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基于SNP标记的小麦品种遗传相似度及其检测准确度分析: 2024年; 遗传相似度检测的准确度估计是对SNP标记法在农作物品种检测体系中应用的必要补充和完善。本研究基于2021年小麦品种SNP标记法跨实验室协同验证实验数据,分析了该方法的检测准确度及在品种间的遗传相似度。分析结果表明:(1)10个实验室对55组小麦品种组合的标记位点相似度检测的总体准确度约为98%。(2)GGE双标图的品种遗传关系功能图显示,7组小麦品种的组内遗传相似度在95%以上,其余组合的遗传相似度较低。(3)依据GGE双标图的“正确度-精确度”功能图和“准确度排序”功能图,发现洛旱7号/洛旱11等品种组合的相似度检测准确度较高,晋麦47/临抗11的检测准确度一般,而济麦22/婴泊700的检测准确度较差。(4)10个实验室的检测准确度存在显著差异,其中2个实验室检测的正确度、精确度和准确度表现显著差于其余实验室。(5)各实验室检测正确度的容许误差分布于1.3%~1.9%之间,平均为1.5%;准确度的容许误差分布于1.5%~2.0%之间,平均为1.7%。其中,Lab2和Lab3的检测正确度和准确度的容许误差显著差于其余实验室。本研究构建了SNP标记法对品种相似性检测的准确度统计模型,分析了品种组合和实验室的检测准确度及其容许误差,采用GGE双标图方法对检测正确度、精确度和准确度进行可视化分析,验证了各实验室对品种位点相似性检测的准确度和可靠性,为SNP标记法在农作物品种遗传相似性检测中的准确度评价提供了理论支持和应用范例。; 许乃银金石桥晋芳刘丽华徐剑文刘丰泽任雪贞孙全许栩庞斌双; 关键词：GGE双标图 SNP标记遗传相似度

一种基于遗传相似度的特异性测试近似品种高效筛选方法: 本发明公开了一种基于遗传相似度的特异性测试近似品种高效筛选方法，可以用于小麦、玉米、大白菜、大豆等植物近似品种的高效筛选。该方法首先对申请品种和已知品种采集一组SSR标记或SNP标记的DNA指纹；然后建立已知品种的DNA...; 李汝玉张晗郑永胜孙加梅王鹏王玮段丽丽王雪梅李华; 文献传递

一种新的分子遗传相似度计算方法被引量：11: 2001年; 指出了Nei氏遗传相似度仅仅是用来描述两个二进制变量差异或相似程度的一种距离系数或相似系数 ,与个体间亲缘程度没有必然联系。根据亲缘系数的定义 ,提出新的遗传相似度计算公式即rA(x ,y) =2N2xyNxNy或rA(x ,y) =N2xyNxNy。并通过实例验证了该公式可用于判断个体间亲缘程度方面。; 高会江杨运清潘玉春; 关键词：亲缘系数

金针菇MNP分子标记菌株鉴别技术建立: 2024年; 金针菇Flammulina filiformis是受《植物新品种保护名录》保护的食用菌之一,品种的知识产权保护受到高度重视,迫切需要准确、可靠、稳定和可操作性强的品种鉴别技术为品种知识产权保护提供技术支撑。本研究利用42株金针菇菌株基因组重测序数据构建了包含428个多核苷酸多态性(MNP)分子标记的数据库,并对试验菌株之间的遗传相似度进行分析。结果显示来自国内金针菇企业所用的12个菌株遗传相似度均为100%,暗示国内金针菇生产品种高度同质化;而12个野生菌株间的遗传相似度介于0.23%–29.44%之间(除F17与F18的相似度为100%外),体现了野生金针菇具有丰富的遗传多样性。此外,MNP分子标记的鉴别结果还与拮抗实验和ISSR分子标记的结果进行了比较,体现出MNP分子标记菌株鉴别技术的灵敏度高、稳定性好、工作量小的优势,因此可为我国金针菇品种知识产权保护提供技术支撑。; 吕志文杨环魏传正叶新怡何小钰陶永新谢宝贵谢路昱; 关键词：遗传相似度 ISSR分子标记

