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慢性肌筋膜触发点模型大鼠的尿液代谢组学分析
2025年
背景:慢性肌筋膜触发点通过非靶向代谢组学技术可识别差异性代谢物变化,有助于从内源性小分子代谢物层面理解并进一步探究慢性肌筋膜触发点的病理生理过程和发病机制。目的:以慢性肌筋膜触发点模型大鼠为研究对象,基于尿液代谢组学寻找潜在生物标志物及相关代谢通路。方法:将16只SD大鼠随机分为造模组和正常组,造模组大鼠采用钝性打击结合离心运动(跑台坡度为-16°,跑速为16 m/min,训练时间为90 min/次)方式建立慢性肌筋膜触发点动物模型,每周1次,连续干预8周,休息4周;正常组大鼠不做干预。12周造模结束后,采用代谢笼法收集大鼠造模后24 h尿液,利用液相色谱-质谱联用非靶向代谢组学技术对尿样进行代谢图谱检测,筛选出共同差异代谢物,并进行生物信息学分析。结果与结论:①与正常组相比,造模组有32个差异代谢标志物,其中上调21个、下调11个;依据变量权重值>3,共14个差异代谢物被认定为潜在生物标志物;②京都基因与基因组百科全书富集分析表明,慢性肌筋膜触发点的形成与初级胆汁酸生物合成、花生四烯酸代谢通路密切相关。
刘琳刘世轩陆馨悦王侃
关键词:肌筋膜触发点代谢组学生物信息学生物标志物
用于胃癌检测的尿液代谢标志物及其应用
本发明涉及用于胃癌检测的尿液代谢标志物及其应用。本发明基于代谢组学方法,对胃癌患者、胃部非癌疾病患者和健康对照组的尿液样本的代谢物进行检测分析,筛选胃部疾病发展相关性高的12个代谢标志物。多变量多分类ROC曲线分析表明,...
李琰 宋林霞 文赫 史菲 何芸 刘丽 于书棋 彭兴 张涛 胡隽源
用于胃癌检测的尿液代谢标志物及其应用
本发明涉及用于胃癌检测的尿液代谢标志物及其应用。本发明基于代谢组学方法,对胃癌患者、胃部非癌疾病患者和健康对照组的尿液样本的代谢物进行检测分析,筛选胃部疾病发展相关性高的12个代谢标志物。多变量多分类ROC曲线分析表明,...
李琰宋林霞文赫史菲何芸刘丽于书棋彭兴张涛胡隽源
儿童OAB尿液代谢标记物的鉴定及分析方法
本发明公开了儿童OAB尿液代谢标记物的鉴定及分析方法,收集临床OAB患儿和正常儿童尿液样本,基于数据非依赖性采集(DIA)技术,通过液相色谱串联高分辨质谱进行定量分析,实现了OAB儿童尿液代谢标记物的鉴定及分析。本发明发...
刘星魏光辉陈虹松章志成王冲
结直肠进展期腺瘤的尿液代谢组学特点初探
2024年
目的分析结直肠进展期腺瘤(advanced adenoma,AA)的尿液代谢组学特点。方法纳入2020年7月至2021年12月于首都医科大学附属北京世纪坛医院消化内科住院行结直肠息肉内镜下治疗者,或伺机筛查行结肠镜检查者,收集患者的临床和内镜资料。按结肠镜和病理结果分为AA和对照组(结肠镜未见明显异常),每组30例。所有研究对象于结肠镜检查或治疗前留取晨起中段尿3~5 mL,以气相色谱-飞行时间质谱联用技术进行代谢组学检测和分析。差异代谢物的筛选基于t检验的P值<0.05和正交偏最小二乘法-判别分析(orthogonal projections to latent structures discriminant analysis,OPLS-DA)模型第一主成分的变量投影重要度(variable importance in the projection,VIP)>1。差异代谢物参考京都基因与基因组百科全书(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)旁路数据库进行KEGG分类。