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基于电子PCR识别样本PCR扩增子长度多态性的保种蜜蜂STRs分型方法: 本发明公开了基于电子PCR识别样本PCR扩增子长度多态性的保种蜜蜂STRs分型方法。本发明通过将在线扩增得到的蜜蜂参考基因组STRs位点的电子PCR扩增子加减STRs位点的重复核苷酸序列得到电子多态性长度值，以此与样本P...; 李兴安张妙冉陈鹏李杰銮徐梦牛庆生

基于聚合酶链式反应⁃限制性内切酶长度多态性方法鉴别鹿角(马鹿)药材及其配方颗粒: 2024年; 鹿角为鹿科马鹿Cervus elaphus或梅花鹿C.nippon已骨化的角或锯茸后翌年春季脱落的角基。目前市场上鹿角基原混杂,为快速准确地鉴别鹿角多基原及混伪品,研究通过比较马鹿、梅花鹿及其混伪品线粒体条形码Cytb基因序列差异,筛选获得鹿角的特异性单核苷酸多态性(SNP)位点,设计鹿角特异性鉴别引物dishmy⁃F及dishmy⁃R,分别采集鹿角及其混伪品,建立鹿角配方颗粒特异性PCR鉴别方法并优化PCR反应体系,对影响该方法重复性的Taq酶种类、PCR仪型号进行耐受性和适用性考察,再使用限制性内切酶MseⅠ对梅花鹿与马鹿的扩增产物进行酶切。结果显示,当退火温度为56℃,循环次数为35时,鹿角药材、标准汤剂及其配方颗粒经PCR反应及凝胶电泳后,马鹿可在近100 bp处观察到单一明亮的特异性鉴别条带,且马鹿的条带较梅花鹿短约60 bp,而其他混伪品如驼鹿、驯鹿、白尾鹿、黑尾鹿、狍子、白唇鹿等及阴性对照均无条带。该研究建立的PCR⁃RFLP方法可快速准确的鉴别出鹿角药材、标准汤剂和配方颗粒中的马鹿成分,并可区分梅花鹿和其他混伪品,同时为其他中药配方颗粒质量标准研究提供了理论依据。; 周海琴海丰胡剑虹李松陈盛君张开雪程梦娟; 关键词：鹿角分子鉴别

我国近5年类NADC30 PRRSV毒株序列的重组及限制性片段长度多态性分析被引量：2: 2023年; 为了解我国类NADC30猪繁殖与呼吸综合征病毒(PRRSV)毒株的流行和遗传变异情况,本研究利用生物信息学软件对本实验室2016-2020年获得的64条类NADC30毒株序列进行分析。Nsp2氨基酸序列比对结果表明,64株毒株均表现出与NADC30毒株一致的131个不连续的氨基酸缺失。其中,9株在Nsp2区域除该缺失特征外,另含有额外的氨基酸缺失。基于全基因组遗传演化分析结果表明,61株分布在Sublineage 1.8(类NADC30),3株分布在Lineage 8(HP-PRRSV)。而基于ORF5序列的遗传演化分析结果则更分散,56株分布在SubLineage 1.8,5株分布在Lineage 8,2株分布在Lineage 5(类VR2332),1株分布在Sublineage 1.5(类NADC34)。经RFP4和Simplot生物学软件进行重组分析结果表明,64株毒株中可能有44株为重组毒株,共表现出5种重组模式,其中以NADC30提供骨架,HP-PRRSV提供重组片段为主要模式。重组热点分布在非结构蛋白区域5′UTR~1500 nt(Nsp1)、5374~8177 nt(Nsp4~Nsp9)和结构蛋白区域12100~13279 nt(ORF2~ORF4)。RFLP结果表明,64条ORF5序列共存在12种RFLP模式,其中与美国高致病性变异株PRRSV RFLP1-4-4 Lineage1C相同的模式RFLP 1-4-4数量最多,共31株。综上所述,本研究为了解我国类NADC30毒株的遗传演化、重组分析和防控提供借鉴意义。; 王彪谷尚品侯晓璇王孟月王小娟谭菲菲田克恭; 关键词：PRRSV 遗传演化分析 RFLP

基于末端限制性片段长度多态性分析鸭肠道微生物群落结构: 2023年; 为探究不同饲养方式和饲料类型对鸭肠道微生物群落的影响,本研究采用末端限制性片段长度多态性分析(T-RFLP)技术,对鸭肠道微生物群落的结构和多样性进行研究。结果表明,鸭肠道微生物群落具有较高的多样性和复杂性,其中包括多种细菌和古菌;不同饲养方式和饲料类型对鸭肠道微生物群落结构有一定影响,但差异不显著;鸭肠道微生物群落中存在着一些特定的菌群,这些菌群可能对鸭的生长和健康状态有一定的影响。本研究为深入了解鸭肠道微生物群落结构提供了重要的参考。; 杨为敏韩登阁孟玉学; 关键词：T-RFLP 肠道微生物群落结构

末端限制性片段长度多态性分析技术在鸭肠道微生物群落结构研究中的应用: 2023年; 本研究采用T-RFLP技术,基于末端限制性片段长度多态性分析,对鸭肠道微生物群落结构进行研究。结果表明,鸭肠道微生物群落具有较高的多样性和复杂性,其中包括了多种细菌和古菌。同时,不同饲养模式和饲料类型对鸭肠道微生物群落结构有一定影响,但这种影响并不明显。此外,本研究还发现鸭肠道微生物群落中存在着一些特定的菌群,这些菌群可能对鸭的生长和健康状态有一定的影响。本研究为深入了解鸭肠道微生物群落结构及其功能提供了重要参考。; 杨为敏孟玉学; 关键词：T-RFLP 肠道微生物群落结构

