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细颗粒物2.5致癌作用的研究进展
2024年
大气细颗粒物(PM)2.5来源广泛,组成成分复杂,其表面积较大,可与有害物质结合,通过直接摄入、皮肤接触、呼吸作用等途径进入人体,对人体健康造成严重危害。PM2.5可通过诱导细胞氧化应激、炎症反应等,造成组织损伤、纤维化,促进肿瘤的发生发展。近年来的研究表明,长期暴露于PM2.5污染的空气中,人类呼吸系统、心血管系统以及肿瘤等疾病的负担日益增加,PM2.5对健康的影响应该引起人们的重视。本文对PM2.5的致癌成分、致癌作用以及PM2.5暴露与肿瘤发生发展的关系进行综述,以期为PM2.5致癌机制的研究和肿瘤防治工作提供参考。
黄兰川刘进于鹏蔡永林
关键词:肿瘤致癌作用
ACAA2在人卵巢癌中的致癌作用及调控机制
背景:卵巢癌是一种恶性肿瘤,原发于卵巢上皮、生殖细胞、性腺间质和非特异性间质。被誉为“妇癌之王”,卵巢癌是女性生殖系统恶性肿瘤中致死率最高的一种。但是其早期症状并不明显,容易被忽略,因此被称为女性的“沉默的杀手”。在妇科...
冷亚徽
关键词:卵巢癌OGT
分析泛素特异性蛋白酶5在不同肿瘤中的致癌作用
2024年
目的分析泛素特异性蛋白酶5(USP5)在不同肿瘤中的致癌作用,为临床治疗提供参考。方法利用癌症基因组图谱(TCGA)、基因型组织表达(GTEx)、基因表达谱交互式分析2(GEPIA2)分析USP5 mRNA在不同肿瘤中的表达情况,USP5与不同癌症患者病理分期的相关性。利用GEPIA2数据库分析USP5表达与不同癌症患者预后的相关性。利用cBioPortal数据库分析USP5基因变异情况。利用UCLCAN数据库分析USP5磷酸化水平。利用TIMER2数据库分析USP5表达与肿瘤相关成纤维细胞(CAFs)免疫浸润的相关性。利用STRING、GEPIA2、注释、可视化及综合发现(DAVID)数据库构建USP5相关基因的富集图。结果USP5在多种肿瘤中的表达显著增高,而在急性髓性白血病(LAML)中表达显著降低;USP5蛋白在乳腺癌(BRCA)、结肠腺癌(COAD)、胶质母细胞瘤(GBM)、肺腺癌(LUAD)及胰腺癌(PAAD)中表达明显偏低;USP5蛋白在肾透明细胞癌(KIRC)、肺鳞癌(LUSC)及卵巢癌(OV)中表达明显偏高;USP5表达与BRCA、KIRC、肝细胞癌(LIHC)、LUAD、OV及PAAD的病理分期之间存在显著关系(均P<0.05)。USP5的高表达与LAML、LUAD、皮肤黑色素瘤(SKCM)及葡萄膜黑色素瘤(UVM)的总体生存率(OS)呈正相关(均P<0.05)。子宫内膜癌(UCEC)中USP5的改变频率最高,主要改变类型为突变;子宫癌肉瘤(UCS)中USP5改变频率次高,主要类型为“扩增”。进一步分析USP5的额外突变和位置,未获得主导性的遗传改变,遗传改变的位置较少。USP5在COAD、GBM等肿瘤中显著的去磷酸化。宫颈鳞状细胞癌(CESC)、头颈部鳞状细胞癌(HNSC)、HPV阴性HNSC的CAFs与USP5水平呈正相关(均P<0.05)。“核部分”“核腔”“剪接体”“泛素介导的蛋白水解”可能参与USP5在肿瘤发生中的作用。结论USP5表达水平与生存预后、基因突变、免疫浸润及与USP5相关基因富集之间有相关性,有助于从多个方面了解USP5在肿瘤发生和发展中的作用,为今后�
张骋刘同刚
关键词:肿瘤基因突变
7-脱氢胆固醇还原酶在人类肿瘤中致癌作用的泛癌分析
2024年
探究DHCR7(7-脱氢胆固醇还原酶)基因在肿瘤里的表达概况,以及临床预后关联情况。方法 采用数据库(TCGA和GEO)的数据研究DHCR7在癌组织和癌旁组织里的表达差异情况,采用GEPIA2数据库里分析DHCR7不同表达情况肿瘤患者的OS(总生存率)和DFS(无病生存率);使用cBioPortal工具分析肿瘤的蛋白质结构的改变频率、突变位点信息及类型、copy number changes (CNA)和3D (three-dimensional)结构数据;使用TIMER2数据库分析DHCR7的表达与所有TCGA数据库中肿瘤免疫浸润的关系。结果 与正常组织相比,DHCR7的表达水平在大多数人类肿瘤中增加,在几种原发性肿瘤组织中DHCR7的蛋白有更高的表达;DHCR7表达的升高与CESC、HNSC、BLCA和UVM癌症的的不良预后有关;DHCR7的最高改变频率在食管腺癌患者中约为22%,在不同类型的遗传改变中,扩增是最常见的类型;免疫细胞浸润分析结果显示DHCR7的表达与HNSC中CD8+ T细胞的浸润之间负相关。结论 DHCR7的表达水平在大多数人类肿瘤中升高,并且和临床不良预后紧密相关,DHCR7的表达的升高影响了肿瘤中免疫细胞的浸润,因此其可能作为肿瘤治疗新靶点。
