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续随子MYB基因家族的鉴定及ElMYB114在油脂合成中的功能分析
2025年
MYB转录因子广泛参与植物的代谢和种子发育等生命过程。为探究其在续随子(Euphorbia lathyris L.)油脂合成及积累过程中的调控作用,本研究对续随子MYB转录因子进行了全基因组鉴定,分析了其基因结构、编码蛋白理化性质、启动子顺式元件以及时空表达谱,并克隆了ElMYB114基因的编码序列,将其转入烟草(Nicotiana tabacum L.),进一步鉴定该基因的生物学功能。结果显示:(1)全基因组鉴定获得199个续随子MYB基因,命名为ElMYB1~ElMYB199,编码蛋白均具有SANT结构域;(2)ElMYB114编码的蛋白定位于细胞核;(3)荧光定量qRT-PCR分析结果表明,ElMYB114基因在种子发育后期的表达量最高;(4)与转空载对照相比,异源表达ElMYB114基因的烟草株系,其叶片总油脂含量分别提高了3.7%和4.2%,种子总脂含量分别提高了11.0%和10.7%,表明过表达ElMYB114基因可提高植物组织的总油脂积累。研究为深入解析MYB介导的续随子油脂生物合成调控网络奠定了基础。
惠生娟葛丽萍王子瑜张玉胜苏云婷孙岩李润植
关键词:续随子MYB转录因子基因克隆
MYB基因调控植物花青素合成的研究进展被引量:1
2024年
花青素是高等植物体内非常重要的一类次生代谢产物,能够决定花和果实的颜色,同时具有很高的营养、保健功能。MYB蛋白是植物花青素合成途径中最广泛的调节因子,在植物花青素合成方面起着重要的调控作用。本研究阐述了花青素合成的研究现状,介绍了MYB基因在不同植物花青素合成中的正负调控作用,总结了MYB基因如何与其他因子相互作用调控花青素的合成以及外界环境因素对花青素合成的影响,旨在为作物品种改良提供理论依据,以期培育出富含花青素、安全优质的农作物品种。
张中华张会灵张菊平赵亚男李宁
关键词:MYB基因花青素生物合成
基于大豆叶枕响应叶柄角变化转录组的MYB基因分析
2024年
【目的】阐明MYB基因家族成员是否参与大豆叶柄角(leaf petioles angle,LPA)变化的调控过程,为大豆理想株型育种研究奠定基础。【方法】以郑196为材料,利用大豆叶枕响应叶片向光运动转录组挖掘差异表达大豆MYB基因(GmMYB);利用ProtComp 9.0进行亚细胞定位预测;以拟南芥MYB蛋白序列为参考,采用MEGA v5.0软件进行系统进化分析;分别利用在线程序MEME和PlantPAN3.0分析差异表达MYB基因保守基序(motif)和启动子序列的顺式作用元件;以NCBI数据库中大豆转录组数据及RNA-seq数据为基础,采用TBtools进行表达模式分析,并在此基础上进行候选基因的精准定量检测。【结果】①鉴定出13个差异表达GmMYB,其中上调表达9个,下调表达4个;亚细胞定位结果表明,11个MYB蛋白位于细胞核,2个位于细胞外基质。②基于MYB蛋白序列构建系统进化树,可将13个差异表达GmMYB分为6组。③对13个差异表达GmMYB基因结构进行分析,结果共鉴定到10个基序,其中基序1和基序2是MYB保守结构域的一部分。④在启动子区域鉴定获得脱落酸响应元件、参与干旱响应元件、响应光照的顺式作用元件、分生组织表达和生长素响应等多个响应逆境胁迫及光照的顺式作用元件。⑤表达模式分析结果表明,13个差异表达GmMYB基因在大豆不同组织器官中存在表达差异,其中Glyma.01G190100和Glyma.08G042100在叶枕处表达。⑥对Glyma.01G190100和Glyma.08G042100进行精准定量检测,结果显示其相对表达量在叶片向光运动前后变化剧烈,可作为大豆叶柄角调控候选基因用于进一步研究。【结论】鉴定出13个与大豆叶柄角调控相关的MYB基因,其中Glyma.01G190100和Glyma.08G042100可作为大豆叶柄角调控候选基因用于大豆理想株型育种研究。
常玮王娟郑清岭张彦威陈吉宝
关键词:大豆叶枕转录组MYB转录因子
高温干旱复合胁迫下铁皮石斛MYB基因家族鉴定及表达分析
2024年
