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单核苷酸多态性与核心基因组多位点序列分型技术在宋 内 志贺 菌 暴发疫情调查中的应用研究 2024年 目的对宋 内 志贺 菌 暴发菌 株的全基因组聚类特征进行比较分析,为全基因组比对溯源分析算法的建立和优化提供参考。方法选取2017年8月河南省某寄宿制初中食物中毒事件中的17例腹泻病例,每个病例采集粪便拭子1份,提取细菌 DNA进行全基因组测序,测序数据经质控过滤、拼接组装后进行全基因组单核苷酸多态性(wgSNP)和核心基因组多位点序列分型(cgMLST)分析。结果经分离培养、系统生化鉴定和血清学分型,共鉴定出17株宋 内 志贺 菌 。wgSNP分析将17株宋 内 志贺 菌 分为3个主要分枝,分枝3内 对应病例的分枝事件频度和时空跨度都较大。cg MLST分析将17株宋 内 志贺 菌 暴发菌 株归为同一分枝。结论wgSNP与cgMLST测序分析技术各有优劣,可以为肠道腹泻传染病日常监测和暴发控制提供参考依据。 郝潇 赵嘉咏 宋威蓉 胡赢心 穆玉姣关键词:宋内志贺菌 全基因组 单核苷酸多态性 一株马源宋 内 志贺 菌 的分离鉴定与耐药性分析 2023年 为鉴定马粪便中分离到的1株细菌 种类,笔者结合形态学观察与序列分析鉴定细菌 ,采用PCR法检测分离其耐药基因,并使用药敏试验对分离菌 进行耐药性分析。结果显示,分离菌 株在MAC琼脂培养基和SS琼脂培养基上均呈半透明、光滑、边缘整齐的圆形小菌 落,镜检可见分离菌 呈两端钝圆的革兰阴性短菌 ;基于16S rDNA基因位点,分离菌 的序列经比对后,与英国人源宋 内 志贺 菌 的序列同源性为100%,结合形态学观察结果,鉴定为宋 内 志贺 菌 ;采用PCR法检测10种耐药基因,发现分离菌 株携带4种耐药基因,分别为parC、gyrA、gyrB和blaCTX;采用9种药物对分离菌 株进行药敏试验,发现分离菌 株对氨苄西林、红霉素、庆大霉素、四环素等药物耐药,呈现多重耐药性;对头孢西丁、阿米卡星敏感。研究结果为志贺 菌 病的防治提供了基础参考。 石帅锋 陀海欣 倪晓彤 刘螯汽 洪皓正 朱婷婷 李静 齐萌关键词:宋内志贺菌 一株同时携带bla_(CTX-M-14)和bla_(CTX-M-15)基因的多重耐药宋 内 志贺 菌 耐药基因及质粒分析 2023年 目的对1株同时耐头孢菌 素和阿奇霉素的多重耐药宋 内 志贺 菌 进行全基因组测序分析,明确其携带的耐药基因和质粒特征。方法通过对2011年上海市的60株宋 内 志贺 菌 进行抗菌 药物敏感性分析,筛选出1株同时耐头孢菌 素和阿奇霉素的菌 株Sh11sh529,使用二代和纳米孔测序技术获得其基因组序列,分析基因组的耐药基因、质粒、可移动遗传元件等。结果Sh11sh529基因组中检测到了11个耐药基因以及gyrA基因喹诺酮耐药决定区(QRDR)的突变位点gyrA-S83L,耐药基因包括2种CTX-M型超广谱β内 酰胺酶(ESBL)基因bla_(CTX-M-14)和bla_(CTX-M-15),其中bla_(CTX-M-14)、mphA、aac(3)-IId、dfrA17、aadA5、sul1和qacEdelta基因由1个IncB/O/K/Z型质粒pSh11sh529-2携带,bla_(CTX-M-14)上游有1个ISEcp1插入子,mphA上游有1个IS26插入子。而bla_(CTX-M-15)由IncFII型质粒pSh11sh529-3携带,在其上游有1个ISEcp1插入子。该菌 株表现出多重耐药性,对头孢菌 素类、大环内 酯类、氨基糖苷类、磺胺类、青霉素类等5类抗菌 药物中的9种耐药。结论应当加强对多重耐药菌 株以及同时携带多个类型ESBL菌 株的监测和研究,以制定策略减少其流行和传播。 刘康康 李春晓关键词:宋内志贺菌 国内 宋 内 志贺 菌 进化与耐药特征研究 由志贺 菌 引起的细菌 性痢疾是对全球公共卫生的持续性威胁。志贺 菌 每年在全球导致约1.88亿人感染,造成约16万人死亡,而且死亡的病例主要为婴幼儿。福氏志贺 菌 和宋 内 志贺 菌 是全球范围内 流行的主要志贺 菌 类型,近些年,宋 内 志贺 菌 逐渐... 