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内江市东兴区乙型肝炎病毒基因型、基本核心启动子和前C区变异分析
2022年
目的了解内江市东兴区乙型肝炎病毒(hepatitis B virus,HBV)慢性感染者中的HBV基因型和基本核心启动子(basal core promoter,BCP)、前C(Precore,PC)区变异。方法从慢性HBV感染者血清标本中提取病毒DNA,进行核苷酸测序,构建进化树确定基因型,分析BCP和前C区位点变异。结果S基因序列进化树分析显示,64份标本为B基因型,7份为C基因型,1份为I基因型;获取的53份BCP和PC序列标本中,25份标本发生A1762T/G1764A或G1896A变异;7份C基因型标本中6份发生A1762T/G1764A变异;B基因型标本以G1896A变异为主,并与A1762T/G1764A联合变异,HBeAg阳性组和阴性组之间G1896A和A1762T/G1764A变异率有差异(P均<0.05)。其他包括HBeAg前体启动子变异、1846位点核苷酸缺失等。结论内江市东兴区慢性HBV感染者以B基因型感染为主,1例为I基因型。B基因型HBV以G1896A变异最常见,并与A1762T/G1764A联合变异,C基因型HBV更容易发生A1762T/G1764A变异;BCP区的A1762T/G1764A变异和PC区的G1896A变异与疾病严重程度、肝硬化和肝癌发生相关。通过对HBV基因型和变异分析,能为病情诊断和治疗提供帮助。
史运林罗水斌曾长英黄照伟
关键词:乙型肝炎病毒测序基因型基本核心启动子前C区
福建省慢性HBV感染者HBV基因S区、基本核心启动子区和前C区基因变异特征分析
2018年
为研究福建省慢性HBV感染者HBV基因多样性及变异规律,了解该人群HBV-DNA的病毒学特征。收集慢性HBV感染者血清标本,通过巢式PCR法扩增其HBV基因序列,比对NCBI数据库中标准基因型序列,分析HBV基因S区,基本核心启动子区(BCP)及前C区的序列变异情况,并对这些变异可能造成的病毒抗原表达,疫苗逃逸,患者病症改变等情况进行探讨。最终成功扩增82例HBV全长基因序列,其中B基因型56例,C基因型26例。基因组特定功能区序列分析发现慢性HBV感染者HBV基因在S区(23.2%)、BCP区(61.0%)和前C区(29.3%)均出现了不同程度的变异。其中主蛋白(HBsAg)主要抗原决定簇a决定簇45.8%位点出现了变异,这些变异位点中包括与肝炎重症化及免疫逃逸密切相关的位点(aa126、aa129、aa145等)。位点G1896A(19.5%),G1764A(11.0%)和A1762T(9.8%)依然是BCP/前C区的主要突变位点。而位点A1752G(25.6%)高突变率的出现在BCP区应引起关注。此外位点G1764A(χ2=5.742,P=0.030)、A1896G(χ2=14.392,P=0.000)以及A1762T/G1764A(χ2=7.289,P=0.012)的突变更容易发生在HBeAg阴性的样品中;而位点A1846T(χ2=11.882,P=0.003)、A1762T(χ2=6.561,P=0.038)和A1896G(χ2=6.958,P=0.030)的突变与HBV-DNA的病毒载量存在一定相关性。总之,福建省慢性HBV感染者在HBV不同基因功能区域均存在不同程度的变异,一些与HBeAg表达情况、HBV-DNA载量、疫苗免疫逃避及肝细胞癌发生具有相关联的变异位点已经出现,BCP区A1752G位点的高频率出现应值得关注,对于这些变异位点的患者应加强监测。
李东杨秀惠陈致飞张苏晗郑凝旋潘伟毅周勇周勇
关键词:基因变异前C区
乙型肝炎病毒基本核心启动子/前C区变异与HBeAg阳性慢性乙型肝炎患者Peg-IFNα-2b单药或联合阿德福韦抗病毒疗效的关系研究
目的探讨HBV前C区(G1896A)和核心启动子区(A1762T/G1764A)突变与Peg-IFNα-2b单药或联合阿德福韦治疗应答的关系。并研究G1896A和A1762T/G1764A位点变异在治疗前后变化情况。材料...
