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搜索到1171篇“ 序列多态性“的相关文章

16S-23S rDNA间区序列多态性数据库的构建及其在菌群组成快速鉴定中的应用: 细菌广泛存在于自然环境如土壤、水体、空气以及各种大型生物体的皮肤、呼吸道、消化道和肠道中。细菌以菌群的形式与宿主在营养、免疫、生理等方面相互作用,构成了动态平衡的复杂生态系统。了解细菌菌群的物种组成和相对丰度对研究菌群功...; 王丽娟; 关键词：BP神经网络细菌鉴定

清远麻鸡禽白血病病毒感染特点及其受体基因序列多态性分析: 2024年; 为了解目前不同清远麻鸡规模化种鸡场外源性禽白血病病毒(avian leukosis virus,ALV)感染特点及其受体基因Tva、Tvb及NHE1序列多态性,本研究对5个清远麻鸡种鸡场进行外源性ALV病毒分离鉴定和受体基因扩增及测序分析。病毒分离及亚群鉴定结果显示:A、B、C 3个场的外源性ALV病毒分离阳性率均低于5%,其中A场存在ALV-J单独感染,B场存在ALV-J和ALV-K混合感染,C场存在ALV-K单独感染,而D场和E场未检测出外源性ALV感染。受体基因多态性分析显示:A~E场均存在不同频率的Tvar 3、Tvar 4和Tvbr 3抗性等位基因,Tvar 3的分布频率为0.2~0.6,Tvar 4的分布频率为0.3~0.7,Tvbr 3的分布频率为0.1~0.7。此外,B场和D场还存在Tvar 5抗性等位基因,分布频率均为0.2。NHE1受体基因序列发生18个SNP突变,其中1279、1361、1369、1406、1442、1912位为非同义突变,可引起氨基酸发生改变。结果表明,5个清远麻鸡规模化种鸡场外源性ALV感染率和亚群有差异,各场应该有更针对性的独特净化策略;不同频率的Tva和Tvb抗性等位基因分布以及NHE1基因发生的6个非同义突变使清远麻鸡具有一定的遗传抗性选育的潜力。; 郑小雪舒雪利王红梅高明超余铭成李奕滨廖明曹伟胜; 关键词：清远麻鸡禽白血病病毒 TVA TVB NHE1

非小细胞肺癌微卫星(GT/CA)_(n)重复序列多态性的研究进展: 2024年; 非小细胞肺癌(NSCLC)是肺癌最主要的组织学类型,患者数量庞大且晚期患者疗效差,现有治疗手段虽取得巨大进展但仍面临挑战。肿瘤的发生伴随大量基因组序列的不稳定,(GT/CA)_(n)重复序列是一种常见的微卫星序列,参与了基因转录和DNA甲基化等调控过程。现有研究表明,NSCLC中(GT/CA)_(n)重复序列的多态性与EGFR、HO-1和HIF-1α基因的表达密切相关,可作为探索NSCLC发生发展的分子机制、开发诊疗预后分子标志物及相关表观遗传学研究的切入点。本文总结了NSCLC中微卫星(GT/CA)_(n)重复多态性的相关研究,希望能为NSCLC的相关研究提供参考。; 杨汶峻傅雨婷袁叶琴刘达蒋斌元; 关键词：非小细胞肺癌微卫星 EGFR

中国汉族人群122个STR基因座序列多态性研究: 【目的】短串联重复序列分型已广泛应用于法医案件工作中,且基于毛细管电泳平台进行STR基因座长度多态性分型已是当前个体识别的金标准。本研究采用二代测序技术对北京、常熟、大连三个人群样本DNA基于序列多态性对122个STR基...; 潘坤鹏; 关键词：短串联重复序列序列多态性长度多态性