结果本研究包括男36例和女24例,年龄(55.9±10.8)岁(27~75岁)。AA组年龄较对照组大[(59.8±9.6)岁vs(52.0±10.7)岁,P=0.004];两组在性别构成、伴高血压、糖尿病、吸烟、恶性肿瘤家族史方面差异无统计学意义。OPLS-DA显示,AA组和对照组样本间横向距离远,出现了明显的分离趋势。共检测出37种差异代谢物;AA组尿嘧啶、3-氨基异丁酸呈显著上调,葡萄糖酸内酯、α-酮基戊二酸、酒石酸、4-羟基苯甲酸、乳果糖、苯乙酸、1,5-酐-D-山梨糖醇、3-羟基丙酮酸呈显著下调。根据KEGG通路注释的结果,将差异代谢物进行富集分析,结果显示AA组与对照组的差异代谢物涉及到氨基酸代谢、碳水化合物代谢、核苷酸代谢等,其中氨基酸代谢涉及到了苯基丙氨酸、缬氨酸、亮氨酸、异亮氨酸、半胱氨酸、蛋氨酸、甘氨酸等多条代谢通路。结论AA尿液代谢组学检测出了葡萄糖酸内酯、尿嘧啶、3-氨基异丁酸等多个差异代谢物质,涉及到氨基酸代谢、碳水化合物代谢、核苷酸�
林琳林琳王沧海张曼吴静
关键词:结直肠癌代谢组学质谱尿液
用于结直肠癌检测的尿液代谢标志物及其应用
本发明利用结直肠癌患者、非结直肠癌疾病患者(结直肠息肉和结直肠腺瘤)和健康对照组的尿液样本,基于代谢组学分析,筛选获得16个尿液代谢标志物组合,从这16种标志物组合中选择12种、8种或4种组合同样具有较好的临床诊断意义,...
李琰文赫史菲张涛王娇娇胡隽源
基于代谢组学分析急性心肌梗死大鼠尿液代谢物变化
2024年
目的通过非靶向代谢组学研究急性心肌梗死(acute myocardial infarction,AMI)大鼠尿液代谢产物的变化,筛选出可用于AMI法医学鉴定的生物标志物。方法建立假手术组、AMI组和高脂血症+AMI组(hyperlipidemia+acute myocardial infarction,HAMI)大鼠模型。运用超高效液相色谱-质谱法(ultra-high performance liquid chromatography-mass spectrometry,UPLC-MS)分析AMI大鼠尿液代谢谱的变化。通过主成分分析、偏最小二乘判别分析、正交偏最小二乘判别分析等筛选差异代谢物。使用MetaboAnalyst数据库进行代谢通路富集分析并评估差异代谢物的预测能力。结果分别筛选出40种和61种与AMI相关和HAMI相关的差异代谢物。其中22种为共同代谢物,这些小分子代谢物主要集中在烟酸和烟酰胺代谢途径中。在95%可信区间内N8-乙酰亚精胺、3-甲基组胺和胸腺嘧啶的受试者操作特征曲线的曲线下面积(area under the curve,AUC)值大于0.95。结论N8-乙酰亚精胺、3-甲基组胺和胸腺嘧啶可作为诊断AMI的潜在生物标志物,烟酸和烟酰胺代谢的异常可能是AMI的主要原因。本研究可为AMI的作用机制和死因鉴定提供参考。
陈念念余娇芳吴鹏罗丽白雅琴王利凯李晓倩李展鹏高彩荣郭相杰
关键词:法医病理学急性心肌梗死尿液
基于UPLC-Q-TOF MS的染毒(PM2.5)大鼠尿液代谢组学研究被引量:1
2024年
