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一种与杨树花青素含量相关数量性状位点分子标记方法
本发明公开了一种与杨树花青素含量相关数量性状位点分子标记方法,涉及杨树分子遗传育种技术领域;本发明在杨树第17号染色体发现与杨树花青素含量相关的主效QTL,并确定6个与杨树花青素含量相关的SNP。本发明的与杨树花青素含量...
张磊胡建军周星鲁王丽娟
甲基化数量性状位点研究及其在精神分裂症中的作用
2024年
人类基因组DNA序列上存在着被称为“甲基化数量性状位点”的位点驱动着DNA甲基化的水平,其在基因组上的分布情况、功能等问题仍在很大程度上是未知的.越来越多的证据表明,甲基化数量性状位点的研究或许能为精神分裂症的发病机制提供新的见解.本研究收集了来自499名中国汉族人群首发精神分裂症患者,以及年龄性别相匹配的500名中国汉族健康对照组的甲基化数量性状位点数据,从不同的角度证明了甲基化数量性状位点与基因表达调控之间存在着紧密的关系,并展示了甲基化数量性状位点在探究精神分裂症遗传因素中的巨大潜力.最后,结合大规模精神分裂症全基因组关联研究数据提出了精神分裂症风险位点可能通过调控AS3MT基因上的甲基化水平,从而影响精神分裂症患病风险的潜在机制.
蔡响姚音
关键词:精神分裂症单核苷酸多态性全基因组关联研究
甜玉米中F_(2:3)群体可溶性糖和子粒嫩度性状数量性状位点(QTL)定位
2024年
利用甜玉米自交系SHL03和SHL01为亲本构建的F_(2:3)群体,用离子色谱法(IC)测定葡萄糖(GLU)、果糖(FRU)、麦芽糖(MAL)和蔗糖(SUC)的含量,用SMS测定果肉硬度(FH)、种皮硬度(PH)、种皮脆性(PB)和果肉紧实度(FM)。结果表明,总共定位到与可溶性糖相关的QTL 34个,子粒柔嫩度相关的QTL 28个,位于1、2、3、4、5、6、7、8、10号染色体上,分别解释表型变异的1%~15.8%。主效QTL qFH3-1、qFH3-2、qFH5-2、qFH5-3、qGLU2-1、qGLU2-2的表型贡献率分别为12.2%、11.4%、12.1%、10.5%、15.8%和12.8%。在主效QTL的置信区间共找到44个注释基因,这些候选基因和相关的QTL为利用分子标记辅助选择具有更好可溶性糖含量的玉米材料和相关功能基因的克隆提供资源。
党冬冬秦涛于典司顾炜阮燕晔郑洪建王慧关媛
关键词:甜玉米可溶性糖QTL分析候选基因
水稻剑叶表达数量性状位点鉴定及候选基因功能研究
水稻(OryzasativaL.)是亚洲的主要粮食作物,也是遗传改良的主要模式作物。目前已经积累了大量的水稻高密度基因型数据和相关的高通量表型数据,并通过全基因组关联分析(GWAS)的方法鉴定到许多控制重要性状的候选基因...
刘畅
关键词:水稻数量性状位点候选基因
利用白色杜洛克×二花脸F2猪资源群体鉴定印记效应表达数量性状位点(ieQTL)
农业动物经济性状不仅受到加性遗传效应的影响,还可能受到其他非加性效应,包括印记效应的影响。比如,猪和羊的肌肉和生长性状,受到IGF2和MSTN等基因大效应印记效应位点的影响,这些位点的发现为相关性状的遗传改良提供了重要分...
陈枫
甜玉米籽粒柔嫩度相关数量性状位点定位
2023年
为挖掘甜玉米籽粒柔嫩度相关数量性状位点(QTL)。本研究以甜玉米自交系SHL01(白色籽粒)为母本和SHL03(黄色籽粒)为父本配置杂交组合,连续自交构建重组自交系群体(RIL群体),利用单核苷酸多态性(SNP)分子标记,应用复合区间作图法(CIM)对甜玉米乳熟期籽粒的果皮硬度、果皮脆性、果肉硬度、坚实度性状进行QTL定位。结果共检测出7个QTL,4个果皮硬度QTL,分别位于第1、3、4、6号染色体,解释表型变异的6.15%~13.49%;1个果皮脆性QTL,位于第5号染色体,解释表型变异的11.31%;2个果肉硬度QTL,分别位于第1号、第5号染色体,解释表型变异的8.84%和8.55%。
任哲哲关媛于典司顾炜党冬冬王慧白光红郑洪建
关键词:甜玉米RIL群体QTL
玉米数量性状位点数据库构建及雄穗性状遗传结构解析
玉米(Zea mays L.)是我国重要的粮食作物,解析重要农艺性状遗传基础、协调改良高产、优质、抗病、抗逆等性状是培育突破性玉米品种的重要途径。玉米雄穗性状是玉米株型结构的重要组成部分,优化雄穗性状不仅增加玉米冠层光合...
