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细菌性条斑病菌JH01诱导水稻抗病均一化文库的构建被引量:1
2016年
[目的]构建细菌性条班病菌诱导下的水稻抗病均一化eDNA文库,对获得的异表达ESTs进行生物信息学及抗病相关基因的表达分析。[方法]以水稻IR26(Tester)和两优培九(Driver)幼苗5~6叶期叶片为材料,采用双链特异性核酸酶(DSN)介导的均一化消杂交技术,构建细菌性条斑病菌JH01诱导的水稻抗病相关基因eDNA文库,以pLB-F和pLB-R为引物,通过菌液PCR扩增对文库的质量进行检测。【结果】eDNA文库的插入片段分布在0.5~2.0kb,平均大小约为1.0kb.重组率达95%。序列测定分析发现,随机挑取的504个克隆中有98条异表达基因;经BLAST比对和GO注释发现,59条序列具有同源基因,分别参与信号转导、能量代谢、过敏性坏死反应、防卫反应等;另外39条序列无相似基因,有待进一步研究。通过实时荧光定量PCR发现,从该文库中分离得到的OsNDPK4参与细菌性条斑病菌JH01诱导的水稻防卫反应。[结论]水稻受细菌性条斑病菌侵染的eDNA文库质量较好,为研究条斑病菌致病性因子与水稻互作机制奠定基础.
凌丹燕路梅
关键词:细菌性条斑病水稻
低温胁迫下凹叶厚朴文库的构建及ESTs序列分析
凹叶厚朴文库的构建及序列分析可以有效找出其主要抗寒相关功能基因,分析代谢途径。进而对与凹叶厚朴亲缘关系相近的植物抗低温特性遗传育种提供理论基础,并且有助于对植物的自然栽培的研究。实验从植物低温胁迫到最终测序的文库...
陆宁
关键词:凹叶厚朴低温胁迫差减文库基因表达量
麻疯树雌花和花芽的文库构建
2015年
目的为探讨麻疯树的性别分化情况,筛选出麻疯树雌花和花芽的异表达基因。方法以麻疯树雌花为驱动子,花芽为检测子,使用SSH法进行正向抑制消杂交。结果得到完整性较好的总RNA,扩增出的双链cDNA效果良好;通过平板筛选,获得2 000余个单克隆;结果表明,用SSH法能有效构建麻疯树花的异表达基因的文库。结论:成功构建了麻疯树花的文库
安利云陈国明田飞
关键词:麻疯树抑制性消减杂交CDNA文库
雌性东方蜜蜂基因表达文库的构建及初步分析
2015年
蜜蜂的蜂王和工蜂是两种不同的表型,这是基于基因的异表达,而不是遗传物质的多态性。本研究以雌性东方蜜蜂为材料,利用抑制消杂交技术构建东方蜜蜂蜂王和工蜂的基因异表达的文库。挑选插入片段大于200 bp的330个阳性克隆进行测序,蜂王消文库176个,工蜂消文库154个。测序后蜂王消文库获得161条ESTs序列,工蜂消文库获得142条ESTs序列。获得的序列采用DNAstar seq Man软件进行载体、接头和低质量序列去除后进行ESTs分析,蜂王消文库获得110个contings,工蜂消文库获得81个contings,蜂王和工蜂文库均有部分重叠的ESTs序列。在NCBI上进行在线BLASTx和t BLASTn同源比较,发现在蜂王的ESTs中有62个已知ESTs,3个未知ESTs,工蜂的ESTs中有49个已知ESTs,8个未知ESTs。通过基因本体论进行功能分析,大部分异表达的基因为酶类和结合蛋白,主要参与基因的转录、翻译和新陈代谢过程。雌性东方蜜蜂文库的构建,为进一步研究蜜蜂级型分化的机制奠定了基础。
樊莹邹丰才董霞匡海鸥
关键词:东方蜜蜂抑制消减杂交消减文库ESTS
金鱼头瘤形成相关基因文库的构建与分析
2014年
采用抑制杂交技术(SSH)以1龄红狮头金鱼(Carassiusauratus)的头瘤组织为检测子(Tester),40日龄红狮头金鱼幼鱼的头顶上皮组织为驱动子(Driver),构建金鱼头瘤相关基因的cDNA文库。以鲫管家基因octubilin为参照检测效率,结果表明该文库效率达210倍,效率较高。随机挑选阳性克隆进行接头特异引物的PCR检测,结果表明插入片段均在0.1~2.0kb之间。利用斑点杂交对PCR检测结果为单一条带的阳性克隆进行筛选并测序,获得高异性的有效序列93条。通过生物信息学方法对文库序列进行比对、分类和注释,发现若干结缔形成基因和原癌/抑癌基囚等与金鱼头瘤彤成相关的功能基因,表明cDNA文库构建成功。
张运超何川顾泽茂
关键词:金鱼CDNA文库
根肿病菌侵染茎瘤芥文库的构建及其异表达基因鉴定
茎瘤芥(Brassica juncea var. tumida Tsen),是重庆市涪陵区的特色农业资源,其收获物瘤茎(俗称青菜头)是世界三大名腌菜之一“涪陵榨菜”的主要原料。茎瘤芥营养丰富,加工后形成的榨菜脆嫩爽口、味...
