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基于综合抗性基因数据库研究介导幽门螺杆菌对克拉霉素和左氧氟沙星耐药的易感基因被引量:3
2022年
目的以拥有不同抗菌药物耐药性的幽门螺杆菌(H.pylori)临床菌株为研究对象,基于全基因组测序探索H.pylori对克拉霉素和左氧氟沙星(LVX)耐药相关新基因。方法纳入2016年9月1日至2019年8月31日在香港大学深圳医院消化及肝脏科因上消化道相关症状就诊且13C尿素呼气试验阳性的1749例患者,在行胃黏膜活体组织检查后进行胃黏膜组织H.pylori分离培养,成功保存H.pylori菌株90株。依据体外药敏试验结果,分别筛选克拉霉素单耐药(克拉霉素组)10株,LVX单耐药(LVX组)10株,克拉霉素和LVX双重耐药(双重耐药组)10株,克拉霉素、LVX、阿莫西林、呋喃唑酮、四环素、甲硝唑全敏感(全敏感组)10株,总计40株H.pylori菌株。通过全基因组测序,与综合抗性基因数据库(CARD)进行比对,分析单核苷酸变异(SNV)和插入缺失突变情况,筛选H.pylori对克拉霉素和LVX耐药相关基因并分析耐药相关新基因在4组间的表达差异。统计学方法采用独立样本t检验、单因素方差分析、最小显著差数法和卡方检验。结果克拉霉素组、LVX组、双重耐药组、全敏感组SNV位点数[(74952.00±8755.21)、(77128.10±3191.35)、(78639.90±601.23)、(77474.60±2421.05)个]和插入缺失突变数[(2582.20±265.45)、(2653.60±108.37)、(2667.10±43.82)、(2641.10±80.25)个]比较差异均无统计学意义(均P>0.05)。与CARD进行比对,共检出223个耐药相关基因,其中克拉霉素组克拉霉素单耐药相关基因19个,LVX组LVX单耐药相关基因24个,双重耐药组中有克拉霉素单耐药相关基因16个,LVX单耐药相关基因14个,双重耐药相关基因12个;全敏感组中有克拉霉素单耐药相关基因11个,LVX单耐药相关基因17个,双重耐药相关基因13个。克拉霉素单耐药相关基因中,红霉素酯酶基因(ere)B在克拉霉素组、LVX组、双重耐药组、全敏感组的检出率(0/10、0/10、3/10、0/10)比较差异有统计学意义(χ^(2)=5.79,P=0.049);红�
吕涛倪丽陈川孙洋洋赵培微吴娟张嘉盛司徒伟基
关键词:螺杆菌克拉霉素左氧氟沙星
一种基于提高烟草综合抗性的病害防治方法
本发明提供一种基于提高烟草综合抗性的病害防治方法,所述防治方法包括育苗前期消毒、育苗期间消毒、还苗期防治、生长期防治。采用本发明的防治方法,提高烟苗自身抗性,烟田病毒病发病率为5‑5.5%、烟草花叶病发病率6.5‑6.8...
郭全伟张英华聂威薛博王术科杜传印宋岗
198份小麦种质资源赤霉病综合抗性鉴定及其FHB1抗性基因检测被引量:6
2021年
选取26份小麦地方品种,75份黄淮麦区小麦改良品种,97份长江中下游麦区小麦改良品种,采用单花滴注法进行赤霉病抗性鉴定并调查供试品种的穗长、株高、千粒质量和小穗密度等农艺性状。结果表明,鉴定筛选到抗病品种2个,中抗品种(系)35个,中感品种(系)77个,高感赤霉病的品种(系)84个。利用FHB1分子标记对供试小麦进行检测。其中在Fhb1位点上表现为抗病性基因型(Fhb1+)的小麦品种(系)33个,在Fhb1位点上表现为感病性基因型(Fhb1-)小麦品种(系)165个,且呈抗病基因型品种与感病基因型品种的平均病小穗率差异显著(P<0.05)。FHB1分子标记检测结果为阳性的小麦品种赤霉病抗性显著高于检查结果为阴性的小麦品种。此外,筛选得到抗性达到中感及以上水平的小麦品种(系)114个,考察农艺性状发现扬麦18、宁麦19、宁麦8号、扬麦12、等18个品种(系)农艺性状优良,可作为小麦赤霉病育种的亲本选用。
贾宝森徐锐熊泽浩高德荣王书平王晓玲方正武
关键词:小麦赤霉病农艺性状
蚕豆锈病综合抗性鉴定方法
本发明涉及及一种蚕豆锈病综合抗性鉴定方法,属于农业育种技术领域。该方法包括菌源收集及混合孢子悬浮液的制备、蚕豆材料的准备及播种、温室内蚕豆锈病苗期接种及温湿度设置、温室蚕豆锈病成株期抗性鉴定四大步骤。本发明在温室的可控环...
于海天王丽萍吕梅媛何玉华杨峰胡朝芹唐永生牛文武杨新王玉宝
文献传递
一种基于高光谱图像的小麦品种赤霉病综合抗性鉴定方法
本发明公开了一种基于高光谱图像的小麦品种赤霉病综合抗性鉴定方法,该方法以不同品种感染赤霉病病菌小麦麦穗为研究对象,综合运用高光谱成像技术、光谱学、时间序列分析、深度学习等诸多领域的知识,提出了:针对感染未发病期小麦品种抗...
