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竹亚科DNA 条形码 研究进展 2024年 传统的植物分类方法主要根据植物的形态特征尤其是有性生殖特征进行分门别类,但竹类植物大多开花周期较长,很难采集到花等有性生殖结构,而其他形态特征容易受到环境影响而发生变化,因此,竹类植物的分类鉴定一直是一个难题。DNA 条形码 是近年来兴起的、借助分子手段对生物进行辅助鉴定的1种分子技术,已在很多植物中得到应用。该文对DNA 条形码 在竹类植物中的研究进展进行概述,提出了DNA 条形码 在竹类植物分类中存在的问题,并对今后该技术在竹类植物分类鉴定中的应用前景进行了展望。 王代波 张玉霄关键词:竹亚科 DNA条形码 鱼胶品种的DNA 条形码 鉴定方法研究 2024年 目的建立鱼胶种属鉴别的DNA 条形码 方法。方法使用不同试剂盒对鱼胶核酸提取效果进行评价和优化,筛选出适用于鱼胶的核酸提取方法,选取3对引物进行扩增对比,建立鱼胶种属鉴别的DNA 条形码 方法。基于建立的方法,对44份鱼胶样品进行特异性扩增,并根据生命条形码 系统(barcode of life data system,BOLD)进行物种鉴定,同时进行系统进化分析。结果对44份鱼胶样品的鉴定结果显示,样品分属8科,11属,15种,石首鱼科(15个)和尖吻鲈科(20个)占比79.5%。系统发育分析表明,同物种的不同个体都聚在了一起,同属以及同科不同属的物种也聚在一支,界限分明。序列比对和系统发育分析较一致确认鱼胶所属的鱼类种类。结论建立的方法能高效、准确地对鱼胶进行种属鉴定,研究结果可有效预防和降低鱼胶产品交易中的欺诈行为,也为促进我国鱼胶产品的高质量发展和进出口贸易的稳定发展提供有利的技术支持。 姚丽锋 张娟 黎财慧 张晴阳 周臣清 林靖 丁琦 游淑珠 王小玉关键词:鱼胶 DNA条形码 物种鉴定 DNA 条形码 技术融入普通昆虫学实验教学2024年 为了提升普通昆虫学实验教学质量,以DNA 条形码 技术为例,尝试将最新科研成果和技术与普通昆虫学实验教学进行融合。介绍了植物保护专业学生掌握DNA 条形码 技术的必要性,分析了在普通昆虫学实验教学中开展DNA 条形码 实验的可行性,在样品保存、DNA 提取、PCR扩增、电泳检测、测序和分析等方面优化了以COI基因序列作为DNA 条形码 开展分子鉴定的具体流程,设计了开展DNA 条形码 专题实验或者将其与传统分类实验结合的实施和考核方案。DNA 条形码 技术的融入改变了普通昆虫学实验传统教学模式,也为探索创新性实验教学提供了思路。 康泽辉 孙丽娟 郑桂玲 张晓关键词:普通昆虫学 课程改革 不同产地铁皮石斛的DNA 条形码 特征分析 2024年 目的为了探讨不同省份基地栽培的铁皮石斛(Dendrobium officinale Kimura et Migo)是否存在分子水平的遗传差异,为种质筛选和栽培选育提供参考。方法通过采集5个省份的30份人工栽培铁皮石斛样品,并利用ITS及叶绿体条形码 标记对其进行种水平遗传分析。结果在种水平上,部分叶绿体条形码 在不同产地的铁皮石斛上可以检测到变异,而ITS片段的种内变异少。其中trnH-psbA长度为790 bp(1 indel,2 SNP),pbsI-pbsK为473 bp(3 indel,1 SNP),trnF-ndhJ为682 bp(1 SNP);而ITS为551 bp(2 SNP)。在叶绿体的NETWORK图和NJ树上可以看出,贵州的铁皮石斛样品具有特有的单倍型,而部分贵州安龙铁皮石斛样品的遗传距离与金钗石斛最接近,ITS分析的结果显示浙江的铁皮石斛样品与金钗石斛遗传距离更近。