罗远莉
关键词:寄生真菌菌株鉴定
溶藻弧菌诱导马氏珠母贝血淋巴cDNA文库的构建及分析被引量:1
2014年
为了探讨马氏珠母贝免疫防御机制,筛选免疫防御相关功能基因,以致病性溶藻弧菌人工感染的马氏珠母贝血淋巴为材料,采用抑制性杂交(SSH)技术,构建了溶藻弧菌诱导的马氏珠母贝血淋巴cDNA文库;以马氏珠母贝管家基因β-actin作为指标检测该文库效率;对选取的600个阳性克隆进行测序及生物信息学分析。结果显示,该文库效率可达2^10倍;PCR阳性检测显示片段为100~750bp,对随机挑取600个克隆的测序结果显示,共获得414个有效EST序列;通过BLAST同源性比对,有167个EST序列(占40.34%)与NCBI数据库中已知功能蛋白质具较高同源性,其中7个EST序列(占1.69%)与免疫防御相关基因同源;此外,204个EST(占49.28%)在数据库中未发现同源序列。研究表明,SSH技术能有效富集马氏珠母贝血淋巴异表达基因,研究结果为探索马氏珠母贝免疫基因作用机理和调控机制奠定了基础。
王忠良简纪常鲁义善王蓓陈刚吴灶和
关键词:马氏珠母贝溶藻弧菌抑制性消减杂交CDNA文库
金鱼头瘤相关基因文库的构建与分析
金鱼(goldfish)属于鲤形目(Cypriniformes)、鲤科(Cyprinidae)、鲫属(Carassius),是我国特有的观赏鱼类,起源于晋代的赤鳞鱼,经过多年的杂交选择育种后获得了各种性状的品种。至今,人...
张运超
关键词:CDNA文库
文献传递
雌性东方蜜蜂基因表达文库的构建及初步分析
蜜蜂的蜂王和工蜂是两种不同的表型,这是基于基因的异表达,而不是遗传物质的多态性.本研究以东方蜜蜂为材料,利用抑制消杂交技术构建东方蜜蜂蜂王和工蜂的基因异表达的文库.挑选插入片段大于200bp的330个阳性克隆进行测...
樊莹匡海鸥邹丰才和绍禹董霞
关键词:东方蜜蜂抑制消减杂交消减文库ESTS
文献传递
银杏雌雄花芽抑制文库(SSH)构建及EST序列分析
银杏是珍贵的雌雄异株多用途树种,集药用、食用、材用、观赏、科研于一身,已广泛深入人们的生活.其雌株和雄株具不同的价值及用途,目前无法对苗期银杏进行性别鉴定,极大制约了银杏生产的发展.抑制性杂交技术(SSH)是一种高效...
张晓文邢世岩张倩吴岐奎
关键词:银杏雌花芽雄花芽EST序列
文献传递

相关作者

李超
作品数:37被引量:130H指数:7
供职机构:广西大学
研究主题:罗非鱼 链球菌 海豚链球菌 链球菌病 外周血白细胞
梁万文
作品数:87被引量:402H指数:12
供职机构:广西水产研究所
研究主题:罗非鱼 海豚链球菌 斑点叉尾鮰 链球菌 链球菌病
黄维义
作品数:191被引量:674H指数:13
供职机构:广西大学动物科学技术学院
研究主题:大片吸虫 罗非鱼 水牛 片形吸虫 大片形吸虫
余晓丽
作品数:80被引量:359H指数:12
供职机构:广西水产研究所
研究主题:罗非鱼 斑点叉尾鮰 海豚链球菌 疫苗 链球菌
董霞
作品数:97被引量:242H指数:9
供职机构:云南农业大学食品科学与技术学院
研究主题:蜜源植物 东方蜜蜂 蜜蜂 烟草 中蜂