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一种蒙古野驴微卫星分子标记组合及其引物和应用
本发明公开了一种蒙古野驴微卫星分子标记组合及其引物和应用,涉及DNA分子标记技术领域。该蒙古野驴微卫星分子标记组合,包括核苷酸序列分别如SEQ ID NO.17‑24所示的Eqr3400、Eqr5948、Eqr732、E...
汪沐阳丁佳佳梅宇徐文轩杨维康师玮
凡纳滨对虾高多态性微卫星分子标记及其应用
本发明提供了凡纳滨对虾高多态性微卫星分子标记及其应用,属于分子标记技术领域。本发明基于凡纳滨对虾基因组中筛选得到的10条微卫星序列,分别编号为Lv‑449、Lv‑460、Lv‑499、Lv‑511、Lv‑442、Lv‑4...
卢霞张泽斌孙利东胡光强唐永政娄方瑞
一种用于黑颈鹤的多态性微卫星分子标记,引物及应用
本发明涉及一种用于黑颈鹤的多态性微卫星分子标记,引物及应用,该用于黑颈鹤的微卫星分子标记,包括微卫星位点Grni‑3、Grni‑12、Grni‑23、Grni‑14、Grni‑20、Grni‑29、Grni‑6、Grni...
朱英刘洋
一种黄颡鱼生长性状相关的微卫星分子标记及其应用
本发明公开了一种黄颡鱼生长性状相关的微卫星分子标记及其应用,属于分子标记遗传育种技术领域。所述微卫星片段的重复序列为(TTCTC)<Sub>n</Sub>,n的取值范围为6~13之间的任意整数;所述生长性状包括全长、体长...
刘乙覃川杰龚全颉江周闯李庆阳周俊宏谢守军胥天琪聂启
七妹羊肚菌的SSR微卫星分子标记及其引物组和应用
本发明涉及分子生物学技术领域,特别是涉及七妹羊肚菌的SSR微卫星分子标记及其引物组和应用。本发明所述SSR微卫星分子标记包括SEQ ID NO.1~40所示的核苷酸序列。本发明基于高质量七妹羊肚菌基因组数据,并重新完成了...
刘伟时晓菲杨振艳于富强
一种须鳗虾虎鱼多态性微卫星分子标记及其引物对和应用
本发明属于入侵物种种群遗传学DNA分子标记技术领域,本发明提供了一种须鳗虾虎鱼多态性微卫星分子标记及其引物对和应用。本发明通过构建须鳗虾虎鱼简化基因组文库,进行高通量测序,对基因组中的微卫星位点进行筛选,对其中的14个位...
秦蛟程飞谢松光张磊
棉鼠微卫星分子标记及其引物对与应用、棉鼠遗传检测的方法
本申请涉及遗传检测的技术领域,具体公开了棉鼠微卫星分子标记及其引物对与应用、棉鼠遗传检测的方法。本申请提供了棉鼠微卫星分子标记,所述棉鼠微卫星分子标记为27个STR位点,所述27个STR位点的核苷酸序列分别对应为SEQ ...
王妍张晓晴张桐陈红谢飞张静薛林朱明强战大伟
基于简化基因组测序宽鳍鱲的微卫星分子标记及遗传多样性分析
2024年
【目的】建立基于简化基因组测序(2b-RAD)宽鳍鱲(Zacco platypus)的微卫星分子标记,并进行遗传多样性分析,为有效开展宽鳍鱲品种间遗传多样性分析和分子育种,挖掘和利用宽鳍鱲种质资源提供参考。【方法】利用限制性内切酶EcoRⅠ打断基因组DNA,每个样本分别进行物理打碎,选取300~700 bp插入片段文库,利用Illumina HiSeq PE150测序平台进行双末端(Paired-End)测序获得海量遗传多态性标签序列。【结果】2b-RAD筛选宽鳍鱲的微卫星位点得到两端各留100 bp作为引物的SSR数量为41018个,带有引物片段的SSR数量为1522个,片段引物的设计率为37.1%,构建的文库质量较高,测序深度达高准确度下的分型标准。在筛选的64个微卫星位点中,有14个位点(21.88%)具有多态性,由于存在无效等位基因,有3个位点(Zpla08、Zpla09和Zpla10)显著偏离Hardy-Weinberg平衡(P<0.05),因此选用其中的11个微卫星位点分析宽鳍鱲群体遗传多样性。基于11个微卫星DNA位点的分析表明,宽鳍鱲7个群体的平均等位基因数(N_(A))为3.66,平均Shannon;s信息指数(I)为0.689,平均观测杂合度(H_(O))为0.315,平均期望杂合度(H_(E))为0.354,平均多态信息含量(PIC)为0.409。【结论】基于简化基因组测序(2b-RAD)开发宽鳍鱲的微卫星分子标记可用于评估野生宽鳍鱲种群的遗传多样性、遗传结构和物种鉴定。宽鳍鱲基因组DNA 14个微卫星位点中有11个微卫星位点具有中高多态性,3个位点(Zpla08、Zpla09、Zpla10)偏离Hardy-Weinberg平衡,在群体遗传研究中应慎用。
覃宁张桂蓉马徐发魏开建
关键词:宽鳍鱲微卫星分子标记微卫星位点等位基因
十二种弱寄生蜜环菌通用多态性微卫星分子标记及其引物与应用
本发明涉及十二种弱寄生蜜环菌通用多态性微卫星分子标记及其引物与应用,属于分子生物学技术领域,本发明公开了十二种弱寄生蜜环菌通用多态性微卫星分子标记,其核苷酸序列如SEQ ID NO.1~13所示;本发明还公开了十二种弱寄...
刘建伟于富强杨祝良杨石美王忠巧丁培超胡德分
扇穗茅微卫星分子标记、特异性引物及制备方法和应用
本申请适用于生物学技术领域,提供了扇穗茅微卫星分子标记、特异性引物及制备方法和应用,所述扇穗茅微卫星分子标记的核苷酸序列如SEQ.ID.No.1‑SEQ.ID.No.15所示。本申请通过利用三代测序技术获得的转录组扫描技...
富贵刘玉萍苏旭周永辉胡淑蓉刘涛才让扎西曲荣举

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作品数:319被引量:2,827H指数:25
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