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鸡Noggin4基因启动子SNPs标记及其在鸡育种中的应用
本发明公开了一种鸡Noggin4基因启动子SNPs标记及其在鸡育种中的应用,属于分遗传学技术领域。本发明通过将蛋鸡群体的SNPs基因型与产蛋性状进行关联分析,首次发现在鸡Noggin4基因启动子存在多个与鸡52周龄...
姜运良公言芹康丽孙亿魏晴晴
CELSR2基因启动子甲基化与代谢综合征痰证的关系研究
2024年
目的 检测代谢综合征(MS)痰证、非痰证患者及健康人外周血中CELSR2基因CpG位点DNA甲基化水平,初步探索MS痰证形成的表观遗传学机制。方法 收集MS患者,运用证素辨证法筛选MS痰证、非痰证患者各27例,并以27名健康人为对照。理化指标检测包括:收缩压(SBP)、舒张压(DBP)、身体重指数(BMI)、腰围(WC)、空腹血糖(FPG)、甘油三酯(TG)、高密度脂蛋白胆固醇(HDL-C)和低密度脂蛋白胆固醇(LDL-C);MethylTarget方法检测CELSR2基因启动子41个CpG位点的DNA甲基化水平。结果 与健康组比较,MS痰证、非痰证组中SBP、DBP、BMI、WC、FPG、TG升高而HDL-C降低(P<0.01);与MS非痰证组比较,MS痰证组中DBP、BMI、WC、FPG、TG升高(P<0.05)。与健康组比较,MS非痰证组中CpG28、CpG34 DNA甲基化水平降低(P<0.05),MS痰证组中CpG24、CpG34 DNA甲基化水平降低(P<0.05);与MS非痰证组比较,痰证组中CpG20、CpG24、CpG34 DNA甲基化水平降低(P<0.01)。与健康组比较,MS患者吸烟、饮酒人数较多(P<0.01);与MS非痰证组比较,痰证组饮酒人数增多(P<0.05)。与CELSR2基因CpG34甲基化率正常比较,低甲基化发生MS痰证的风险是其4.14倍(95%CI:1.25~13.70,P<0.05);与未饮酒相比,饮酒发生MS痰证的风险是其3.55倍(95%CI:1.07~11.82,P<0.05)。结论 DBP、BMI、WC、FPG、TG升高可能使MS痰证形成的风险升高,CELSR2基因CpG34位点的DNA低甲基化可能是MS痰证形成的表观遗传学基础,饮酒是MS痰证形成的危险因素。
郑秀娟李缘缘熊文慧陈继承杨梦晗黄涛高碧珍
关键词:代谢综合征痰证DNA甲基化中西医结合
FAM 19A 4、PAX 1及miRNA124-2基因启动子甲基化在宫颈病变早期诊断中的价值
2024年
背景与目的:目前有关宫颈病变的DNA甲基化研究较多,但DNA甲基化作为宫颈病变的诊断及分流指标在临床实践中的报道较少。本研究拟探讨FAM19A4、PAX1及miRNA124-2基因启动子甲基化在宫颈病变进展中早期诊断的价值。方法:收集2020年3月—2022年3月在郑州大学第三附属医院同时行宫颈液基细胞学(thinprep cytologic test,TCT)和HPV检测的患者的宫颈细胞学标本共129例,采用甲基化特异性PCR(methylation-specific PCR,MSP)检测不同宫颈病变中FAM19A4、PAX1及miRNA124-2基因启动子甲基化改变情况,采用受试者工作特征(receiver operating characteristic,ROC)曲线评估3个基因甲基化改变对宫颈病变的诊断价值。本研究经郑州大学第三附属医院伦理委员会批准(伦理审批编号:2023-135-01)。