聚合酶链式反应-限制性片段长度多态性分析复方川贝散中川贝母成分被引量：2: 2021年; 目的采用聚合酶链式反应-限制性片段长度多态性(PCR-RFLP)分析复方川贝散中川贝母成分。方法研究起止时间为2019年2月至2019年5月。新型快速植物基因组DNA提取试剂盒分别提取复方川贝母和蛇胆川贝液中DNA,PCR扩增后采用SmaⅠ限制性内切酶酶切,并进行琼脂糖凝胶电泳分析。同时,对川贝母含量为0%-40%的样本进行PCR-RFLP检测。结果复方川贝散和蛇胆川贝液PCR扩增后均出现特异性条带,但经SmaⅠ酶切后复方川贝散在100-250 bp出现两条特异性酶切条带,而蛇胆川贝液无特异性条带。川贝母含量为4%时,经PCR-RFLP分析在100-250 bp得到两条特异性DNA条带。结论PCR-RFLP可有效分析复方川贝散中川贝母成分,且对含量超过4%的样本可有效检出。; 张国林魏星邢以文薛满; 关键词：贝母属聚合酶链式反应限制性片段长度多态性川贝母平贝母

人ABO血型PCR与限制性片段长度多态性的遗传分析: 2021年; 由于三个等位基因IA、IB、i的不同组合,红细胞表面带有不同的抗原,因而ABO血型分为A型、B型、AB型、O型。其中A型血个体的基因型可能是IAIA或IAi,B型血个体的基因型可能是IBIB或IBi,因此,利用血清学方法无法直接判断A或B型血个体的基因型。根据IA、IB与i基因在序列上的区别,应用PCR与限制性内切酶片段长度多态性相结合的技术,可以进行人ABO血型的基因型鉴定。本实验用PCR-RFPL法对一名A型血个体进行基因型鉴定,并用测序进行验证。结果显示,PCR-RFLP法与测序得到的结论一致,说明该方法可行性较高。; 白东升康宇佳石金磊; 关键词：PCR-RFLP ABO血型开放式实验教学

应用限制性片段长度多态性检测幽门螺杆菌对克拉霉素的耐药性被引量：1: 2019年; 目的建立限制性片段长度多态性(restriction fragment length polymorphism,RFLP)快速检测HP对克拉霉素耐药性的方法。方法抽提37例经纸片琼脂扩散法鉴定为克拉霉素耐药的HP菌株DNA及其对应的胃黏膜组织标本DNA,通过PCR技术扩增23S rRNA区425 bp基因,运用RFLP技术,采用BbsⅠ和BsaⅠ内切酶对PCR产物进行酶切分析,并进行DNA测序。结果37例克拉霉素耐药的HP菌株DNA经RFLP分析,21例能被BbsⅠ内切酶切开,13例能被BsaⅠ内切酶切开,3例不能被BbsⅠ和BsaⅠ内切酶切开,而且37例组织标本DNA检测结果与菌株DNA检测结果一致。结论RFLP可应用于HP对克拉霉素耐药性的快速检测,为临床用药提供指导。; 吴文冰方超英陈雯吴绍莲; 关键词：幽门螺杆菌 RRNA 克拉霉素耐药限制性片段长度多态性基因突变

两种白茅根聚合酶链式反应法-限制性片段长度多态性分析鉴别方法的研究被引量：7: 2019年; 目的从分子水平鉴别2种不同性状的白茅根。方法采用植物通用DNA条形码ITS1、ITS2、psb A-trnH、rbc L和mat K对30份白茅根样品的序列进行比较研究,分析2种不同性状白茅根的多个位点差异。结果 30批白茅根的psb A-trnH、rbc L和mat K基因序列无位点差异,ITS1序列含3个关键差异位点,ITS2序列含1个关键差异位点,且ITS2序列上的关键差异位点可被限制性内切酶Hpy CH4Ⅲ识别。结论 ITS1和ITS2序列可作为2种不同性状白茅根鉴别用的DNA条形码序列,且利用ITS2序列上可被限制性内切酶Hpy CH4Ⅲ识别的关键差异位点可建立2种不同性状白茅根的PCR-PFLP鉴别方法。; 朱晓燕黄韵璇黄昌杰蓝永锋侯惠婵陈伟盛; 关键词：白茅根 DNA条形码

限制性片段长度多态性聚合酶链反应法检测人细胞色素氧化酶2D6药物代谢相关基因位点多态性被引量：4: 2019年; 目的建立测定人细胞色素氧化酶2D6(CYP2D6)基因多态性的限制性片段长度多态性聚合酶链反应(polymerase chain reaction restriction fragment length polymorphism,PCR RFLP)检测方法。方法通过增加PCR扩增体系中DNA模板上样体积、降低引物浓度以及减少限制性内切酶的用量等方法改进、优化实验条件,建立以PCR RFLP法为基础的肝药酶CYP2D6基因型检测方法。结果采用PCR RFLP法能够检测CYP2D6?2、CYP2D6?10和CYP2D6?14基因型,且过程简便,经济实用。结论该方法检测CYP2D6药物代谢相关基因位点基因型具有简便、高效、准确和经济的特点,可在临床及实验室推广使用。; 夏清荣单锋徐亚运梁俊曹银柳杨闫春宇; 关键词：CYP2D6

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