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一种基于回文序列的DNA分子量标准制备方法: 本发明提供了一种基于回文序列的DNA分子量标准制备方法，属于分子生物学技术领域，包括以下步骤：根据DNA分子量标准设计含回文序列的串联引物，进行Quickchange PCR反应，扩增靶质粒。串联引物间碱基的互补配对，在...; 窦金河张之勇于长斌许文硕孔姝涵齐莹欣孙文李佳起

一种基于靶点内回文序列介导的MMEJ靶向基因组修饰方法和应用: 本发明属于生物技术领域，公开了一种基于靶点内回文序列介导的MMEJ靶向基因组修饰方法和应用。本发明利用CRISPR/Cas9系统借助内外源同一靶点反向互补后形成6bp的微同源序列可对鱼类基因进行内源修饰标记。以斑马鱼为例...; 王厚鹏孙永华何牡丹叶鼎王小四; 文献传递

一种提高外源基因mRNA的重复性回文序列及其应用: 本发明公开了一种提高外源基因mRNA的重复性回文序列及其应用，属于基因工程技术领域。本发明的重复性回文序列及其间隔区序列序列如SEQ ID NO,1所示，该信号肽能通过改变mRNA的二级结构提高其稳定性，从而够使目的蛋白...; 刘龙堵国成陈坚李江华邓琛

秀丽线虫基因组中的回文序列分布: 2017年; 回文序列在基因组既可以作为基因表达调控的模体,也能引起基因组的不稳定而导致疾病.本文通过全基因组范围的回文识别,揭示回文在线虫基因组上的总体分布模式,并结合回文丰度和分布特征,探讨回文的生物学功能.结果发现:(1)基因组不同功能区域(如编码区、内含子、基因间区)中,回文在内含子中分布最多,基因间区次之,在编码区分布最少;(2)回文的相对丰度随着回文长度的增加而增加,这反映了基因组对不同长度回文的使用选择性;(3)总体而言回文GC含量随着回文长度的增加而降低,而且在不同的基因组区域(编码区、内含子和基因间区)中回文的GC含量有很大差异;(4)搜索转录因子结合位点模体与回文模体,发现转录因子结合位点富含模体与回文模体,且转录因子结合位点模体中有很明显的回文模体,表明回文可能作为转录因子结合模体而调控转录.; 冯芬刘国庆; 关键词：回文序列 GC含量转录因子结合位点

利用回文序列生产闭合线性DNA: 一种引物，用于扩增包含原核端粒酶靶序列的DNA模板，特别用于生产闭合线性DNA，上述引物能够特异性地结合于原核端粒酶靶序列内的回文序列并引发在两个方向上的扩增。; 尼尔·波特莉萨·卡普罗尼卡伦·奥利弗金高·卡尔博夫尼采克安格斯·奈特; 文献传递

活化TLR9的牛种布氏菌基因外重复回文序列筛选及活性检测: 2016年; 目的筛选具有活化Toll样受体9(TLR9)的牛种布氏菌基因外重复回文序列(Repetitive Extragenic Palindrome Squence,REPs)并检测其活性,为布氏菌病的治疗提供新思路。方法基于Brucella abortus A13334基因组序列,利用生物信息学技术识别其REPs后,合成序列。将合成的天然骨架的脱氧寡核苷酸(ODNs)转染小鼠单核巨噬细胞株RAW264.7,以ELISA检测IFN-α的分泌水平。采用TLR9-siRNA沉默RAW264.7中的TLR9,将上述诱导IFN-α分泌增加的阳性ODN序列转染RAW264.7,ELISA方法检测IFN-α的分泌变化。结果筛选出1 857条牛种布氏菌REPs,选择2级茎环结构较好的5条ODNs序列进行合成,ELISA方法检测显示ODNs M4、M5介导IFN-α分泌量显著高于阴性对照(P<0.05),且阳性ODN M5所介导的IFN-α分泌可以被TLR9-siRNA显著抑制。结论布氏菌基因组中存在可以活化TLR9信号通路的REPs,此结果有助于对布氏菌致病和免疫机制的认识。; 张雅娴白丽云王占黎王英于慧; 关键词：巨噬细胞 TOLL样受体9 Α-干扰素

