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蒲公英总DNA的提取及其RAPD-PCR反应条件的优化被引量:3
2010年
目的建立并优化蒲公英样品总DNA提取方法及其RAPD-PCR反应体系。方法采用改良的CTAB法提取基因组DNA,对蒲公英RAPD-PCR反应体系中各个主要影响因子进行了优化和筛选。结果建立了多态性高、重复性好、可用于蒲公英RAPD分析的最佳反应体系。25μl反应体系中含有:1×TaqMix buffer,50 ng DNA模板,0.4μmol/L引物,1.5mmol/L Mg2+,0.25 mmol/L dNTPs,1.25UTaq酶。扩增程序为:94℃预变性5 min;94℃变性1 min,38℃复性1 min,72℃延伸2 min,共40个循环;72℃延伸10 min,反应结束后,4℃保存。结论这一优化体系的建立为今后利用RAPD标记技术进行蒲公英鉴定及种质资源遗传多样性分析奠定了基础。
李喜凤杜云锋张红梅郝哲许闽白雁
关键词:蒲公英基因组DNA提取随机扩增多态性DNA技术
甘薯RAPD-PCR反应条件的优化被引量:5
2009年
以徐薯22的基因组DNA作为PCR反应模板,以随机引物进行RAPD-PCR反应,通过设置TaqDNA聚合酶加量、MgCl2浓度、dNTPs浓度、模板DNA加量、引物加量的不同梯度,探索出一套适合甘薯RAPD-PCR的最优反应条件。试验结果表明,最优反应条件反应体系25.0μL,2.5μL的PCR 10×Buffer、0.15U的Taq DNA聚合酶、3.0 nmol·μL-1的MgCl2、0.6 nmol·μL-1的dNTPs、40 ng的DNA模板、40 ng的RAPD引物。
雷剑杨新笋
关键词:甘薯
人参基因组DNA的提取及RAPD-PCR反应条件的优化被引量:6
2009年
探讨了人参基因组DNA提取方法及RAPD-PCR反应条件的优化.结果表明,用改良的CTAB方法提取的DNA均达到了RAPD-PCR分析的要求;优化的RAPD-PCR反应条件为:在25μL RAPD-PCR反应体系中,模板DNA 20 ng,dNTP 200μmol/L,MgCl21.5mmol/L,10×Buffer 2.5μL,引物浓度0.4μmol/L,Taq DNA聚合酶1.0 U,其余以ddH2O定容至25μL.PCR反应程序为:94℃预变性5 min;94℃45 s,40℃退火1 min,72℃1 min,共40个循环;最后在72℃延伸5 min.
周桐金东淳伊旭武立丹
关键词:人参DNA
荷包猪RAPD-PCR反应条件研究
2009年
[目的]建立适合荷包猪RAPD-PCR反应的最佳反应体系。[方法]以荷包猪为试验材料,以MgCl2浓度、引物浓度、dNTP浓度、模板DNA用量、TaqDNA聚合酶用量及退火温度为影响因子,在保持其他影响因子一致的条件下,变化单一因子,筛选最优参数,研究各影响因子对RAPD-PCR反应的影响。[结果]最佳反应体系的总体积为20.0μl,MgCl2浓度为2.5μmol/L、引物浓度2.0μmol/L、dNTP浓度400.0μmol/L、模板DNA为100 ng/μl、TaqDNA聚合酶为1.0 U。PCR反应程序:94℃预变性2 min(94℃变性1 min,36℃退火1 min,72℃延伸1 min,循环40次),72℃延伸5 min。此反应体系所扩增出来的结果比较稳定,带型清晰且亮度适中。[结论]该研究为应用RAPD技术对荷包猪作进一步的遗传分析奠定了基础。
赵艳刘伟朱雷
关键词:荷包猪RAPD-PCR
北五味子RAPD-PCR反应条件优化被引量:4
2009年
以采自吉林省汪清地区野生北五味子叶片为材料,提取其基因组DNA,并以此为模板进行北五味子RAPD-PCR反应条件的优化.结果表明,PCR反应混合液为:25μL PCR反应体系中加入20 ng模板DNA,200μmol/L dNTPs,0.3μmol/L引物,2.0 mmol/L Mg2+,1 UTaqDNA聚合酶,2.5μL 10×Buffer;PCR反应程序为:94℃预变性5 min后,在94℃变性1 min,40℃退火1 min,72℃延伸2 min,共40个循环后,在72℃下最后延伸5 min时,在不同引物中均扩增出清晰而稳定的DNA电泳谱带.