汪波
关键词:前C区
文献传递
儿童慢性乙型肝炎患者HBV前C/基本核心启动子区基因变异特点研究被引量:1
2018年
目的探讨慢性乙型肝炎(慢乙肝)患儿HBV前C(procore, PC)/基本核心启动子(basic core promoter,BCP)区的变异特点。方法收集符合慢乙肝和肝硬化诊断标准的患儿血清166例。采用DNAout方法提取血清HBV DNA;巢式PCR方法扩增HBVPC/BCP区序列,PCR产物纯化后直接测序。分析HBVPC/BCP区相关位点变异情况。结果 166例患儿中,HBV B基因型的患儿占比20.83%,HBV C基因型的患儿占比79.17%。在感染HBV B基因型的患儿中,乙型肝炎(乙肝)肝硬化患儿与慢乙肝患儿的HBV DNA水平无明显差异,但前者G1899A位点突变率高于后者。在感染HBV C基因型的患儿中,与慢乙肝患儿相比,乙肝肝硬化患儿发生A1762T/G1764A、G1896A突变的比率明显升高且ALT水平较高。结论 HBV C基因型,ALT水平升高,发生A1762T/G1764A,G1896A位点变异的患儿,更容易发展为乙肝相关肝硬化。
储芳钟彦伟杨红艳王丹温梦凡刘超孙群兰李晶张明官卉卉王文波张敏
关键词:儿童慢性乙型肝炎前C区
HBV基本核心启动子区和前C区变异与HBeAg阴性患者肝癌发生的关系被引量:1
2017年
目的探讨HBV基本核心启动子区(BCP)和前C区(PreC)变异与HBeAg阴性患者肝癌发生的关系。方法 204例HBeAg阴性患者分为A组(肝硬化肝癌,102例)、B组(非肝硬化肝癌,36例)和C组(慢性乙型肝炎,66例)。检测三组患者的HBV基因型及HBV BCP和PreC变异情况,分析HBV BCP和PreC变异与肝癌发生的关系。结果 A组中,HBV基因B型87例,C型14例,D型1例;B组中,HBV基因B型31例,C型5例;C组中,HBV基因B型54例,C型11例,D型1例。B组的A1896变异率高于C组(P<0.01)。单因素和多因素分析发现,A1896变异是非肝硬化肝癌发生的危险因素(P<0.01)。结论在HBeAg阴性患者中,A1896变异是非肝硬化肝癌发生的危险因素,对于肝癌的筛查有重要价值。
陈飞李传生
关键词:乙型肝炎病毒基本核心启动子乙型肝炎病毒E抗原肝癌
乙型肝炎病毒基本核心启动子区A1762T/G1764A突变检测的意义被引量:5
2017年
目的探讨乙型肝炎(乙肝)病毒(HBV)基本核心启动子区(BCP)A1762T/G1764A联合突变在不同疾病中发生的差异及其与乙肝相关肝癌预后的关系。方法选择慢性乙肝(CHB)患者38例、乙肝肝硬化(LC)患者36例、乙肝相关肝细胞肝癌(HCC)患者74例,用巢式PCR扩增患者血清中HBV BCP区,直接测序法检测HBV BCP区变异,分析A1762T/G1764A突变与HBV复制、HBeAg表达和HBV感染不同阶段的关系,以及与HCC患者预后的关系。结果在148例患者中,A1762T/G1764A突变总体发生率为54.7%,乙肝相关HCC组中A1762T/G1764A突变发生率为79.7%,而CHB、LC患者分别为31.6%、27.8%,HCC组变异的发生率明显高于CHB组(P<0.05)和LC组(P<0.05);A1762T/G1764A突变组HBV-DNA载量与非突变组比较差异无统计学意义(P>0.05);HBeAg阳性组A1762T/G1764A突变发生率为41.4%,HBeAg阴性组为73.5%,HBeAg阴性组变异发生率明显高于HBeAg阳性组(P<0.05);HCC患者A1762T/G1764A变异组与非变异组之间无病生存期及总体生存期差异无统计学意义(P>0.05)。结论 HBV核心启动子区A1762T/G1764A联合突变与HCC发生具有显著关系,该变异与血清HBV-DNA的复制水平无关,但与血清HBeAg表达水平有关,与乙肝相关HCC预后无显著关系。
