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水稻G蛋白γ亚基DEP1的C端结构域的功能分析
水稻种子的大小不仅决定了粒重,同时还影响稻米的外观品质。研究种子大小对提高水稻产量以及改良外观品质具有重要的指导意义,对种子大小调控机制的研究将为培育高产优质的水稻品种提供重要的基因资源和理论依据。迄今为止,已经发现5类...
张译文
关键词:水稻G蛋白C端结构域酵母双杂交
C端结构域截短提高苏云金芽孢杆菌来源几丁质酶的活力被引量:1
2022年
【目的】尝试利用蛋白质结构域工程的手段优化苏云金芽胞杆菌(Bacillus thuringiensis BMB 171)来源的几丁质酶BtChiA的酶活力,并对水解胶体几丁质的产物进行定性和定量分析。【方法】根据BtChiA的序列分析其结构域的组成,构建BtChiA及部分结构域缺失的突变体蛋白在大肠杆菌中的表达菌株并进行蛋白的表达纯化;利用HPLC分析几丁质酶水解产物的类型及含量。【结果】异源表达纯化获得了纯度90%以上,大小正确的BtChiA (全长蛋白)和BtChiA△50 (截短几丁质结合结构域CBD和纤连蛋白结构域FnⅢ)。BtChiA△50水解胶体几丁质的活力是BtChiA的1.64倍。两者水解胶体几丁质的产物均为几丁单糖GlcNAc和几丁二糖(GlcNAc)2,全长蛋白BtChiA的水解产物中(GlcNAc)2的含量是GlcNAc的0.97倍,BtChiA△50水解产物中(GlcNAc)2的含量是GlcNAc的1.79倍。【结论】利用蛋白质结构域工程构建了水解活性提高的BtChiA△50突变体、优化了水解产物的组成。
黎欣宇邓旭蒋思婧周玉玲欧阳玉茹贺妮莎张桂敏
关键词:苏云金芽胞杆菌几丁质酶酶活力
一种结合破伤风毒素重链C端结构域的人源抗体及应用
本发明公开了一种结合破伤风毒素重链C端结构域的人源抗体,所述抗体具有独特的CDR区,与抗原的亲和力达到0.397nM。所述抗体能够有效中和破伤风毒素,可以完全保护破伤风毒素攻毒的小鼠。本发明提供的抗体具有独特的作用位点,...
陈薇于长明张冠英于蕊李建民迟象阳范鹏飞房婷刘渝娇郝勐董韵竹宋小红陈旖刘树玲
文献传递
Antiviral drug design based on structural insights into the N-terminal domain and C-terminal domain of the SARS-CoV-2 nucleocapsid protein
2022年
Nucleocapsid(N) protein plays crucial roles in the life cycle of severe acute respiratory syndrome coronavirus 2(SARS-CoV-2), including the formation of ribonucleoprotein(RNP) complex with the viral RNA.Here we reported the crystal structures of the N-terminal domain(NTD) and C-terminal domain(CTD) of the N protein and an NTD-RNA complex. Our structures reveal a unique tetramer organization of NTD and identify a distinct RNA binding mode in the NTD-RNA complex, which could contribute to the formation of the RNP complex. We also screened small molecule inhibitors of N-NTD and N-CTD and discovered that ceftriaxone sodium, an antibiotic, can block the binding of RNA to NTD and inhibit the formation of the RNP complex. These results together could facilitate the further research of antiviral drug design targeting N protein.
Xiaodong LuanXinming LiYufan LiGengchen SuWanchao YinYi JiangNing XuFeng WangWang ChengYe JinLeike ZhangH.Eric XuYi XueShuyang Zhang
利用分子动力学模拟揭示ADAMTS13C端结构域与Spacer结构域的结合特性
ADAMTS13(Adisintegrinandmetalloproteinasewithathrombospondintype1motif,member13)通过特异性酶切VWF多聚体调控血小板富含型血栓的形成。野生型...
吴芝伟
关键词:分子动力学模拟
嗜肺军团菌效应蛋白SdeA C端结构域的功能与机制研究
泛素化修饰调控着真核细胞内几乎所有的重要生命活动,包括细胞凋亡、细胞自噬、细胞免疫跟炎症反应等。一部分由细菌表达分泌的效应蛋白被发现能通过对泛素化系统的调控来干扰宿主细胞这一翻译后修饰过程。最近,有研究小组发现嗜肺军团菌...
李阿荣
关键词:嗜肺军团菌泛素化
文献传递
一种结合破伤风毒素重链C端结构域的人源抗体及应用
本发明公开了一种结合破伤风毒素重链C端结构域的人源抗体,所述抗体具有独特的CDR区,与抗原的亲和力达到0.397nM。所述抗体能够有效中和破伤风毒素,可以完全保护破伤风毒素攻毒的小鼠。本发明提供的抗体具有独特的作用位点,...