伊旭金东淳武立丹周桐
关键词:北五味子基因组DNARAPD-PCR
散斑壳属真菌RAPD-PCR反应条件的优化被引量:3
2006年
以分离自四川省二郎山林场云南松上的松针散斑壳菌(Lophodermium pinastri)为材料,提取其总基因组DNA做为RAPD-PCR体系优化的模板。研究了dNTPs、Mg^(2+)、DNA模板、Taq酶、引物等组分对RAPD反应结果的影响,并建立了最佳反应体系:25μL PCR反应体积,10×Taq酶缓冲液2.5μL,1.5 U Taq酶,20 ng DNA模板,0.4 mmol/L dNTPs,4.0 mmol/L Mg^(2+),0.48μmol/L引物,10.2μL ddH_2O。
杨静刘应高
关键词:RAPD-PCR
罗汉果DNA的提取及RAPD-PCR反应条件的优化
2006年
本研究采用改良SDS方法提取罗汉果基因组DNA,得到的DNA质量较高,适合于RAPD-PCR分析,在25μl反应体系中,RAPD分析的优化反应体系:200μmol/LdNTP,0.4μmol/L随机引物,ExTaqDNA聚合酶1U,模板DNA50ng/反应
黄江庾韦花韦弟陈廷速蒋慧萍李杨瑞
皮下盘菌属及其近似类群RAPD-PCR反应条件的优化被引量:10
2005年
以悬钩子皮下盘菌等总基因组DNA为皮下盘菌属(Hypodermade Not.)及其近似类群RAPD体系优化的模板,对模板DNA浓度、dNTPs浓度、Mg2+浓度、引物浓度、TaqDNA聚合酶浓度等反应体系以及退火温度和时间、延伸时间、循环次数等扩增程序条件进行优化,寻找出适合此类菌物RAPD-PCR反应的最佳反应体系和最佳扩增程序。
何宇峰王士娟叶光斌林英任
关键词:皮下盘菌属齿裂菌属散斑壳属RAPD-PCR反应条件
沙棘属植物RAPD-PCR反应条件的优化被引量:4
2005年
采用L16(45)正交试验设计研究了沙棘属植物RAPDPCR反应中DNA模板浓度、引物浓度、dNTPs浓度、Mg2+浓度和Taq酶含量等5个因素对于PCR扩增效果的影响,并对照温度梯度探讨了退火温度等热循环参数,确定适合沙棘属植物的最佳扩增体系为:模板DNA1.0mg·L-1,引物3.0μmol·L-1,dNTPs0.1mmol·L-1,Mg2+2.5mmol·L-1,Taq聚合酶8.33~16.67nkat;扩增程序中最适退火温度为35~36℃.
张辉张建清苏雪张超强杜斌
关键词:沙棘RAPD
小鼠基因组RAPD-PCR反应条件的优化与筛选被引量:1
2005年
目的筛选优化小鼠RAPD-PCR反应体系及扩增程序。方法以2条引物对4个品系的小鼠基因组DNA在各种不同条件下进行RAPD-PCR,分析比较扩增结果。结果扩增结果较好的反应体系及扩增程序如下:在25 ml的反应体系中含有10×buffer2.5μl,dNTP 200 mmol/L,Mg2+ 2.5mmol/L,引物0.2 mmol/L,Taq酶1.25 U,扩增程序为94℃变性1 min,40℃退火1 min,72℃延伸90 s,40个循环后72℃延伸5 min。结论这一反应体系和扩增程序在我们实验室得到了较好的扩增效果。
梁永利刘学玲李浩朱健

相关作者

武立丹
作品数:4被引量:20H指数:3
供职机构:延边大学农学院
研究主题:北五味子 外植体 愈伤组织 DNA RAPD-PCR反应条件
韦弟
作品数:99被引量:296H指数:11
供职机构:广西农业科学院
研究主题:香蕉 香蕉枯萎病 枯萎病 香蕉品种 抗枯萎病
张辉
作品数:55被引量:285H指数:11
供职机构:西北师范大学生命科学学院
研究主题:中国沙棘 孟德尔 RAPD 棱果沙棘 遗传学
黄江
作品数:15被引量:60H指数:4
供职机构:桂林医学院生物技术学院
研究主题:抗病基因 小麦 RAPD 白粉菌 白粉病
庾韦花
作品数:60被引量:201H指数:9
供职机构:广西农业科学院
研究主题:铁皮石斛 五指毛桃 移栽 育苗 毛葡萄