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大麦DUF668家族基因鉴定及表达分析
2024年
DUF668家族基因对植物逆境胁迫响应有重要作用。为探讨大麦DUF668家族基因的结构及表达模式,采用生物信息学的方法对大麦DUF668基因结构、蛋白结构、系统进化树、共线性及表达模式进行了分析。结果显示,供试大麦中共鉴定出9个DUF668基因,分布在5条染色体上。系统发育进化树将9个DUF668基因分为三个亚组,第Ⅰ亚组包括HvDUF668-01、HvDUF668-02和HvDUF668-09,内含子数量较多,均有11个内含子;第Ⅲ亚组包括HvDUF668-04、HvDUF668-05、HvDUF668-07和HvDUF668-08,内含子数0~3个,其中HvDUF668-04与HvDUF668-05没有内含子;第Ⅱ亚组包括HvDUF668-03和HvDUF668-06,内含子数量(9和7)介于第Ⅰ亚组和第Ⅲ亚组之间。蛋白保守基序分析表明,9个蛋白均含有DUF668保守结构域的特征序列及DUF3475保守结构域的特征序列(HvDUF668-06除外);第Ⅰ亚组蛋白的Motif数量(8~10个)比第Ⅱ、Ⅲ亚组(4~6个)多,且包含第Ⅱ、Ⅲ亚组中的所有Motif。表达谱分析表明,不同DUF668基因在不同组织和发育时期的表达量存在差异,HvDUF668-09在颖果中的表达量随着颖果的发育而升高,而HvDUF668-01和HvDUF668-02则相反;HvDUF668-01和HvDUF668-02在花序中的表达量随着花序的发育而升高。qRT-PCR结果显示,受黄矮病病毒侵染大麦幼苗与未受侵染幼苗相比,HvDUF668-04、HvDUF668-05和HvDUF668-08表达量提高了100~180倍。
王月雪母景娇王孜逸耿梓瀚倪守飞刘梦迪蔡倩赵彦宏王艳芳
关键词:大麦生物信息学逆境胁迫
玉米DUF668基因家族全基因组鉴定及其表达分析
2024年
未知功能域668(DUF668)家族是植物中一个功能尚不清楚的家族。为了解玉米DUF668基因家族成员及其特征,运用生物信息学方法对ZmDUF668基因家族进行鉴定分析。结果表明,玉米8条染色体上共分布19个ZmDUF668基因,分别命名为ZmDUF668-1~ZmDUF668-19;ZmDUF668蛋白以碱性蛋白为主,且大部分成员定位于细胞核、细胞质和叶绿体中。多物种系统进化树将19个ZmDUF668家族蛋白成员分为2个亚组;19个ZmDUF668中鉴定出10种蛋白保守基序,所有成员都含有Motif 1和Motif 5;通过对蛋白保守域分析发现,19个成员中有14个不仅含有DUF668结构域还含有DUF3475结构域;基因结构分析表明,同一亚群中成员基因结构相似。根据共线性分析可知,13个ZmDUF668基因与10个OsDUF668组合形成21种共线性关系。ZmDUF668顺式作用元件分析发现,家族成员启动子区域分布着光响应、植物激素及非生物胁迫相关作用元件。蛋白质互作网络(PPI)预测结果表明,ZmDUF668家族蛋白中只有ZmDUF668-10与其他蛋白存在互作关系。通过RNA-Seq数据分析发现,ZmDUF668基因家族部分成员在受到冷、热、盐胁迫和紫外处理下基因表达量明显变化,实时荧光定量PCR试验验证了ZmDUF668家族部分成员在冷胁迫和热胁迫下的响应。研究主要是将生物信息学运用于对玉米DUF668基因家族的分析,揭示了ZmDUF668基因家族成员的特征,为后续研究玉米DUF668家族基因的分子生物学功能提供了理论基础。
夏轲罗堰木黄敏杜何为
关键词:玉米基因家族生物信息学基因表达
吊灯(A668
1.本外观设计产品的名称:吊灯(A668)。;2.本外观设计产品的用途:室内照明灯具。;3.本外观设计产品的设计要点:在于形状。;4.最能表明设计要点的图片或照片:设计1立体图。;5.本外观设计产品的顶面为使用时不容易看...
范学文
床架(A668
1.本外观设计产品的名称:床架(A668)。;2.本外观设计产品的用途:用于床架。;3.本外观设计产品的设计要点:在于形状。;4.最能表明设计要点的图片或照片:立体图。;5.本外观设计产品的仰视图为使用时不容易看到或看不...
王涛
文胸(668
1.本外观设计产品的名称:文胸(668)。;2.本外观设计产品的用途:本外观设计产品用于女性文胸内衣。;3.本外观设计产品的设计要点:在于形状、图案及其结合。;4.最能表明设计要点的图片或照片:立体图。;5.为在其他已提...
韩杰生
凉鞋(668
1.本外观设计产品的名称:凉鞋(668)。;2.本外观设计产品的用途:作为凉鞋使用。;3.本外观设计产品的设计要点:在于形状与图案的结合。;4.最能表明设计要点的图片或照片:立体图。
黄子群
文胸(668
1.本外观设计产品的名称:文胸(668)。;2.本外观设计产品的用途:本外观设计产品用于女性文胸内衣。;3.本外观设计产品的设计要点:在于形状、图案及其结合。;4.最能表明设计要点的图片或照片:立体图。;5.为在其他已提...
杨晓霞
文胸(668
1.本外观设计产品的名称:文胸(668)。;2.本外观设计产品的用途:女性穿戴文胸。;3.本外观设计产品的设计要点:在于形状与图案的结合。;4.最能表明设计要点的图片或照片:立体图。;5.俯视图设计要点已在其他视图中显示...
郑耿杰
沙发(668
1.本外观设计产品的名称:沙发(668)。;2.本外观设计产品的用途:用于家具。;3.本外观设计产品的设计要点:在于形状。;4.最能表明设计要点的图片或照片:设计1立体图。;5.设计1、设计2的俯视图可在各设计的立体图中...
姚少现
座椅(668#)
1.本外观设计产品的名称:座椅(668#)。;2.本外观设计产品的用途:用于家具。;3.本外观设计产品的设计要点:在于形状。;4.最能表明设计要点的图片或照片:立体图。;5.本外观设计产品的底面为使用时不容易看到或看不到...
蒋晓凯