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细菌基因组DNA提取试剂盒及其使用方法
本发明属于生物技术领域,公开了一种细菌基因组DNA提取试剂盒和细菌基因组DNA提取方法,所述试剂盒包括悬浮液、结合液、去蛋白液、漂洗液和洗脱液。本发明的试剂盒采用独特的缓冲液系统配合特异性吸附DNA的离心柱,能够快速1h...
肖晓文王文朋李妍东昱汝
细菌基因组绝缘位点的鉴定方法及应用
本发明公开了一种细菌基因组绝缘位点的鉴定方法及应用,该方法利用生物学方法测定待测位点的两端均具有转录强终止子且两个所述转录强终止子的末端相对,即鉴定为绝缘位点。本发明实现了将外源基因插入到细菌绝缘表达位点,使外源基因表达...
胡杨波何丽娜陈士云
一种来源于野生亚洲象肠道丁酸球菌科细菌基因组的单宁酶及其基因
本发明涉及酶的基因工程技术领域,具体为一种来源于野生亚洲象肠道丁酸球菌科细菌基因组的单宁酶及其基因,利用宏基因组分箱技术装获得一株丁酸球菌科(Butyricicoccaceae)细菌基因组,经InterPro和Pfa...
黄遵锡张呈波吴倩
一种快速细菌基因组DNA提取试剂盒、使用方法及应用
本发明公开了一种快速细菌基因组DNA的提取试剂盒及使用方法。所述试剂盒的试剂包括:裂解液、加强液、清洗液和洗脱液。所述使用方法包括在样品中加入裂解液和加强液裂解、清洗液清洗、核酸洗脱液洗脱后的得到细菌核酸。本发明的快速细...
王伟洪钱福初尹维宏牟颖胡凯金伟童照威钟剑峰
一种在细菌基因组中定点插入DNA的基因编辑系统及其应用
本发明公开了一种在细菌基因组中定点插入DNA的基因编辑系统及其应用,系统包括:第I调节元件,其包括转座模块和靶向效应模块,其核苷酸序列如SEQ ID No.1所示,编码7个氨基酸序列;第II调节元件,其包括“II‑1核苷...
邓杰王新磊
一种细菌基因组DNA提取试剂盒
本实用新型公开了一种细菌基因组DNA提取试剂盒,包括底壳,所述底壳的内部设置有动力空间,所述动力空间内设置有电机,所述电机的上侧输出端动力连接有转轴,所述底壳的上侧固设有盒体,所述盒体内可转动的设置有内盒,所述转轴的上端...
李鹏尹锐王志豪陈惠杰刘喜东董长颖
一种原核细菌基因组连续随机转座整合系统的构建
本发明公开了一种原核细菌基因组连续随机转座整合系统的构建,属于生物工程技术领域。该系统利用Mariner家族转座子,由单质粒或双质粒实现转座功能,通过诱导型启动子控制转座酶的表达,使得该系统的转座过程受到诱导剂调控,可将...
刘展志吴敬陶尊
16S-rRNA测序技术分析早产儿肠道细菌基因组指导新生儿坏死性小肠结肠炎手术时机选择的研究
2024年
目的探讨16S-rRNA测序技术分析早产儿肠道细菌基因组指导新生儿坏死性小肠结肠炎(NEC)手术时机选择。方法前瞻性选择2021年1月至2022年6月百色市人民医院需要手术治疗的NEC患儿30例为观察,选择同期内科保守治疗的Ⅰ期15例和Ⅱa期15例患者为对照。采用HiSeq测序平台,借助双端测序模式进行高通量二代测序,比较两多样性指数、优势均属丰度及不同优势菌比值等;绘制受试者操作特征(ROC)曲线,分析16S-rRNA测序技术的指导价值。结果60例患者60份样本中共获得细菌84个,且两样品均为副杆状菌属最高,其次为Ruminococcus、Blautia、Aeromonas和Fusobacterium;两肠道菌群上述菌门丰度存在差异(P<0.05);从粪便标本中共获得有效序列7347481条,人均130857条,测序平均覆盖度为(92.15±5.61)%;观察手术治疗的NEC患儿中香农-维纳(Shannon)及辛普森多样性(Simpson)指数低于对照内科保守治疗患儿,差异有统计学意义(P<0.05);ROC曲线结果表明,16S-rRNA测序技术在NEC患儿手术时机选择中的指导AUC为0.846,指导灵敏度为87.51%,特异度为83.16%。结论NEC患儿常伴有肠道细菌基因组改变,且菌群结构的变化与患儿病情严重程度有关,通过16S-rRNA测序技术能指导NEC患儿手术治疗时机。
翟刚
关键词:新生儿坏死性小肠结肠炎手术时机
基于CTAB改性凹土的细菌基因组DNA提取方法研究
2024年
利用HCl和十六烷基三甲基溴化铵(CTAB)对凹凸棒土进行改性,增加其表面功能基团,研究改性材料对脱氧核糖核酸(DNA)的吸附与解吸效果。通过X射线衍射(XRD)仪、傅里叶变换红外光谱(FTIR)仪、扫描电子显微镜(SEM)和比表面积测试仪(BET)等对改性前后的凹凸棒土进行表征。以金黄色葡萄球菌为例,考察改性凹凸棒土用于核酸提取的得量、纯度及完整性。结果表明,改性材料对DNA的饱和吸附量可达18.657μg/mg,对金黄色葡萄球菌核酸提取得量为(5.45±0.46)ng/105 CFU,且结构完整、纯度高。
臧垚王为彦王莫凡潘家昊张孝杰郭亚辉
关键词:凹凸棒土改性
一种细菌基因组多重编辑方法及其应用
本发明属于微生物基因工程技术领域,具体涉及一种细菌基因组多重编辑方法及其应用。本发明实际提供一种基于改进的dReaMGE重工程和线性CRISPR‑Cas系统的多重基因组编辑方法经试验证明,其显著提高了在诸如大肠杆菌和伯...
王雪王宇璇郑文韬卞小莹涂强张友明

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作品数:206被引量:456H指数:12
供职机构:广州金域医学检验中心有限公司
研究主题:军团菌 医学独立实验室 嗜肺军团菌 分子分型 全血
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作品数:22被引量:13H指数:3
供职机构:广州金域医学检验中心
研究主题:军团菌 特异引物 嗜肺军团菌 引物 单核苷酸多态性位点
朱庆义
作品数:220被引量:891H指数:16
供职机构:广州金域医学检验中心
研究主题:军团菌 嗜肺军团菌 聚合酶链反应 分子分型 PCR
杨朝国
作品数:79被引量:223H指数:8
供职机构:成都中医药大学医学技术学院
研究主题:聚合酶链反应 细菌 隐匿性乙型肝炎病毒感染 教学改革 结核分枝杆菌
孔庆科
作品数:71被引量:26H指数:3
供职机构:四川农业大学
研究主题:O-抗原 大肠杆菌 基因簇 抗原基因 糖基转移酶基因