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- 一种用于亚细胞蛋白质定位的多视角多分类方法
- 本发明公开了一种用于亚细胞蛋白质定位的多视角多分类方法,首先训练优化学习分类器模型,然后通过优化后的学习分类器模型预测蛋白质在细胞内的位置;而在训练优化学习分类器模型时,对亚细胞蛋白质定位的训练数据进行多视角分析,将含有...
- 钟光正肖燕珊刘波
- 四种机器学习算法预测大豆蛋白质定位对比研究被引量:1
- 2022年
- 为探索不同缺失程度大豆蛋白质亚细胞定位预测的有效方法,提升大豆蛋白质亚细胞定位预测能力,本研究以1万条已知亚细胞定位位置的大豆蛋白质序列数据为研究对象,进行5%、10%、15%、20%和30%不同缺失比例完全随机缺失,分别运用SVM算法、朴素贝叶斯算法和随机森林算法和决策树4种机器学习算法预测缺失序列的亚细胞位置,对原始位置和预测后的位置进行相关性分析,对比分析不同算法的准确性和性能。结果显示:随机森林算法预测的准确率最高;朴素贝叶斯算法的运行速度最快;朴素贝叶斯算法的运行内存最小。在不考虑运行时间和运行内存因素,且对预测的准确率要求较高的情况下,随机森林算法的预测效果要优于另外3种算法;同种情况下,若对运行内存要求较高时,可优先考虑朴素贝叶斯算法。结果说明不同机器学习方法在不同缺失程度的预测需求下的适用性,可应用于大豆蛋白质数据的定位预测。
- 李佳楠高兴泉李卓滕小华黄斌张继成唐友
- 关键词:支持向量机算法朴素贝叶斯算法决策树算法大豆蛋白质
- 一种用于亚细胞蛋白质定位的多视角多分类方法
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- 文献传递
- 不同月龄牦牛睾丸中LYZL4、LYZL6的基因表达及蛋白质定位被引量:3
- 2019年
- 为探讨人源类溶菌酶蛋白4(Human lysozyme-like protein4,LYZL4)和人源类溶菌酶蛋白6(Human lysozyme-like protein 6,LYZL6)在牦牛睾丸中的表达机制,分别选取6、18、30、72月龄健康的牦牛12头(每组3头)采集睾丸组织。应用qRT-PCR、Western-blot和免疫组化技术分别分析了LYZL4和LYZL6在不同月龄牦牛睾丸中的表达和定位。结果显示,在不同月龄牦牛睾丸中均检测到 LYZL4、LYZL 6 基因和相关蛋白质的表达,其基因表达量随着牦牛月龄增加呈现上升趋势。72、30月龄牦牛睾丸中 LYZL4、LYZL 6 基因及蛋白质的表达量极显著高于6月龄和18月龄牦牛( P < 0.01)。LYZL4蛋白在6月龄牦牛睾丸中定位于间质细胞内,在18月龄牦牛睾丸中主要定位于精原细胞和支持细胞内,在30、72月龄牦牛睾丸中定位于圆形精子细胞内。而LYZL6蛋白在6月龄牦牛的睾丸中定位于间质细胞内,在18月龄牦牛睾丸中主要定位于精原细胞内,在30、72月龄牦牛睾丸中定位于圆形精子细胞和初级精母细胞内。 LYZL4和LYZL 6 基因主要在牦牛性成熟后高丰度表达,而在性成熟前相对低丰度表达。因此,在牦牛雄性生殖系统的发育过程以及在精子发生的调控过程中LYZL4和LYZL6均发挥着重要的作用。
- 李忠邦阎萍
- 关键词:牦牛睾丸
- 蛋白质定位技术平台的建立及应用
- <正>1.成果的创新点建立了蛋白质定位全方位研究的复杂体系,特别是创新性地建立了基于细胞微阵列技术的高通量、大规模的多蛋白质定位技术,为功能蛋白质组学研究提供了一种全新的技术手段。同时利用该技术平台在哺乳动物细胞中筛选泛...
- 周涛张学敏梁冰张志毅巩伟丽张飒李慧艳何昆李爱玲
- 文献传递
- 检测重金属胁迫下核仁C23蛋白质定位的免疫荧光方法
- 本发明公开了一种检测重金属胁迫下植物细胞核仁C23蛋白质定位的免疫荧光方法。它是切取重金属处理后的植物根尖分生组织细胞,于4%多聚甲醛中固定1h;采用酶液酶解后;用滴管吸取约0.1ml样品液,均匀涂于载玻片上分散成单个细...
- 刘东华张慧敏张闪闪秦蓉
- 文献传递
- 蛋白质定位标记方法
- 本发明涉及蛋白质定位标记方法,包括N-S酯酰基重组、巯基小分子参与的转酯作用、多肽参与的转酯作用、S-N酯酰基重组,用于蛋白拼接的两条蛋白和多肽,其中一条N-末端必须是Cys,另一条C-末端必须含有硫酯基团(-NR),本...
- 汪弋
- 文献传递
- 快速检测重金属胁迫下核仁蛋白质定位的免疫荧光方法
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- 刘东华秦蓉张闪闪张慧敏
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相关作者
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- 供职机构:山东大学
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- 李坤朋

- 作品数:42被引量:56H指数:3
- 供职机构:山东大学
- 研究主题:玉米 缺失突变体 蛋白质定位 高等植物 甘氨酸甜菜碱
- 张举仁

- 作品数:204被引量:950H指数:20
- 供职机构:山东大学
- 研究主题:玉米 转基因 基因 转基因植株 重组基因
- 何春梅

- 作品数:89被引量:134H指数:7
- 供职机构:山东省农业科学院
- 研究主题:玉米 甘氨酸甜菜碱 甜菜碱 底座 转基因
- 张闪闪

- 作品数:7被引量:0H指数:0
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