一种杉木高世代种子园的配置方法及装置: 本发明属于计算机技术领域，尤其涉及一种杉木高世代种子园的配置方法及装置，方法包括：101、获取杉木高世代种子园的基础信息；102、根据所述基础信息，构建遗传相似度和花期同步相似度的第一计算信息，根据第一计算信息，获取种子...; 张建国段爱国伍汉斌

菠萝液相芯片及其应用: 本发明涉及液相芯片技术，尤其涉及菠萝液相芯片及其应用。本发明开发了一套包含40349个SNP位点的液相芯片，对10个菠萝品种进行检测，位点捕获效率均在98％以上，利用探针进行位点捕获最终获得10个菠萝的SNP位点的基因型...; 陈晶晶陈志辉顾帅磊井敏敏李栋梁戴小红马朝明

菠萝液相芯片及其应用: 本发明涉及液相芯片技术，尤其涉及菠萝液相芯片及其应用。本发明开发了一套包含40349个SNP位点的液相芯片，对10个菠萝品种进行检测，位点捕获效率均在98％以上，利用探针进行位点捕获最终获得10个菠萝的SNP位点的基因型...; 陈晶晶陈志辉顾帅磊井敏敏李栋梁戴小红马朝明

一种高产奶山羊快速育种的智能化构建系统: 本发明公开了一种高产奶山羊快速育种的智能化构建系统，涉及育种智能化构建技术领域，现提出如下方案，包括重测序单元、芯片设计单元、大数据采集单元、数据库构建单元和芯片优化单元；本发明通过物种全基因组重测序技术，分析萨能奶山羊...; 诺苏雅拉图海尔汗吴志红王忠华王建光

水稻种质资源全基因组DNA指纹鉴定方法研究被引量：3: 2023年; 开展水稻种质资源DNA指纹鉴定可以赋予每份种质统一的身份信息,对于查清我国资源家底、评估资源遗传基础、提高资源利用效率和保护种业知识产权等具有重要意义。本研究利用已完成全基因组DNA重测序的5374份水稻种质资源为材料,通过参考样本资源的选择、高质量SNP位点分析以及最优SNP数量和SNP组合的挑选,建立了2套水稻种质资源全基因组DNA指纹标准。通过主成分分析和系统进化树分析,指纹标准1和2选择的SNP可以代表94,197个高质量群体共有SNP进行群体遗传多样性检测;群体遗传相似度分析验证了指纹标准1和2对于开展水稻种质资源遗传相似性鉴定的有效性。本研究有望为水稻种质资源保护与利用以及种业知识产权保护等提供技术支撑,并为其他作物制定全基因组DNA指纹鉴定标准提供参考。; 马小定崔迪韩冰焦成智韩龙植; 关键词：SNP标记指纹图谱遗传相似度

基于GBS-SNP的武夷茶树(Camellia sinensis,Synonym:Thea bohea L.)遗传分析及标记开发被引量：4: 2023年; 为深入了解武夷茶树(Camelliasinensis,异名:TheaboheaL.)的遗传多样性与背景关系,收集126个武夷茶树品种/品系与223个来自12个不同地区的优异茶树品种/品系,共349份茶树资源。采用基因分型测序(Genotyping by sequencing,GBS)技术筛选出973个高质量核心SNP进行茶树遗传多样性及背景关系分析。基于模型的遗传结构(Structure)、系统发育树(NJtree)和主成分分析(PCA)结果表明,349个茶树可分为5个亚群,亚群聚类主要是基于茶树之间的亲缘关系,而不是树型或叶形等形态特征。基因流分析表明,从闽南地区到武夷山地区和武夷山地区到浙江地区存在基因渗入。遗传相似度分析显示,在349个茶树中有136对样本的遗传相似系数大于0.9,其中有26对涉及武夷茶树品种/品系。通过两两比对的辨识度分析,从973个SNP标记中筛选出21个可100%识别349个茶树品种/品系的SNP标记,其中18个SNP标记即可100%识别126个武夷茶树品种/品系,并建立遗传指纹图谱与开发鉴定引物。研究结果为今后武夷茶树种质资源的管理和育种提供有价值的信息。; 李力罗盛财王飞权王飞权冯花石玉涛冯花刘菲石玉涛李舒莹叶江华; 关键词：武夷茶遗传相似度基因流

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