公共文化服务平台

搜索到370篇“ SSR荧光标记“的相关文章

利用SSR荧光标记构建山楂种质分子身份证: 2024年; 以91份山楂种质资源为材料,使用SSR标记对其进行分子身份证构建,并进行遗传多样性分析。从山楂基因组数据库中开发并设计了96对引物,筛选出了12对多态性好的引物,利用SSR荧光标记毛细管电泳技术检测扩增条带的分子量,并分析参试样品的扩增带型。采用数字与字母组合的方式,依据12对引物的多态性信息含量由高到低排列引物扩增结果,生成各材料的指纹编码。基于非加权组平均法(unweighted pair-group method with arithmetic means,UPGMA)对91份山楂资源进行聚类分析。结果表明,12对SSR引物从91个山楂种质资源样品中共扩增到67个等位基因,其平均等位基因数、有效等位基因数、观测杂合度、期望杂合度分别为5.583、2.730、0.490、0.593,Shannon’s信息指数平均值为1.195,多态性信息含量介于0.300~0.715之间,平均为0.551。91份山楂资源的遗传相似系数范围为0.25~0.98,平均值为0.529,在遗传相似系数0.46处时可分为5大类群。根据引物的多态性信息含量高低选择引物组合,构建了山楂种质区分需要的最少引物组合。; 秦宇郭荣琨农惠兰王燕崔凯董宁光; 关键词：山楂种质资源 SSR荧光标记分子身份证

基于SSR荧光标记的121份野生枸杞种质遗传结构解析: 2024年; 以采集的121份野生枸杞(Lycium barbarum L.)种质为材料,用9对SSR引物进行扩增,采用GeneALEX、Power Marker软件进行多态性分析,利用NTSYS、STRUC-TURE软件进行遗传多样性分析、聚类分析和主成分分析。结果表明,9对SSR引物共检测到108个等位基因,等位基因数(Na)、有效等位基因数(Ne)、观测杂合度(Ho)、期望杂合度(He)、多态信息含量(PIC)、Shannon’s信息指数分别为12个、4.620个、0.678、0.651、0.629、1.568;聚类结果显示121份野生枸杞种质可划分为5个亚群,群体遗传结构表明当K=5时,121个种质划分为5个亚群,来自宁夏的NXGY-02、NXGY-032个种质与来自内蒙古的6个种质之间的遗传距离最远,亲缘关系较远,来自青海省、新疆、甘肃省及内蒙古的其余野生枸杞种质之间存在广泛的基因交流现象;宁夏、内蒙古的野生枸杞种质具有独立起源进化的可能,而新疆、甘肃省、青海省的种质与宁夏种质亲缘关系较近,很可能属于同一起源。; 戴国礼刘娜秦垦张波尹跃米佳何昕孺; 关键词：种质 SSR荧光标记

应用SSR荧光标记法构建22个柚类品种的分子身份证被引量：8: 2023年; 【目的】应用荧光SSR分子标记构建柚类种质分子身份证,用于品种资源鉴定。【方法】收集22份柚类材料,筛选SSR荧光标记引物,采用荧光毛细管电泳检测技术分析扩增条带分子质量和等位基因,获得相应的扩增带型,从而对每份柚材料进行标记。采用个位阿拉伯数字和小写英文字母对不同等位基因分子质量大小进行编码,再按照引物扩增带型数由大到小顺序将各位点赋值编码的数字串联排序,构建供试样品的分子身份证。【结果】筛选出4对多态性较好的引物,使用这4对引物共检测到49个扩增带型和41个SSR等位位点,平均每对引物的有关带型数12.25个、位点数10.25个。【结论】通过扩增带型分析,构建了22份柚类种质的分子身份证,包括12条信息独特的身份证。遗传聚类与分子身份证分析结果一致,为柚类品种鉴定和保护提供了重要依据。; 吴仕蔓娄兵海陈传武唐艳邓崇岭武晓晓; 关键词：柚类种质资源 SSR荧光标记分子身份证