不同鸭品种脂肪型脂肪酸结合蛋白基因部分序列多态性差异研究: 2023年; 为了解地方鸭品种脂肪型脂肪酸结合蛋白(A-FABP)基因点突变信息、群体遗传结构和遗传参数差异,设计了1对引物扩增A-FABP基因外显子3和内含子2部分序列,采用PCR-SSCP方法检测9个地方鸭品种单核苷酸突变,并分析基因型、等位基因频率和群体遗传参数的差异。结果显示:在9个鸭品种之间发生了6个点突变,4个点突变在内含子2中,2个点突变在外显子3中,为同义突变。9个鸭品种均以D等位基因频率最高,E为靖西大麻鸭的第二等位基因,而其他8个鸭品种的第二等位基因为C。χ2检验显示靖西大麻鸭的基因型分布与巢湖鸭、临武鸭存在显著性差异(P<0.05),与其他品种存在极显著差异(P<0.01)。巢湖鸭的多态信息含量高于0.5,其他8个鸭品种的多态信息含量在0.25~0.5之间。攸县麻鸭偏离了哈代温伯格平衡状态。A-FABP基因在不同鸭品种中具有较丰富的多态性,为鸭品种资源保护和新品种培育提供参考。; 董飚王健孙国波孙国波张干生; 关键词：地方鸭品种单核苷酸多态性

MNS血型相关基因GYPA、GYPB、GYPE mRNA全长序列多态性分析: 2023年; 目的:分析MNS血型相关基因GYPA、GYPB、GYPE mRNA全长序列的特征,了解MNS血型基因的多态性。方法:随机选取无偿献血者500人份离体24 h内的抗凝血各8 ml,以血型血清学方法鉴定MN、Ss、Mia血型。从500例样本中随机选取MNS与Mia血型不同组合的5例样本,使用密度梯度离心法分离外周血中的单个核细胞(PBMC)并提取总mRNA,使用逆转录试剂盒制备cDNA,采用巢式PCR(nested PCR)方法扩增目标片段,切胶回收后分别对GYPA、GYPB、GYPE mRNA全长序列进行测序,通过Oligo 6.0软件分析碱基序列。结果:血清学检测得到MN、Ss和Mia表现型,不同个体间的红细胞与抗-Mia血清反应存在凝集强度差异。检测了5例不同表现型组合样本的GYPA、GYPB、GYPE基因mRNA全长序列,1例样本的GYPA mRNA中exon-6完整缺失,其他4例样本的GYPA mRNA全长完整;2例样本的GYPB mRNA中exon-2完整缺失,Mia血型阴性;2例样本的GYPB mRNA全长完整,Mia血型阳性;1例样本的GYPB mRNA中exon-5存在碱基替换;5例样本的GYPE mRNA全长完整。结论:MNS血型相关基因具有明显的多态性,mRNA全长序列的检测为GYPA、GYPB、GYPE基因结构的分析与MNS血型抗原表达的深入研究奠定了基础。; 梁延连吴凡梁爽徐筠娉苏宇清

转录因子GeBPTF17的序列多态性与玉米粒重的关联及其表达模式分析: 玉米(Zea mays L.)是我国重要的粮食、饲料、能源以及经济作物,其产量的高低对于保障国家安全、稳定社会经济方面具有重要意义。粒重是玉米产量的重要构成要素,属于典型的数量性状,受较多因素影响,也受大量基因调控。实验...; 马倩楠; 关键词：玉米粒重

荔波樟江野生斑鳜线粒体Cyt b基因序列多态性分析被引量：1: 2023年; 为探明贵州省荔波樟江野生斑鳜(简称荔波野生斑鳜)的遗传多样性水平和种质资源现状,科学保护和开发野生斑鳜种质资源,以线粒体DNA细胞色素b(Cyt b)基因作为分子标记,对野生斑鳜群体遗传多样性进行分析。研究结果显示,共获得75条长度为1141 bp的Cyt b基因同源序列,其碱基A、T、G和C的平均含量分别为24.4%、27.2%、15.5%和32.9%,A+T的含量(51.6%)略高于G+C(48.4%)的含量。共检测到17个变异位点,其中8个为简约信息位点,9个为单一信息位点。共定义15个单倍型,单倍型之间的平均遗传距离为0.003,邻接法构建的分子系统发育树显示,所有的单倍型均聚成一支;单倍型多样性指数和核苷酸多样性指数分别为0.613±0.064和0.00172±0.00021,平均核苷酸差异数为1.968。中性检验Tajima′s D值为-1.37917,差异不显著(P>0.10)。荔波漳江流域的野生斑鳜群体呈现高单倍型多样性和低核苷酸多样性,遗传多样性低,无种群扩张史,且与长江中上流的支流陆水河和洞庭湖水系的斑鳜群体有较高的亲缘性。研究结果可为当地斑鳜种质资源的保护和开发利用提供依据。; 麻智芳余科安苗黄胜潘秋芝李珊何孝宽; 关键词：斑鳜

