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探究渊源 增强自信——“温州模式”的文化基因论坛侧记
2018年
进入新时代,温州发展也步入新的关口,如何赋予'温州模式'新内涵,使其焕发新生机,是关乎温州前途命运的时代课题。不知今者察之古,欲知来者察之今。9月6日下午,市人民大会堂三楼会议室高朋满座。
吴佳颖
关键词:永嘉学派文化基因温州文化
阿尔茨海默病NK细胞与铜死亡的相关基因
2025年
背景:阿尔茨海默病的免疫相关致病机制尚不明确,通过生物信息学探讨阿尔茨海默病患者NK细胞与铜死亡机制的相关性,可为研究阿尔茨海默病的发生发展提供新方向。目的:使用生物信息学析方法筛选阿尔茨海默病患者外周血中NK细胞与铜死亡相关的关键基因,并在临床标本水平加以验证。方法:利用GEO在线数据库筛选阿尔茨海默病患者外周血转录组差异表达基因和NK细胞相关基因,与已报告的铜死亡因子取交集,获取差异表达的铜死亡相关基因;接着采用RT-qPCR技术对基因相对表达量进行实验验证,实验样本来自于安徽省立医院神经内科2021-2023年住院患者的外周血,按照纳排标准纳入疾病组30例及对照组20例。后续进一步使用在线GeneMANIA网站构建蛋白质-蛋白质互作网络;利用R语言进行免疫浸润析;基于ENCODE数据库进行转录因子预测。结果与结论:①利用GSE63060数据集中阿尔茨海默病患者外周血转录组差异表达基因、GSE168522数据集中NK细胞相关基因、已报告的铜死亡基因,应用在线韦恩图工具、LASSO算法及随机森林机器学习方法筛选获取4个差异表达的铜死亡相关基因:铁氧还原蛋白1(ferredoxin 1,FDX1)、铜离子转运ATP酶a肽(ATPase Cu^(2+)transporting alpha polypeptide,ATP7A)、丙酮酸脱氢酶β(pyruvate dehydrogenase El subunit beta,PDHB)和二氢硫辛酰胺琥珀酰转移酶(dihydrolipoamide succinyltransferase,DLST)。②临床样本实验验证,FDX1和ATP7A在阿尔茨海默病患者外周血中表达上调(P<0.001),且在载脂蛋白E4不同基因型中呈差异性表达(P<0.01,P<0.001);PDHB和DLST在阿尔茨海默病患者外周血中表达下调(P<0.001),在载脂蛋白E4不同基因型中表达无显著性意义(P>0.05)。③蛋白质-蛋白质互作网络发现20种功能蛋白与关键基因相关联,免疫浸润析结果验证了关键基因与12个免疫细胞具有显著相关性(以P<0.05为具有�
陈桂琳汤其强
关键词:阿尔茨海默病生物信息学NK细胞
新疆冬小麦种质资源粒重基因布与育种适用性
2025年
小麦粒重是重要的产量构成因素之一,也是受遗传因素影响的数量性状。为了解粒重基因在新疆小麦的布及相关子标记在育种上的适用性,以253份新疆冬小麦品种为试验材料,利用KASP(竞争性等位基因特异性PCR)标记进行基因型检测,并与2个年份的株高、穗长、穗粒数、千粒重、粒长、粒宽等育种选择性状进行关联析。结果表明,优异等位基因TaSus1-7A-Hap1、TaCwi-A1b、TaTGW-7Aa、TaGS5-A1b、TaGS2-A1b、TaGS-D1a、TaSus2-2B-HapH、TaTGW6-A1a、TaGW2-6B-Hap3和TaSus2-2A-HapA在参试材料的布频率别为100%、100%、84.98%、56.92%、51.78%、39.13%、33.20%、11.07%、3.16%和1.58%;14对等位基因在参试材料中共出现118种组合;标记GS5-2334-SNP、TaGS2-A1-239IND2、TGW7-986-SNP和GW2-6B-721SNP可应用于小麦粒重的辅助选择;被检测标记的连锁基因均与1个或1个以上育种性状显著相关;GS5-2334-SNP连锁基因TaGS5-A1对粒宽的效应达36.65%,对千粒重效应次之(27.76%),GS5-2334-SNP连锁基因TaGS5-A1对株高和穗粒重、GW2-6B-721SNP连锁基因TaGW2-6B和TGW7-986-SNP连锁基因TaTGW7对粒长、Sus2-2A-20SNP连锁基因TaSus2-2A对穗粒重、千粒重和粒宽的效应均达到10%以上。本研究结果可为子标记辅助育种奠定基础。
曹俊梅周安定刘娜哈力旦·依克热木张新忠刘联正
关键词:小麦粒重基因分布
皮肤保湿能力基因检测的引物组合及其应用
本发明涉及基因型技术领域,具体涉及一种皮肤保湿能力基因检测引物组合及其应用,包括检测人基因组的7个皮肤保湿能力基因的12个SNP位点的多重PCR扩增引物组和单碱基延伸引物组。每个SNP位点别设计一对多重PCR扩增引物...
李文郭之彬张欣鑫廖俊杰
一种奶牛全基因组液相芯片及其应用
本发明属于全基因基因芯片技术领域,具体涉及一种奶牛全基因组液相芯片及其应用。所述液相芯片包括探针,所述探针的基因型对象包括位于奶牛参考基因组ARS‑UCD‑1.2上的50K个SNP位点;所述SNP位点在奶牛参考基因组...
