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西藏岗巴拉山土壤细菌多样性海拔分布格局及其驱动因子被引量：2: 2024年; 高原山地是对全球气候变化最为敏感的脆弱生态系统之一,研究高原山地土壤细菌群落沿海拔变化特征,对于揭示受气候变化和人为干扰的山地微生物群落结构和功能有十分重要的科学意义。研究以西藏岗巴拉山作为研究对象,运用Illumina MiSeq高通量测序技术,基于精细样方尺度分析了岗巴拉山沿海拔梯度土壤细菌群落组成和多样性的变化特征及其驱动因子。结果表明:岗巴拉山土壤细菌共包含36门125纲307目477科838属1878种,将12个海拔带分为高中低3组(低海拔从3800—4100 m、中海拔从4200—4500 m、高海拔从4600—4900 m),中海拔总分类操作单元(OTU)数最多,特有OTU数最少,土壤细菌群落丰富度随海拔升高呈单峰趋势,但其特异性随海拔呈U型分布格局。岗巴拉山土壤细菌群落中的优势菌门是放线菌门、酸杆菌门、变形菌门、绿弯菌门、疣微菌门和芽单胞菌门等,土壤细菌群落Shannon多样性指数随海拔升高而逐渐减小,而Simpson多样性指数在高海拔最高,Chao指数随海拔升高呈单峰变化趋势。主坐标分析(PCoA)表明土壤细菌群落结构在不同海拔梯度上存在显著差异,且低海拔土壤细菌群落组内也存在显著差异。冗余分析(RDA)表明海拔、pH、总氮、总磷和有机碳对土壤细菌群落结构有显著影响,与环境因子相关性分析表明海拔、pH、总氮、总磷和有机碳与土壤细菌群落结构显著相关,曼特尔检验表明pH和海拔是影响土壤细菌群落的关键因素。岗巴拉山土壤细菌多样性沿海拔梯度呈单调下降趋势,pH是影响土壤细菌群落沿海拔变化特征的关键环境因子,总氮、总磷和有机碳也是影响土壤细菌群落的重要环境因子。; 李伊凡王俊伟陈永豪何柄枚拉琼; 关键词：土壤细菌多样性海拔

施肥对贺兰山东麓酿酒葡萄园土壤细菌多样性的影响: 2024年; 探究微生物肥料对不同生长时期酿酒葡萄园土壤化学性质和细菌群落组成的影响及其相互关系,为贺兰山东麓酿酒葡萄园健康种植及土壤管理提供科学依据。以广泛种植于宁夏贺兰山东麓的酿酒葡萄品种“梅鹿辄”为试验材料,采用随机区组试验设计设置4个处理:生物有机肥+化肥减量、生物有机肥灭活+化肥减量、常规化肥用量和空白对照,通过高通量测序技术比较分析了不同生长时期各施肥处理条件下土壤细菌多样性以及群落结构的变化规律。结果表明:不同生长时期各施肥处理土壤细菌优势门为变形菌门(Proteobacteria)、酸杆菌门(Acidobacteriota)、拟杆菌门(Bacteroidota)、放线菌门(Actinobacteriota),优势菌属为亚硝化螺菌属(Nitrosospira)、酸杆菌属(Acidobacterium)RB41、鞘氨醇单胞菌属(Sphingomonas)。各施肥处理土壤细菌多样性指数显著高于对照,且转色期较收获期土壤细菌群落结构差异显著。施用生物有机肥及其基质处理分别显著增加了亚硝化螺菌属和酸杆菌属RB41的相对丰度,而不施肥处理则降低了亚硝化螺菌属的相对丰度。通过冗余及相关性分析结果发现,土壤碱解氮、有机质含量及pH值是影响土壤细菌群落多样性的主要因子,其中碱解氮含量为最主要驱动因子,放线菌可以适应该研究区土壤盐渍化程度。微生物肥料能够不同程度提高土壤养分含量、降低土壤pH值和全盐含量,增加土壤细菌群落多样性,其中以施用生物有机肥配施化肥减量处理整体效果最显著。; 孙豪杰王静程昱润王静毕江涛; 关键词：微生物肥料土壤细菌群落多样性