血小板CD36抗原Ⅱ型缺失与内含子序列多态性的相关性: 2022年; 目的研究分析血小板CD36抗原Ⅱ型缺失与内含子序列多态性的相关性。方法随机抽取辽宁省血液中心健康血小板捐献者516名,其中241例分别进行CD36抗原检测和CD36基因序列分析;剩余275例只进行CD36基因序列分析。CD36抗原检测采用流式细胞术法,基因序列分析采用PCR-SBT法。结果在241例标本中检测到Ⅰ型缺失1例和Ⅱ型缺失4例,频率分别为0.41%和1.66%。3例Ⅱ型缺失者编码区无突变。所有Ⅱ型缺失个体在内含子3区域具有共同的多态性特征,即同时携带(TG)11和12个串联突变,且两者位于同一等位基因。(TG)11在516例随机人群中的基因频率仅为11.72%,远低于(TG)13的30.43%。12个串联突变在516例随机人群中的基因频率为8.81%。96.7%的12个串联突变都与(TG)11同时出现,但只有72.7%的(TG)11携带12个串联突变。流式细胞术检测发现,只携带(TG)11的标本,其血小板CD36抗原表达水平与正常标本相当,而93.1%的同时携带(TG)11和12个串联突变的标本血小板CD36抗原水平明显降低。结论内含子3区域内的(TG)11不是血小板特异性沉默因子,但它们之间存在某种间接的相关性。(TG)11与12个串联突变具有较强连锁关系。血小板特异性沉默因子可能有多个。; 林凤秋李晓丰李剑平; 关键词：CD36抗原

STING基因启动子序列多态性与COPD合并肺炎易感性及严重程度的关系被引量：1: 2022年; 目的研究STING基因启动子序列多态性与慢性阻塞性肺疾病(COPD)合并肺炎易感性及严重程度的关系。方法选取2020年10月-2021年3月于医院诊治的96例COPD患者,随访3个月,根据有无肺炎分为感染组与未感染组,提取两组患者DNA,经聚合酶链式扩增反应(PCR)及测序技术检测STING基因启动子多态性,分析各位点多态性与COPD肺炎易感性和疾病严重程度的关系,采用Logistic分析COPD合并肺炎患者预后的影响因素。结果感染组的PCT水平高于非感染组,两组患者的吸烟史、机械通气情况比较,差异有统计学意义(P<0.05);两组患者STING基因的rs7380272、rs7380824位点等位基因和基因型分布比较,差异无统计学意义;STING基因rs7380272、rs7380824位点基因多态性与COPD肺炎易感性无相关性;rs7380824位点TT基因型与COPD肺炎感染严重程度有相关性(P<0.05);不同机械通气、病情程度、抗菌药使用>2种、rs7380824 TT基因型的患者预后情况比较,差异有统计学意义(P<0.05);病情程度(Ⅲ、Ⅳ级)(OR=1.533)、rs7380824基因型TT(OR=1.608)是影响COPD合并肺炎感染患者预后的独立危险因素(P<0.05)。结论STING基因2个位点rs7380272、rs7380824多态性与COPD合并肺炎易感性无明显相关,但rs7380824TT基因型与患者疾病严重程度相关,可能提示COPD合并肺炎患者的预后恶化。; 胡帆庞思思张丽汪海涛孙雅玲; 关键词：多态性肺炎易感性

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