搜索到306篇“ 遗传相似系数“的相关文章
- 基于SSR标记的桃品种遗传多样性分析及遗传相似系数比较被引量:13
- 2017年
- 【目的】利用NCBI数据库中桃的EST信息开发SSR引物,分析成都平原主栽桃品种的遗传多样性,探讨各遗传相似系数在桃SSR分析中的适用性,以期为桃种质资源的研究提供参考。【方法】利用来自NCBI-EST数据库的100对SSR引物对12个不同形态的桃品种进行PCR扩增,分析筛选20对多态性好、稳定性高且均匀分布于桃8个连锁群的引物对40个桃品种进行PCR扩增,并采用5个遗传相似系数分别对扩增结果进行分析。【结果】使用20对引物共检测出68个多态性等位基因位点,每对引物的等位基因数在2~5之间,平均为3.4。多态信息含量在0.36~0.73间变化,平均为0.54。Jaccard相似系数为0.106~1.000;Jaccard系数的共表型相关系数rc最高,为0.772;Dice系数次之,为0.719;Jaccard和Dice系数的系统树一致性最高,CI_c为1。Nei’s基因多样性指数在种级水平上和类群水平上分别为0.603和0.374,相应的Shannon’s信息指数分别为1.041和0.591。40个桃品种在聚类中首先分为观赏桃和食用桃2大类,再细分为各类群,聚类结果与传统系谱基本吻合。【结论】基于NCBI数据库中桃的EST信息开发的SSR引物多态性较好,可用于桃的SSR分析。Jaccard和Dice系数适合桃的SSR分析。桃品种总体遗传多样性较丰富,但水蜜桃品种仍需加强种质创新。
- 叶宇芸王清明马建伟张银平陈其阳汤浩茹张勇
- 关键词:遗传相似系数引物筛选
- 基于月季微卫星标记的7个遗传相似系数比较被引量:7
- 2013年
- 以月季品种的微卫星标记数据为基础,选择7个遗传相似系数对月季品种间遗传相似度进行计算,并采用非加权组平均法(UPGMA)建立相应的系统树。通过遗传相似系数相关性、聚类结果一致性以及拟合优度等分析方法,探讨不同的遗传相似系数在微卫星遗传分析中的适用性。分析数据显示7个系数之间相关系数介于0.726~1.000。共表型相关系数rc介于0.85~0.93,表明品种间遗传差异在基于UPGMA方法的聚类树状图中有良好体现。系统树之间的CIc指数范围为0.468~1.000,表明采用不同相似系数进行聚类分析时,结果存在较大差异。7个遗传相似系数的S统计值介于16.24%~29.90%,RusselandRao系数最低,SimpleMatching等3个系数S值均大于20%。综合考虑分子标记特点、物种杂合度、Kruskal拟合优度等因素,并结合聚类分析与品种谱系比较结果,研究认为Dice系数和Jaccard系数适用于月季的微卫星遗传分析,其次是SimpleMatching系数。
- 黄平崔娇鹏郑勇奇张川红
- 关键词:月季多倍体微卫星标记遗传相似系数聚类分析
- 利用Excel电子数据表计算遗传相似系数的方法被引量:12
- 2005年
- 利用分子标记技术对生物物种群进行类群分类时,一般需要通过分析电泳图谱获得0/1矩阵,通过统计计算来得到其遗传相似系数和遗传距离指数。科学工作者常借助计算器徒手计算,容易出错,速度又慢。本文介绍一种以MicrosoftExcel电子数据表为平台,能较轻松又准确地根据0/1矩阵实现遗传相似系数和遗传距离指数计算的操作方法。
- 艾华水黄路生
- 关键词:遗传相似系数EXCEL表
- 10个白粒玉米自交系配合力效应及同工酶遗传相似系数与杂种优势关系的分析
- 该实验以331<,98-2>、云187A-1等10个玉米自交系为亲本,按Griffing Ⅳ配成45个杂交组合,分析了株高、穗位高、穗三叶叶面积、穗长、穗粗、穗行数、行粒数、百粒重和单株产量等9个农艺性状的一般配合力和特...
- 王保
- 关键词:玉米双列杂交配合力谷蛋白遗传相似系数
- 文献传递
- 七种杜氏藻遗传相似系数初探
- <正> 杜氏藻(Dunaliella sp.)又名盐藻,是一类极端耐盐的单细胞真核绿藻。盐藻细胞都很小,约呈上小下大的梨形,长径不超过20μm,短径仅有数微米,因此很难借助它们的形态进行鉴定,同时也造成了盐藻分类的混乱。...
- 刘广发张会永林慧馨
- 文献传递
- 基于SSR标记分析31份甘薯品种(系)的遗传多样性
- 2024年
- 为了解不同甘薯资源材料之间的亲缘关系,以收集保存的31份甘薯品种(系)为研究对象,采用SSR标记分析不同材料之间的遗传多样性。结果表明,基于筛选获得的多态性较好的21对SSR标记,共检测到405个多态性等位位点,平均每对引物等位位点数为19.3个。31份甘薯材料遗传相似性系数在0.2829~0.9758之间,平均值为0.430419,说明遗传多样性丰富。聚类分析表明,在遗传距离为0.638时,可将31份甘薯品种(系)分为四个类群。
- 罗密尹旺吴巧玉付梅邓仁菊邓仁菊
- 关键词:甘薯SSR标记遗传相似系数
- 基于AFLP标记的薄壳山核桃种质资源遗传多样性分析被引量:3
- 2022年