基于16S rRNA测序的植茶温室土壤细菌多样性及群落结构研究: 2024年; 为了明确温室栽培模式对茶园土壤细菌多样性和群落结构的影响,找寻温室栽培、露天栽培模式之间的差异指示种,以更科学地为管理温室茶园提供理论依据。采用NovaSeq 6000高通量测序技术,以及主坐标分析(PCoA)、置换多元方差分析(Adonis)及LEfSe等分析方法对不同栽培模式茶园土壤细菌多样性及群落结构进行研究。结果表明,16S rRNA测序质控后,土壤样品总共获得操作分类单元(OTU)数量为11137个(497556条有效序列)。3个处理间共同含有200个OTU,温室间共同含有495个OTU。茶园土壤细菌主要优势菌门为变形菌门、酸杆菌门、放线菌门等。ACE指数、Chao1指数、Simpson指数与Shannon指数等α多样性指数均以露天栽培模式极显著高于温室。PC1和PC2主成分贡献率分别为65.10%、21.55%,共解释了86.65%(R 2=0.612,P=0.001)的信息。露天栽培处理差异指示种为酸杆菌门(Acidobacteriota)、Acidobacteriae等。温室处理指示种为罗丹诺杆菌科(Rhodanobacteraceae)、黄单胞菌目(Xanthomonadales)、弗兰克氏菌目(Frankiales)等。以上研究结果为从微生物水平上研究温室栽培模式对茶园土壤生态质量的影响提供了参考。; 孙君朱留刚林志坤张文锦; 关键词：温室土壤细菌 Α多样性 Β多样性

连作对甜瓜根际土壤细菌多样性及群落结构的影响: 2024年; 通过高通量测序研究不同连作年限甜瓜根际土壤中细菌的多样性和菌群结构,以期了解甜瓜连作的微生态机制,为连作障碍提供防治参考。研究结果表明:随着连作时间的增加,细菌多样性指数和丰富度指数先增加后下降。从4份甜瓜土壤样本中共获得35门和60属的细菌。优势门有6个,分别为:变形菌门(Proteobacteria)、酸杆菌门(Acidobacteriota)、芽单胞菌门(Gemmatimonadota)、放线菌门(Actinobacteria)、unclassified-Bacteria和拟杆菌门(Bacteroidota)。其中,变形菌门和拟杆菌门的丰度是先增加后下降,放线菌门丰度呈逐渐下降的趋势,酸杆菌门、芽单胞菌门和unclassified-Bacteria和绿弯菌门丰度呈先下降后上升的趋势;优势属分别为unclassified-Gemmatimonadaceae、unclassified-Bacteria、unclassifiedVicinamibacteraceae、unclassified-Vicinamibacterales、Subgroup-10、溶杆菌属(Lysobacter)、鞘脂单胞菌属(Sphingomonas)、假单胞菌属(Pseudomonas)、硝化螺旋菌(Nitrospira)。; 吴秋芳何玲敏张美玲郜新强王景顺齐英; 关键词：高通量测序技术甜瓜连作细菌群落结构细菌多样性

青海不同区域农田作物土壤细菌多样性及群落结构分析被引量：1: 2024年; 【目的】探讨青海省农田土壤细菌多样性及群落结构组成。【方法】采用高通量测序技术分析都兰县、互助县、共和县和大通县种植小麦、油菜、青稞土壤细菌群落结构组成及多样性差异,并解析其与土壤理化特性的关系。【结果】4个地区的土壤pH、水分、有机质、Chao1指数、Shannon指数、线性判别分析效应大小(linear discriminant analysis effect size,LEfSe)组间差异这些指标中部分指标存在极显著差异性(P<0.01),而3种作物的这些指标无显著差异(P>0.05)。主成分分析(principal component analysis,PCA)显示,不同区域细菌群落组成差异性较大,3种作物农田土壤细菌群落、物种组成相似度较高。4个地区共有3127个可操作性分类单元(operational taxonomic units,OTUs),3种作物农田土壤细菌共有OTUs为3694个;细菌物种隶属于36门93纲192目276科450属423种;4个地区或3种作物土壤具有相似的优势门、属、种,但相对丰度不同。水分、pH、有机质与Chao1、Shannon存在显著相关性,pH、有机质与未分类种、unclassified RB41、unclassified Sphingomonas具有显著正相关或负相关。Chao1、Shannon与unclassified Sphingomonas显著负相关,与unclassified RB41、unclassified Vicinamibacteraceae显著正相关。【结论】区域差异对土壤的理化性质、细菌群落结构和多样性具有显著影响,相较于作物而言其影响更加明显。; 马学兰周连玉周连玉王龙瑞刘钰马云; 关键词：农田土壤细菌多样性群落结构