【目的】研究铁皮石斛Dendrobium catenatum MYB(DcMYB)基因转录因子家族成员的结构和功能,鉴定参与高温干旱复合胁迫的主要成员及其表达模式,为今后研究铁皮石斛适应逆境胁迫的生理机制提供参考。【方法】基于铁皮石斛的全基因组与高温干旱复合胁迫处理后的转录组数据,筛选出响应高温干旱复合逆境的关键MYB转录因子,利用生物信息学方法进行分析和鉴定,实时荧光定量PCR分析在不同胁迫处理下的表达模式。【结果】鉴定出38个DcMYBs基因,可分为1R-MYB、R2R3-MYB和3R-MYB三种类型,其中R2R3-MYB占比89%;DcMYBs蛋白长为203-581aa,热稳定性佳,多具亲水性;亚细胞定位预测显示均存在于细胞核中,部分并存于其他细胞器;MEME分析揭示同亚组的MYB基因具有相似的结构特征;DcMYBs进化发育后将其分为19个亚组(D1-D19);顺式作用元件预测结果表明DcMYBs参与生物、非生物胁迫与激素诱导,DcMYB6、DcMYB15、DcMYB16、DcMYB21、DcMYB23、DcMYB35均含有干旱响应元件MBS,DcMYB6、DcMYB35还具有4个ABA响应元件ABRE;在高温干旱复合胁迫下,R2R3-MYB亚家族基因被显著诱导,关键基因的RT-qPCR验证与转录组数据一致,DcMYB6、DcMYB35在胁迫下上调,DcMYB15、DcMYB16、DcMYB21、DcMYB23下调;外源脱落酸和20%PEG6000处理具有干旱响应元件MBS基因结果显示在处理后都呈现先上升后下降的趋势,这6个基因可能参与ABA信号途径与干旱胁迫的响应。【结论】逆境胁迫下从铁皮石斛中鉴定出38个DcMYBs基因,R2R3-MYB为主要类型,编码蛋白均具有良好的热稳定性和亲水性且预测主要定位于细胞核;DcMYBs基因与拟南芥MYB具有较高的同源性;特定基因被干旱和外源脱落酸显著诱导,其可能参与生物、非生物胁迫与激素诱导,在铁皮石斛逆境生长发育中发挥重要作用。
田姗姗黄诗宇杨天为高曼熔张尚文何龙飞张向军李婷石前
关键词:铁皮石斛高温干旱MYB转录因子
一种检验MYB基因MYB lncRNA的引物及检测白血病的试剂盒
本发明涉及生物技术和医药领域,公开了一种检测MYB基因MYB增强子lncRNA的引物,其序列如SEQ ID NO.1‑6所示。还公开了一种检测白血病相关基因的试剂盒,含有上述的特异性引物。该引物和试剂盒可用于制备白血病...
张俊芳韩兵社王玉成王翔昌
铁十字秋海棠R2R3-MYB基因家族的鉴定及表达分析
2024年
【目的】对铁十字秋海棠(Begonia masoniana)R2R3-MYB基因家族进行鉴定分析,并检测R2R3-MYB基因家族成员在铁十字秋海棠叶片不同生长发育时期中叶斑区和非叶斑区的表达模式,为铁十字秋海棠叶斑分子调控机制和叶色改良及新品种培育提供理论参考。【方法】以铁十字秋海棠3个关键生长发育时期的叶片为试验材料,参考拟南芥R2R3-MYB家族蛋白序列,利用生物信息学方法从铁十字秋海棠基因组数据库中鉴定出R2R3-MYB基因家族成员,并对其理化性质、染色体定位、系统发育、基因结构、保守基序及启动子顺式作用元件等进行预测分析,并通过实时荧光定量PCR检测7个BmaMYBs基因在铁十字秋海棠3个生长发育期中叶斑区和非叶斑区的表达模式。【结果】从铁十字秋海棠基因组中鉴定出110个R2R3-MYB基因家族成员,该基因家族成员的氨基酸数量为128~870个,分子量为14660.85~97435.93 Da,理论等电点(pI)为4.92~10.10,成员之间差异较大,大部分为不稳定的疏水性蛋白,均定位在细胞核。110个R2R3-MYB家族基因在15条染色体上均有分布,部分基因在同一染色体上集中分布,形成基因簇;BmaMYBs含有0~10个内含子;约94%的成员含有Motif1、Motif2和Motif3基序;R2R3-MYB基因家族成员启动子均含有大量光响应元件;BmaMYB10、BmaMYB18、BmaMYB38、BmaMYB53、BmaMYB97、BmaMYB99和BmaMYB109基因在叶片发育过程中叶斑区与非叶斑区均有表达,叶斑区BmaMYB53基因的相对表达量较非叶斑区高达19.41~131.99倍。【结论】在铁十字秋海棠基因组中鉴定出110个R2R3-MYB基因家族成员,叶斑区与非叶斑区BmaMYB53基因的相对表达量差异最大,推测该基因是调控铁十字秋海棠叶斑形成的关键基因
刘雅芝邓惠敏彭嘉慧余义勋刘娟旭
关键词:花青苷叶斑
控制苹果果实中苹果酸含量的MYB基因及其应用
本发明公开了一种调控苹果果实中苹果酸含量的MdMYB123/mdmyb123基因,含有MdMYB123/mdmyb123基因的重组过量表达载体和沉默载体,含有MdMYB123/mdmyb123基因的重组菌和转基因植物组织...