梁琨闫胜琪韩东燊徐剑宏赵康怡周佳英
文献传递
黄淮冬麦区小麦主栽品种赤霉病综合抗性鉴定及其FHB1抗性基因检测被引量:6
2020年
本研究明确了黄淮冬麦区主栽小麦品种对赤霉病的抗侵染、抗扩展、抗毒素积累和抗籽粒侵染能力以及几种抗性之间的相互关系,并检测了各品种是否带有FHB1抗性基因,旨在为该区小麦赤霉病抗性鉴定评价、抗性品种培育和利用提供科学依据。小麦赤霉病综合抗性鉴定结果表明:22个黄淮冬麦区主栽品种中,有20个为感病品种,只有‘郑麦9023’和‘西农979’为中感品种,所有品种均不含FHB1基因;长江中下游麦区的9个品种中,‘扬麦17’和‘宁麦9号’等6个品种表现中抗,‘扬麦23’表现中感,‘苏麦3号’和‘扬麦21’表现抗,‘扬麦14’‘扬麦17’和‘扬麦23’不含有FHB1基因,其他品种均含FHB1基因。小麦品种的抗扩展能力与抗侵染能力无显著相关性(r=0.27,P>0.05);两种接种条件下小麦品种的病粒率与抗脱氧雪腐镰刀菌烯醇(DON)毒素积累能力呈极显著正相关(r=0.86,P<0.01;r=0.88,P<0.01);单小花滴注法接种条件下,小麦品种的平均病级与病粒率和籽粒中DON含量都呈极显著正相关(r=0.71,P<0.01;r=0.81,P<0.01);喷雾接种条件下,小麦品种的病小穗率与平均病级、病粒率、籽粒中DON含量和ZEN含量都呈极显著正相关(r=0.78,P<0.01;r=0.73,P<0.01;r=0.78,P<0.01;r=0.63,P<0.01)。在毒素积累抗性上,DON含量和ZEN含量呈极显著正相关(r=0.70,P<0.01)。在目前黄淮冬麦区没有中抗品种的情况下,可以增加育种和鉴定目标为抗籽粒侵染和抗毒素积累的品种,在小麦品种推广过程中加以运用,可以达到较好的效果。
徐飞王俊美杨共强宋玉立刘露露李丽娟李亚红韩自行张姣姣
关键词:赤霉病病粒率脱氧雪腐镰刀菌烯醇
一种基于高光谱图像的小麦品种赤霉病综合抗性鉴定方法
本发明公开了一种基于高光谱图像的小麦品种赤霉病综合抗性鉴定方法,该方法以不同品种感染赤霉病病菌小麦麦穗为研究对象,综合运用高光谱成像技术、光谱学、时间序列分析、深度学习等诸多领域的知识,提出了:针对感染未发病期小麦品种抗...
梁琨闫胜琪韩东燊徐剑宏赵康怡周佳英
文献传递
水稻新品种对稻瘟病和稻曲病的综合抗性评价被引量:3
2018年
为明确水稻品种对稻瘟病和稻曲病的抗病性,本研究通过室内人工接种和田间病圃自然诱发法开展101个水稻新品种对稻瘟病和稻曲病的抗性评价。结果表明,水稻品种在室内人工接种和田间自然诱发的抗瘟性表现相近;FJSM-25(元优2105)、FJSM-26(元优919)、FJSM-70(春优84)等43个水稻新品种对稻瘟病抗性较好;FJSM-21(绿两优2740)、FJSM-23(瑞优178)、FJSM-24(宜优嘉7)等33个水稻新品种对稻曲病抗性表现较好;FJSM-1(广优1029)、FJSM-11(天丰优110)、FJSM-25(元优2105)等9个水稻新品种对稻瘟病和稻曲病均具有较好的抗性。调查还发现,田间病圃水稻稻瘟病和稻曲病的混合发生的比率较高,达92%以上。
曾慧芳
关键词:水稻新品种稻瘟病稻曲病抗性评价
薄皮甜瓜对南方根结线虫的综合抗性评价被引量:2
2017年
目的:研究南方根结线虫对薄皮甜瓜幼苗生长、发病指数的影响,对6种不同品种薄皮甜瓜的综合抗性作出评价。方法:采用6个不同品种的薄皮甜瓜为实验材料,采取盆栽人工接种方式,通过对甜瓜幼苗的植株鲜重、根瘤数、根结指数、卵粒指数、病情指数、根系电导率、根系MDA含量进行测定,并利用隶属函数对此进行综合分析。结果:接种南方根结线虫45 d后,不同品种的甜瓜幼苗长势、发病指数等差异较大。结论:地方栽培的常规品种中,‘九道沟’与‘羊角酥’甜瓜对南方根结线虫的抗性较强,‘绿宝石’、‘苹果酥’以及‘海南3号’甜瓜对南方根结线虫抗性居中,‘甜宝’甜瓜对南方根结线虫的抗性最差。
郭远远陈杰高青海
关键词:薄皮甜瓜根结线虫抗性评价
转ClCBF1基因地被菊的综合抗性研究
菊花(Chrysanthemum morifolium)为我国传统名花,在全世界各地受到广泛栽培。地被菊是菊科地被菊属宿根草本植物,经过人工杂交选育所得,开花密集,花期长,抗逆性强,是城市园林绿化的优良地被植物。目前有关...
张雨
关键词:抗性育种生理特性

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作品数:275被引量:230H指数:5
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