公共文化服务平台

搜索到806篇“ 序列同源性“的相关文章

基于序列同源性的特定生物序列预测方法及其系统: 本发明提供了一种基于序列同源性的特定生物序列预测方法及其系统，包括，准备特定生物序列相关的原始序列数据集；原始序列数据集包括训练集和测试集，训练集用于训练模型，测试集则用于对训练的模型进行测试；构造基于序列同源性评分的模...; 李萍过骁忆邹权丁漪杰郭菲刘利

基于序列同源性的特定生物序列预测方法及其系统: 本发明提供了一种基于序列同源性的特定生物序列预测方法及其系统，包括，准备特定生物序列相关的原始序列数据集；原始序列数据集包括训练集和测试集，训练集用于训练模型，测试集则用于对训练的模型进行测试；构造基于序列同源性评分的模...; 李萍过骁忆邹权丁漪杰郭菲刘利

两类生物序列同源性分析算法的重用设计与实现: 在生物信息学领域,同源性分析是一种依托于先进计算技术的手段,旨在从庞大的生物序列数据库中发掘具有相同或高度相似序列的生物大分子。该过程深刻遵循“序列决定结构,结构决定功能”的生物学基本原则。通过分析序列之间的同源性可以了...; 龙海; 关键词：同源性分析可重用构件

高明地区手足口病EV71的分子流行病学情况及核酸序列同源性的进化性分析被引量：1: 2023年; 目的:探究高明地区手足口病肠道病毒71型(EV71)的分子流行病学,并对其核酸序列同源性进行进化分析。方法:选择2020年1月-2022年12月高明区人民医院及疾控中心提供来源于1547例手足口病患者的标本共1547份,采用荧光定量RT-PCR对标本进行肠道病毒核酸检测,并对其进行EV71、柯萨奇病毒A组16型(CA16)、非EV71/CA16(N)分类,从时间、地区、年龄、性别、疾病类型5个方面对EV71病毒引起手术口病的分子流行病学进行调查,分离部分EV71毒株进行全基因测序分析,另采用生活信息学软件对病毒基因特征进行分析。结果:5-7月为EV71病毒引起手足口病高发时间;高明地区与佛山市其他地区EV71病毒引起手足口病病例占比无显著差异;≤1岁患者为手足口病高发群体,2021年和2022年EV71病例占比分别为36.36%和36.28%;男性为手足口病高发群体,2021年和2022年EV71病例男女比例分别为2.140∶1和2.092∶1。基于全基因序列构建亲缘进化树,分离的6株EV71毒株与C4亚型毒株具有最近的亲缘性和最高的同源性。结论:2021-2022年EV71病毒是高明地区手足口病流行的主要病原,EV71毒株属C4型且遗传性较为稳定。; 钟剑文陈卓仪陈健珍谭安琦刘翠娴张宇; 关键词：手足口病 EV71 分子流行病学核酸序列同源性

生物序列同源性分析中两类算法的设计与实现: 随着第三代测序技术的飞速发展，生物学界涌现出了海量的数据，如何高效、快速、准确地分析处理这些数据已经成为生物信息学发展的瓶颈。无符号反向基因组重排算法和RNA二级结构预测算法是生物信息学中重要的算法，其在生物相似性、物种...; 靖小骞; 关键词：RNA二级结构预测算法产生式编程

黄麻与其他物种HD-ZIPⅠ和LEA14蛋白序列同源性及其盐胁迫表达分析: 2022年; 利用黄麻与水稻、拟南芥和大豆等的HD-ZIPⅠ和LEA14蛋白的相似性构建系统进化树,并以耐盐性不同的两个黄麻品种福农1号(较耐盐)和中黄麻1号(较敏感)为材料,利用实时荧光定量PCR分析盐胁迫下HDZ4和LEA14基因的表达情况.结果表明:在黄麻中鉴定到10个与其他作物具有同源性的HD-ZIPⅠ编码蛋白,其与大豆、拟南芥(双子叶)的蛋白序列相似度高于与水稻(单子叶)的相似度,与拟南芥的进化分歧时间明显短于与水稻的进化分歧时间,表明HD-ZIPⅠ家族基因在单子叶和双子叶植物中存在功能分化;鉴定到1个与其他作物同源性较高的LEA14编码蛋白,其与棉花的进化关系最近.在盐胁迫处理下,HDZ4在不同黄麻品种及不同时间点的表达量没有明显差异;而LEA14在中黄麻1号中的表达量随时间延长呈先下调再上调最后下调的趋势,在福农1号中的表达量呈先上调后下调的趋势,同时,在福农1号中的表达量整体高于在中黄麻1号中的表达量;LEA14在两个黄麻品种叶片中的表达量均高于在根部的表达量,并且在两个品种叶片和根部的表达量均在盐处理48 h时达到高峰.; 陈毓娜Manuel Sebastian Fiallos李静李云清祁建民徐建堂方平平林荔辉张立武陶爱芬; 关键词：黄麻同源分析