马毅陈丽丽李双双
耐铬Serratia sp. CM01基因组序列及铬代谢基因
2024年
以耐铬(VI)菌株Serratia sp. CM01为研究对象,探究其全基因组信息,挖掘其潜在的铬代谢相关基因。本研究采用基因组测序技术对CM01进行全基因组测序并析其基因序列特征;同时,结合前期差异蛋白研究结果,进行铬代谢相关基因析。测序结果表明,CM01基因组大小为4,902,254 bp,预测编码蛋白序列的基因有4547个;蛋白功能注释结果显示其涉及氧化还原、氨基酸代谢、碳水化合物和能量代谢编码的基因有较高的占比。结合前期蛋白组学的结果,筛选出了12个与铬代谢相关的基因。qRT-PCR析结果显示,在Cr(VI)胁迫下,ChrA1、Srpc、GrxA和NemA基因的表达上调。CM01基因组全序列已上传至NCBI,序列号:PRJNA675313。本研究通过对CM01的基因组序列析,为全面了解细菌的铬代谢机制提供基础,为修复环境铬污染的新生物技术提供理论依据。The study focused on the chromium (VI)-resistant bacterial strain Serratia sp. CM01 to explore its whole-genome information and to mine its potential chromium metabolism-related genes. In this research, genomic sequencing technology was employed to perform whole-genome sequencing on CM01 and to analyze its gene sequence characteristics. Additionally, the results from previous differential protein studies were integrated to analyze genes related to chromium metabolism. The sequencing results indicated that the CM01 genome is 4,902,254 base pairs in size, with 4547 genes predicted to encode protein sequences. Protein function annotation revealed a high proportion of genes involved in oxidation-reduction, amino acid metabolism, carbohydrate metabolism, and energy metabolism. Combining the outcomes from previous proteomics studies, 12 genes related to chromium metabolism were identified. Quantitative real-time PCR analysis showed that the expression of ChrA1, Srpc, GrxA, and NemA genes was upregulated under Cr(VI) stress. The complete genome sequence of CM01 has been uploaded to NCBI with the acces
吴焰清李星龙王梦佳肖虹
关键词:全基因组测序
一种基于HRM的精油玫瑰基因型检测体系、检测方法及应用
本发明公开了一种基于HRM的精油玫瑰基因型检测体系,该检测体系包括SSR1、SSR2、SSR3三组引物对、1×Eva Green染料、Taq酶混合液和DNA模板。检测方法:提取待检精油玫瑰的基因组DNA,采用上述引物对...
许笑语王建文冯立国魏国徐勇白梦娟
一种转基因玉米向非转基因玉米基因漂移频率的监测方法
本发明公开了一种转基因玉米向非转基因玉米基因漂移频率的监测方法,涉及转基因生态安全监测技术领域,包括以下步骤:步骤S1、针对相邻种植的转基因玉米和非转基因玉米,待生长成熟后,采集非转基因玉米的种子作为待检样品;步骤S2、...
刘来盘刘标方志翔沈文静张莉
一种鉴定薄皮甜玉米的等位基因子标记及鉴定方法和应用
一种鉴定薄皮甜玉米的等位基因子标记及鉴定方法和应用,涉及基因工程技术领域;基因Su1的等位基因在甜玉米果皮厚度的鉴定中的应用,所述等位基因型为Su1‑RC等位基因型,通过等位基因Su1‑RC能鉴定出果皮厚度较薄的高...
李坤 朱文广文天祥 许洁婷李高科于永涛胡建广 严建兵
兔源肠致病性大肠埃希菌全基因组测序及毒力和耐药基因
2024年
目的揭示一株从腹泻实验兔中离到的肠致病性大肠埃希菌ILAREc-01的基因组特征、毒力基因和耐药基因布情况。方法采用高通量测序法对基因组序列进行测定,采用VFDB、ARDB、CAZy、SWISS-PROT、COG、CARD、KEGG、T3SS等8个数据库对基因组中的基因功能进行预测,并且对ILAREc-01菌株进行了遗传进化析。结果ILAREc-01基因组中编码5249个基因;CARD数据库析表明ILAREc-01菌株具有7类耐药机制的59个耐药基因;通过VFDB数据库析,在ILAREc-01中注释了553个毒力基因,并发现了肠细胞脱落位点毒力岛(LEE);ILAREc-01与FORC028、E2865和110512株具有较高的同源性。结论本研究进行了兔源肠致病性大肠埃希菌ILAREc-01的全基因组测序,完成了毒力基因和耐药基因的注释,并开展了遗传进化析,为揭示该病原的致病机制和科学防控实验兔大肠埃希菌病提供了数据支撑。
董浩赵明海刘志国李楠邢壮壮张乐颖左琴董青花梁春南刘佐民马丽颖
关键词:肠致病性大肠埃希菌全基因组测序毒力基因耐药基因

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聂庆华
作品数:331被引量:710H指数:14
供职机构:华南农业大学
研究主题:分子标记 性状相关 基因分子标记 屠体性状 屠体
王明山
作品数:364被引量:1,347H指数:17
供职机构:温州医科大学
研究主题:凝血因子 家系 缺陷症 基因突变 遗传性
徐海平
作品数:68被引量:89H指数:7
供职机构:华南农业大学
研究主题:性状相关 分子标记 基因分子标记 屠体性状 分子标记辅助选择
金艳慧
作品数:171被引量:416H指数:11
供职机构:温州医科大学
研究主题:家系 凝血因子 缺陷症 基因突变 遗传性
谢海啸
作品数:81被引量:206H指数:9
供职机构:温州医科大学
研究主题:凝血因子 缺陷症 家系 基因突变 基因分析