吴芬芬吴家棋陈晓文徐宇
关键词:临床预后
细胞分裂周期相关蛋白5(CDCA5)在人类肿瘤中致癌作用的泛癌分析
2024年
CDCA5高表达已被发现在多种肿瘤中具有致癌作用.运用生物信息学方法探讨CDCA5在泛癌中的表达特征,通过TCGA和GTEX数据库获得CDCA5在肿瘤样本和癌旁样本中的表达情况,从基因表达、生存分析、基因变异和免疫浸润等方面探讨了CDCA5在不同肿瘤发病机制中的作用;通过GSCA(Gene Set Cancer Analysis)分析CDCA5表达与药物IC_(50)(半数抑制浓度)的关系并用免疫组化验证了该基因;通过STRING和GEPIA2数据库获取与CDCA5相关的基因并进行KEGG(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes)富集分析.结果表明:CDCA5在大多数肿瘤中高表达,且与部分肿瘤患者的预后存在明显的相关性.CDCA5表达与肿瘤浸润免疫细胞(TIICs)显著相关并且TIICs标记物表现出不同的免疫浸润模式.拷贝数变异(CNV)与CDCA5的表达呈正相关,甲基化与CDCA5的表达呈负相关.IC_(50)数据显示多种药物可显著抑制CDCA5的表达.免疫组化实验证实了CDCA5在肝恶性肿瘤和结肠恶性肿瘤中具有促癌作用,可作为肿瘤治疗的生物标志物,为肿瘤治疗提供了一种新的研究方向.
陈铭丁勇高振国
关键词:肿瘤
TCGA数据库分析EGFR在结直肠癌中的分子特征、致癌作用以及相关免疫和药物基因组学特征
2024年
目的 探讨EGFR在结直肠癌中的分子表达与结肠癌增殖转移,肿瘤免疫和肿瘤信号通路以及肿瘤预后中的作用。方法 从TCGA数据库下载结直肠癌的mRNA表达数据和癌旁组织及对应的临床资料数据,使用在线网站TIMER2.0分析泛癌中EGFR的表达情况;使用Deseq2程序包分别对miRNA和mRNA的表达数据进行差异基因筛选,采用Spearman相关性分析,探讨EGFR与上述因素在泛癌中的相关性;单样本基因集富集分析(single sample gene set enrichment analysis, ssGSEA)推断肿瘤浸润免疫细胞的丰度;用pRRophetic包估计代表药物反应的半抑制浓度(IC50)进行癌症药物敏感性评估;使用miRWalk预测EGFR靶向的miRNA并通过miRmap预测结合位点。结果 EGFR与相应的正常样本相比,在大多数癌症类型中表达呈现降低的趋势,包括结直肠癌;在结直肠癌中,EGFR表达与DNA甲基转移酶、DNA错配修复基因、m6A调节因子、TMB和MSI显著相关。EGFR高表达提示结直肠癌患者预后不良。此外,其表达上调与免疫细胞浸润增强、基质和免疫激活增加、肿瘤免疫周期活性升高有关。在EGFR高表达亚群中研究了更高频率的扩增和缺失。经验证,EGFR衍生的基因组模型可靠地预测了患者的预后和药物反应。高EGFR表达亚群中,体细胞更容易发生突变;通过GSEA涉及EGFR的信号通路发现,EGFR参与了多种致癌途径,表明了EGFR的致癌作用;EGFR衍生基因可能在结直肠癌进展中发挥显著作用。结论 本研究结果为指导EGFR在结直肠癌中的作用机制和治疗分析提供了有价值的线索。
金雷唐晓磊顾俊菲
关键词:结直肠癌EGFR
多酚化合物或其衍生物在制备具有抑制电子烟致癌作用的添加剂中的应用
本发明涉及多酚化合物或其衍生物在制备具有抑制电子烟致癌作用的添加剂中的应用,同时提供一种具有抑制电子烟致癌作用的添加剂;所述多酚化合物或其衍生物可通过化学合成、生物技术或从植物中提取获得;所述植物优选唇形科植物如迷迭香。
周楚晗杨舒婷
在人类肿瘤中黏蛋白16致癌作用的泛癌分析
2023年