刘康康关键词:志贺菌 耐药 进化 全基因组测序 人血清中福氏2a及宋 内 志贺 菌 O-特异性多糖抗体IgG含量间接ELISA定量检测方法的验证及应用 2023年 目的验证人血清中福氏2a及宋 内 志贺 菌 O-特异性多糖(分别简称福氏2a多糖及宋 内 多糖)抗体IgG含量的ELISA定量检测方法,并用于福氏宋 内 痢疾双价疫苗免疫前后人血清样本的检测。方法将参考血清及质控血清按一定比例混合,制备成10份不同浓度的血清样本(编号为S1~S10),采用企业提供的间接ELISA定量检测方法检测样本,连续测定6 d,计算多糖抗体IgG回收率和变异系数(coefficient of variation,CV),并以回收率CV低于20%的相应参考血清含量作为定量限(limit of quantitation,LOQ)。采用相同检测方法连续6 d测定血清样本S10及质控血清,每天重复检测3次,计算CV;采用参考血清进行多糖竞争抑制ELISA试验,计算血清对多糖的抑制率。采用企业提供的方法检测参考血清,确定线性范围,获得曲线方程,计算相关系数(R^(2))。采用验证的方法检测1842份福氏宋 内 痢疾双价疫苗免疫前后的人血清样本。结果10份血清样本中福氏2a和宋 内 多糖抗体IgG回收率分别为73.21%~222.68%和83.67%~123.56%;试验间及试验内 精密性CV均<30%;参考血清对100μg/mL福氏2a和宋 内 多糖的抑制率分别为85.95%和88.42%;福氏2a和宋 内 多糖抗体IgG检测的线性范围分别为0.05~0.125和0.025~0.125 EU/mL,R^(2)均≥0.99,LOQ分别为0.050和0.025 EU/mL。福氏宋 内 痢疾双价疫苗免疫后血清IgG含量大幅高于免疫前。结论企业提供的ELISA定量检测方法具有良好的准确性、精密性及特异性,可用于痢疾疫苗免疫血清的检测。 李红 石刚 郭丽娜 陈琼 付宏斌 王国东 胡小华 朱卫华 王斌 叶强关键词:抗体IGG 志贺菌 痢疾疫苗 Hfq依赖性sRNA调控宋 内 志贺 菌 毒力和耐药的分子机制 王亚一起宋 内 志贺 菌 引起的细菌 性痢疾暴发病原学检测及分子溯源 被引量:5 2022年 目的对淮南市发生的一起宋 内 志贺 菌 暴发疫情进行病原学溯源分析,并对菌 株毒力基因和耐药谱进行检测。方法采集2020年8月淮南市一起感染性腹泻暴发疫情相关水样、粪便,进行多重病原体核酸检测和分离培养,对分离的宋 内 志贺 菌 进行毒力基因PCR检测、微量肉汤法药敏检测、脉冲场电泳和全基因组测序溯源分析。结果56份黏稀样粪便分离出38株宋 内 志贺 菌 (阳性率67.86%),血清型均为宋 内 志贺 菌 Ⅰ相;3份末梢水和井水革兰阴性菌 (GN)增菌 液荧光PCR检测志贺 菌 阳性;菌 株毒力基因携带情况为侵袭性质粒抗原H(ipaH)阳性(38份),侵袭性质粒抗原H(ipaH)/侵袭相关基因(ial)阳性(31份),侵袭性质粒抗原H(ipaH)/侵袭相关基因(ial)/肠毒素2基因(sen)阳性(1份);耐药谱显示14种抗生素中9种100.00%耐药,仅亚胺培南、氯霉素、头孢他啶、环丙沙星为有效药物;36株菌 XbaⅠ限制性酶切图谱带型完全一致,其中3株菌 株基因组ST型分析均为ST152型;全基因组测序和分析验证了此次暴发由单一克隆群菌 株引起,且揭示此次暴发分离株与数据库中3株中国菌 株、1株韩国菌 株聚集成一个大簇,而与其他国家的菌 株距离较远。结论本起由水源污染单一宋 内 志贺 菌 克隆引起,分离株为低毒力株,呈多重耐药表型。 刘江 孙永 张洁 曾凡荣 王小波 朱利杰 孙梦阳 余寿杰关键词:宋内志贺菌 全基因组测序 药敏试验 北京市一起由宋 内 志贺 菌 引起的细菌 性痢疾暴发病原学分析 被引量:7 2022年 目的对北京市一起由宋 内 志贺 菌 引起的暴发疫情进行流行病学调查以及病原学分析,为此类疫情处理提供参考。