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一种大豆根瘤高表达基因及其应用: 本发明公开了一种大豆根瘤高表达基因及其应用。具体地公开了蛋白质GmbHLH93(SEQ ID No.1)及其编码基因在调控植物根瘤形成和/或生长、调控植物根瘤固氮效率和/或培育高效结瘤固氮植物中的应用。实验证明，将大豆中...; 任勃孙宝成王青高晗牛海雨李岩松马群

一种在莲子子叶中瞬时表达基因的方法: 本发明提供了一种在莲子子叶瞬时表达基因的方法，该方法主要包含以下步骤：（1）授粉后9‑15天莲子的选择和子叶的获取；（2）目的基因表达载体的构建；（3）重组表达载体转化到农杆菌；（4）农杆菌注射到莲子子叶。本发明所述的方...; 杨美孙恒宋贺云邓显豹刘娟杨东

用于鉴定和表达基因簇的系统和方法: 本申请涉及用于鉴定和表达基因簇的系统和方法，公开了用于鉴定生物合成基因簇的方法，所述生物合成基因簇包括用于产生与特定靶蛋白质相互作用的化合物的基因。一些方法涉及用于鉴定和/或按优先顺序排列生物合成基因簇的生物信息学方法。...; B·T·纳古藤C·哈维U·施乐驰M·E·海伦梅耶J·霍雷卡

基于分层自注意力机制的差异表达基因预测系统: 本发明公开了基于分层自注意力机制的差异表达基因预测系统，包括：获取模块，获取待测细胞对对应基因的表观遗传学数据；根据表观遗传学数据，构建不同表观遗传因素的输入矩阵；编码模块，将每种表观遗传因素的输入矩阵，输入到第一自注意...; 王峻黄子墨余国先闫中敏崔立真

一种针对家蚕MSG和PSG表达基因的可控编辑方法: 本发明提供了一种针对家蚕MSG和PSG表达基因的可控编辑方法，其通过GAL4/UAS系统，分别构建了若干个在家蚕MSG中特异启动表达的GAL4表达载体和多个在家蚕PSG中特异启动表达的GAL4表达载体，通过将表达Cas9...; 徐汉福刘荣鹏曾文慧马艳罗琴欧瑶马静文唐艺芸胡杰向仲怀

一种耐葡萄糖的β-葡萄糖苷酶及其表达基因和应用: 本发明涉及生物技术领域，尤其涉及一种耐葡萄糖的β‑葡萄糖苷酶及其表达基因和应用。本发明从红树林土壤中筛选到以葡萄糖为底物时可产β‑葡萄糖苷酶的聚多曲霉L1，通过比较转录组的方法筛选聚多曲霉L1分别以葡萄糖、微晶纤维素和纤...; 王学梅刘晓烜孙楠张冰溪张海文管庆丰

加权基因共表达网络分析联合差异表达基因分析法鉴定重度抑郁症关键基因: 2024年; 目的应用加权基因共表达网络分析(WGCNA)联合差异表达基因(DEG)分析法鉴定重度抑郁症(MDD)的关键基因。方法从基因表达数据库中获取MDD患者和健康志愿者死后脑组织mRNA微阵列数据。应用WGCNA和DEG分析法筛选与MDD最显著相关的模块和DEG,对WGCNA模块基因和DEG进行基因本体论富集分析和京都基因与基因组百科全书通路富集分析,取WGCNA模块基因与DEG的交集,绘制受试者工作特征曲线评估交集基因诊断MDD的能力。结果最终获得10个基因(FLJ20021、FLJ30058、NNAT、MRPS12、KCNK4、TROVE2、MESP1、MIF、TMEM93、SYNGR1),均具有良好诊断MDD的潜力。结论 FLJ20021、FLJ30058、NNAT、MRPS12、KCNK4、TROVE2、MESP1、MIF、TMEM93、SYNGR1可作为辅助诊断MDD的生物标志物。; 佘细虹曾智何月婷; 关键词：重度抑郁症受试者工作特征曲线

外周血差异表达基因用于慢性主观性耳鸣客观分型的可行性研究:以高频耳鸣为例: 2024年; 目的探讨联合加权基因共表达网络分析(Weighted Gene Co-expression Network Analysis,WGCNA)及随机森林算法构建基于外周血差异表达基因(differentially expressed genes,DEGs)的主观性耳鸣客观分型模型的可行性。方法2019年10月至2020年6月期间,对中山大学附属第三医院37例慢性主观性高频耳鸣患者(代偿型21例,失代偿型16例)及20名健康志愿者通过高通量测序获得外周血DEGs。采用WGCNA构建不同表达模式的基因模块,并分析各自与耳鸣特征之间的关系。随后采用随机森林算法构建分型模型,并通过受试者工作特征曲线下面积(area under the curve,AUC)、准确度和F1-score对分型性能进行评价。结果12351个组间DEGs被分成9个基因模块,其中MEblue、MEgreen和MEbrown与健康志愿者组呈负相关,MEpink与耳鸣困扰组呈正相关。基于MEblue及MEpink分别构建"耳鸣-正常"及"代偿-失代偿"分型模型,AUC均>0.80,准确度均>90%,F1-score均>0.90,分型性能良好。结论外周血DEGs是慢性主观性耳鸣客观分型的潜在生物学指标,而WGCNA和随机森林算法的联合应用是构建慢性主观性耳鸣客观分型模型的可行方案。但模型的外延、跨数据集性能的验证,以及模型算法的优化仍需进一步探索并完善。; 黎志成方必兴谢津王心怡周靖诗曾祥丽

基于高通量基因表达数据库及生物信息学对坐骨神经痛差异表达基因的分析研究: 2024年; 目的基于高通量基因表达(GEO)数据库及生物信息学筛选坐骨神经痛相关差异表达基因(DEGs),分析其生物学功能,为临床治疗坐骨神经痛提供参考。方法通过GEO数据库获取坐骨神经痛基因芯片(GSE124272)数据集,经仙桃学术软件异质性分析获取坐骨神经痛相关DEGs,对坐骨神经痛相关DEGs进行基因本体论(GO)、京都基因与基因组百科全书(KEGG)的通路富集分析。借助Cytoscape软件实施蛋白质互作网络(PPI)分析获取关键基因,经转录因子调控网络专用数据库(TRRUST)确定关键基因的主要调节转录因子及相应的调节关系。结果415个坐骨神经痛相关DEGs经PPI分析共获取15个关键基因,经TRRUST确定共12个TF协同参与检查点激酶1(CHEK1)、含杆状病毒IAP重复序列蛋白5(BIRC5)、细胞周期蛋白B2(CCNB2)、胸苷酸合成酶(TYMS)、细胞周期蛋白B1(CCNB1)关键基因的调控。结论CHEK1、BIRC5、CCNB2、TYMS、CCNB1可作为坐骨神经痛的新治疗靶点和预防标志物。; 曲艳平贺文廷王旭董浩范智东; 关键词：生物信息学坐骨神经痛差异表达基因

卵细胞特异表达基因ECS制备被子植物单倍体的方法及应用: 本发明公开了一种利用调控卵细胞特异表达基因制备植物单倍体的方法，及该方法在制备被子植物单倍体制备中的应用。卵细胞特异表达的天冬氨酸蛋白酶ecs1 ecs2双突变体能够产生供育种使用的单倍体植株。本发明克服了传统的父本表达...; 孙蒙祥张雪成史册

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