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一种植物细胞组固体培养装置及其培养方法: 本发明适用于植物组织细胞技术领域，提供了一种植物细胞组固体培养装置，包括桶体和纵向转轴一，定向旋转机构布置在纵向转轴一端部，用于放置植物细胞组织，供液系统对经过植物组织细胞加注培养液，浮动混合机构安装在桶体上，以便于当放...; 朱虹苏镕杰叶爱云

一种应用于单细胞组学分析的细胞-微珠配对捕获方法: 本发明提供一种应用于单细胞组学分析的细胞‑微珠配对捕获方法，包括以下步骤：S1：提供一种微流控捕获装置，包括可分离的颗粒捕获层与衬底层，颗粒捕获层中设置有若干捕获微结构，用于细胞‑微珠的一对一配对捕获；S2：从入口处通入...; 罗源邢晓星赵建龙王宁高文冰

一种用于单细胞组学分析的细胞-微珠捕获配对的装置以及方法: 本发明提供一种用于单细胞组学分析的细胞‑微珠捕获配对的装置以及方法，该装置包括：微井捕获层，其包括：通过若干微井组成的微井阵列，每个微井包括通过连接沟道连接的细胞捕获井和微珠捕获井；以及辅助捕获结构，通过包括：1)在细胞...; 罗源邢晓星赵建龙杨世佳刘珠珠

儿童阻塞性睡眠呼吸暂停患者外周血白细胞组学分析: 2024年; 目的:研究儿童阻塞性睡眠呼吸暂停患者与健康儿童的外周血白细胞在基因表达和功能富集方面的差异情况。方法:招募我院确诊为阻塞性睡眠呼吸暂停(OSA)的患儿5名作为病例组,以及健康儿童7名作为对照组。多导睡眠监测结束后的清晨采集静脉血3 mL,离心分离白细胞并提取RNA,进行高通量测序和转录组学分析,鉴定差异表达基因,并进行GO项目和KEGG项目通路富集、蛋白互作分析。结果:在比较OSA患儿与健康组的外周血白细胞时,发现两者在基因表达水平上有显著差异,这些差异主要集中在与炎症反应和缺氧相关的生物过程。显著改变的信号通路涵盖了细胞因子与细胞因子受体的相互作用、Toll样受体信号传导以及MAPK信号传导等。此外,一些关键蛋白的相互作用也受到影响,包括细胞周期调控蛋白(如CDK1、CCNB1、BUB1)、干扰素诱导蛋白(如IFIT1、XAF1)以及多种细胞因子(如CXCL8、IL6、TNF)。结论:OSA患儿的外周血白细胞的免疫和炎症相关基因表达变化显著,提示存在全身炎症反应,这可能是儿童OSA发展的潜在机制。; 齐雨薇孔雅茹季洁王珊邰隽; 关键词：儿童阻塞性睡眠呼吸暂停炎症转录组学

基于单细胞组学的胶质母细胞瘤放射敏感性的分析: 张筱迪

单细胞组学技术揭示放射性肺纤维化新机制: 研究目的放射性肺纤维化(radiation-induced pulmonary fibrosis,RIPF)是胸部放疗中的主要限制因素,其中氧化应激和炎症反应在其发病机制中起着关键作用。刻画肺组织各种细胞在放射诱导的氧化...; 卢一鸣; 关键词：放射性肺纤维化放射性损伤动态景观肺组织组学技术

基于图对比神经网络的单细胞组学数据嵌入表示提取方法: 基于图对比神经网络的单细胞组学数据嵌入表示提取方法属生物信息学与机器学习交叉技术领域，本发明使用基于zinb的自编码器架构，以应对单细胞数据中的高维、稀疏和噪声挑战；引入聚类引导的对比学习，能有效地提升正负样本的质量；通...; 丰小月曹博雯管仁初曾安

单细胞组学揭示免疫补体系统抑制作为牙周炎与阿尔茨海默病的共同病理机制: 2024年; 目的牙周炎和阿尔茨海默病(AD)作为老年人常见病,发病率随年龄增长而增高。为了探究两种疾病之间是否存在共同致病因素,从而为AD的早期诊断提供理论依据,本研究利用单细胞转录组数据和Bulk RNA-seq测序数据解析牙周炎与AD之间致病风险的相关性。方法从基因表达数据集(GEO)数据库下载牙周炎(GSE164241)和AD(GSE157827)单细胞数据,包括3例患者样本与3例对照。对单细胞数据进行质控、数据整合、降维聚类、细胞类型注释及差异表达基因鉴定。比较两种疾病组间差异表达基因,获取共有的差异表达基因。随后对共有差异表达基因进行富集分析,并针对基因所编码蛋白构建蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络以了解蛋白之间的相互作用关系。从GEO数据库下载牙周炎(GSE16134)与AD(GSE63060)的Bulk RNA-seq芯片测序表达矩阵与样本信息,验证单细胞数据中PPI的核心基因表达量,评估基因与疾病的相关性。结果通过对比牙周炎和AD的样本数据分析,发现牙周炎与AD中共有的免疫细胞为CD163+髓系细胞群,其中牙周炎来源的髓系细胞,疾病组/对照组发现1 934个下调的差异表达基因,AD来源的髓系细胞,疾病组/对照组发现232个下调的差异表达基因,两者取交集后得到49个共有的下调差异表达基因,对其进行富集分析,主要富集于髓系细胞和补体相关反应等。进一步分析表明补体通路中的STAB1基因表达与牙周炎和AD呈显著负相关(P<0.05)。结论髓系细胞是牙周炎和AD共有的免疫细胞,其中补体通路中STAB1基因是两种疾病发生过程中共同下调的免疫相关基因,并且与疾病的发生呈显著负相关,提示牙周炎患者中STAB1基因表达的检测可作为AD早期诊断和治疗的潜在靶点。; 孙天萌孙泽文赵天元徐梦钰孙宏晨安政雯; 关键词：牙周炎阿尔茨海默病免疫反应髓系细胞补体

人类子宫内膜的单细胞组学研究进展: 2024年; 子宫内膜中各种亚型细胞的表达和功能对于维持正常子宫内膜功能、提供胚胎植入环境非常重要。近年单细胞组学研究因其可以在单个细胞水平上对不同来源、不同时期子宫内膜进行高通量测序,逐渐成为子宫内膜相关基础研究和临床应用的一个重要研究手段。通过对子宫内膜相关单细胞组学的研究进行综述,包括子宫内膜生理状态,以及复发性流产、子宫内膜异位症、子宫腺肌病、薄型子宫内膜、宫腔粘连、反复种植失败以及子宫内膜癌等病理情况下子宫内膜单细胞层面差异、细胞间相互作用。更深入地理解单细胞组学在子宫内膜研究中的应用,有助于揭示子宫内膜相关疾病的病理生理机制。; 姜乐然张园王琳刁飞扬; 关键词：子宫内膜单细胞分析容受性胚胎植入

面向高通量单细胞组学数据的插补模型研究: 随着高通量测序技术的快速发展,基因组、转录组、表观组等组学测序数据规模增长迅速,为理解生命活动进程、细胞命运周期调控、基因转录机制等科学问题提供了充足的数据支撑。然而,由于测序深度、捕获效率等诸多因素的影响,测序数据中往...; 苏延池; 关键词：插补矩阵分解

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