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基于细菌细胞蛋白质-蛋白质相互作用的深度突变扫描方法及结合亲和力预测方法
本发明公开了一种基于细菌细胞蛋白质蛋白质相互作用的深度突变扫描方法及结合亲和力预测方法。本发明将分裂dCas9蛋白(SEQ ID NO.1、SEQ ID NO.2)分别与待测结合亲和力的受体和配体融合表达,并结合毒性...
崔论王玉梁钱英
一种细胞蛋白质折叠状态的测定方法
本发明提供了一种细胞蛋白质折叠状态的测定方法,属于定量蛋白质组学测定技术领域。本发明先在收集细胞后加入非特异性蛋白酶,然后冷冻研磨,离心过滤后收集滤液和蛋白质蛋白质进一步使用特异性酶胰蛋白酶进行酶解,接着使用质谱分析...
赵樑赵婷孙振兴马拯
一种用于靶向降解细胞蛋白质的ORF、质粒和mRNA及其使用方法和应用
本发明公开了一种用于靶向降解细胞蛋白质的ORF、质粒和mRNA及其使用方法和应用,属于靶蛋白降解技术领域。本发明提供的方法可有效、持续降解目标蛋白质,具有高效性、可扩展性;通过抗原抗体特异性杂交反应实现对靶蛋白的特异性...
林佳奇 都书博 韩宏丽
一种测定细胞蛋白质构象变化和相互作用的方法及装置
一种测定细胞蛋白质构象变化和相互作用的方法及装置,该方法包括:标记步骤,包括使用化合物标记细胞样本中的蛋白,获得标记后的细胞样本;裂解步骤,包括对标记后的细胞样本进行裂解,获得裂解液,从所述裂解液中提取蛋白;酶解步骤,...
陈顺兴李鹏飞郑圳香
一种活细胞蛋白质相互作用实时荧光显示方法
本发明涉及蛋白质相互作用检测方法技术领域,具体涉及一种活细胞蛋白质相互作用实时荧光显示方法,包括:建立蛋白质荧光显示序列快速克隆质粒α、β和γ;将蛋白A的cDNA序列克隆入蛋白质荧光显示序列快速克隆质粒α和蛋白质荧光显...
陈典刚李光辉王欣欣刘博陈旭
核酸适体介导细胞蛋白质功能调控抗肿瘤的机制研究
蛋白质是构成细胞的重要成分,也是生命活动的直接执行者,参与基因表达、信号转导、细胞周期、细胞分化等细胞过程。蛋白质功能异常会影响机体的正常生理过程,如通过影响细胞增殖、生长、死亡、代谢的信号通路促进肿瘤的发生和发展。调节...
凌能
关键词:核酸适体蛋白质定位蛋白质降解抗肿瘤治疗
一种细胞蛋白质复合物原位分析方法及其应用
本发明涉及一种细胞蛋白质复合物原位分析方法及其应用。在该方法中,利用包裹交联剂载体与细胞共同孵育,利用细胞吞,载体将交联剂运送至细胞特定部位,并且释放化学交联剂,从而使蛋白质复合物进行原位交联。随后,利用基于离子液...
张丽华周雯杨开广陈玉宛裴家琪梁振张玉奎
文献传递
一种用于细胞蛋白质复合物原位分析的载体及其制备方法和应用
本发明涉及一种用于细胞蛋白质复合物原位分析的载体及其制备方法和应用。所述的细胞蛋白质复合物原位分析的载体,其作用在于将用于蛋白质复合物分析的化学交联剂,通过跨膜递送的方式,运送至细胞特定部位,并且释放化学交联剂,从...
张丽华陈玉宛杨开广周雯裴家琪梁振张玉奎
文献传递
人造细胞蛋白质合成的研究进展
2021年
细胞蛋白质合成(cell-free protein synthesis,CFPS)是一种在体外快速合成目标蛋白质的方法,通过构建含有CFPS系统的人造细胞,能够实现蛋白质的高通量表达和功能性膜蛋白的体外重构.本文详细综述了4种CFPS系统(包括大肠杆菌裂解液、兔网织红细胞裂解液、小麦胚芽提取物、酵母提取物)的适用范围和优缺点,总结了基于CFPS系统构建的人造细胞体系蛋白质合成的研究现状,以及该领域面临的挑战及未来的发展方向.
赵晶晶王雪靖穆韡韩晓军
建立BioID-质谱联用技术筛选细胞蛋白质相互作用
2021年
目的通过BioID-质谱联用技术建立一种新的蛋白质相互作用的筛选系统,并采用免疫共沉淀-蛋白质印迹法验证与Yes相关蛋白1(YAP1)相互作用的蛋白质。方法构建YAP1-BirA*融合表达质粒,将质粒转染进293T细胞后,在细胞培养基中加入50μmol/L生物素,继续培养24 h后提取细胞蛋白质。利用YAP1特异抗体,采用蛋白质印迹法检测YAP1-BirA*融合蛋白的表达。利用HRP偶联的亲和素检测细胞蛋白质被生物素标记的水平。通过亲和素磁珠对细胞生物素化的蛋白质进行亲和纯化,多次洗涤去除亲和素磁珠上非特异性结合的蛋白质后对亲和素磁珠纯化的蛋白质进行溶解。取40μg总蛋白行SDS-PAGE,然后采用蛋白质银染试剂盒对凝胶中的蛋白质进行染色,确定亲和素磁珠对生物素化蛋白的纯化效果。用非标记定量质谱法鉴定生物素化的蛋白质。针对鉴定得到的蛋白质,采用蛋白质印迹法对生物素化的SMAD家族成员3(SMAD3)进行验证。通过YAP1的免疫共沉淀-蛋白质印迹法确定SMAD3能否与YAP1相互作用。结果成功构建YAP1-BirA*融合表达质粒,该质粒在293T细胞中能够高效表达融合蛋白。在生物素存在的情况下,YAP1-BirA*融合蛋白能够利用生物素标记细胞与YAP1-BirA*融合蛋白邻近的蛋白质。在细胞裂解后,这些在细胞被生物素标记的蛋白质能够被偶联亲和素的磁珠纯化,经过多次洗涤,能够富集生物素标记的蛋白质。质谱鉴定显示,能够获得细胞与YAP1在空间上相互靠近的蛋白质。免疫共沉淀-蛋白质印迹法结果证明SMAD3蛋白能与YAP1相互作用。结论BioID-质谱联用方法是一种能用于蛋白质相互作用筛选的简单、高效技术,与免疫共沉淀-蛋白质印迹法联合使用可以成为一种新的蛋白质相互作用研究体系。
赵峰唐文栋郭志福吴弘宋晓伟
关键词:蛋白质相互作用质谱分析法

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作品数:1,062被引量:2,257H指数:22
供职机构:中国科学院大连化学物理研究所
研究主题:蛋白质 蛋白质组 肽段 高效液相色谱 整体柱
张丽华
作品数:706被引量:817H指数:13
供职机构:中国科学院大连化学物理研究所
研究主题:蛋白质 蛋白质组 肽段 整体柱 蛋白质组学
杨开广
作品数:342被引量:28H指数:3
供职机构:中国科学院大连化学物理研究所
研究主题:肽段 蛋白质 蛋白质组 糖肽 蛋白质复合物
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研究主题:蛋白质相互作用 蛋白质组 离子液体 细胞内蛋白质 肽段
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作品数:79被引量:18H指数:2
供职机构:中国科学院大连化学物理研究所
研究主题:蛋白质相互作用 蛋白质复合物 蛋白质组 离子液体 蛋白质复合体