目的探究黏蛋白16(MUC16)基因在33种人肿瘤组织内的基因及蛋白表达水平,并探讨其临床意义及在肿瘤发生发展中潜在的机制。方法利用癌症基因组图谱(the cancer genome atlas,TCGA)、基因表达综合数据库(gene expression omnibus,GEO)数据集、人类蛋白图谱(human protein atlas,HPA)和一些生物信息学工具来探索MUC16在33种肿瘤类型中的表达情况,分析其与肿瘤预后的关系和相关通路。结果基因表达以及免疫组织化学染色结果显示,MUC16基因在不同肿瘤中表达不同,且在多种常见肿瘤组织中的表达均升高(P均<0.05)。泛癌Cox回归分析表明,MUC16的高表达通常预示着间皮瘤、肺腺癌等6种肿瘤患者的总生存期(OS)更差。对MUC16以及邻近基因进行富集分析显示,MUC16与肿瘤转录失调密切相关。结论MUC16在多种肿瘤中的表达水平与癌旁组织不同,其功能机制与肿瘤转录失调密切相关。
马磊陈静陈静刘翔刘翔
关键词:生物信息学预后分析
ACTA2基因在人肿瘤中致癌作用的泛癌分析
2023年
目的:研究ACTA2基因在人肿瘤组织的表达、预后相关性、基因变异和免疫浸润等情况,进而探究其临床意义。方法:使用TIMER2.0、GEPIA2、HPA数据库及仙桃学术网站,分析各种类型肿瘤组织中ACTA2的表达情况及其与预后的相关性。使用cBioPortal数据库分析ACTA2基因变异情况。使用TIME2.0分析ACTA2在肿瘤中的免疫浸润水平。使用STRING、GEPIA2、Veen网站和R包进行ACTA2相关基因的富集分析。结果:胶质细胞瘤、肝癌、胰腺腺癌等肿瘤组织中,ACTA2高表达与预后不良相关;子宫内膜癌组织中ACTA2低表达与预后不良相关(均P<0.05)。ACTA2最主要的变异类型是拷贝数缺失。ACTA2的表达与多形成性胶质细胞瘤及肺腺癌等的肿瘤相关成纤维细胞浸润水平呈正相关(均P<0.05)。ACTA2相关基因的富集分析显示,肌动蛋白细胞骨架调节、血管平滑肌收缩参与了ACTA2的功能机制。结论:ACTA2表达与临床预后、基因变异及免疫浸润水平相关,ACTA2可能作为多种肿瘤新的生物标记物。
侯佳茂陈东茂戚德峰高兴成
关键词:肿瘤相关成纤维细胞预后肿瘤免疫
TCF3调控linc00152在伯基特淋巴瘤中发挥致癌作用的功能和机制研究被引量:1
2023年
目的探讨TCF3通过linc00152调控Daudi和Raji细胞增殖和凋亡中的功能和机制。方法采用实时定量聚合酶链反应(qPCR)检测linc00152的干扰效率;利用CCK8、Western blotting和流式细胞术检测linc00152对Daudi和Raji细胞增殖和凋亡的影响;ChIP-PCR检测TCF3与linc00152的启动子区结合;qPCR和Western blotting检测TCF3的干扰效率;qPCR检测TCF3对linc00152表达水平的影响。结果在Daudi和Raji细胞中siRNA能成功干扰linc00152的表达;CCK8结果显示,干扰linc00152能抑制Daudi和Raji细胞增殖,Western blotting和流式结果显示干扰linc00152能促进细胞凋亡(Daudi:35.30±2.84 vs.6.95±0.82;Raji:33.17±2.18 vs.6.47±0.38);ChIP-PCR结果显示,TCF3能与linc00152的启动子结合;qPCR和Western blotting结果显示,TCF3的mRNA和蛋白水平均能被siRNA成功干扰;在Daudi和Raji细胞中,si-TCF3能降低linc00152的表达量(Daudi:0.509±0.048 vs.0.906±0.146;Raji:0.502±0.052 vs.0.966±0.103)。结论linc00152能促进Daudi和Raji细胞增殖,抑制细胞凋亡,可能与TCF3对linc00152的调控有关。
魏小芳陈巧琳冯友繁伏媛刘菲张雯洁陈阳赵阳阳黄秀娟张启科
关键词:伯基特淋巴瘤增殖凋亡

相关作者

付玉娥
作品数:33被引量:4H指数:1
供职机构:中国海洋石油总公司
研究主题:精制油 芳烃含量 致癌作用 白土 抽提
安艳
作品数:161被引量:274H指数:9
供职机构:苏州大学
研究主题:砷 氧化应激 亚砷酸钠 细胞恶性转化 恶性转化
杨秉辉
作品数:769被引量:1,739H指数:14
供职机构:复旦大学上海医学院
研究主题:癌症 健康 肝癌 心脑血管病 肝肿瘤
刘起展
作品数:169被引量:430H指数:10
供职机构:南京医科大学公共卫生学院卫生毒理学系
研究主题:亚砷酸钠 恶性转化 脂质过氧化 砷中毒 氟中毒
张祥宏
作品数:282被引量:1,260H指数:20
供职机构:河北医科大学第二医院
研究主题:杂色曲霉素 胃肿瘤 脱氧雪腐镰刀菌烯醇 乳腺癌 免疫组织化学