结论贵州的铁皮石斛样品具有更高的遗传多样性,提示其可能具有多个种质来源,而贵州和浙江的铁皮石斛样品与金钗石斛的遗传距离更近,说明其在种源上可能属于进化过程中较早的一支,其他样本更有可能是由其发展而来。研究结果表明,虽然目前不能依靠种内的遗传变异对各地区的铁皮石斛进行产地区分,但可用于揭示不同地区铁皮石斛在种质来源上的遗传差异性,为铁皮石斛的栽培选育提供一定的科学依据。 田中佳 胡欢 何芋岐 李昊 秦琳 王倩关键词:铁皮石斛 条形码 单倍型 遗传资源 种质 DNA 条形码 技术在蛇类鉴别中的应用2024年 从NCBI中GenBank数据库下载蛇类细胞色素b基因(Cytb)序列7329条,以MT765098.1序列为标准进行对比和修剪,获得蛇类Cytb序列4665条。对蛇类Cytb序列进行核苷酸饱和度、遗传多样性、种内和种间遗传距离计算,构建系统发育树。结果表明,基于Kimura–2–Parameter模型,蛇类平均种内遗传距离为3.3%,普遍小于6.7%,而平均种间遗传距离为19.96%,普遍高于9.3%,说明蛇类物种间遗传距离存在较大差异。根据蛇类物种间遗传距离,识别出蛇类23个物种的亚种,Pareas和Hydrophis属物种含有复合体,Atractus dunni、A.iridescen和A.occidentali互为姐妹物种。 李晓冰 方来杉 陈洪博 陈洪博 尹会方 林秀娇 尹会方关键词:细胞色素B基因 DNA条形码 基于ITS序列的五味子DNA 条形码 鉴定分析 2024年 基于五味子的内转录间隔区(Internal transcribed spacer,ITS)条形码 序列,探讨五味子药材基源的鉴定方法,为该药材来源的鉴别和规范栽培种植提供参考。本研究共收集16份五味子样品,提取样品基因组DNA ,PCR扩增ITS序列后双向测序,所得序列经SeqMan拼接后,采用MEGA11软件对序列进行分析比对,计算K2P遗传距离,并利用邻接(NJ)法建立系统发育树。结果表明,研究区16个样本的ITS序列结构差异较小,碱基序列相似,其中2份样本出现1个变异位点;结合遗传距离和NJ聚类树结果可看出,五味子属所有样品聚为一支,其中研究区五味子样本与来自GenBank的五味子聚为一支,南五味子属作为外群单独聚为一支,且分支具有很高的支持率,种内差异不明显,可与五味子属近缘种区分开。基于ITS序列的DNA 条形码 技术能够对五味子及其同科植物进行区分鉴别。 马紫萸 安星华 薛嘉宁 赵容关键词:五味子 ITS DNA条形码 系统发育分析 物种鉴定 寇蛛属部分种类DNA 条形码 鉴定方法研究 2024年 以国内口岸已截获的4种寇蛛为研究对象,应用PCR技术扩增这4种寇蛛标本的COⅠ序列,并与GenBank记录的5种寇蛛COⅠ序列进行比对,分析其序列特征,并构建系统发育进化树。结果显示:寇蛛属不同种类间的遗传差异显著,可将该COⅠ序列作为DNA 条形码 ,用于寇蛛属不同种类的分子鉴定。 禹海鑫 黄静 吴晶 钟勇 孙民琴关键词:DNA条形码 分子鉴定 系统发育 档案库房鞘翅目害虫DNA 条形码 鉴定研究 2024年 鞘翅目害虫是目前档案库房中最常见的有害生物之一,害虫严重爆发时,被蛀食的档案纸张被大面积毁损且无法修复,所以档案虫情监测和预防极为重要。由于库房中害虫成虫采集难度大、害虫形态虫态差别大、发生规律各异、专业人员紧缺等,档案库房鞘翅目害虫的快速准确鉴定成为一个难点。为了更好地解决这个问题,本研究利用DNA 条形码 鉴定技术将采集到的样本进行分子鉴定,利用线粒体基因组的COI基因片段,建立了档案鞘翅目害虫DNA 条形码 数据库。