不同施肥年限对红壤细菌多样性及群落结构演替的影响: 2024年; 为探讨不同年限施肥处理对旱地红壤细菌多样性和群落结构演替的影响,基于中国科学院红壤生态实验站设置的不同秸秆还田方式长期定位试验,采集种植玉米后第1年(Y2011)、第3年(Y2013)和第7年(Y2017)的土样进行分析。试验处理分为不施肥(CK)、化肥(N)和化肥+秸秆猪粪配施(NSM)3个处理,通过高通量测序技术研究旱地红壤细菌多样性和群落结构差异。结果表明:(1)施肥处理显著提高了土壤有机碳、全氮、全磷和有效磷养分含量,NSM处理对土壤肥力的提升效果比N处理好,且随着施肥年限的延长,提升效果越显著;(2)与Y2011相比,Y2013和Y2017下CK、N和NSM处理的细菌α多样性均显著提高,且N和NSM处理细菌多样性显著高于CK处理;(3)主坐标分析和聚类分析表明,土壤细菌群落主要通过施肥年限聚类在一起,但同一施肥年限下不同施肥处理之间细菌群落结构没有显著差异;(4)土壤全磷是驱动细菌多样性和群落结构变异的最关键因子。本研究从细菌多样性增加的角度,为探索有机培肥下红壤肥力提升和生态系统健康管护提供了科学依据。; 石广萍栾璐曾昭阳郑洁靳乐乐孙波蒋瑀霁; 关键词：旱地红壤秸秆还田细菌多样性细菌群落结构

基于高通量测序技术的老化油泥对大庆油田土壤细菌多样性的影响: 2024年; 采集大庆油田不同泥龄老化油泥污染土壤样本,采用高通量测序技术对样本细菌多样性特征开展研究,结合土壤理化性质分析,揭示老化油泥对大庆油田土壤细菌多样性的影响效应,并筛选确定样本中的优势特色耐油菌,为老化油泥污染土壤的原位微生物修复提供理论依据和数据支持。理化性质分析结果表明,污染土壤pH值下降,由碱性(8.44)变为中性(7.47~7.85),总有机碳(TOC,20.12~28.35g·kg^(-1))和总石油烃(TPHs,2475~2955 mg·kg^(-1))含量均显著升高,有效磷(AP)和有效氮(AN)急剧降低。Illumina Miseq高通量测序结果显示,老化油泥对土壤细菌多样性和群落结构具有显著影响。土壤受老化油泥污染后,厚壁菌减少了约85%,变形菌(Proteobacteria)和芽单胞菌(Gemmatimonadetes)的相对丰度显著增加至46.63%±4.65%和14.11%±1.53%,且污染时间越长,对变形菌的促进作用越大。细菌科和属水平凸显了Woeseiaceae(γ-变形菌)和JTB255-MBG(变形菌门-Woeseiaceae菌科)的丰度增长,且其相对丰度与油泥污染时间呈显著正相关。高通量测序结果揭示,老化油泥污染一方面抑制了土壤中许多重要细菌的生长,另一方面也衍生和促进了具有耐油特性的其他细菌的生长发育。其中,变形菌门是石油污染土壤中最主要的优势菌门,它与所包含的耐油细菌科、属形成了“变形菌门-Woeseiaceae菌科-JTB255-MBG菌属”的优势耐油细菌群落结构。本研究成果可为老化油泥污染土壤的原位微生物修复提供理论依据与支持。; 王卉卉匡少平王炳辰; 关键词：高通量测序细菌多样性土壤

