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药物设计: 高等学校应用化学专业系列教材:本书内容分为四大部分。前两章介绍了药物设计的概况及一些必备的基础知识；第三章和第四章分别介绍了经验层面的两个药物设计原理——生物电子等排原理和前药原理；第五至第八章对计算机辅助药物设计的一些...; 俞庆森; 关键词：药物

通过计算机辅助的药物设计系统: 本发明公开了通过计算机辅助的药物设计系统，所述的系统模块包括用户界面、数据输入、数据处理、药物设计、结果输出、系统性能等模块，所述的用户界面输出端为数据输入，所述的数据输入输出端为数据处理，所述的数据处理输出端为药物设计...; 王志豪于长永

人工智能与分子模拟在药物设计中的研究进展被引量：2: 2024年; 随着现代药物研究的不断深入,传统计算机模拟已经不能满足未来药物设计实验的需求。分子模拟作为传统计算机模拟的经典技术之一,可以构造分析复杂的分子模型,研究分子运动的动态过程,但模拟结果受人为因素影响大,准确度较低。近年来,人工智能与分子模拟技术的融合成为药物设计研究的新方法。人工智能技术利用大数据筛选出对应的化合物进行分子模拟,并将模拟结果反馈给人工智能系统进行学习,不断优化人工神经网络。联用人工智能与分子模拟技术,提高了药物设计研究的效率,降低了人为因素对模拟结果的影响,增加了模拟结果的可信度。该文总结了当前国内外应用人工智能和分子模拟技术进行药物设计的研究成果,以期为未来药物研发从计算机辅助药物设计(CADD)向人工智能辅助药物研发(AIDD)的转变提供参考。; 张民权龚铭城陈泽锴陈振华周良良; 关键词：分子模拟人工智能药物载体药物设计

用于药物设计的方法、装置、设备、介质和程序产品: 本公开的实施例提供了用于药物设计的方法、装置、设备、介质和程序产品。用于药物设计的方法包括获取表示蛋白质三维结构的蛋白质数据和表示待与蛋白质三维结构结合的初始分子的初始分子数据。该方法还包括：基于蛋白质数据和初始分子数据...; 乔楠任飞霄林歆远熊招平邱静

一种基于化学反应和分子砌块的靶向药物设计方法: 本发明公开了一种基于化学反应和分子砌块的靶向药物设计方法，其特点是充分考虑药物设计过程中的合成性问题，将化学砌块转化为合成子，构建合成子数据库，再通过在蛋白质口袋中进行虚拟合成反应进行药物设计。在分子设计阶段，该方法重点...; 张跃庆张芝晗潘肖林张增辉季长鸽

计算机辅助药物设计筛选嗜水气单胞菌AhyⅠ合成酶抑制剂: 2024年; 【背景】AhyⅠ合成酶在嗜水气单胞菌(Aromonas hydrophila)群体感应调控毒力产生中发挥着关键作用。【目的】研究其结构以寻找高效抑制剂,切断细菌致病性的源头,具有极其重要的意义。【方法】利用已解析的蛋白质结构为模板,运用同源模建和分子动力学模拟手段,成功建立了AhyⅠ合成酶的三维结构。接下来,基于先前研究的基础,选取2个高效抑制剂N-3-氧代己酰基高丝氨酸内酯(N-3-oxo-hexanoyl-homoserine lactone,NOO)和5-脱氧-5-甲硫腺苷(5'-deoxy-5'-methylthioadenosine,MTA)以及传统中药中的部分活性成分,共选取214个候选配体与受体蛋白进行分子对接。【结果】筛选出4个潜在抑制剂,经过最小抑菌浓度(minimal inhibit concentration, MIC)值、生长曲线、紫色菌素、生物膜形成、胞外蛋白酶、群集运动和泳动实验验证后,发现青蒿素可以作为嗜水气单胞菌群体感应系统的高效抑制剂。【结论】传统中药青蒿素为水产养殖业中嗜水气单胞菌的有效防治提供基础,在治疗细菌感染方面具有广阔的应用前景。; 奉玉欣李冰昕邹飘张耘泽孙维宝刘家璇宋杰耿辉熊丽; 关键词：嗜水气单胞菌计算机辅助药物设计

计算机辅助药物设计课堂教学研究: 2024年; 计算机辅助药物设计是一门受到广泛关注的交叉学科,在药学、医学、生物学、化学等领域有着重要的应用。文章分析计算机辅助药物设计课程教学存在的主要问题,并结合课程特点和课程内容进行精心安排,提出有别于常规的教学方法和评价策略。; 梁立唐凌凯李思瑶胡建平; 关键词：计算机辅助药物设计教学改革课程教学

以天然产物吴茱萸碱为先导结构的抗肿瘤药物设计策略研究进展: 2024年; 天然产物是发现抗肿瘤药物的重要来源,吴茱萸碱作为传统中药吴茱萸的有效成分,具有微弱的抗肿瘤活性,近年来,以其为先导结构开展的药物研究发现了多个高活性抗肿瘤候选药物,取得了较为显著的研究进展。本文综述了以吴茱萸碱为先导结构开展的抗肿瘤药物设计策略的研究进展,以期为以天然产物为先导结构的新药开发提供借鉴和参考。; 夏哲炜孙驭航黄天乐孙华陈玉平盛春泉武善超; 关键词：吴茱萸碱药物设计结构优化抗肿瘤

中医药院校计算机辅助药物设计课程改革与实践: 2024年; 计算机辅助药物设计(CADD)主要是以数学、药物化学、生物化学、分子生物学、结构化学等学科为基础,以量子化学、分子力学等为理论依据,借助计算机进行合理的药物设计。它不仅仅是交叉理论学科,更具有很强的实践性。计算机辅助药物设计技术在中药活性成分筛选、靶标发现、毒性预测、处方作用机制研究等方面已表现出独特优势。学科交叉是科技与医学高速发展的大势所趋,在传统中医药理论指导下,借助计算机辅助药物设计结合现代生物学进行中医药理、法、方、药的研究,可以促进中医药研究的广度与深度。让中医药院校学生学习计算机辅助药物设计的理论及实践知识,可为日后跨学科助力药物研发做好准备。因此,在中医药院校开展计算机辅助药物设计等交叉性强的课程有助于中医药多学科交叉复合型人才的培养,建立适合中医药院校学生的计算机辅助药物设计授课模式对深入发掘中医药宝库中的精华,加快推进中医药现代化具有极大作用。基于此,本文结合自身教学经验及时代发展特点,在计算机辅助药物设计课程的授课过程中引入注重基础、衷中参西、重视实践等教学理念,在培养中医药多学科交叉复合型人才过程中取得较为明显的效果。通过对中医药专业计算机辅助药物设计的教改和实践进行深层次、全方位探讨和总结,可提升本课程的教学效果,为培养复合型中医药人才、拓宽中医药院校大学生的就业渠道奠定基础。; 靳晓杰; 关键词：计算机辅助药物设计中医药院校教学改革

基于深度学习和树搜索的计算机辅助药物设计系统和方法: 本发明提供一种基于深度学习和树搜索的计算机辅助药物设计系统和方法，该系统包括：受体‑配体特征学习模块，采用层次化跳跃连接Transformer神经网络，对蛋白质受体残基序列和配体SMILES序列进行多层次的特征抽取和融合...; 钱浩林铖赵登伟涂仕奎徐雷

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