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- 融合标签相关信息的不平衡多标记蛋白质亚细胞定位预测方法研究
- 蛋白质通常在核糖体中合成,它们在生物体的生长、发育和繁殖等活动中发挥着至关重要的作用。每种蛋白质会通过细胞的分泌途径或者内质网途径运送到特定的亚细胞位置,只有当蛋白质在各个亚细胞结构中正确分布时,其功能才能正常表达;否则...
- 闫梓铭
- 基于融合特征和多标签深度森林模型的多位点蛋白质亚细胞定位预测方法研究
- 蛋白质是生物体中不可或缺的有机分子,维持着生命的正常活动,在现代生物医学中具有重要的研究价值。研究表明多位点蛋白质具有更为复杂的生物学功能,预测多位点蛋白质亚细胞定位对解释生命现象以及设计和开发相关疾病的药物具有重要意义...
- 杨红日
- 关键词：特征提取多特征融合
- 基于机船学习的农作物蛋白质亚细胞定位预测研究
- 蛋白质亚细胞定位预测有助于帮助研究者了解农作物蛋白质性质和功能、理解农作物表型性状产生的原因、对开发新药物等方面有着很大的促进作用。为了更加精准、快速地解决农作物蛋白质亚细胞定位问题,研究者将研究方法从传统的实验手段逐步...
- 李佳楠
- 关键词：蛋白质亚细胞定位多特征融合SVM算法集成分类器
- 多标记学习的蛋白质亚细胞定位预测
- 蛋白质是根据肽链空间折叠而得到的一种有机化合物，作为人类细胞和组织的重要组成部分，为维持人体正常的生命活动提供所需的营养物质。它只有定位在正确的亚细胞上才能发挥作用，因此，准确定位蛋白质所处的亚细胞位置是发挥蛋白质功能的...
- 靳淑平
- 基于机器学习的蛋白质亚细胞定位预测方法被引量：1
- 2022年
- 蛋白质亚细胞定位预测有助于了解蛋白质性质和功能,理解蛋白质复杂的生理过程和调控机理,对开发新药物等方面有着很大的促进作用。随着人类在蛋白质组学方面研究的不断深入,蛋白质序列数据量呈指数式增长,单纯依靠传统的试验方法已无法满足生命科学研究的需要,于是人们将蛋白质亚细胞定位的研究方法转向了机器学习领域,研究机器学习算法变得越来越重要。从蛋白质序列特征的刻画、预测算法、算法评价3个方面阐述现阶段蛋白质亚细胞定位预测的研究进展。最后,总结蛋白质亚细胞定位预测方法方面取得的成果及需要不断完善的3个方面(特征选择、数据处理和改进算法),并提出了未来机器学习在提高预测性能方面的研究重点及重要意义。
- 李佳楠李卓滕小华高兴泉唐友
- 关键词：蛋白质亚细胞定位
- 基于深度时间卷积网络的蛋白质亚细胞定位预测研究
- 蛋白质亚细胞定位可以为揭示致病机制、疾病治疗以及药物设计提供非常有价值的信息。随着生物数据库中蛋白质序列的快速积累,基于机器学习与深度学习的蛋白质亚细胞定位方法成为近年来的研究热点。然而,蛋白质序列的高复杂性使得现有的一...
- 崔文志
- 关键词：蛋白质亚细胞定位预测
- 基于多标记学习的蛋白质亚细胞定位预测研究综述被引量：2
- 2021年
- 确定蛋白质的亚细胞位置对了解胞内蛋白质功能以及药物设计具有重要作用。利用机器学习手段进行蛋白质亚细胞定位预测可以有效弥补传统实验手段耗时费力的不足。有些蛋白质同时存在于多个亚细胞位置中,或者游走于不同亚细胞之间,以实现其生物学功能,因此,蛋白质亚细胞定位预测实际上是一种多标记学习问题。本文主要从蛋白质序列的特征提取方法和多标记学习算法两方面归纳和阐述,最后从蛋白质序列特征提取,非平衡数据集和标记相关性三个方面提出进一步研究方向。
- 余静张靖
- 关键词：蛋白质序列多标记学习特征提取
- 基于机器学习的蛋白质亚细胞定位预测
- 随着数据库中蛋白质序列的指数增长,传统生物相关的预测算法面临一系列挑战.大数据时代的来临为处理批量数据提供了机遇.另外,如何通过蛋白质序列特征预测其所在亚细胞位置是蛋白质组学一项重要的研究内容,不仅可以帮助我们更好的了解...
- 谢新蒙
- 关键词：亚细胞定位
- 文献传递
- 基于特征融合与平衡数据集的蛋白质亚细胞定位预测研究
- 2021年
- 确定蛋白质的亚细胞位置对于了解蛋白质的功能以及药物设计具有重要作用。在后基因时代,测序序列呈现爆发式增长,而传统实验手段无法满足海量蛋白质的亚细胞定位需求。将蛋白质亚细胞定位问题引入到机器学习领域可有效解决该难题。本文提出基于PSSM-MLSMOTE方法的革兰氏阴性菌蛋白质亚细胞定位预测。首先使用AAO和PSSM-AAO方法对蛋白质序列进行特征提取,并将两种算法融合。然后采用MLSMOTE方法平衡数据集,最后将处理后的数据集输入MLkNN算法分类器中预测蛋白质的亚细胞位置。通过jackknife检验,总体召回率可达到83.4%,此模型能够有效预测蛋白质的亚细胞位置。
- 余静张靖
- 关键词：蛋白质序列革兰氏阴性菌
- 基于进化信息和特征融合的蛋白质亚细胞定位预测研究
- 测序技术的发展让生物序列的数目持续增长，为人类进行生命探究提供了丰富的原材料，但与此同时也带来了更大的挑战：在巨额的生物数据面前，传统的实验方法显得愈加力不从心。快速发展的生物信息学理论为生物数据挖掘提供了支持，通过生物...
- 杜蕾
- 关键词：亚细胞定位降维算法
- 文献传递