王彦博
关键词:雄穗性状GWAS
棉花籽指数量性状位点(QTL)的初步定位被引量:2
2022年
为挖掘棉花籽指相关的分子标记,以棉花籽指差异较大的陶小铃和大桃棉为亲本,构建F2群体,对F_(2)群体的籽指进行调查,选取具有极端籽指的植株构建混合群体分离分析(bulked segregant analysis,BSA)混池进行测序。对测序结果进行分析,发现3个与棉花籽指相关的区域,分别位于A07染色体42.6~91.6 Mbp,A13染色体2.2~5.3 Mbp,D10染色体7.1~8.3 Mbp。3个区域的Δ(SNP-index)峰值区段共包含142个候选基因。这些结果为棉花籽指相关基因的精细定位和克隆奠定了基础。
李蓓姚金波李燕朱守鸿房圣涛陈伟张永山
关键词:棉花
一种与杨树花青素含量相关数量性状位点分子标记方法
本发明公开了一种与杨树花青素含量相关数量性状位点分子标记方法,涉及杨树分子遗传育种技术领域;本发明在杨树第17号染色体发现与杨树花青素含量相关的主效QTL,并确定6个与杨树花青素含量相关的SNP。本发明的与杨树花青素含量...
张磊胡建军周星鲁王丽娟
整合全基因组关联研究和大脑表达数量性状位点探究精神分裂症重要风险基因
2022年
目的探究精神分裂症表达异常的致病风险基因。方法选取56418例精神分裂症患者与78818名健康对照者的全基因组关联研究(genome-wide association study,GWAS)数据和大脑表达数量性状位点(expression quantitative trait loci,eQTLs),采用基于汇总数据的孟德尔随机化(summary data-based mendelian randomization analysis,SMR)整合分析精神分裂症的重要风险致病基因,并采用精神分裂症患者尸脑背外侧前额叶皮质第3层和第5层锥体神经元、人诱导多能干细胞(human induced pluripotent stem cell,hiPSC)和全血表达数据集进行差异表达分析,以验证风险基因表达失调情况。结果基于SMR共发现16个精神分裂症风险基因(P_(SMR)<5×10^(-6)),分别为C4A、HLA-C、EMB、SLC9B1、PCDHA7、BTN3A2、KRT8P46、PCDHA8、SFMBT1、PCCB、WBP1L、BTN3A3、MUSTN1、PPM1M、TYW5和SF3B1。差异表达分析结果进一步验证显示,SF3B1在大脑背外侧前额叶皮质第3层和第5层锥体神经元(P_(adjust)=5.22×10^(-3))和hiPSC(P_(adjust)=1.41×10^(-4))中表达水平均显著下调。WBP1L在hiPSC(P_(adjust)=1.28×10^(-8))和全血(P_(adjust)=1.17×10^(-4))中表达水平均显著上调。TYW5(P_(adjust)=3.06×10^(-6))在hiPSC中表达水平显著上调,PCCB(P_(adjust)=1.34×10^(-4))、BTN3A2(P_(adjust)=1.48×10^(-3))、PPM1M(P_(adjust)=5.13×10^(-6))和PCDHA8(P_(adjust)=4.31×10^(-2))在hiPSC中表达水平显著下调。BTN3A3(P_(adjust)=2.18×10^(-2))在全血中表达水平显著下调。结论精神分裂症风险基因SF3B1、TYW5、PCCB、BTN3A2、PPM1M、PCDHA8、WBP1L和BTN3A3异常表达可增加发病风险。
贾婷婷张程程
关键词:数量性状基因座位全基因组关联研究易感基因

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万建民
作品数:554被引量:4,184H指数:36
供职机构:南京农业大学
研究主题:水稻 编码基因 植物遗传改良 植物 基因
徐建龙
作品数:252被引量:1,276H指数:23
供职机构:中国农业科学院作物科学研究所
研究主题:水稻 分子标记 QTL 聚合育种 白叶枯病
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作品数:485被引量:2,313H指数:26
供职机构:西南大学
研究主题:甘蓝型油菜 油菜 甘蓝型黄籽油菜 甘蓝型 基因家族
李新海
作品数:276被引量:3,269H指数:34
供职机构:中国农业科学院作物科学研究所
研究主题:玉米 玉米自交系 分子标记 SSR标记 自交系
何予卿
作品数:104被引量:1,211H指数:19
供职机构:华中农业大学
研究主题:水稻 水稻育种 数量性状位点 基因 稻米