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转录起始位点预测方法的研究进展: 2024年; 详细介绍了计算定位法在转录起始位点(TSS)鉴定中的重要作用,并重点分析了不同计算方法的建模原理、DNA序列特征采集和运行效率等。最后,展望了预测工具的未来发展方向,为有效开展TSS定位及转录调控研究奠定了基础。; 郝瑞杰李星雨马子菡李敏邵燕瑞晋朦朦杨稚萱杨柯华丁依菲李浩哲魏雪锋; 关键词：转录起始位点

从快照到电影:捕捉单核苷酸分辨率的真核生物转录起始过程: 2024年; The process of transcription is generally delineated into three sequential phases:initiation,elongation,and termination.The transition between these phases,particularly from initiation to elongation,requires substantial conformational and compositional reconfigurations within the transcription machinery to enable functional switches.Transcription initiation is characterized by the assembly of a preinitiation complex(PIC).; 尚雪莹徐从玲陈飞; 关键词：TERMINATION

拟南芥叶片和花蕾表达基因转录起始位点的研究: 转录起始位点（Transcription start site，TSS）是5’非翻译区（Untranslated region， UTR）对应到DNA序列上的首个碱基，是基因转录的重要位点。TSS上、下游各50 bp区间...; 单倩茹; 关键词：真核生物转录起始位点

多种癌症的可变转录起始位点系统分析及数据库构建: 可变转录起始位点(Alternative Transcription Start Site,ATSS)是一种重要的转录调控机制,可以产生具有不同5’非翻译区(5’UTR,5’Untranslated Region),或者...; 朱昊天; 关键词：癌症 DNA甲基化转录因子

Sigma54依赖性转录起始被引量：1: 2022年; 作为细菌RNA聚合酶(RNAP)的组成型辅助因子,sigma70和sigma54分别参与了原核细胞不同类型基因的转录起始调控。sigma70负责管家基因的自发转录起始;而sigma54负责应激信号相关的基因转录起始。sigma54与RNAP形成复合物后,会通过空间阻滞的方式阻碍DNA进入RNAP中,抑制基因转录起始。当细胞环境变化后,特定应激信号会通过细菌增强子结合蛋白(bEBP)诱发sigma54的构象发生变化,解除sigma54对RNAP的抑制,启动sigma54依赖的基因转录。最近的结构生物学研究揭示了sigma54依赖性转录起始的若干复合物结构,包括全酶、封闭式复合物、2个中间状态复合物及开放式复合物。通过分析这些转录起始复合物的结构,本文阐述了转录起始过程中复合物的结构变化。描述并分析了sigma54和bEBP在转录起始过程中所发挥的功能。本文有助于了解转录起始分子水平的变化,为深入理解sigma54和bEBP促进转录起始的分子机制提供了参考。; 洪婷梅子青王丰; 关键词：转录调控 RNA聚合酶

一种特定基因转录起始位点的鉴定方法: 本发明公开了一种特定基因转录起始位点的鉴定方法，其特征在于，包括如下的步骤：步骤S1，固相介质支持的特异性反转录引物的制备；步骤S2，使用S1步制备特异性反转录引物，将RNA反转录为cDNA；步骤S3，对S2步骤得到的c...; 郝瑞杰张铭铭李敏李星雨王君陈亚珍张艳玲徐淑雨杜书增; 文献传递

大肠杆菌转录因子σ32介导转录起始的结构机制及其改造: 转录是基因表达的第一步,是生命中最基本的过程之一。RNA聚合酶(RNA polymerase,RNAP)是生物体执行转录的分子机器。细菌RNAP核心酶(RNAP core)本身不具备转录活性,它需要与转录起始因子σ形成全...; 卢强; 关键词：RNA聚合酶转录起始冷冻电镜

转录组水平水稻叶片和花序基因转录起始位点的研究: 转录是基因表达的核心步骤，mRNA-Seq是在转录组水平研究真核生物基因表达的主要技术，但其检测的poly(A)RNA既包括5’端有m7G帽的完整mRNA，也包括降解的、不完整mRNA。m7G帽是核糖体识别mRNA的信号...; 赵淼; 关键词：水稻转录起始位点核心启动子

人巨细胞病毒感染人胚肺成纤维细胞不同时间点的病毒转录起始位点分析: 目的:使用DeepCAGE-seq分析HCMV Han-BAC感染人胚肺成纤维细胞(HELF)不同时间后转录起始位点(TSS)的特点及差异。研究方法:HCMV Han-BAC株以MOI=5感染HELF细胞,分别在感染后1...; 孟祥静; 关键词：人巨细胞病毒转录起始位点核心启动子; 文献传递

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