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砗磲分子系统发育学研究综述
2023年
砗磲是目前现存体型最大的海洋双壳纲软体动物,具有重要的观赏价值和经济价值,研究其系统发育关系对于砗磲种质保存、利用和遗传育种具有重要意义。该文从不同分类单元的系统关系总结了砗磲分子系统发育学研究进展。结果表明,现有分子发育学研究结果大多支持砗磲为亚科,亚科下有砗磲属、砗蚝属,砗磲属下分为3个亚属,种群亚属之前的系统发育关系仍然模棱两可,需要更多的实验和数据进行分析明确。此外,还对近年来新发现的种类重新分析、梳理,为砗磲的进一步研究提供了参考。
胡美玲王沛张明哲周卫川陈宇
关键词:砗磲分子系统发育基因组
PhyloSuite:生物领域分子系统发育分析新平台
2023年
生物领域的分子系统发生学(molecular phylogeny)是利用生物的DNA、蛋白质序列等各种分子数据构建生物实体之间的起源和演化关系。20世纪80年代后期,随着保守引物PCR扩增和DNA测序技术的应用,系统发生(也称系统发育)研究迎来了分子数据的时代。生物分子序列的同源位点数量远远超过传统的形态数据.
张东张东李文祥
关键词:DNA测序技术分子序列蛋白质序列
九棘鲈属鱼类DNA条形码及分子系统发育关系
2023年
为从分子水平分析九棘鲈属(Cephalopholis)鱼类物种分类关系,并验证细胞色素C氧化酶亚基Ⅰ(COI)作为DNA条形码对九棘鲈属物种鉴定的有效性,采集了我国分布的12种九棘鲈属鱼类,利用PCR扩增及测序方法获得COI基因部分序列,结合GenBank下载的4种九棘鲈COI基因进行分析,利用MEGA 7.0软件计算碱基信息与遗传距离,基于最大似然法和邻接法构建分子系统进化树。结果表明,16种九棘鲈种内平均遗传距离为0.002,种间平均遗传距离为0.142,两者相差71倍,表明COI基因可作为九棘鲈属鱼类分子鉴定的条形码基因。在分子系统进化上,16种九棘鲈属鱼类聚为体色特征不同的3个类群,其中七带九棘鲈(C.igarashiensis)与卜氏九棘鲈(C.polleni)体色为多彩颜色,两者最先分化,位于进化树底部。其余的九棘鲈主要形成体色为红色与体色为褐色的类群,与形态学的分类结果一致。对于以往部分存在误鉴或同种异名分类争议的九棘鲈品种:青星九棘鲈(C.miniata)与半斑九棘鲈(C.hemistiktos)、橙点九棘鲈(C.aurantia)与黑边九棘鲈(C.spiloparaea),通过本研究构建的进化树枝长能清晰加以区分,并且两两之间的遗传距离也远大于0.020,揭示其各自应为独立的物种。研究结果可为九棘鲈属鱼类的分类及物种鉴定提供分子水平分类依据。
张国庆梁冠宇杨森蔡林豪何静董烨玮梁日深
关键词:COI基因DNA条形码分子系统进化
安徽省皮下盘菌属的分类及分子系统发育学研究
本研究包括两大部分,第一部分是采用现代菌物分类法,即形态学结合分子生物学技术。从形态解剖学、系统发育学、地理分布以及生态等多个方面入手,对安徽省的皮下盘菌属(Hypoderma)成员进行较系统全面的研究。第二部分采用分子...
杨富霞
关键词:斑痣盘菌科系统发育学分子验证
中国南方六省根结线虫种类鉴定及分子系统发育关系分析
根结线虫(Meloidogyne spp.)是一类重要的植物病原线虫,寄主范围广、危害性强、防治难度大,被多数国家列为检疫性有害生物。了解根结线虫的种类、寄主、地理分布、优势种群,是制定有效防治措施的基础。为明确根结线虫...
夏晓珊
关键词:根结线虫COII分子生物学特征
基于形态及分子系统发育学的四种检疫性担子菌物种界定
防止外来有害生物入侵是实现我国农林业可持续发展和维护国家生态安全的重要保障。《中华人民共和国进境植物检疫性有害生物名录》中列有130种真菌,由于大部分真菌形态微小、难以简单依靠形态特征进行精确的鉴定识别,其检测与防控一直...
李琰
关键词:分类学系统发育学
世界劳弗蛛分支的分子系统发育和分类(跳蛛科:跳蛛亚科:斑蛛族)
劳弗蛛分支Laufeiaclade隶属于蜘蛛目Araneae、跳蛛科Salticidae、跳蛛亚科Salticinae、斑蛛族Euophryini。本研究前,该分支全世界仅记述4属15种,缺乏系统性的分类研究及多样性调查...
余锟
关键词:分子系统发育跳蛛科
部分碘泡虫物种的整合分类学及其分子系统发育研究
粘孢子虫是一类主要寄生并危害鱼类的后生动物。碘泡虫属是已知物种数目最多的粘孢子虫类群。传统分类方法常不能准确定义碘泡虫物种,系统学关系和演化历史也尚不明晰。本研究以采自我国部分地区的碘泡虫为研究对象,综合应用形态学、组织...
张波
关键词:寄生虫分类学分子系统发育
中国窄头叶蝉属分子系统发育研究
窄头叶蝉属Batracomorphus隶属于半翅目Hemiptera、叶蝉科Cicadellidae、叶蝉亚科Iassinae、窄头叶蝉族Batracomorphini,是叶蝉亚科最大的属,目前世界共记录360余种,中国...
陆继开
关键词:物种分类系统发育树基因组测序
额尔齐斯河东方欧鳊及其指环虫的种群动态及分子系统发育研究
指环虫(Dactylogyrus)是单殖吸虫类(Monogenean)物种多样性最丰富的物种之一,主要寄生于鲤科鱼类鳃部,是典型的体外寄生虫,具有很强的宿主特异性。指环虫感染会造成鱼类鳃部鳃丝肿胀、病变甚至坏死,影响鱼类...
魏念文
关键词:指环虫种群动态线粒体基因系统发育树

相关作者

沈韫芬
作品数:125被引量:657H指数:19
供职机构:中国科学院水生生物研究所
研究主题:原生动物 土壤原生动物 纤毛虫 生物监测 微型生物群落
余育和
作品数:102被引量:556H指数:15
供职机构:中国科学院水生生物研究所
研究主题:浮游生物群落 RAPD 原生动物 PCR-DGGE 浮游生物
缪炜
作品数:104被引量:193H指数:9
供职机构:中国科学院水生生物研究所
研究主题:嗜热四膜虫 四膜虫 纤毛虫 原生动物 缘毛类纤毛虫
程汉良
作品数:151被引量:805H指数:15
供职机构:淮海工学院
研究主题:西施舌 草鱼 鲤鱼 线粒体基因组 帘蛤科
郝大程
作品数:55被引量:201H指数:9
供职机构:大连交通大学环境与化学工程学院
研究主题:药物资源 分子系统发育 红豆杉 药物发现 生物学