略的三株海洋真菌次级代谢产物分子多样性挖掘: 朱夏濠

胶州湾及周边海域底栖桡足类分子多样性研究: 作为数量第二丰富的海洋小型底栖动物类群,底栖桡足类在海洋生态系统的物质传递和能量转移中发挥着重要的作用。然而,由于其个体较小、研究难度大、研究人员少等原因,我国海洋底栖桡足类的分类学研究还十分不充分,多样性状况尚不明确,...; 吴怡宏; 关键词：分子多样性形态学高通量测序

基于赤泥土壤化的披碱草种植对DOM分子多样性的影响研究: 赤泥是氧化铝生产过程中产生的高碱性固体废弃物,目前全球累积堆存量已高达50亿吨,赤泥的大量堆存严重威胁堆场周边土壤、水体及大气的生态环境,其处置已成为制约铝行业可持续发展的关键问题。而通过降碱和培肥改善赤泥理化特性以实现...; 张熙; 关键词：披碱草团聚体形成

南海冷泉及周边海域沉积物中微型生物分子多样性及相互关系研究: 冷泉生态系统孕育了独特的微型生物群落,其中化能自养细菌和古菌可利用甲烷与硫化氢等,通过甲烷厌氧氧化过程产生有机物,为冷泉生态系统提供能量。然而,由于难以培养和研究不足等原因,丰富多样的真核微生物在冷泉中的作用尚不明确。随...; 李龙召; 关键词：冷泉原核微生物

航天诱变黔草1号高羊茅分子多样性研究: 2023年; 试验以黔草1号为材料,采用RAPD分子标记技术对经航天搭载后的黔草1号高羊茅子代进行遗传多样性分析,探讨空间环境对其遗传多样性的影响。结果表明,利用RAPD引物进行PCR扩增,产生的扩增条带中,多态性条带占83.85%;34份供试材料的相似系数在0.5364~0.7411之间,说明航天搭载黔草1号高羊茅可以造成其遗传物质的变化,诱变后的各株系发生了不同程度的遗传变异,可以从航天诱变后的株系中选择符合育种目标的材料。RAPD聚类分析将供试材料分为七大类。总体来看,具有相似性状的株系基本上能聚在一类,呈现出一定的性状差异。; 尹琼陈超吴佳海郭俊峰; 关键词：航天诱变 RAPD

利用单细胞RNA测序研究胚胎脑干细胞分子多样性: 背景:脑干在调节和维持人体生命中发挥着至关重要的作用,涉及心脏、呼吸、消化、体温调节、睡眠等方面。然而,目前对于人类胚胎脑干细胞发育和多样性的研究仍十分有限。随着科学技术的不断进步,单细胞转录组测序技术被广泛应用于研究胚...; 涂超; 关键词：神经祖细胞谷氨酸能神经元 GABA能神经元

黑龙江省典型城市湿地龙凤湿地和呼兰河口湿地的原生生物分子多样性被引量：1: 2022年; 城市湿地是城市生态环境的重要组成部分,具有多种生态及社会服务功能。单细胞真核的原生生物是湿地水生态系统物质和能量流动的关键环节,是湿地生态功能和生态健康状况的敏感指示者。本研究基于高通量测序技术,对黑龙江省两个典型城市湿地即沼泽型的龙凤湿地和河川型的呼兰河口湿地的真核微生物18S rRNA基因V9区进行测序,共获得5713个操作分类单元(operational taxonomic units,OTU)。通过两个湿地原生生物物种分类和相对丰度、α多样性、β多样性、主坐标分析(principal coordinate analysis,PCoA),并结合环境因子的冗余分析(redundancy analysis,RDA),探讨两个湿地原生生物的多样性、群落组成及其与环境因子的关系。主要结果如下:(1)两个湿地共鉴定到原生生物有24门74纲114目135科265属;(2)两个湿地原生生物群落的空间分布差异显著;(3)溶解氧、水温、盐度是影响两个湿地原生生物群落结构的关键环境因子。本研究利用高通量测序技术进行黑龙江典型城市湿地的原生生物调查,有助于全面系统地了解高寒、高纬度城市湿地的原生生物群落,为龙凤湿地和呼兰河口湿地的水环境监测和健康评估提供基础和参考。; 刘斌刘真诚罗帅陈凯熊杰姜传奇缪炜; 关键词：城市湿地原生生物物种多样性

