搜索到721篇“ 核糖体基因“的相关文章
- 基于生物信息学探究核糖体基因在肝癌发生发展过程中的作用
- 背景:肝癌(liver cancer)是一种高发病率和高死亡率的恶性肿瘤。根据全球统计,在2020年全球新确诊肝癌905677例,其中830180人死于肝癌相关疾病[1]。肝癌主要包括肝细胞癌(Hepatocellula...
- 唐琴
- 关键词:核糖体蛋白肝细胞癌
- 线粒体核糖体基因MRPL35在食管癌中的功能与相关分子机制研究
- 研究背景: 食管癌是世界范围内常见的癌症类型,其发病率在所有恶性肿瘤中排名第七,总体死亡率排名第六。世界范围内,中国食管癌发病率居高。食管癌预后不良,尽管在诊断和治疗方面取得了进展,但全球和中国的食管癌患者总体五年生存...
- 包顺超
- 关键词:食管癌细胞凋亡信号通路
- 浣熊贝氏蛔虫核糖体基因和线粒体基因分析
- 2022年
- 目的 探讨浣熊贝氏蛔虫(Baylisascaris procyonis)核糖体基因和线粒体基因的特征及其与其他贝氏蛔虫的系统进化关系。方法 从昆明动物园1头病死的浣熊肠道收集浣熊贝氏蛔虫成虫,形态学初步鉴定后挑取20条(雌虫、雄虫各10条)进行形态特征测量和相关分子生物学研究。用DNA提取试剂盒提取浣熊贝氏蛔虫DNA, PCR扩增核糖体内转录间隔区(ITS)、细胞色素c氧化酶亚基1 (cox1)、 cox2、 cox3、细胞色素氧化酶b (cytb)、烟酰胺腺嘌呤二核苷酸脱氢酶亚基1 (nad1)、 t RNA-nad2-t RNA和nad5,测序后与GenBank中的序列进行BLAST比对,使用MEGA X软件进行单核苷酸多态性(SNP)位点分析,采用最大似然法分别构建基于ITS、 cox1和cox2序列的系统进化树。结果 浣熊贝氏蛔虫成虫呈乳白色,雌、雄虫大小分别为(9.15~14.50) cm×(0.20~0.32) cm和(6.45~8.70) cm×(0.15~0.20) cm,雄虫尾端有交合刺。浣熊贝氏蛔虫的8个遗传标志均被成功测序并提交至GenBank,分别为ITS (MZ092850~MZ092855)、 cox1 (MZ164969)、 cox2 (MZ172987)、 cox3(MZ172988)、 cytb (MZ172982~MZ172986)、 nad1 (MZ172989)、 nad5 (MZ172981)和t RNA-nad2-t RNA (MZ172980)序列与GenBank中已有的浣熊贝氏蛔虫序列的相似性分别为98.6%~100%、 98.5%~99.5%、 99.4%~99.7%、98.3%、 98.8%~99.0%、 98.2%、 97.8%和99.2%;与GenBank中已有的柱状贝氏蛔虫ITS、 cox1、 cox2和t RNAnad2-t RNA序列的相似度分别为98.6%~100%、 99.2%~100%、 99.4%~100%和99.6%~99.9%。SNP位点分析结果发现,ITS、 cox1、 cox2和t RNA-nad2-t RNA与GenBank中已有的浣熊贝氏蛔虫和柱状贝氏蛔虫相应序列分别有8、 28、 7和12个SNP位点,但这些位点并不能对这2个物种进行有效区分;新测序的ITS序列中包含有7~9个GA串联重复序列,其中7和8个GA串联重复为本研究发现。在基于ITS、 cox1和cox2序列构建的系统进化树上,浣熊贝氏蛔虫和柱状贝氏蛔虫均形成一个独立的分支,该分支中不同地�
- 韦开文曾红霞何牧胡俊杰
- 关键词:浣熊系统发育
- 组蛋白去甲基化酶Rph1在核糖体基因合成中的作用及调控机制