方法2019年9月5—20日,采集病例及厨师粪便/肛拭子样本,以及水样、外环境等标本进行病原分离鉴定,并将分离到的病原菌 进行药物敏感性试验、脉冲场凝胶电泳(PFGE)分子分型、全基因组测序,利用全基因组数据分析病原菌 的耐药、毒力相关基因,并进行多位点序列分型(MLST),构建全基因组单核苷酸多态性(wgSNP)分型树状图。结果共分离到16株宋 内 志贺 菌 和1株肠产毒性大肠埃希菌 (ETEC),志贺 菌 均对氨苄西林、四环素、复方新诺明、头孢唑啉、头孢噻肟、庆大霉素、萘啶酸、阿奇霉素、多西环素耐药,且均为产超广谱β-内 酰胺酶(ESBLs)菌 株。均为ST152型,是国内 常见型别。其中1株宋 内 志贺 菌 全基因组中存在insA插入序列,而在其他志贺 菌 全基因组中未发现,与其同时分离到的ETEC全基因组中发现有该插入序列。结论本次疫情是由多耐药宋 内 志贺 菌 引起。在病原溯源研究中,全基因组数据分析是PFGE分型的必要补充。 吕冰 田祎 杨艳娜 甄博珺 贾蕾 林长缨 张新 黄瑛 曲梅关键词:宋内志贺菌 全基因组 脉冲场凝胶电泳 cfa基因通过半胱氨酸和甲硫氨酸代谢通路调控宋 内 志贺 菌 氨苄西林耐药机制研究 志贺 菌 是细菌 性痢疾的病原体,其流行范围广,感染率高,危害严重,是全球重要的公共卫生挑战之一。随着抗生素在临床上的广泛应用,志贺 菌 耐药负担愈发凸显,这也成为志贺 菌 感染药物治疗失效的主要原因。本课题组前期对cfa基因调控志贺 ... 耿娟关键词:宋内志贺菌 耐药 蛋白质组学分析 广西宋 内 志贺 菌 药敏特性及ESBLs基因检测分析 被引量:1 2021年 目的了解广西地区宋 内 志贺 菌 的药敏特性及携带超广谱β-内 酰胺酶(ESBLs)基因与型别特征,为临床合理用药和控制耐药性的传播提供科学依据。方法采用微量肉汤稀释法对宋 内 志贺 菌 分离株进行药物敏感试验;采用PCR方法和毛细管电泳方法检测菌 株携带相关ESBLs基因;采用近邻相接法构建系统进化树,分析菌 株CTX-M型基因型别;对菌 株携带ESBLs基因与特定抗菌 药物耐药性的关系进行统计学分析。结果90株宋 内 志贺 菌 对环丙沙星敏感率为86.67%,无耐药现象;头孢曲松耐药率为96.67%,阿奇霉素耐药率为96.67%,多重耐药率为98.89%。90株宋 内 志贺 菌 中50株检出blaCTX-M-9 group基因,检出率为55.56%,经系统发育分析均为CTX-M-14亚型;1株检出blaTEM基因,检出率为1.11%;未检出blaCTX-M-1 group,blaCTX-M-2 group,blaCTX-M-8 group,blaCTX-M-25 group和blaOXA,blaSHV,blaNDM,blaVIM等β-内 酰胺酶基因。blaCTX-M-14基因阳性菌 株与blaCTX-M-14基因阴性菌 株对头孢噻肟的耐药率差异无统计学意义(χ^(2)=0.000,P>0.05);携带blaTEM基因的菌 株对头孢他啶不耐药。结论广西地区的宋 内 志贺 菌 对主要治疗药物头孢曲松高度耐药,且多重耐药现象严重;菌 株普遍携带ESBLs基因,主要为CTX-M-14亚型;携带单一型别的ESBLs基因与菌 株对特定β-内 酰胺类抗菌 药物耐药无明显关联。 廖驰真 廖驰真 王鸣柳 林玫 曾竣 李艳文关键词:宋内志贺菌 超广谱Β-内酰胺酶 耐药基因
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曲芬 作品数:239 被引量:1,216 H指数:17 供职机构:解放军302医院 研究主题:耐药性 腹泻 宋内志贺菌 肝硬化患者 耐药性分析 鲍春梅 作品数:138 被引量:692 H指数:16 供职机构:解放军第302医院 研究主题:耐药性 腹泻 宋内志贺菌 耐药性分析 腹泻病原菌 陈素明 作品数:88 被引量:380 H指数:12 供职机构:解放军第302医院 研究主题:宋内志贺菌 耐药性 耐药性分析 腹泻 肝硬化患者 崔恩博 作品数:151 被引量:743 H指数:16 供职机构:解放军302医院 研究主题:耐药性 腹泻 肝硬化患者 耐药性分析 宋内志贺菌 王欢 作品数:74 被引量:324 H指数:10 供职机构:解放军第302医院 研究主题:耐药性分析 耐药性 宋内志贺菌 腹泻 肝病患者