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RNA编辑被引量：2: 1999年; ＲＮＡ编辑是一种基因转录产物所包含的信息在转录中或转录后被改变的过程，从某种意义上是对中心法则的一种扩展。本文以Ｋｉｎｅｔｏｐｌａｓｉｄ线粒体ＲＮＡ为例，对ＲＮＡ编辑反应的基本过程及反应模型进行了综述，并对可能参与编辑反应的反式因子及ＲＮＡ编辑反应类型与进化意义作了简单介绍。; 刘巍峰高东; 关键词：RNA编辑

基于大规模RNA-seq数据绘制猪RNA编辑图谱的研究: 2024年; 【目的】A-to-I RNA编辑是一种由ADAR酶家族介导的共转录/转录后修饰,系统绘制猪的RNA编辑图谱,为猪的分子育种提供候选靶标。【方法】收集16种猪组织的3461个RNA-seq数据,采用生物信息学方法检测猪RNA编辑位点。【结果】共检测到130989个RNA编辑位点,其中,A-to-I RNA编辑位点有124208个。A-to-I RNA编辑位点特征分析表明,98.2%的位点位于重复区域,且主要位于猪特异性的SINE反转录转座子区域的PRE-1/Pre0_SS元件内。只有12.3%的A-to-I RNA编辑位点具有编码意功能。最后,本研究分析了7种组织(脂肪、大脑、大肠、小肠、骨骼肌、肝和肺)的特异性A-to-I RNA编辑位点,脂肪组织特异性位点宿主基因的功能富集分析表明,这些基因在与细胞脂质代谢过程、脂质代谢过程、硫酯代谢过程等相关的信号通路中富集。在这些通路中,与脂肪沉积相关的基因有PDK1、ACSL1和PDE3B等。【结论】绘制了猪的RNA编辑位点图谱,为猪的分子育种提供了候选靶点。; 龙佳佳刘玮玮范新浩黎旺长杨小淦唐中林; 关键词：脂肪沉积

RNA编辑: 本发明涉及一种在多聚谷氨酰胺(polyQ)疾病的治疗和/或预防中供使用的反义寡核苷酸，其中所述反义寡核苷酸能够与编码polyQ疾病相关蛋白质的mRNA的CAG重复区域特异性结合，使得形成双链RNA，所述双链RNA能够吸引...; L·约森T·默克尔A·莫埃哈特霍格J·维克萨

ADAR1介导的RNA编辑在血液肿瘤中的调控作用: 2024年; RNA编辑是发生于双链RNA(dsRNA)上的一类重要转录后反应,可通过碱基插入、缺失或替换的方式改变RNA的核苷酸序列从而丰富转录组和蛋白质组水平的多样性。哺乳动物中最常见的RNA编辑是ADAR家族介导的腺嘌呤-次黄嘌呤编辑(A-to-I),其在碱基配对过程中被识别为鸟嘌呤。人类转录组中已报道了数百万个A-to-I编辑位点,而ADAR1是最主要的催化酶。在血液肿瘤中,ADAR1的失调将直接影响基因编码区、非编码区和miRNA前体的A-to-I编辑状态,从而导致一系列分子事件改变,如蛋白质编码序列改变、内含子滞留、选择性剪接和miRNA生物发生受抑制。近年来研究发现,异常的RNA编辑导致分子调控网络的紊乱,促进细胞增殖、凋亡受阻和细胞耐药,是白血病干细胞(LSCs)生成和干性维持的重要因素。目前,以RNA编辑为靶点的新药(如rebecsinib)已经在动物实验中取得良好疗效。有别于传统抗肿瘤药,表观遗传抗肿瘤药有望克服血液肿瘤的耐药、复发难题,为患者提供全新治疗选择。本综述总结了ADAR1介导的RNA编辑在血液肿瘤中的作用机制及其生物学功能研究的进展,并探讨了其在药物研发和临床应用中的价值。; 万星煜郭焕平黄瑞昊王筱淇曾令宇吴涛夏琳张曦; 关键词：血液肿瘤 RNA编辑