马百全郑丽桐袁阳阳李明军马锋旺
百香果(Passiflora edulis)R2R3-MYB基因家族的结构和功能分析被引量:1
2024年
【目的】探究R2R3-MYB转录因子在代谢、发育等多种生物学过程中发挥的调控作用。对百香果R2R3-MYB基因家族进行表达分析并探究其在花果发育过程中的调控机制,对深入研究R2R3-MYB转录因子在百香果中的生物学作用中具有重要意义。【方法】基于百香果全基因组数据,通过HMM搜索对R2R3-MYB家族成员进行筛选鉴定,并利用实时荧光定量PCR分析其在百香果花不同组织中的表达模式。【结果】从百香果基因组中鉴定出99个R2R3-MYB基因,根据系统进化分析将其分为36个亚组。99个R2R3-PeMYB基因随机分布在9条百香果染色体上。基序和基因结构分析表明,R2R3-PeMYB在同一亚组中具有相对保守的结构特征。共线性分析表明,片段复制事件促进了百香果R2R3-MYB家族的扩张。基于转录组数据和qRT-PCR分析,发现R2R3-PeMYB基因在百香果花的不同组织的不同发育阶段中表现出差异的表达模式,说明R2R3-PeMYB基因在花不同组织和果实的发育过程中发挥重要作用,尤其是PeMYB62和PeMYB63在百香果果皮转色期的高表达,说明其可能参与百香果花青素的合成。同时8个R2R3-PeMYB基因在非生物胁迫(冷、热、盐和渗透压)下也表现出不同的反应,说明R2R3-PeMYB基因还受到非生物胁迫的诱导。【结论】鉴定了99个R2R3-PeMYB基因家族成员,发现其在百香果花果发育和胁迫诱导方面发挥重要作用,为今后研究百香果R2R3-MYB基因在花果发育中的功能和进化提供了有价值的线索。
张丹郑平邓彪柴改凤安昌邓考张文斌陆宇明卢翔宇王小媚王小媚
关键词:百香果系统发育分析
KLF1、BCL11A和HBS1L-MYB基因对β地中海贫血表型影响的研究进展
2024年
β地中海贫血(β地贫)是一种由β珠蛋白基因缺陷引起的遗传性溶血性疾病,其表型的影响因素在血液学研究领域中一直备受关注,其中激活胎儿血红蛋白(HbF)的持续表达被证明是缓解β地贫临床症状的有效方式之一。据文献报道,KLF1、BCL11A和HBS1L-MYB等修饰基因的突变会影响体内HbF的表达水平。现就KLF1、BCL11A和HBS1L-MYB基因对β地贫表型影响的研究进展进行综述,以便为β地贫的临床治疗提供新的参考依据。
胡俊杰龚维谢于旭徐卫华陈鑫苹
关键词:Β地贫HBF
丝瓜MYB基因家族的鉴定与表达模式分析
2024年
目的研究药食同源植物丝瓜Luffa cylindrica MYB(LcMYB)基因转录因子家族成员的结构和功能,鉴定参与抗褐化作用的主要成员及其作用机制。方法基于Pfam数据库及NCBI保守结构域分析,对丝瓜全基因组水平MYB转录因子进行鉴定。通过Expasy、MEME等在线工具分析LcMYB转录因子家族蛋白理化性质、顺式作用元件及保守结构域。然后利用MEGA软件构建系统发育树,分析丝瓜与拟南芥、苹果、番茄、茄子及马铃薯等植物MYB蛋白的系统发育关系。结合2个褐化敏感程度不同的丝瓜转录组,筛选了丝瓜褐化相关的关键MYB转录因子及其靶基因。结果全基因组水平共鉴定到449个具有相似基因结构及保守基序的MYB基因,可聚类为4个亚家族(R1_MYB、R2R3_MYB、R3_MYB和R4_MYB),并在正反链均存在可能的顺式调控元件。靶基因基因表达分析结果显示多个MYB及其靶基因尤其是多铜氧化酶相关基因可能在鲜切丝瓜的不同褐化阶段起重要的作用,是丝瓜褐化的关键调节因子。结论系统鉴定了LcMYB家族基因,并鉴定了可能参与丝瓜褐化的MYB基因及其靶基因,有助于进一步了解和丰富LcMYB基因家族的生理功能,并为进一步解析果实褐化调控机制,提高果实品质提供了候选基因
吴珊余小丽宋航孙淼曾厚圆杨丽欣刘雷练华山刘鹏
关键词:丝瓜转录因子褐化

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牛建新
作品数:217被引量:988H指数:19
供职机构:石河子大学农学院
研究主题:库尔勒香梨 核桃 葡萄 RT-PCR RT-PCR检测
汤晓玉
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