结果:根据病理学检查结果分为4组:未见上皮内病变或恶性细胞(no intraepithelial lesions or malignant lesions,NILM)组(42例)、低度鳞状上皮内病变(low grade squamous intraepithelial lesion,LSIL)组(28例)、高度鳞状上皮内病变(high grade squamous intraepithelial lesion,HSIL)组(36例)和鳞癌(squamous cervical cancer,SCC)组(23例)。随宫颈病变级别的增加,FAM19A4、PAX1及miRNA124-2基因甲基化检出率逐步增高,差异有统计学意义(P均<0.05)。在HSIL组FAM19A4、PAX1、miRNA124-2甲基化检出率分别为81.2%、80.5%和71.8%,在SCC组3种基因甲基化检出率均高达100.0%;细胞学诊断宫颈癌的ROC曲线下面积(area under curve,AUC)为0.731,诊断灵敏度和特异度分别为65.9%和80.4%;FAM19A4、PAX1及miRNA124-2基因单独诊断HSIL+(HSIL和SCC)时,PAX1甲基化诊断HSIL+的效能最高,AUC为0.925,灵敏度为92.8%,特异度为87.3%;两两联合诊断时,FAM19A4与PAX1联合诊断HSIL+的AUC为0.930,灵敏度为95.7%,特异度为87.1%;FAM19A4与miRNA124-2联合诊断HSIL+,AUC为0.895,灵敏度为97.6%,特异度为85.7%;PAX1联合miRNA124-2诊断HSIL+,AUC为0.928,灵敏度为95.7%,特异度为89.1%;P
李雅刘慧任静静李肖甫智艳芳
关键词:甲基化宫颈病变
鸡TRAF7基因启动子SNP标记及其在鸡育种中的应用
本发明公开了一种鸡TRAF7基因启动子SNP标记及其在鸡育种中的应用,属于分遗传学技术领域。本发明通过品种间SNPs的筛选,发现鸡TRAF7基因启动子存在SNP标记;所述SNP标记的核苷酸序列如SEQ ID No....
姜运良庞喜晶康丽孙亿魏晴晴
一种与鸡产蛋性状相关的FGF9基因启动子SNP分标记组合及其应用
本发明公开了一种与鸡产蛋性状相关的FGF9基因启动子SNP分标记组合及其应用,属于分遗传学技术领域。本发明通过品种间SNPs的筛选,发现鸡FGF9基因启动子存在多个SNP位点;并首次将济宁百日鸡群体的SNPs基因...
姜运良王月康丽孙亿魏晴晴
CD14基因启动子-159C/T多态性在H型高血压患者中的分布
2024年
目的:调查H型高血压患者中CD14基因启动子-159C/T基因多态性分布情况。方法:用聚合酶链反应-限制性片段长度多态性(PCR-RFLP)分析技术对H型高血压组、普通高血压组和对照组的CD14基因启动子-159C/T多态性分布进行研究,同时检测血清同型半胱氨酸(HCY)及其他生化指标。结果:H型高血压组CC型、CT型、TT型分布频率分别为10%、43%、47%,C和T等位基因频率分别为31.5%、68.5%;普通高血压组CC型、CT型、TT型分布频率分别为10%、50%、40%,C和T等位基因频率分别为35%、65%;对照组CC型、CT型、TT型分布频率分别为13%、53%、34%,C和T等位基因频率分别为39.5%、60.5%,三组基因分型和等位基因频率均无统计学意义(P>0.05)。与对照组相比,H型高血压组、普通高血压组高密度脂蛋白(HDL-C)水平降低,差异有统计学意义(P<0.05)。结论:H型高血压患者CD14基因启动子-159C/T多态性分布无明显差异。
田卫花周思彤侯娟娟张丹马剑华
关键词:同型半胱氨酸H型高血压
正常孕妇及妊娠糖尿病患者apoA1基因启动子-75 G/A多态性的研究
2024年