为探明PM2.5对大鼠代谢组学的影响,将SD大鼠随机分为对照组(SC)和PM2.5模型组(MG),每组15只。将生理盐水和PM2.5混悬液分别注入各组大鼠气管,每周2次,持续4周。通过超高效液相色谱-四极杆-飞行时间质谱(UPLC-Q-TOF MS)对各组大鼠尿液代谢组学变化进行检测,采用多元统计分析探究整体代谢组学的变化。通过数据分析和数据库检索,从大鼠尿样中鉴定出17种潜在生物标记物,主要代谢途径涉及戊糖和葡萄糖醛酸相互转化、色氨酸代谢、酪氨酸代谢、苯丙氨酸代谢、嘌呤代谢、对乙酰氨基酚代谢、视黄醇代谢和丙戊酸代谢途径,PM2.5对大鼠诱导损伤作用,可能与其扰乱大鼠体内正常代谢活动有关。研究结果有助于了解PM2.5的毒理学机制,筛选PM2.5暴露大鼠的潜在生物标志物,为进一步探索PM2.5毒性作用及致病机制提供了理论依据。
鲁婷婷秦鹏薛慧铭冯真罗旭萍郑梅竹
关键词:PM2.5代谢组学尿液
柴归颗粒动态调控CUMS大鼠尿液代谢标志物抗抑郁机制研究
2024年
目的 基于1H-NMR动态代谢组学和整合网络药理学探究柴归颗粒调控慢性温和不可预知应激(CUMS)大鼠尿液代谢标志物发挥抗抑郁作用的关键途径和潜在靶点。方法 除对照组外,各组大鼠均进行7周CUMS造模,前4周仅造模,后3周ig给药1 h后造模并对盐酸文拉法辛(35 mg·kg^(-1))组和柴归颗粒(8.3 g·kg^(-1))组进行药物干预,通过称体质量、糖水偏爱实验、强迫游泳实验研究柴归颗粒的抗抑郁作用;收集各组大鼠不同时间节点的尿液,采用1H-NMR代谢组学监测柴归颗粒给药过程中尿液代谢标志物的动态变化规律,整合网络药理学分析挖掘其治疗抑郁症的关键途径和潜在靶点。结果与模型组比较,柴归颗粒显著增加大鼠的体质量(P<0.05),显著升高糖水偏爱率(P<0.01),显著减少游泳不动时间(P<0.05、0.01);柴归颗粒可以动态调控天冬氨酸等10个尿液代谢标志物接近正常水平,且不同代谢物回调至正常水平的给药周期不同,泛酸、马尿酸含量在柴归颗粒给药1周后显著回调(P<0.05、0.01);蛋氨酸、甲胺和天冬氨酸含量在柴归颗粒给药2周后显著回调(P<0.01);2-酮戊二酸、牛磺酸、丁酸、赖氨酸和乳酸含量在柴归颗粒给药3周后显著回调(P<0.05、0.01)。同时,网络药理学分析结果表明柴归颗粒可能通过调控丙氨酸、天冬氨酸和谷氨酸代谢这一关键途径发挥疗效,且其代谢途径上的GPT、GLUD1、GLUD2、GOT2等4个靶点可能是柴归颗粒治疗抑郁症的潜在靶点。结论 柴归颗粒可能通过调控丙氨酸、天冬氨酸和谷氨酸代谢这一关键途径发挥抗抑郁作用。
胡婷吴振宁许腾周玉枝高晓霞高晓霞田俊生
一种基于高压光电离飞行时间质谱的尿液代谢组学分析方法
本发明提供了一种基于高压光电离飞行时间质谱(HPPI‑TOFMS)的尿液代谢组学分析方法,通过构建尿液代谢组学分析模型对尿液进行分析,模型构建方法包括:收集健康人尿液样本和患病患者尿液样本;对尿液样本进行高压光电离飞行时...
李海洋杨明花磊吴称心蒋吉春

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沈洪兵
作品数:490被引量:4,020H指数:31
供职机构:南京医科大学公共卫生学院
研究主题:流行病学 标志物 基因工程 糖尿病 乳腺癌
胡志斌
作品数:235被引量:1,015H指数:15
供职机构:南京医科大学
研究主题:标志物 基因工程 诊断试剂 肿瘤医学 乳腺癌
洪志明
作品数:206被引量:300H指数:8
供职机构:深圳市中医院
研究主题:CP 精液 慢性前列腺炎 中医 少弱精子症
张扬
作品数:28被引量:15H指数:2
供职机构:北京航空航天大学
研究主题:尿液 IDH 氢 高速脉冲 胶质母细胞瘤
孙伟
作品数:16被引量:6H指数:2
供职机构:北京协和医院
研究主题:血液 个性化治疗 子宫内膜癌 代谢物 尿液代谢