- RNA聚合酶(RNAP)协同调控核糖体RNA(rRNA)合成和核糖体蛋白(RP)基因的转录是控制细胞正常生长的关键条件。已有证据表明,RNAPⅠ(RNA polymerase Ⅰ)介导的35S rRNA的合成与RNAPⅡ...
- 舒文杰
- 关键词:转录细胞生长营养胁迫
- 核糖体基因GmRPL12对大豆低硫耐性的调控作用研究被引量:2
- 2020年
- 为研究大豆中核糖体基因对大豆耐低硫胁迫功能的调控作用,从科丰1号根中克隆1个大豆核糖体蛋白编码基因GmRPL12。分析基因结构和低硫胁迫下不同组织中的表达情况,将基因过表达载体和干扰载体转化科丰1号毛状根,获得转基因嵌合体,并进行基因表达分析和植株表型分析。序列分析结果表明:基因编码区全长576 bp,预测蛋白C端包含1个核糖体蛋白L7/L12保守结构域RPL12。该基因在根中表达量较高,表达水平受低硫诱导,不同品种中该基因对低硫响应的模式不同。通过毛状根遗传转化获得GmRPL12基因过表达、RNA干扰以及空载体对照的大豆嵌合体。低硫处理与正常硫水平处理相比,GmRPL12基因过表达的大豆嵌合体植株倒一叶和倒二叶SPAD、株高、地上部鲜重和干重、地下部鲜重和干重显著增加,RNA干扰下调大豆嵌合体植株的以上指标。GmRPL12基因的过量表达能显著增加低硫处理时地上部、地下部的无机硫含量,以及正常硫水平处理时地上部的无机硫含量。研究结果暗示GmRPL12基因可能参与大豆对低硫耐性和大豆硫代谢的调控。
- 陈燕宁吴志医元文杰阚贵珍黄方喻德跃王慧
- 关键词:大豆核糖体硫
- 基于线粒体编码核糖体基因的海蛇DNA条形码筛选被引量:4
- 2020年
- 海蛇是名贵中药材,也是滋补佳品,分子鉴定方法可适用于海蛇组织。为筛选适合海蛇DNA条形码的基因,本研究搜索并下载了GenBank上所有12S和16S基因序列。其中每个物种每个基因,尽量保留所有序列,但最多保留不同来源的5条序列。运用Mega软件比对后,建立MrBayes系统聚类树。结果显示,相对12S基因,16S基因序列包含物种多;其MrBayes树拓扑结构清晰,支持率高,适合作为DNA条形码。因此得出结论,不是每类物种的DNA条形码都必须是COI基因,对于海蛇的线粒体编码核糖体基因,16S适合度更高。筛选DNA条形码基因,可通过蛇肉、蛇皮、蛇胆、蛇血等组织,测得DNA序列片段,从而鉴定物种;可用于海关、餐饮、中药、环保等部门,从而保护野生动物,打击走私犯罪。
- 王湘君陈文苏海英杜宇林炽贤
- 关键词:海蛇DNA条形码系统树
- 海参核糖体基因间隔区2(ITS2)的克隆及序列分析
- 2020年
- 为探讨刺参科海参和海参科海参的系统进化关系,本研究通过PCR技术获取19种刺参科和海参科海参的ITS2序列,从NCBI上获取瓜参(C. salma)的ITS2序列。结果表明ITS2序列具有长度多态性,从318 bp (绿刺参)到591 bp (白尼参属)。海参属的ITS2序列长度多态性高,ITS2的GC含量从56.7%(糙海参)到70.6%(瓜参)。海参ITS2序列保守性不高,仅有48个保守位点,其余均为变异位点。基于ITS2的系统进化树结果显示进化树主要分成两支,一支包括海参科的4个属:海参属、白尼参属、辐肛参属和格皮氏海参属。辐肛参属和格皮氏海参属为姐妹关系,二者聚在一起后与白尼参属聚为一支,随后再与海参属聚在一起。白尼参属和辐肛参属为单系,海参属为复系。另一支为C. salma和刺参科。梅花参属与刺参属聚为一支后,再与仿刺参属聚在一起,3个属都是单系。在20种海参中,S. naso与B. argus的遗传距离最大(6.415)。刺参属中,S. monotuberculatus和S. horrens遗传距离最近(0.012),海参属中,糙海参与H. fuscopunctata的遗传距离最大(3.24)。本研究为从分子水平上研究海参科和刺参科之间的系统进化关系奠定了基础。
