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具最大动物基因组的鱼
2024年
肺鱼是名副其实的“活化石”,而且是现存所有鱼类中和人类演化关系最接近的。约4.2亿年前,人类还和肺鱼有一个共同的老祖先物种,之后,人类的祖先登上陆地,肺鱼的祖先选择留在水里。早在2018年,一群德国科学家对来自美洲、非洲和澳大利亚的肺鱼进行细致研究后发现,虽然都是肺鱼,但它们的差异还挺大。
王丹(编译)
关键词:肺鱼德国科学家活化石动物基因组名副其实
能介导大片段DNA整合到哺乳动物基因组的酶及其应用
本发明涉及一种能介导大片段DNA整合到哺乳动物基因组的酶及其应用。具体地,提供了新的可以把大片段DNA整合到基因组的酶,包括如SEQ ID NO:1‑7所示的整合酶。本发明进一步涉及包含编码整合酶的核苷酸序列的多核苷酸和...
程艳李泽许张鹤馨
一种基于MCP稀疏深层神经网络模型估计水产动物基因组育种值的方法
本发明提供一种基于MCP稀疏深层神经网络模型估计水产动物基因组育种值的方法,针对SNP直接加性和互作上位效应利用基于最小最大凹度惩罚函数(MCP)正则化稀疏深层神经网络(DNN‑MCP)模型估计水产动物基因加性效应及非线...
王扬帆王孟秋倪萍侯虎胡景杰包振民
一种抽提动物基因组DNA的方法及其应用
本发明涉及动物基因型鉴定技术领域,尤其是涉及一种抽提动物基因组DNA的方法及其应用。本发明将动物织预处理后与强碱消化液A混匀,高温消化后,得到混合液;然后将混合液与酸性终止消化液B混匀,完成动物基因组DNA的抽提,得到...
刘寒刘威伍均
基因修饰的啮齿动物基因组
本申请涉及经基因修饰的啮齿动物基因组。本文中公开编码嵌合C1q多肽的核酸和表达嵌合C1q多肽的蛋白质、包含所述核酸的非人类动物以及制备或使用所述非人类动物的方法。
B·普拉赛德涂纳新K·梅家赫尔L·麦克唐纳德A·墨菲S·史蒂文斯
一种哺乳动物基因组编辑方法及其应用
本发明提供一种哺乳动物基因组编辑方法,包括在哺乳动物基因组的ApoE基因位点上插入人源PCSK9基因。本发明还提供了用于在哺乳动物基因组的ApoE基因位点上插入人源PCSK9基因的构建体、由所述构建体转染受体细胞获得的重...
赵建国王霄李华闫星慧孙泽文张颖秦国嵩
机器学习在动物基因组选择中的研究进展被引量:6
2023年
基因组选择是指利用覆盖在全基因组范围内的分子标记信息来估计个体育种值。利用基因组信息能够避免因系谱错误带来的诸多问题,提高选择准确性并缩短育种世代间隔。根据统计模型的不同,基因组选择方法可大致分为基于BLUP(best linear unbiased prediction,BLUP)理论的方法、基于贝叶斯理论的方法和其他方法。目前应用较多的是GBLUP及其改进方法ssGBLUP。准确性是基因组选择模型最常用的评价指标,用来衡量真实值和估计值之间的相似程度。影响准确性的因素可以从模型中体现,大致分为可控因素和不可控因素。传统基因组选择方法促进了动物育种的快速发展,但这些方法目前都面临着多群体、多学和计算等诸多挑战,不能捕获基因组高维数据间的非线性关系。作为人工智能的一个分支,机器学习是最贴近生物掌握自然语言处理能力的一种方式。机器学习从数据中提取特征并自动总结规律,利用该规律与新数据进行预测。对于基因组信息,机器学习无需进行分布假设,且所有的标记信息都能够被考虑进模型当中。相比于传统的基因组选择方法,机器学习更容易捕获基因型之间、表型与环境之间的复杂关系。因此,机器学习在动物基因组选择中具有一定的优势。根据训练期间接受的监督数量和监督类型,机器学习可分为监督学习、无监督学习、半监督学习和强化学习等。它们的主要区别为输入的数据是否带有标签。目前在动物基因组选择中应用的机器学习方法均为监督学习。监督学习可以处理分类和回归问题,需要向算法提供有标签的数据和所需的输出。近年来机器学习在动物基因组选择中的应用不断增多,特别是在奶牛和肉牛中发展较快。本文将机器学习算法划分为单个算法、集成算法和深度学习3类,综述其在动物基因组选择中的研究进展。单个算
李棉燕王立贤赵福平
关键词:动物育种
基因修饰的啮齿动物基因组
本文中公开编码嵌合C1q多肽的核酸和表达嵌合C1q多肽的蛋白质、包含所述核酸的非人类动物以及制备或使用所述非人类动物的方法。
B·普拉赛德涂纳新K·梅家赫尔L·麦克唐纳德A·墨菲S·史蒂文斯
大样本、多种动物基因组学数据的遗传变异挖掘与分析
蒋光辉
一种富含几丁质的动物基因组DNA的提取方法
本发明提供了一种高效并且成本低廉的适用于富含几丁质外壳的动物基因组DNA提取的方法,对多种节肢动物样本,例如昆虫、蜘蛛织样本的基因组DNA提取效果远优于市售试剂盒,适用于产业化应用。
张蔚王姝婷

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石德顺
作品数:602被引量:1,143H指数:14
供职机构:广西大学
研究主题:水牛 卵母细胞 体外成熟 猪卵母细胞 体外受精
洪孝友
作品数:89被引量:258H指数:10
供职机构:中国水产科学研究院珠江水产研究所
研究主题:中华鳖 美洲鲥 分子标记 性别鉴定 引物
李伟
作品数:100被引量:125H指数:6
供职机构:中国水产科学研究院珠江水产研究所
研究主题:中华鳖 引物 分子标记 黄喉拟水龟 基因
李宁
作品数:921被引量:5,892H指数:38
供职机构:湖北省农业科学院
研究主题:辣椒 转基因 克隆 绵羊 基因
朱新平
作品数:380被引量:1,453H指数:22
供职机构:中国水产科学研究院珠江水产研究所
研究主题:黄喉拟水龟 中华鳖 美洲鲥 引物 乌鳢