长爪沙鼠CST3序列同源性分析及蛋白体外表达: 2019年; 目的分析长爪沙鼠半胱氨酸蛋白酶抑制剂C (Cystatin C,CST3)cDNA序列同源性,并建立CST3蛋白原核表达体系,为长爪沙鼠CST3抗体制备和后续基因功能研究奠定基础。方法对长爪沙鼠Cst3 cDNA序列进行克隆、同源性分析及密码子优化;将优化后序列酶切连接到pET28a载体,完成重组CST3蛋白表达载体构建;将该载体转化到感受态细胞中,通过异丙基硫代半乳糖苷(Isopropylβ-D-Thiogalactoside,IPTG)诱导实现CST3蛋白的原核表达,并用SDS聚丙烯酰胺凝胶电泳(SDS-PAGE)和蛋白质印迹法(Western blotting)验证。结果长爪沙鼠Cst3基因与人和小鼠Cst3基因的序列同源性较低。密码子优化后的长爪沙鼠Cst3表达序列插入到pET28a质粒中,获得了CST3蛋白表达载体。经1 mmol/L IPTG 37℃诱导12 h,可获得大量CST3蛋白。结论成功地构建了长爪沙鼠CST3蛋白的体外表达体系。; 王妍郭萌杜小燕李长龙路静霍学云吕建祎刘欣陈振文; 关键词：长爪沙鼠原核表达

长爪沙鼠CST3序列同源性分析及蛋白体外表达: 目的分析长爪沙鼠半胱氨酸蛋白酶抑制剂C(Cystatin C,CST3)cDNA序列同源性,并建立CST3蛋白原核表达体系,为长爪沙鼠CST3抗体制备和后续基因功能研究奠定基础。方法对长爪沙鼠Cst3 cDNA序列进...; 王妍郭萌杜小燕李长龙路静霍学云吕建祎刘欣陈振文; 关键词：长爪沙鼠原核表达

鲁西南地区间日疟原虫PvMSP-1基因分型和序列同源性研究: 背景：　　自从人类发现疟疾以来，全球各国一直致力于消除疟疾的研究和防治中。现在中国绝大部分地区已经消除了疟疾的本地感染。但是，随着全球气温变暖和对外合作交流，人员流动性加大，导致我国输入性疟疾病例有所上升。其中主要为恶性...; 宋观波; 关键词：间日疟原虫基因分型同源性

鲁西南地区间日疟原虫Pvmsp-1基因分型及序列同源性研究: 2018年; 目的了解不同时期鲁西南地区间日疟原虫Pvmsp-1基因分型及序列同源性特征。方法收集不同时期采制的鲁西南地区间日疟患者厚、薄血膜标本,用巢式PCR方法扩增间日疟Pvmsp-1基因icb5~icb6片段,对产物进行PvuⅡ酶切鉴定和序列比对分析及系统进化分析。结果 25份间日疟样品巢式PCR产物大小均为470bp,经PvuⅡ酶切均获得350bp和120bp两条片段,为Sal-1型。进化树分析25个样品株处于同一个大分支,且与Sal-1型标准株株同属一个总分枝,而与Belem型标准株遗传距离较远。结论鲁西南地区不同时期流行株间日疟原虫Pvmsp-1基因均为Sal-1型,株间序列同源性较高。; 宋观波徐超王利磊魏庆宽李瑾尹昆肖婷孙慧黄炳成; 关键词：基因分型同源性

加载更多 ∨

相关作者

用户反馈

相关作者

用户登录

用户反馈