目的研究载脂蛋白A1(apoA1)基因启动子-75 G/A(apoA1-75 G/A)单核苷酸多态性是否与妊娠糖尿病(GDM)有关联,为探讨本病的分遗传基础提供依据。方法应用聚合酶链反应-限制性片段长度多态性(PCR-RFLP)技术检测1022名正常妊娠对照者和626例GDM患者apoA1-75 G/A基因多态性。酶法测定总胆固醇(TC)、三酰甘油(TG)、高密度脂蛋白胆固醇(HDL-C)、低密度脂蛋白胆固醇(LDL-C)和血糖(Glu),化学发光法测定血浆胰岛素(INS)。免疫透射比浊法测定载脂蛋白A1(apoA1)和B(apoB)水平。结果apoA1-75 G/A多态位点等位基因G、A频率在GDM组和对照组分别为0.718、0.282和0.713、0.287。两组人群基因型频率分布均符合Hardy-Weinberg平衡定律。apoA1-75 G/A多态性基因型频率、等位基因G、A频率在GDM组和正常对照组间比较差异无统计学意义(P>0.05)。在GDM组apoA1-75 G/A多态性AA基因型者较GG型者、GA型者在TC、HDL-C和apoA1水平均增高(P均<0.05);GDM患者进一步划分为肥胖和非肥胖亚组后,apoA1基因型与apoA1水平的关系仅在肥胖亚组观察到,与TC和HDL-C的关系在非肥胖亚组观察到(P<0.05)。与GG基因型者比较,正常妊娠对照组AA和GA基因型者的收缩压(SBP)和HDL-C水平均有所升高(P均<0.05);AA基因型者较GG型和GA型者Glu水平降低(P<0.05)。对照组人群按体质量指数(BMI)分亚组后基因型与SBP和HDL-C水平的关系仅在肥胖对照亚组观察到,与Glu水平的关系在肥胖和非肥胖亚组均存在。结论apoA1-75 G/A多态性与GDM无关联,但该变异与GDM患者血浆apoA1、HDL-C和TC水平密切有关。该基因位点的变异在正常妊娠孕妇中与血浆HDL-C、Glu和SBP水平相关联。该变异在两组人群与血脂和血压水平改变的关系具有BMI依赖的特性。
李若雨白怀关林波刘兴会范平周密吴玉洁王玉峰朱正婷王国玉王永红李德华
关键词:糖尿病妊娠多态性
ABCG2基因启动子rs2231142位点单核苷酸多态性与新疆维吾尔自治汉族男性人群高尿酸血症易感性分析
2024年
目的探讨ABCG2基因rs2231142(G/T)位点单核苷酸多态性与高尿酸血症易感性的关系。方法以2018~2020年在新疆医科大学附属中医医院、新疆维吾尔自治人民医院、新疆医科大学第一附属医院就诊的865例男性为研究对象,收集其血液样本,按其血尿酸水平分为高尿酸血症组(n=367)和健康对照组(n=498)。采用多重荧光聚合酶链反应(polymerase chain reaction,PCR)技术检测ABCG2基因rs2231142(G/T)位点的基因型并观察两组的基因多态性。利用双荧光素酶报告基因实验证实该序列对荧光素酶表达活性的影响。结果高尿酸血症组的尿酸、体重指数、葡萄糖、肌酐、甘油三酯、舒张压、高密度脂蛋白、低密度脂蛋白高于健康对照组,差异均有统计学意义(P<0.05)。两组基因rs2231142位点均符合Hardy-Weinberg平衡性检验(P>0.05),表明该位点具有群体代表性。高尿酸血症组和健康对照组中GG、GT、TT 3种基因型的分布频率差异有统计学意义(χ^(2)=17.146,P<0.001),等位基因G和T在两组间分布频率比较差异有统计学意义(χ^(2)=19.115,P<0.001)。不同遗传模型中,TT基因型均表现为高尿酸血症的危险因素(加性模型OR=2.302,95%CI:1.472~3.603;显性模型OR=1.689,95%CI:1.283~2.210;隐性模型OR=1.867,95%CI:1.221~2.874)。尿酸、葡萄糖、甘油三酯在不同基因型分组间比较,差异均有统计学意义(P<0.05)。两两比较结果显示,G/T组与G/G组、T/T组与G/G组组间的尿酸、葡萄糖、甘油三酯水平差异均有统计学意义(P<0.05)。其中T/T组尿酸水平最高,G/G组葡萄糖和甘油三酯水平最高。双荧光素酶活性测定结果显示,rs2231142(G/T)具有启动子功能;且含G等位基因比含T等位基因的重组质粒荧光素酶报告基因的表达水平较高,是其1.120倍(P=0.012)。结论ABCG2基因rs2231142(G/T)位点单核苷酸多态性与高尿酸血症易感性间存在关联,等位基因T可能是高尿酸血症的危险因素。