- 利用荧光AFLP分子标记技术,对引种到山东地区的30份薄壳山核桃品种(系)的遗传多样性和亲缘关系进行分析,旨在加深山东地区引进的薄壳山核桃品种资源遗传背景的认识,为以后山东地区薄壳山核桃的品种选育在分子层面提供理论基础。总体上,9对引物组合共扩增出1425个条带,多态性条带1381个,平均多态性比例为96.9%,其中有4个引物组合的多态性比率达到100%。30个薄壳山核桃品种(系)利用9对引物组合所检测到的不同位点的等位基因数范围在1.6528—1.8889之间,平均为1.7103;有效等位基因数范围在1.1821—1.3068之间,平均为1.2403;基因多样度范围在0.1201—0.1909之间,平均为0.1522;Shannon信息指数范围在0.2000—0.3048之间,平均为0.2455。30个供试样品遗传相似系数范围为0.7464—0.8853,变异范围为小(0.1389),表明30个品种遗传背景宽度较窄。在遗传相似系数0.796处,30个薄壳山核桃品种分为3个组,小糙皮系列聚为一类,与其他品种遗传相似系数整体较小,是很好的亲本,值得更深一步研究与利用。
- 梁燕韩传明孙超王翠香闵旭峰王静王清海
- 关键词:AFLP分子标记薄壳山核桃遗传相似系数
- 肺形侧耳菌株的遗传差异分析与农艺性状评价被引量:3
- 2022年
- 分析评价肺形侧耳菌株的遗传多样性及其农艺性状,为肺形侧耳种质资源分类鉴定及遗传育种等提供理论参考。结合拮抗试验、ISSR分子标记技术和农艺性状评价等方法,综合分析10个不同来源、产量较高的肺形侧耳菌株的遗传多样性。结果表明,10个供试肺形侧耳菌株遗传相似水平为0.63~0.92,其中以PL7和PL8的遗传相似系数最高,说明两者亲缘关系最近;其余各菌株间遗传相似系数较低,亲缘关系较远。当相似系数为0.69时,10株肺形侧耳菌株可以分为3个类群;供试菌株在苹果木屑和玉米芯基质上的生物学转化率为75.64%~88.21%,农艺性状存在较大差异,菌盖颜色包括黄白、灰色、白+褐、淡黄、褐色、深灰色6种,菌柄分为细长、中粗、粗长3类。结合ISSR分子标记技术、拮抗对峙试验和农艺性状评价等方法可以准确对供试肺形侧耳菌株进行遗传差异鉴定,表明供试肺形侧耳菌株具有较丰富的遗传差异和遗传多样性。
- 汪乔王祥锋郭玉峰王丽
- 关键词:拮抗试验分子标记遗传相似系数农艺性状
- CDDP结合SRAP标记分析杧果品种的遗传多样性被引量:2
- 2022年
- 应用CDDP和SRAP分子标记技术对35个杧果品种进行遗传多样性分析,统计遗传多样性信息数据,并进行聚类分析和主成分分析。结果表明,12条CDDP引物和12对SRAP引物组合分别扩增得到条带263条和243条。其中多态性条带数分别为250条和230条,多态性条带比率分别为95.45%和94.61%,有效等位基因数分别为1.59和1.62,Nei’s基因多样性分别为0.32和0.24,Shannon信息指数分别为0.55和0.46,多态性信息含量分别为0.60和0.59,遗传相似系数变化范围分别为0.64~0.96和0.64~0.92,平均遗传相似系数分别为0.80和0.78,CDDP结合SRAP标记遗传相似系数变化范围为0.62~0.94,平均遗传相似系数为0.78。CDDP标记、SRAP标记以及CDDP结合SRAP标记分别在遗传相似系数为0.7095、0.6947以及0.6850处可以将35个杧果品种分别分为3类、3类和5类,说明两种标记结合分析能够更加详细地解释杧果品种间的亲缘关系。而主成分分析结果和聚类分析结果有相似之处,但也有很大不同。
- 张宇黄国弟莫永龙罗世杏赵英唐玉娟陆祖双单彬荣涛
- 关键词:杧果CDDPSRAP聚类分析主成分分析遗传相似系数
- MPMS诱变技术选育榆黄蘑优良发酵菌株及应用
- 在取得脱贫攻坚战的全面胜利之中,食用菌产业发挥了巨大贡献,许多地方政府将食用菌产业作为发展的重要产业之一。在接下来巩固脱贫攻坚成果、完成乡村振兴战略中食用菌产业仍有着重要角色地位,继续发挥作用。珍稀类食用菌作为朝阳产业仍...
- 高珊
- 关键词:榆黄蘑遗传相似系数
相关作者
- 刘广发

- 作品数:62被引量:194H指数:8
- 供职机构:厦门大学
- 研究主题:杜氏藻 克隆 遗传相似系数 盐藻 假单胞菌
- 郑有良

- 作品数:545被引量:2,983H指数:30
- 供职机构:四川农业大学
- 研究主题:小麦 分子标记 醇溶蛋白 聚类分析 农艺性状
- 苟本富

- 作品数:21被引量:169H指数:9
- 供职机构:重庆文理学院生命科学与技术学院
- 研究主题:AFLP 遗传多态性 遗传相似系数 蔷薇 AFLP标记
- 番兴明

- 作品数:155被引量:740H指数:16
- 供职机构:云南省农业科学院
- 研究主题:玉米 杂种优势群 配合力 优质蛋白玉米 热带
- 李新海

- 作品数:276被引量:3,269H指数:34
- 供职机构:中国农业科学院作物科学研究所
- 研究主题:玉米 玉米自交系 分子标记 SSR标记 自交系