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NCOA1{1}SNP位点的应用及其试剂盒
本发明涉及生物技术领域,尤其涉及NCOA1{1}SNP位点的应用及其检测试剂盒。本发明通过分析,发现了多浪羊产羔数与NCOA1{1}32015148G>A、32033237A>G处的SNP位点密切相关。基于此,本...
史洪才牛志刚王珊冯东河李晓林汪立芹林嘉鹏吴阳升常璐黄俊成
文献传递
多浪羊NCOA1{1}多态性与产羔数的相关分析被引量:3
2020年
分析研究了新疆多浪羊核受体辅激活蛋白基因(Nuclear receptor coactivator1 gene,{1}1)的多态性及其与产羔数的相关性。结果表明:{1}1基因存在两个多态位点,分别为内含子12的g.166397 A>C突变位点和外显子17的g.187501 G>A突变位点;g.166397 A>C突变位点的优势基因为A等位基因,基因频率为0.968;g.187501 G>A突变位点的优势基因为B等位基因,基因频率为0.643,且在该突变位点发生了错义突变,由原编码的丝氨酸(Ser)改变为谷酰胺酸(Gln);在多浪羊{1}1基因的g.166397 A>C突变位点,AA基因型个体的产羔数显著高于BB基因型个体的(P<0.05);在多浪羊{1}1基因的g.187501 G>A突变位点,BB基因型个体的产羔数显著高于AA和AB基因型个体的(P<0.05)。由此推断{1}1基因可以作为多浪羊多羔性状的候选基因
牛志刚王珊常璐史洪才
关键词:多浪羊繁殖率NCOA1基因
NCOA1{1}mRNA表达及多态性与黔北麻羊产羔性状关联性分析
2020年
为了研究核受体辅激活蛋白1(NCOA1)对黔北麻羊繁殖性能的影响,试验采用DNA测序技术,利用SeqMan软件分析测序结果初步筛选SNP位点,根据筛选出的SNP位点应用RNA在线二级结构预测软件中的RNA secondary structure prediction、ProtScale、DNAStar软件中的EditSeq分析NCOA1基因突变位点的二级结构、理化性质、亲疏水性、结构域,运用SPSS 20.0软件分析NCOA1基因型与产羔数的关联性;再应用实时荧光定量PCR方法检测NCOA1基因在黔北麻羊子宫、输卵管、垂体、下丘脑、卵巢5个器官中mRNA的表达水平。结果表明:在外显子7处发现2个SNP位点,命名为G144A和G155A,其中G144A属于同义突变,编码的氨基酸未发生改变,G155A属于错义突变,编码的精氨酸突变为赖氨酸,导致外显子7所编码的氨基酸自由能升高,稳定性降低,分子质量变大,等电点升高,疏水性增强,但未发现保守结构域和特殊结构域,即NCOA1基因外显子7编码的蛋白无特异结构和独立功能;对G155A位点进行基因分型,发现GG基因型个体产羔数分别比GA、AA基因型个体多0.249只(P>0.05)和0.377只(P<0.05);NOCA1基因mRNA在黔北麻羊5个器官中均有表达,在下丘脑中的表达量最高,在输卵管中的表达量最低,且卵巢、下丘脑中的表达量极显著高于输卵管、子宫(P<0.01),垂体中的表达量显著高于子宫和输卵管(P<0.05)。说明NCOA1基因对黔北麻羊繁殖性能有一定影响,有G155A突变位点的GG基因型也对黔北麻羊高产有一定影响,可作为筛选黔北麻羊高繁殖力品系的一个潜在指标。
敖叶周志楠吴雨洪磊骆金红张艳张艳
关键词:黔北麻羊基因分型产羔性状
红眼白水貂FSHβ和NCOA1{1}多态性及其与繁殖性状的相关分析被引量:5
2018年
本研究旨在检测红眼白水貂促卵泡激素β(follicle-stimulating hormone beta subunit,FSHβ)和核受体辅激活蛋白1(nuclear receptor coactivator 1,NCOA1){1}多态性与繁殖性状的关系。采用单链构象多态性(SSCP)和DNA测序相结合的方法检测了红眼白水貂215个个体的单核苷酸多态性,针对红眼白水貂群体的特点建立合适的统计分析模型,利用SAS 9.4统计软件对候选{1}进行多态性分析,并采用最小二乘法分析了总产仔数和产活仔数的遗传效应。结果表明,在红眼白水貂FSHβ{1}上存在2个多态位点,分别为内含子1处的g.1228G>A突变和外显子2处的g.1866T>C突变;在NCOA1{1}上存在1个多态位点,为第6外显子处g.151536T>C突变。在红眼白水貂群体中,FSHβ{1}的优势{1}为B等位{1},NCOA1{1}的优势{1}为A等位{1};FSHβ{1}g.1228G>A位点的AA和AB{1}型个体在总产仔数、产活仔数上均极显著高于BB{1}型(P<0.01),g.1866T>C位点在总产仔数和产活仔数上呈现BB>AB>AA的趋势;NCOA1{1}的AB{1}型个体的总产仔数和产活仔数均极显著高于AA{1}型(P<0.01);g.151536T>C与g.1228G>A的合并{1}型对繁殖性状有显著影响(P<0.05)。因此,可以利用以上突变位点对红眼白水貂的繁殖性状进行标记辅助选择研究。
霍自双刘宗岳岳志刚杜智恒丛波刘琳玲杨福合孙余卓白秀娟
关键词:繁殖性状单核苷酸多态性FSHΒ基因NCOA1基因
ESR与NCOA1{1}多态性对大白猪繁殖性能的影响被引量:2
2018年
为研究ESR与NCOA1{1}多态性对大白猪产仔数的影响。试验采用PCR-RFLP技术检测{1}多态性,并分析{1}型与母猪的产仔数的关系。结果两个{1}都检测到了3种{1}型。分析发现经产母猪中ESR{1}BB型个体的健仔数比AA型个体多0.31头,经产母猪NCOA1{1}AB型个体的死胎比AA型多0.10头。经产母猪中合并{1}型AAAB型的活仔数和健仔数比AAAA型多0.49和0.48头;而ABAA型个体的活仔数和健仔数比AAAA型多0.27和0.14头。结果表明,ESR和NCOA1{1}对大白猪的繁殖性状有一定的影响。
邱梅玉黄涛孙敬礼胡九英汪德明来红霞
关键词:ESR繁殖性能
NCOA1{1}SNP位点的应用及其试剂盒
本发明涉及生物技术领域,尤其涉及NCOA1{1}SNP位点的应用及其检测试剂盒。本发明通过分析,发现了多浪羊产羔数与NCOA1{1}32015148G&gt;A、32033237A&gt;G处的SNP位点密切相关。基于此,本...