夏依代·图尔荪何爽孙红光刘璐叶飞陈昱名王宇婷苗蕾
关键词:高尿酸血症单核苷酸多态性
双相抑郁患者认知功能损害与GRIN2B基因启动子DNA甲基化的相关性研究
余浩
伴有焦虑症状双相抑郁患者认知功能损害与GRIN2B基因启动子DNA甲基化相关性研究
2024年
目的探索伴有焦虑症状双相抑郁患者认知功能与N-甲基-D-天冬氨酸受体2B亚基(glutamate iono-tropic receptor NMDA type subunit 2B,GRIN2B)基因启动子各CpG位点甲基化水平的相关性。方法根据汉密尔顿焦虑量表(14-item Hamilton anxiety rating scale,HAMA)评分将31例双相抑郁患者分为焦虑组15例和非焦虑组16例,同期选取16名健康对照。采用蒙特利尔认知评估量表(Montreal cognitive assessment,MoCA)、数值广度测验(digital span test,DST)、连线测试A部分(trail making test A,TMT-A)、斯特鲁普色词测验(Stroop color and word test,SCWT)评估3组总体认知功能、注意力及执行控制、信息处理速度、执行功能等认知功能维度,采用Massarray质谱法检测所有受试者外周血GRIN2B基因启动子各CpG位点的DNA甲基化水平。结果3组GRIN2B基因启动子DNA甲基化水平差异性位点为CpG3、CpG5、CpG7、CpG10、CpG12(P<0.05),其中,焦虑组CpG12甲基化水平低于非焦虑组(36.23%±16.41%vs.50.20%±19.79%,P<0.05)。偏相关分析显示,焦虑组患者中较差的命名能力与GRIN2B基因CpG4低甲基化水平相关(r=0.670,P=0.034),较差的执行功能与CpG6低甲基化水平相关(r=0.926,P<0.001),较差的注意力与GRIN2B基因CpG8高甲基化水平相关(r=-0.810,P=0.025),较差的言语记忆与CpG9高甲基化水平相关(r=-0.810,P<0.001),较差的抽象能力与CpG10高甲基化水平相关(r=-0.756,P=0.011)。结论GRIN2B基因启动子DNA甲基化水平与伴有焦虑症状双相抑郁患者认知功能损害可能有关联,与双相抑郁患者焦虑症状的产生也可能有关联。
余浩王丞基吴瑶邹韶红
关键词:DNA甲基化双相障碍抑郁发作焦虑症状

相关作者

段世伟
作品数:80被引量:113H指数:6
供职机构:宁波大学医学院
研究主题:引物 甲基化特异性 试剂盒 分子水平 基因启动子区
宋滇平
作品数:241被引量:848H指数:12
供职机构:昆明医学院第一附属医院
研究主题:糖尿病 多态性 2型糖尿病 糖尿病肾病 2型糖尿病患者
李加琪
作品数:259被引量:564H指数:12
供职机构:华南农业大学
研究主题:卵巢颗粒细胞 细胞工程 颗粒细胞 超表达 卵泡发育
金玮
作品数:66被引量:180H指数:7
供职机构:上海交通大学医学院附属瑞金医院
研究主题:单核苷酸多态 冠心病 心力衰竭 基因启动子区域 血管紧张素原基因
张哲
作品数:152被引量:250H指数:8
供职机构:华南农业大学
研究主题:卵巢颗粒细胞 细胞工程 颗粒细胞 超表达 卵泡发育