徐丹丹张曼吴黎黎
关键词:乙型肝炎病毒基因突变肝细胞癌
广东汉族人群HBV基因型、基本核心启动子/前C区突变与肝癌易感相关性研究被引量:2
2017年
目的研究广东汉族肝癌HBV基因型、基本核心启动子(BCP)/前C区突变与肝癌易感性的相关关系。方法按照病例对照研究设计方法,纳入HBV合并肝癌患者(病例组)100例和HBV携带者(对照组)100例,收集血清样本,提取HBV DNA,采用巢式PCR扩增HBV S区、BCP及前C区片段,双向测序,分析HBV基因型、BCP/前C区基因突变与HBV合并肝癌易感性的相关性。结果病例组BCP区A1762T/G1764A突变及前C区T1858C突变高于对照组,分别为92.0%和73.0%(P<0.05)、52.0%和32.0%(P<0.05);对照组A1775G突变发生率高于病例组,分别为31.0%和14.0%(P<0.05)。多因素Logistic回归分析显示,HBV BCP区A1762T/G1764A突变和前C区T1858C突变与HBV合并肝癌发生独立相关[OR 6.508(95%CI:1.287~16.739,P<0.05)和3.371(95%CI:2.268~8.163,P<0.05)];而BCP区A1775G突变则为保护因素[OR=0.163(95%CI:0.043~0.489,P<0.05)]。结论 HBV C基因型是广东深圳地区HBV合并肝癌的主要流行株,HBV BCP区A1762T、G1764A、A1775G、前C区T1858C基因多态性与HBV合并肝癌的易感性具有密切关系。
刘树旺张丽芬刘利平刘林森张悦李琪彭公泽鲍世韵
关键词:肝癌HBV基因型突变
HBV基本核心启动子和前C区变异的深度测序分析被引量:1
2016年
目的利用Ion Torrent PGM深度测序技术,探讨乙型肝炎病毒e抗原(HBe Ag)阳性慢性乙型肝炎(CHB)患者乙型肝炎病毒(HBV)基本核心启动子和前C区突变特征。方法收集HBe Ag阳性CHB患者血清样本25例,提取HBV DNA,采用巢式PCR方法扩增HBV基本核心启动子和前C区片段,构建深度测序文库,基于Ion Torrent PGM平台深度测序,生物信息学分析突变位点及其突变率;构建HBV基本核心启动子和前C区突变型和野生型参考质粒,作为深度测序质控品。结果在25例HBe Ag阳性CHB患者HBV基本核心启动子和前C区检出流行率达20%的突变位点10个:G1746A、A1752G/T、T1753C/G、A1762T、G1764A、C1817G/A、T1825C/A、A1846T、G1896A、G1899A;G1746A和T1825C/A的流行率分别达92%和100%。突变位点在HBV B基因型和C基因型感染者的分布情况显示,A1752G/T和G1896A主要流行于B基因型感染者(63.6%vs 0.0%,χ^2=12.374、P=0.0007;72.7%vs 28.6%,χ^2=4.812、P=0.0472),A1762T和G1764A主要流行于C基因型感染者(27.3%vs 78.6%,χ^2=6.579,P=0.0172);C基因型感染者A1762T/G1764A突变率显著高于B基因型感染者,但差异无统计学意义(25.7%±28.4%vs 68.4%±42.7%,t=1.614、P=0.1326)。25例HBe Ag阳性CHB患者中,32.0%患者仅有A1762T/G1764A突变,24.0%患者仅有G1896A突变,24.0%患者同时携带A1762T/G1764A和G1896A突变。结论深度测序分析可用于定量检测HBV基本核心启动子和前C区突变,为HBV突变研究的临床应用提供了技术平台。