基于A-to-I RNA编辑的列线图预测肺腺癌患者的总生存期: 2024年; 目的应用ATIRE建立预后模型预测LUAD患者的总生存期(OS),并根据ATIRE风险评分和临床病理特征构建预测LUAD患者OS的列线图。方法从癌症基因组图谱(TCGA)数据库中下载LUAD患者的RNA编辑数据、转录组数据及相应的临床资料,探讨与生存相关的ATIRE。患者随机分为建模组(n=287)与验证组(n=192),通过单因素COX风险回归、套索算法(Lasso)回归以及多元逐步COX风险回归分析,识别与生存相关的ATIRE位点并建立ATIRE风险评分。构建列线图预测LUAD患者的OS。分析RNA编辑与基因表达的相关性以及ATIRE对转录组表达的影响。结果确定了4个位点作为最优预后位点,ADAM19|chr5:156904952、CWF19L1|chr10:101992267、FOXK1|chr7:4809281、CPT1A|chr11:68523468。建立风险评分,高风险组的OS在建模组、验证组和所有患者组均明显降低。列线图在预测LUAD的OS方面表现良好。结论基于AITRE模型可作为预测LUAD生存率的新工具。; 朱鑫杰包德荣徐玉芬; 关键词：肺腺癌 RNA编辑列线图

一种新的基于A-I RNA编辑预测乳腺癌预后模型的建立和验证: 2024年; 目的:开发一种基于腺苷到肌苷的脱氨基(A-to-I RNA编辑,ATIRE)的预后模型用于改善乳腺癌的个体化治疗。方法:首先使用单变量Cox回归分析来获得训练集中与总生存(OS)相关的ATIRE位点,然后进行最小绝对收缩和选择算子(LASSO)回归算法来确定最佳预后ATIRE位点,进行多因素Cox比例风险回归分析建立风险模型,纳入ATIRE风险评分和临床病理学特征变量构建预后列线图,绘制校准曲线并计算一致性指数以评价模型的预测概率与实际的一致性,通过决策曲线分析(DCA)评价该模型的临床收益价值。结果:确定18个预后位点用来构建预后模型,并生成ATIRE风险评分。高风险评分患者的中位生存时间显著缩短,列线图在预测乳腺癌的OS概率方面表现良好。校准曲线表现出优异的一致性,决策曲线显示其具有更高的净收益。结论:分析ATIRE事件在预测乳腺癌生存中的作用,基于AITRE的预后模型可以帮助临床医师更好进行临床决策。; 李健刘阳闫霞王颜; 关键词：乳腺癌列线图

RNA编辑组合物和使用方法: 本文提供了工程化向导，其被构造用于在与靶RNA分子杂交时形成双链RNA底物，所述双链RNA底物包含(i)包含至少一个结构特征的区域；和(ii)第一内环和第二内环，其中双链RNA底物募集RNA编辑实体并促进靶RNA分子中的...; 扬尼斯·萨瓦杰森·撒迪厄斯·迪恩布赖恩·约翰·布斯理查德·托马斯·沙利文阿德里安·阮格汉姆·布里格斯莉娜·拉吉里·巴盖帕尔利亚兹明·伊内斯·罗维拉冈萨雷斯郭岚

采用工程化RNA利用内源ADAR进行靶向的RNA编辑: 本申请提供了通过在宿主细胞中引入脱氨酶募集RNA以使靶RNA中的腺苷脱氨来编辑RNA的方法。本申请还提供了用于RNA编辑方法的脱氨酶募集RNA以及包含其的组合物和试剂盒。; 魏文胜伊宗裔璩良田峰王春慧朱诗优周卓

靶向LRRK2的RNA编辑工程化指导RNA和多核苷酸: 本文公开了用于治疗受试者的疾病或疾患(例如，帕金森病)的靶向LRRK2的工程化潜在指导RNA和包含其的组合物。本文还公开了通过施用本文所述的工程化潜在指导RNA或药物组合物来治疗受试者的疾病或疾患(例如，帕金森病)的方法...; 布赖恩·布斯杰森·撒迪厄斯·迪恩郭岚理查德·托马斯·沙利文莉娜·拉吉里·巴盖帕尔利扬尼斯·萨瓦阿德里安·阮格汉姆·布里格斯

反义寡核苷酸（ASO）与内源性作用于RNA的腺苷脱氨酶（ADAR）用于高效精确RNA编辑: 本发明涉及一种用于在具有内源性ADAR的细胞内对靶RNA进行定点A到I编辑的经化学修饰的寡核苷酸，其包含能够与所述靶RNA中的靶序列结合的11至100个核苷酸长度的序列，所述序列具有3个核苷酸的中心碱基三联体，其中，中心...; 托斯顿·斯塔福斯特恩加金姆·拉蒂菲劳拉·索菲亚·普菲弗

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