羊种布鲁氏杆菌基因外重复回文序列经TLR9诱导IFN-α表达的研究: 目的：　　筛选具有活化Toll样受体9(TLR9)活性的羊种布鲁氏杆菌DNA中基因外重复回文序列(REPs)，检测其经TLR9诱导的干扰素-α(IFN-α)表达，为羊种布鲁氏杆菌病的防治提供新思路。　　方法：　　针对羊种...; 白丽云; 关键词：干扰素-Α 生物信息学; 文献传递

细菌规律成簇间隔短回文序列相关机制的研究进展被引量：1: 2015年; 近年来，在许多细菌和古细菌中发现一种新的基因干扰途径一规律成簇间隔短回文序列（Clusteredregularlyinterspacedshortpalindromicrepeats，CRISPR），该序列是许多细菌和古细菌用来保护自己免受噬菌体、接合质粒和其他转座因子（Mobilegeneticelements，MGEs）干扰的一段DNA序列，其转录的RNA序列与相关蛋白结合在一起可使入侵的特异性核酸发生降解。目前CRISPR已被开发为一种基因编辑工具，; 王立燕刘永生; 关键词：回文序列古细菌成簇 RNA序列转座因子

羊种布氏杆菌基因外重复回文序列经Toll样受体9诱导IFN-α表达的研究被引量：1: 2015年; 目的筛选具有活化Toll样受体9（TLR9）活性的羊种布氏杆菌DNA中基因外重复回文序列（REPs）,检测其经TLR9诱导的干扰素-α（IFN-α）表达,为羊种布氏杆菌病的防治提供新思路.方法针对羊种布氏杆菌Brucella melitensis NI基因组序列,利用生物信息学技术识别其REPs后,合成序列.将合成的天然骨架脱氧寡核苷酸（ODNs）转染小鼠单核巨噬细胞株RAW264.7,酶联免疫吸附测定法（ELISA）检测IFN-α的分泌水平.采用TLR9-siRNA沉默RAW264.7中的TLR9,将上述诱导IFN-α分泌增加的阳性ODN序列转染RAW264.7,ELISA方法检测IFN-α的分泌变化.结果筛选获得2 200个羊种布氏杆菌基因组REPs,选择二级茎环结构较好的12条ODNs序列进行合成,ELISA结果显示,ODNs M2、M3、M4、M5、M6、M7、M9、M12介导IFN-α分泌量分别为（26.944±1.868）、（46.461±2.562）、（34.980±2.055）、（43.016±2.162）、（62.533±4.031）、（67.125±5.069）、（18.908±1.633）、（39.572±2.465）pg/ml,显著高于阴性对照组的（12.594±1.338）pg/ml,差异有统计学意义（t=10.817、20.295、15.812、20.724、20.365、18.016、5.180、16.660,均P＜0.05）,且阳性ODN M6所介导的IFN-α分泌可以被TLR9-siRNA显著抑制.结论羊种布氏杆菌基因组REPs可经TLR9信号通路引起炎性因子IFN-α分泌增加,参与介导羊种布氏杆菌早期感染后的固有免疫应答.; 白丽云张雅娴王占黎王英于慧; 关键词：TOLL样受体9 TOLL-LIKE

Ⅱ型成簇恒间隔短回文序列及相关蛋白系统（CRISPR／Cas）研究近况: 2014年; 1987年在大肠杆菌K12的碱性磷酸酶（ iap）基因的3′侧翼区首先发现了一类具有短回文特质的DNA重复序列［1］。2002年，这类结构被正式命名为成簇恒间隔短回文重复序列（CRISPR），CRISPR关联蛋白也同时得以命名［2］。2005年，3个研究课题组同时发现间隔序列可能源自于细菌染色体外的其他遗传物质，如噬菌体和接合质粒，并推论CRISPR／Cas系统可以抵制入侵的外源 DNA［3-5］。2007年，来源于侵染噬菌体的新的整合间隔序列得到实验验证；研究同时建立了新获得的间隔序列与细菌抵抗该噬菌体侵袭的直接关联关系，证明了CRISPR／Cas系统是抵抗噬菌体的获得性免疫系统［6］。 Marraffini和Sontheimer［7］证实CRISPR／Cas系统对于接合现象和质粒转化的干扰作用。最近基于CRISPR／Cas作用机制的研究，发现了其在细菌毒力、致病性以及如何逃避宿主免疫系统等方面的相关作用［8］。; 王蕾马丽俐孙桂芹李蒙策力木格陈力; 关键词：回文序列成簇 DNA重复序列

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