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H9N2禽流感不同毒株鸡胚交叉中和指数及其与HA基因氨基酸同源性相关的研究被引量：2: 2013年; 对国内1998-2011年流行的22株H9N2分离株进行病原鉴定和HA基因的序列测定,结合在GenBank中公开的46株国内外H9N2病毒进行序列比对,绘制系统发育树。选取在时间、地点和遗传进化方面具有代表性意义的6株H9N2毒株,分别制备单因子血清,进行鸡胚交叉中和试验,计算不同毒株之间的鸡胚交叉中和指数,确定H9N2不同毒株之间的抗原相关系数,并与其HA基因氨基酸的同源性进行相关比较。以期在分子水平上探讨我国疫苗免疫压力下H9N2禽流感病毒的变异,研究病毒的抗原性变化,探讨HA基因变异对抗原性的影响。结果表明:鸡胚中和指数与HA氨基酸同源性呈显著相关(P<0.01,r=0.639 8),表明在多年的疫苗免疫压力下,H9N2病毒已经在分子水平和抗原性上发生了一定程度的变异。该结果为研制新型的H9N2疫苗提供理论支持。; 刘娟张伟徐怀英马秀丽李建黄兵秦卓明崔言顺; 关键词：H9N2 HA基因抗原性

支持hPSCs体外贴壁和长期培养的变体多肽及其设计与应用: 本发明公开了支持hPSCs体外贴壁和长期培养的变体多肽及其设计与应用。本发明以VN多肽为对象进行变体设计以得到所述变体多肽，所述变体的内容选自以下任意一项：(1)由在VN多肽的氨基酸序列中发生1个或多个氨基酸的缺失、取代...; 周平秦丽颖李生振张瑞

青岛市7株柯萨奇病毒A4型分离株全基因特征分析被引量：1: 2022年; 目的了解7株青岛市CVA4病毒株的全基因组特征,探讨CVA4毒株的基因变异进化特征。方法对人恶性胚胎横纹肌瘤细胞(human malignant embryonal rhabdomyoma cell, RD cell)培养分离得到的7株来源于青岛市手足口病普通病例的CVA4毒株进行全基因组序列扩增,应用BioEdit7.09、DNASTAR6.0、MEGA5.2和SimPlot序列分析软件对扩增产物进行拼接比对测序,并与从GenBank中选取的5株中国CVA4毒株进行比对。结果 7株青岛CVA4毒株基因组核苷酸数目为7 344~7 395 bp,与原型株AY421762.1HIGH POINT比较,在编码区无碱基插入和缺失。对7株毒株进行两两同源比对,结果显示7株青岛CVA4毒株全基因组序列核苷酸一致性为87.44%~97.79%,氨基酸同源性为97.17%~99.09%。基因重组分析结果显示,15FG936株与A2/P373/2013/China株存在基因重组,15FG1059株与CV-A6/40428/TKM/2011株存在基因重组,其他5株CVA4毒株未发现明显的重组。结论青岛市7株CVA4毒株中有2株发生了基因重组变异。; 宫金伶张秀莲肖思颖刘思彤刘颂孙睿汪照国柴青; 关键词：全基因组氨基酸同源性

一种鸭2型甲肝病毒检测试剂盒及其检测方法: 本发明提供一种鸭2型甲肝病毒检测试剂盒及其检测方法，所述试剂盒包含了鸭2型甲肝病毒的引物对，序列如SEQ ID NO.1‑2所示。本发明采用的特异性引物选择DHAV‑2与DHAV‑1、DHAV‑3氨基酸同源性最低的2A2...; 万春和黄瑜陈翠腾施少华傅光华程龙飞刘荣昌陈红梅傅秋玲; 文献传递

2017年淮南市外环境H7N9病毒HA和NA基因特征分析被引量：3: 2018年; 目的分析淮南市2017年外环境标本中H7N9禽流感病毒血凝素基因(hemagglutinin,HA)及神经氨酸酶基因(neuraminidase,NA)的基因特征。方法采集活禽市场禽类咽拭子、肛拭子、粪便、笼具、台面或砧板、脱毛机、禽类饮水、污水等标本,进行禽流感病毒Real-time PCR分型检测,选取H7N9核酸阳性标本(CT值≤28),对其HA和NA基因进行特异性扩增,并对扩增产物进行基因序列测定。采用Bioedit5.0.9、DNASTAR7.1软件对测序结果拼接,并选取国内外H7N9参考序列使用Mega 6.06软件构建HA和NA基因遗传进化树。结果淮南市外环境3株H7N9禽流感毒株HA基因其核苷酸同源性为98.7%~100.0%,氨基酸序列同源性为99.3%~100.0%,基因进化分析显示,该3株H7N9禽流感毒株与安徽、江苏、浙江分离毒株亲缘性较近,处于长三角分支内,与2017年安徽株A/Anhui/13449/2017/H7N9(EPI258029)核苷酸同源性为98.7%~99.9%,氨基酸同源性为99.3%~100.0%,HA发生G186V、Q226L突变;NA基因核苷酸同源性为98.3%~100.0%,氨基酸同源性为99.5%~100.0%;基因进化分析显示,淮南株HN-3、HN-4与2017年安徽分离株A/Anhui/13449/2017/H7N9(EPI 258029)亲缘性最近,核苷酸同源性为98.7%~99.7%,氨基酸同源性为99.5%~100.0%,NA蛋白R294K耐药位点无变异,NA茎区69~73位缺失了"QISNT"序列。结论淮南市活禽市场外环境H7N9病毒HA基因和NA基因与人感染H7N9安徽株(EPI 258029)A/Anhui/13449/2017/H7N9高度同源,处于同一进化分支,有共同的进化来源;HA受体结合位点氨基酸发生G186V、Q226L变异,NA茎区69~73位缺失"QISNT"序列均加强了病毒感染人类的能力。; 刘江何军曾凡荣余寿杰何玢杨光李杰; 关键词：氨基酸同源性