史洪才牛志刚王珊冯东河李晓林汪立芹林嘉鹏吴阳升常璐黄俊成
NCOA1{1}多态性与豫南黑猪繁殖性能相关分析被引量:5
2013年
文章从147头豫南黑猪毛囊中提取基因组DNA,采用PCR-RFLP方法检测{1}1基因在豫南黑猪中多态性分布,并分析不同基因型与繁殖性能关系。结果表明,{1}1基因RsaI酶切多态性对母猪繁殖性能有显著影响,在总产仔数、产活仔数、出生窝重和21日龄断奶窝重上都呈现AA>AB>BB趋势,豫南黑猪AA型母猪平均总产仔数、产活仔数、出生窝重和21日龄断奶窝重分别是10.271头、9.786头和12.768 kg、40.559 kg,比BB型高1.364头、1.274头和1.401 kg、4.222 kg。在试验猪群中,A为优势等位基因,AA基因型为优势基因型。
任广志郭吉利郜军伟范兴兴李改英李新建
关键词:豫南黑猪NCOA1基因基因型
邵伯鸡母系(S2)ESR和NCOA1{1}多态性与产蛋性能关联分析及其表达规律研究
本研究以江苏省家禽科学研究所培育的优质肉鸡新品种(配套系)——邵伯鸡母系品系(S2系)为研究对象,以ESR和NCOA1{1}为候选{1}。研究结果如下:  (1)采用单链构象多态性PCR技术对ESR和NCOA1{1}进行多态性...
武子寅
关键词:邵伯鸡基因多态性产蛋性能
NCOA1{1}和ADAMTS1{1}多态性及其与繁殖性状相关性分析
核受体辅激活蛋白1(NCOA1){1}通过与结合到DNA上的核受体相互作用并增强转录活性,受到影响的雄激素受体、雌激素受体等受体在动物的生长发育和繁殖等生理过呈起到重要作用。含凝血酶敏感蛋白模体的去解联金属蛋白酶(ADAM...
郜军伟
关键词:NCOA1基因繁殖性状
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NCOA1{1}发育性表达模式的研究被引量:2
2011年
应用实时荧光定量PCR技术,以不同繁殖性能的母系(S3系)、父系(Y、F、D系)为研究对象,研究了鸡NCOA1{1}不同发育时期在下丘脑、垂体、卵巢、肝脏和血液中的相对表达量及表达模式。结果表明,NCOA1{1}在鸡性腺轴组织中高水平表达,NCOA1{1}在组织中的表达量与鸡性腺发育和产蛋性能呈相似的变化规律。随着生长发育的变化NCOA1{1}表达量也呈波动性增加,14周龄前其表达量较少,性成熟后NCOA1{1}表达量快速增加,28周龄时表达量达到峰值,之后表达量下降。产蛋性能较好的母系鸡NCOA1{1}的相对表达量比产蛋性能较差的父系鸡较早地开始增加,并在14周龄后表达量显著高于父系鸡(P<0.05)。本研究初步揭示了鸡生长发育过程中NCOA1{1}表达的发育性变化模式和品系差异,为进一步研究NCOA1{1}对鸡繁殖性状的影响提供了基础数据。
赵振华黎寿丰黄华云李春苗张静薛龙岗丁余荣
关键词:实时荧光定量PCRNCOA1基因

相关作者

赵振华
作品数:256被引量:445H指数:12
供职机构:中国农业科学院家禽研究所
研究主题:优质肉鸡 肉鸡 优质鸡 邵伯鸡 肉品质
黄华云
作品数:195被引量:379H指数:12
供职机构:中国农业科学院家禽研究所
研究主题:优质肉鸡 肉鸡 优质鸡 邵伯鸡 母系
张静
作品数:173被引量:329H指数:9
供职机构:中国农业科学院家禽研究所
研究主题:试剂盒 PCR引物 性别鉴定 引物 鸡肉
黎寿丰
作品数:198被引量:420H指数:12
供职机构:中国农业科学院家禽研究所
研究主题:优质肉鸡 优质鸡 肉鸡 邵伯鸡 母系
丁余荣
作品数:45被引量:216H指数:6
供职机构:江苏省家禽科学研究所
研究主题:青壳蛋鸡 母系 邵伯鸡 种鸡 产蛋性状