闫琳琳张恒辉马慧刘翟李伟陈红松邵启祥
关键词:基本核心启动子前C区
乙型肝炎病毒前C/基本核心启动子区变异的生物学意义
2015年
乙型肝炎病毒(HBV)基因组变异率约为其他DNA病毒的104倍,主要原因:(1)HBV复制是以mRNA为模板反转录合成代病毒DNA,该过程中缺乏校对酶的作用,容易发生碱基错配;(2)在内源性(宿主免疫清除)和外源性(疫苗接种、乙型肝炎免疫球蛋白注射、抗病毒药物治疗和诊断试剂检测)选择性压力下,
向瑶杨朝国
关键词:乙型肝炎病毒前C区基因基本核心启动子突变
广西肝癌高发区乙型肝炎病毒基本核心启动子区A1762T/G1764A双突变对肝癌家族聚集的影响被引量:1
2015年
目的探讨广西肝癌高发区乙型肝炎病毒(HBV)基因组基本核心启动子(BCP)区A1762T/G1764A双突变对肝癌家族聚集的影响。方法收集2007年7月—2012年7月广西肝癌高发区39个肝癌高发家族中103例成员作为试验组,在相同地区59个无癌家族中选择与试验组年龄、性别、生活环境匹配的103例成员作为对照组,将试验组按家族患肝癌例数分为2~3例亚组(45例)和≥4例亚组(58例);按亲属分级分为一级亲属组(48例),二级亲属组(32例),三级及以上亲属组(23例)。提取所有研究对象HBV DNA,PCR扩增并测序检测BCP区A1762T/G1764A双突变情况。结果试验组A1762T/G1764A双突变率高于对照组〔χ^2=12.518,P〈0.001;OR=2.788,95%CI(1.569,4.955)〕。试验组男性A1762T/G1764A双突变率高于对照组〔χ^2=11.377,P=0.001;OR=3.450,95%CI(1.659,7.176)〕;两组女性A1762T/G1764A双突变率比较,差异无统计学意义〔χ^2=1.983,P=0.159;OR=1.950,95%CI(0.766,4.965)〕。试验组≥30岁年龄段A1762T/G1764A双突变率高于对照组〔χ^2=10.743,P=0.001;OR=3.444,95%CI(1.622,7.314)〕;两组〈30岁年龄段A1762T/G1764A双突变率比较,差异无统计学意义〔χ^2=2.489,P=0.115;OR=2.053,95%CI(0.836,5.041)〕。试验组患肝癌2-3例亚组与≥4例亚组A1762T/G1764A双突变率比较,差异有统计学意义〔(χ^2=6.639,P=0.01;OR=3.122,95%CI(1.290,7.555)〕。3组A1762T/G1764A双突变率比较,差异有统计学意义(P〈0.05)。一级亲属亚组双突变率高于二级亲属亚组(P〈0.05)。试验组HBe Ag阴性者突变率高于HBe Ag阳性者(χ^2=6.361,P=0.012)。试验组A1762T/G1764A双突变者HBV DNA水平低于无双突变者(Z=-3.957,P〈0.01)。结论广西肝癌高发区HBV BCP区A1762T/G1764A双突变与肝癌家族聚集密切相关,A1762T/G1764A双突变可能对肝癌的发生具有重要的预测价值。
石仁芳吴继周万裴琦吴健林宁秋悦庞裕
关键词:乙型肝炎病毒家族聚集

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刘悦晖
作品数:23被引量:92H指数:6
供职机构:中南大学湘雅医院
研究主题:限制性片段长度多态性 乙型肝炎病毒前C区 基本核心启动子变异 基因型 乙型肝炎病毒
丁静娟
作品数:61被引量:128H指数:6
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