陈薇于长明张冠英于蕊李建民迟象阳范鹏飞房婷刘渝娇郝勐董韵竹宋小红陈旖刘树玲
噬菌体phi29末端酶gp16蛋白C端结构域在溶液中的构象分析被引量:1
2019年
噬菌体phi29是一种双链DNA病毒,它的增殖和成熟过程需要将较大的子代DNA包装入一个空间极其有限的新生病毒衣壳中,这一步骤由其转运马达完成.转运马达具有三个部分:头颈连接器蛋白(the connector)、pRNA和ATP水解酶蛋白(gp16).在结构预测中发现gp16蛋白的C端结构域可能与pRNA或DNA结合,但尚未有相关文献可以证明这种相互作用,因此其结构的解析成为研究其功能的关键.本文利用大肠杆菌SUMO表达系统,对噬菌体phi29 gp16蛋白的C端结构域进行重组构建并诱导表达后,通过Ni-NTA亲和层析纯化,再用分子排阻色谱获得高纯度的目的蛋白质单体,纯度达到95%左右.最后用X射线小角散射技术(small angle X-ray scattering)对其构象进行分析,收集小角散射数据,当目的蛋白的浓度为1.3 g/L、所得到的目的蛋白的三维结构与同源蛋白FtsK的晶体结构高度拟合,且通过CRYSOL软件反推计算的曲线与实验曲线高度重合.通过原核表达、纯化及结构分析,成功获得了该结构域在溶液中的状态信息.这一研究不仅为后续关于该结构域的功能研究奠定基础,也为病毒感染的诊断和治疗提供新思路.
武飞飞蔡汝洁陈婷张云龙陆昌瑞
关键词:C端结构域
人源Pelota C端结构域的纯化、结晶及晶体结构分析被引量:1
2017年
Pelota在进化上是非常保守的RNA结合蛋白,人源Pelota mRNA分布于几乎所有的组织并作为一个多功能的蛋白参与多种生物途径.为解析人源Pelota C端结构域(C-terminal domain,CTD)的晶体结构,首先在大肠杆菌(Escherichia coli)中表达,并采用亲和层析、凝胶过滤柱层析的方法,获得了纯度大于97%的蛋白.动态光散射实验表明纯化的蛋白有较高的均一性.在筛选了1 852个结晶条件后,优化的人源Pelota CTD蛋白晶体能衍射X射线至0.26nm分辨率.蛋白晶体的空间群为P6522,晶胞常数a=7.882nm,b=7.882nm,c=19.746nm.上述结果为进一步研究Pelota的功能及其与下游蛋白的相互作用奠定了结构基础.
张兰君靳林丹任海霞林天伟
关键词:C端结构域人源纯化
第一类肽链释放因子C端结构域参与调控终止密码子的识别过程被引量:2
2017年
真核生物蛋白质翻译终止过程中,第一类肽链释放因子(eukaryotic polypeptide release factor,eRF1)利用其N端结构域识别终止密码子。eRF1的N结构域中的GTS、NIKS和Yx Cxxx F模体对于终止密码子的识别发挥重要作用。但至目前为止,eRF1识别终止密码子的机制,尤其是对于终止密码子的选择性识别机制仍不清楚。我们构建了四膜虫(Tetrahymena thermophilia)eRF1的N端结构域与酿酒酵母(Saccharomyces cerevisiae)或裂殖酵母(Schizosaccharomyces pombe)eRF1的M和C结构域组成的杂合eRF1,即Tt/Sc eRF1和Tt/Sp eRF1。双荧光素酶检测结果证实,两种杂合eRF1在细胞中识别终止密码子的活性具有显著差异。Tt/Sc eRF1仅识别UGA密码子,与四膜虫eRF1一致,具有密码子识别特异性;而Tt/Sp eRF1可以识别3个终止密码子,无密码子识别特异性。为解释这一现象,将Sp eRF1的C结构域中的1个关键的小结构域中的氨基酸进行突变,与Sc eRF1相应位点的氨基酸一致。分析结果显示,突变体Tt/Sp eRF1识别密码子UAA和UAG的性质发生显著变化,说明第一类肽链释放因子的C端结构域参与了终止密码子的识别过程。这提示,四膜虫eRF1识别终止密码子的特异性可能依赖于eRF1分子内的结构域间相互作用。本研究结果为揭示肽链释放因子识别终止密码子的分子机制提供了数据支持。
闫静石文鑫王美申泉柴宝峰
关键词:肽链释放因子

相关作者

陈婷
作品数:59被引量:125H指数:7
供职机构:东华大学
研究主题:教学改革 思政 生物工程专业 课程建设 胶原蛋白
柴宝峰
作品数:143被引量:1,436H指数:21
供职机构:山西大学
研究主题:八肋游仆虫 肽链释放因子 纤毛虫 无义突变 水分参数
张云龙
作品数:24被引量:54H指数:4
供职机构:东华大学化学化工与生物工程学院
研究主题:思政 教学改革 生物工程专业 课程建设 蛋白表达纯化
徐春艳
作品数:19被引量:7H指数:2
供职机构:中国科学院上海应用物理研究所
研究主题:晶体结构 上海光源 蛋白 甲基转移酶 C端结构域
于竞飞
作品数:2被引量:2H指数:1
供职机构:山西大学生物技术研究所
研究主题:终止密码子 功能结构域 纤毛虫 肽链释放因子 四膜虫