不同肥力条件下添加黄腐酸对土壤细菌多样性、甘蓝养分吸收及产量的影响: 2024年; 为探究不同肥力条件下添加黄腐酸对土壤细菌多样性、甘蓝养分吸收和产量的影响,试验以甘蓝‘优贝特’品种为研究材料,共设置4个处理:施底肥+黄腐酸(H-FA)、施底肥(H-CK)、不施底肥+黄腐酸(L-FA)、不施底肥(L-CK),1株甘蓝总计施入黄腐酸30 mg。结果表明,黄腐酸的施用和肥力对土壤细菌的物种丰富度和群落多样性无显著影响,但添加黄腐酸提高了解磷细菌和促生细菌的相对丰度。施底肥条件下,添加黄腐酸能显著提高氮和磷的生理利用效率,H-FA处理氮和磷生理利用效率分别为(341.00±8.34)和(2296.98±47.49)kg·kg^(-1),分别为H-CK处理的1.11和1.07倍。未施底肥条件下,添加黄腐酸后植株地上部氮、磷、钾积累量均高于对照。添加黄腐酸显著提高了甘蓝地上部和地下部鲜重,施底肥条件下,与对照相比分别增加了15.8%和20.7%,未施底肥条件下,与对照相比分别增加了16.2%和7.7%。因此,黄腐酸通过促进甘蓝根系生长,从而促进甘蓝产量的增加,添加黄腐酸是实现减肥不减产的有效措施。; 王玉琪张泽锦张泽锦唐丽李如龙; 关键词：黄腐酸甘蓝细菌多样性养分吸收

模拟氮沉降对猫儿山亚热带常绿阔叶林土壤细菌多样性和群落结构的影响: 2024年; 为了解大气氮沉降下猫儿山土壤细菌群落的变化规律,以猫儿山亚热带常绿阔叶林为对象,设置4种不同施氮处理[0(CK)、50(Ⅱ)、100(Ⅲ)和150(Ⅳ)g·m^(-2)·a^(-1)],采用高通量测序技术研究不同施氮量对土壤细菌多样性和群落结构的影响。结果表明,处理Ⅲ的特有土壤细菌OTU数量最多。随施氮量增加,辛普森指数降低,处理Ⅱ的辛普森指数最高;随施氮量增加,香农和Chao 1指数均呈先升后降的趋势,处理Ⅲ的香农和Chao 1指数均最高。土壤细菌群落以酸杆菌门(Acidobacteria)、变形菌门(Proteobacteria)、绿弯菌门(Chloroflexi)、厚壁菌门(Firmicutes)、疣微菌门(Verrucomicrobia)和放线菌门(Actinobacteria)为主。NMDS和聚类分析表明,不同施氮处理未造成细菌群落结构明显分离。LDA分析表明,处理Ⅲ的差异性物种数量最多,绿弯菌门可作为氮添加后的指示性物种。100 g·m^(-2)·a^(-1)施氮量最有利于土壤细菌生长,150 g·m^(-2)·a^(-1)施氮量对土壤细菌生长有一定抑制作用。; 蒋行健欧芷阳谭长强谭长强郑威何琴飞何峰郑威; 关键词：氮沉降土壤细菌群落结构

阴香龙脑含量对叶际细菌多样性的影响: 2024年; 为了解龙脑含量的高低对阴香Cinnamomum burmanni叶不同发育阶段叶际细菌群多样性的影响,文章以2个阴香品系(高龙脑含量—H和低含量—L)的2个发育时期叶片(嫩叶和成熟叶)为研究材料,利用气相-质谱联用仪检测4组样本的龙脑含量,利用16S测序结果比较分析叶际细菌结构和相对丰度的变化。结果表明:(1)相较于嫩叶,2个品系的成熟叶中龙脑含量均显著增加。(2)4组样本共检测出259个操作分类单元,其中H特有操作分类单元的数量最多。(3)基于这些H成熟叶的菌群α多样性指数在4组样本中最高,高龙脑含量品系的叶片中叶际细菌群落多样性随着叶片成熟而提升,低龙脑含量品系的叶际细菌群落多样性随着叶片成熟变化并不显著。4组样本之间菌群丰度的差异主要集中在鞘氨醇单胞菌属菌Sphingomonas sp.、短小杆菌属菌Curtobacterium sp.、假单胞菌属菌Pseudomonas sp.、肠杆菌科菌Enterobacteriaceae sp.、类芽孢杆菌属菌Paenibacillus sp.和芽孢杆菌属菌Bacillus sp.。研究结果表明阴香叶中龙脑含量的变化影响了叶际细菌菌群结构和丰度,阴香叶片中的龙脑含量越高则叶际细菌菌群多样性随着叶片成熟后越容易发生变化。; 张宏博李兵钟泳林张谦何波祥汪迎利侯晨殷祚云; 关键词：龙脑生物多样性

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