- 曾玲文菁孙玉林
- 关键词:海参ITS2系统发育
- 艰难梭菌数字化PCR-核糖体基因分型方法的建立与应用
- 2019年
- 目的建立艰难梭菌数字化PCR-核糖体基因分型方法并用于临床菌株的基因分型。方法利用荧光毛细管电泳技术代替琼脂糖凝胶电泳检测艰难梭菌PCR-核糖体分型产物,建立数字化PCR-核糖体分型方法;利用40株分属于10种核糖体型(RT)的艰难梭菌参考菌株构建常见基因型的数字化参考图谱,利用71株艰难梭菌临床菌株初步验证该方法的临床实用性。结果荧光毛细管电泳技术准确地检测出40株艰难梭菌参考菌株的PCR-核糖体分型片段,并以数字化的形式呈现出来,10种核糖体型艰难梭菌的PCR-核糖体分型数字化图谱差异明显。同为RT027的21株菌株间、RT002的3株菌株间和RT015的2株菌株间的数字化分型结果相似性都非常高,而7株RT001菌株则可分为4种亚型,2株RT014分为2种亚型。49株深圳地区儿童中分离出的艰难梭菌共分为22种核糖体型,其中RT017共7株,BA03和BA16各5株,BA13共4株。22株悉尼地区莫西沙星耐药的艰难梭菌均为高毒力核糖体型027(RT027)。结论成功建立艰难梭菌数字化PCR-核糖体分型方法,同时构建了艰难梭菌10种核糖体型的数字化PCR-核糖体分型参考数据库;深圳地区婴幼儿中分离出的艰难梭菌基因型以RT017为主,与国内成人中的分离株相似。悉尼地区莫西沙星耐药的艰难梭菌均为高毒力RT027。
- 束振华陈思达范回生古聪慧黄震
- 关键词:艰难梭菌数字化
- 鸡新勋恙螨核糖体基因和线粒体cox1基因序列分析及植物精油杀螨试验
- 鸡新勋恙螨是放养肉鸡常见的体外寄生虫,在我国各地均有分布,尤以长江以南的亚热带地区发病较为严重。鸡新勋恙螨的幼虫寄居在鸡体皮肤内,以组织液和血液为食,造成鸡体组织反应较大,在鸡体皮肤形成痘疹样病灶。由于目前我国黄羽肉鸡朝...
- 周强
- 关键词:恙螨核糖体基因基因序列分析植物精油杀螨
- 文献传递
- 五种帘蛤科贝类的核糖体基因簇比较与系统发育研究
- 帘蛤科是帘蛤目中物种最多的科,包含许多经济种。目前对这些经济种的研究主要集中在养殖技术和环境因子影响等方面。长期的人工养殖已造成种质退化、抗逆性差和遗传多样性降低。利用分子生物学手段对其遗传信息进行研究,为帘蛤科贝类的遗...
- 韩冷
- 关键词:核糖体基因系统发育
相关作者
- 彭德良

- 作品数:410被引量:1,290H指数:20
- 供职机构:中国农业科学院植物保护研究所
- 研究主题:孢囊线虫 禾谷孢囊线虫 大豆孢囊线虫 线虫 马铃薯腐烂茎线虫
- 叶文兴

- 作品数:12被引量:37H指数:2
- 供职机构:甘肃农业大学草业学院
- 研究主题:核糖体基因 小麦禾谷孢囊线虫 禾谷孢囊线虫 ITS-RFLP D2
- 李玉

- 作品数:1,333被引量:5,077H指数:32
- 供职机构:吉林农业大学
- 研究主题:黏菌 香菇 食用菌 粘菌 生物学特性
- 陈建民

- 作品数:87被引量:428H指数:11
- 供职机构:扬州大学生物科学与技术学院
- 研究主题:长穗偃麦草 小麦 转录因子 大麦 水稻
- 李梅

- 作品数:195被引量:573H指数:13
- 供职机构:甘肃省农业科学院
- 研究主题:马铃薯 贮藏 抑芽 马铃薯块茎 抑芽剂