陕西省和上海市市售猪肉中金黄色葡萄球菌分子多样性及耐药性研究被引量：3: 2022年; 目的了解陕西省和上海市市售猪肉中金黄色葡萄球菌的分子多样性和耐药性。方法对分离于陕西省和上海市的110株猪肉源金黄色葡萄球菌进行15种抗生素耐药性、26种耐药基因、23种毒力编码基因及金黄色葡萄球菌A蛋白A(Staphylococcus aureus protein A,SPA)分型和多位点序列分型(multilocus sequence typing,MLST)检测。结果药敏结果显示,菌株对β-内酰胺类和叶酸代谢途径抑制剂的耐药性最为普遍,其次为四环素和大环内酯类抗生素。其中β-内酰胺类抗生素耐药相关基因主要为bla Z、四环素类抗生素耐药相关基因主要为tet K和大环内酯类抗生素耐药相关基因主要为ermB和ermC。分离株耐药性受采样地点和耐药基因影响,分离自上海市分离菌株较陕西省分离株耐药更为严重(P<0.01)。此外,还检测到2株耐甲氧西林金黄色葡萄球菌菌株。23种被检毒力编码基因中有18种毒力编码基因被检出,其中seg、sei、sem、sen、seo、seu、sea、sep、sed、sej、ser基因携带率较高。陕西省毒力编码基因的携带率85%(34/40)显著高于上海市27.1%(19/70),其中经典肠毒素编码基因的携带率分别为65.0%(22/40)和10.0%(10/70)。所有分离株共有31种克隆型,陕西省的主导分子型为ST6-t701(22.5%,9/40),上海市的主导分子型为ST3055-t084(31.4%,22/70)。此外,分离株携带肠毒素编码基因与分子型有相关性,如ST6-t701高度携带sea,ST7-t091主要携带sep,ST5-t002主要携带seg-sei-sem-sen-seo-seu。结论市售猪肉中金黄色葡萄球菌耐药严重,携带肠毒素编码基因较多,可能通过食物链进行传播。; 张鹏飞阮傅倩徐旭李佳瑶侯乐乐常冠红王晔茹王新; 关键词：猪肉金黄色葡萄球菌分子特征耐药性

DNA/RNA提取及处理方法对评价沉积物中纤毛虫分子多样性的影响: 2022年; 环境DNA(eDNA)技术结合高通量测序已广泛应用于评价微型生物多样性与群落构成。相较于eDNA,RNA在环境中易降解,环境RNA(eRNA)可更准确地反映群落近期生命活性状态。理论上,基于eRNA检获的生物多样性要低于eDNA检获的总体多样性。但前期已发表研究显示同一站点eDNA获得的多样性低于eRNA检获量,推测可能原因包括:1)样本量不同;2)RNA中存在DNA污染。为验证假设,本研究以陆架区2个站位沉积物中的纤毛虫为实验对象,系统性比较4种DNA/RNA提取方法:DNA直接提取(0.9 g沉积物),大样本量DNA直接提取(2 g),DNA洗脱法(2 g),RNA直接提取法(2 g);以及3种RNA提取后的处理方法:无DNA酶反转录,含DNA酶反转录,先纯化RNA再反转录。研究结果表明,大样本量(2 g)DNA直接提取法所检获的可操作分类单元(OTUs)约为小样本量(0.9 g)的2倍。相同样本量下,DNA洗脱法检获的OTUs最多,而DNA直接提取检获的OTUs低于有/无DNA酶反转检获的数量,先纯化再反转录所获得OTUs最少。就群落构成而言,DNA洗脱法和RNA纯化可有效降低浮游类群比例,可更真实展现底栖群落的构成。综上,建议使用DNA洗脱法评价沉积物中微型生物的总体多样性;采用eRNA研究具有生命活性的生物群落时,反转录之前可纯化RNA,以获得更加准确的具有生命活性的群落信息。; 李龙召黄平平徐奎栋赵峰; 关键词：EDNA 纤毛虫分子多样性

南海中部超微型真核生物分子多样性、群落组成及代谢潜力研究: 超微型真核生物一般指粒径小于3 μm的真核生物,具有自养、混养、异养等多种营养方式,在能量流动和物质循环中发挥重要作用。近年来生态学家运用显微镜及高通量测序等技术对超微型真核生物进行了诸多研究,但大多数研究都集中于真光层...; 张慧琳; 关键词：南海中部

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