我国小反刍兽疫病毒H基因序列分析被引量：2: 2017年; 为了分析我国小反刍兽疫疫情的特点,从GenBank下载我国和其他国家小反刍兽疫病毒(PPRV)毒株H基因全序列,应用分子生物学软件DNAStar进行序列分析。结果显示,始于2007年的我国首次PPR疫情中,我国西藏地区PPRV各毒株间H基因核苷酸同源性介于99.6%~100.0%之间,我国西藏与其他国家PPRV毒株核苷酸同源性介于86.7%~98.3%之间;我国西藏地区PPRV毒株间氨基酸序列同源性介于99.7%~100.0%之间,我国西藏与其他国家PPRV毒株氨基酸序列同源性介于89.3%~98.4%之间。始于2013年年底的我国又一次PPR疫情中,我国PPRV毒株间核苷酸同源性介于99.7%~99.8%之间,我国与其他国家PPRV毒株核苷酸同源性介于87.2%~97.5%之间;我国PPRV毒株间氨基酸序列同源性介于99.2%~99.8%之间,我国与其他国家PPRV毒株氨基酸序列同源性介于89.0%~98.4%之间。H基因进化树分析结果显示,我国的9株PPRV划分为基因Ⅳ系。我国PPRV毒株与印度毒株及土耳其毒株同源性最高,可能由这2个国家传入我国。; 李飞李岳洋张路瑶马海璐张保军蒋秀梅马世强赵丽刘永宏; 关键词：小反刍兽疫 H基因氨基酸同源性

尖吻蝮（Deinagkistrodon acutus）TRPA1基因的克隆及生物信息学分析: TRP (Transient receptor potential)离子通道是一个位于细胞膜上的离子通道大家族,依据其序列同源性可将哺乳动物中的TRP离子通道分为六个亚家族：TRPC、 TRPM、TRPV、TRPA、TR...; 邓可宣; 关键词：尖吻蝮蛇氨基酸同源性; 文献传递

禽Toll样受体5(TLR5)的遗传特征: Toll样受体(TLRs)通过识别病原相关的分子模式(PAMP)而介导免疫应答反应，在宿主防御反应，中起到重要作用。TLR5的多态性会影响机体对细菌鞭毛的识别，导致不同宿主对病原感染的易感性产生差异。在本研究中，我们从雉...; 阮文科郑世军; 关键词：免疫应答氨基酸同源性; 文献传递

即刻早期基因Arc/Arg3.1在部分两栖爬行动物中的克隆及其表达: 活性调节的细胞骨架蛋白（activity-regulatedcytoskeletalprotein, Arc）基因为即刻早期基因（Immediate-early genes, IEGs）中的一种,它的表达产物为细胞结构元...; 邓欢欢; 关键词：ARC 氨基酸同源性原位杂交; 文献传递

猪伪狂犬病病毒四川株的分离鉴定及UL43基因序列分析被引量：6: 2010年; 从四川某猪场发病仔猪体内分离到1株病毒,该毒株能在Vero、MDBK、PK15、ST、MDCK、BHK21、Marc145、鸡胚成纤维细胞(CEF)上增殖并产生细胞病变。通过蚀斑克隆对其进行纯化,克隆毒株在Vero细胞上为3.0×107TC ID50/0.1mL。该病毒在Vero细胞上连传15代,其TCID50变化很小。病毒对5-溴脱氧尿核苷、氯仿敏感。用该病毒接种家兔和仔猪均出现典型的伪狂犬病症状,gE-ELISA检测接种分离毒的仔猪血清,伪狂犬病毒(PRV)抗体阳性。电镜观察可见直径110～140 nm的典型疱疹病毒粒子。上述结果表明分离株为PRV,并命名为SE株。根据已发表的UL43序列设计1对引物,以分离毒株基因组DNA为模板进行PCR扩增,对目的产物进行克隆及测序分析,结果与GenBank收录的其他PRV毒株(Becker、Ea)的UL43核苷酸序列同源性为98.8%,氨基酸同源性分别为95.2%、97.3%。; 王小玉李小欢郭万柱左健韩国全李宇徐志文王印朱玲Xiao-yu Xiao-huan Wan-zhu Guo-quan Zhi-wen; 关键词：猪伪狂犬病病毒基因序列分析鸡胚成纤维细胞蚀斑克隆氨基酸同源性 TCID50

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