除此之外,本研究还利用分子数据将三种害虫的成、幼虫进行配对,为解决幼虫形态鉴定困难的问题提供了新的思路。最后,本研究讨论了如何更好地结合形态数据和DNA 条形码 数据进行物种鉴定,说明了DNA 条形码 技术能利用最少的取样实现快速高效鉴定档案鞘翅目害虫常见种类各虫态样本的目标。 丁双玫 陈菲 荆秀昆关键词:档案害虫 DNA条形码 COI基因 基于DNA 条形码 技术鉴定库尔勒机场的蝙蝠物种 2024年 随着航空业的发展,野生动物与航空器之间的冲突愈演愈烈,研究机场周边飞行动物对机场动物撞击防范工作具有重要意义。蝙蝠作为世界上唯一的飞行类哺乳动物,也是严重影响夜间飞机飞行安全的隐患之一,但由于蝙蝠体型较小,发生撞击后往往无法发现相对完整的尸体,多为血液和毛发等,因此物种鉴定比较困难。从库尔勒机场防鸟网采集到一具蝙蝠样本,基于DNA 条形码 技术(DNA barcoding),通过16S rRNA遗传距离分析,发现棕蝠属(Eptesicus)与库尔勒样本群体间遗传距离为0.031~0.092,属内与库尔勒样本种间差异最大的是南美棕蝠(Eptesicus diminutus),遗传距离为0.092;差异最小的是大棕蝠(Eptesicus serotinus),遗传距离为0.031。结合形态学分析并通过解剖证实该个体的性腺尚未发育,确定了库尔勒机场挂网蝙蝠物种为大棕蝠。本研究为机场不易辨认或者保存不完整样本的物种鉴定提供方法依据。在确定物种后,了解其生活史特征,有利于机场动物撞击防范工作的精准实施,从而最大限度降低机场损失。 陈曦 丁鹏 高为震 梁倩如 时磊关键词:DNA条形码 系统发育树 采用DNA 条形码 技术鉴定口岸输入性鼠形动物 2024年 目的针对形态上难以识别的境外输入性鼠形动物,探索DNA 条形码 技术鉴定鼠种的可行性。方法江苏口岸收集1份输入性且在形态上难以鉴别的鼠形动物,通过PCR法扩增线粒体细胞色素C氧化酶Ⅰ基因(COI),目的片段经测序后进行序列比对分析,计算物种种间和种内的遗传距离,采用邻近法构建系统发育树。结果序列比对显示该输入性鼠形动物为黑家鼠(Rattus rattus);系统发育分析显示,物种种内遗传距离为7.7%,种间距离为11.6%~21.0%,该输入性鼠形动物在进化树上形成独立的进化分支。结论DNA 条形码 技术能准确鉴定输入性鼠形动物,尤其是有助于提高在形态上难以鉴别的鼠形动物鉴定的准确性。 孙玉婷 田锋 易海华 杨国平 张荣 田玲玲 孟媛 杨庆贵 耿合员关键词:DNA条形码 输入性 鼠形动物
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陈士林 作品数:847 被引量:8,476 H指数:48 供职机构:中国中医科学院中医药信息研究所 研究主题:DNA条形码 药用植物 中药材 产地适宜性 ITS2 宋经元 作品数:307 被引量:2,829 H指数:30 供职机构:中国医学科学院北京协和医学院药用植物研究所 研究主题:DNA条形码 ITS2 混伪品 条形码 药用植物 姚辉 作品数:150 被引量:1,755 H指数:25 供职机构:中国医学科学院北京协和医学院药用植物研究所 研究主题:DNA条形码 ITS2 混伪品 分子鉴定 条形码 石林春 作品数:87 被引量:929 H指数:17 供职机构:中国医学科学院北京协和医学院药用植物研究所 研究主题:DNA条形码 ITS2 混伪品 中药材 分子鉴定 孙伟 作品数:482 被引量:2,566 H指数:23 供职机构:中国医学科学院北京协和医学院基础医学院基础医学研究所 研究主题:股骨头坏死 ITS2 DNA条形码 混伪品 股骨头