SSR荧光标记毛细管电泳分析16个博落回种质资源的遗传多样性: 2023年; 为分析我国13个省份博落回种质资源的遗传多样性,明确其亲缘关系和遗传差异。利用SSR荧光标记毛细管电泳技术对16份博落回种质资源进行遗传多样性分析。结果表明:16个博落回种质资源多态信息含量(PIC)值的变化范围为0.375~0.687,遗传相似系数范围为0.0714~0.7142。聚类分析结果显示,在相似系数0.3处可将16份博落回种质资源分为3个大类群,第Ⅰ大类有7份种质资源,第Ⅱ大类有1份种质资源,第Ⅲ大类有8份种质资源。此外,构建了16份博落回种质资源的DNA指纹图谱数据库,开发了相对应的指纹图谱。研究结果可为博落回种质资源的分类鉴定、遗传多样性分析和品种选育提供可用的分子标记以及参考依据。; 牛雨晴朱育菁郑梅霞朱雁鸣陈宏苏海兰; 关键词：博落回 SSR 分子标记

基于SSR荧光标记构建睡莲核心种质被引量：3: 2023年; 采用SSR荧光标记技术对240份睡莲资源进行遗传多样性分析;利用Structure软件分析其群体结构,采用主成分分析和聚类分析进行验证;基于最小距离逐步取样法构建核心种质并进行t筛选验证。结果表明,16对SSR荧光引物共检测到205个等位基因,平均Shannon’s信息指数(I)为0.2036,Nei’s基因多样性指数(H)为0.1168,有效等位基因数(N_(e))为1.1697,表明睡莲的遗传多样性丰富。Structure软件分析结果显示最优的群体数K值为3,群体间有少量种质混杂;群体结构分析将240个睡莲品种(种)分为3个类群。采用最小距离逐步取样法,按70%、65%、60%、55%、50%、45%、40%、35%、30%、25%、20%、15%和10%的比例取样,各个核心子集遗传多样性指数总体上变化不明显;最终确立了15%的取样比例,包含36个睡莲品种(种)核心种质,其中Shannon’s信息指数(I)保留率为117%,Nei’基因多样性指数(H)保留率为118%,有效等位基因数(N_(e))保留率为102%。t检验结果表明,构建的包含36个睡莲品种(种)的核心种质与原始种质的遗传参数无显著差异,能充分代表原始种质的多样性。; 苏群王虹妍刘俊李春牛卜朝阳林玉玲卢家仕赖钟雄; 关键词：睡莲 SSR荧光标记核心种质

一种基于SSR荧光标记的非洲菊种质资源鉴评方法: 本发明公开了一种基于SSR荧光标记的非洲菊种质资源鉴评方法，属于分子生物学领域，以编号GHSSR‑1、GHSSR‑18、GHSSR‑20和GHSSR‑21的4对引物为核心，基于该4对SSR荧光标记引物扩增结果，对多态性片...; 刘小飞于波钟荣辉孙映波黄丽丽杨钰钗

SSR荧光标记毛细管电泳分析24个广西常规香稻品种的遗传多样性被引量：4: 2023年; 分析香稻品种的遗传多样性和理清香稻品种之间的亲缘关系,可为选育优质香稻品种提供参考。为分析广西审定的24个常规香稻品种的遗传多样性,明确其遗传差异,本研究利用SSR荧光标记毛细管电泳技术对24个广西常规香稻品种进行遗传多样性分析。结果表明,48对SSR引物共检测出170个等位基因位点;遗传多样性参数中观测等位基因数(Na)变化幅度为1~9,平均为3.54;有效等位基因数(Ne)的变化幅度为1~4.5534,平均为2.0736,其中有效等位基因数最高是RM21,其次是RM481、RM493和RM258,说明这4对引物有较高的检测效率;Shannon’s指数(I)的变化幅度为0~1.7942,平均为0.7726;多态信息含量(PIC)值的变化幅度为0~0.7541,平均为0.3732,属于中度多态位点,说明24个广西常规香稻品种具有一定的遗传变异。24个品种遗传相似系数范围为0.3299~0.9600,其中‘三香628’与‘农香32’遗传相似系数最小,说明这2个品种遗传基础差异最大,亲缘关系最远,‘万香696’与‘广粮香2号’遗传相似性系数最大,说明这2个品种遗传基础差异较小,亲缘关系接近。聚类分析结果显示24个广西常规香稻品种在相似系数0.504处可以分为3个大类群和4个亚类群,第Ⅰ大类2个品种,第Ⅱ大类19个品种,第Ⅲ大类3个品种;第Ⅱ大类在相似系数0.624处可分为4个亚类,第ⅰ亚类1个品种,第ⅱ亚类14个品种,第ⅲ亚类3个品种,第ⅳ亚类1个品种。研究结果表明24个广西常规香稻品种具有一定的遗传多样性,但不够丰富。以数字编码形式构建24个广西常规香稻品种的DNA指纹图谱。其分析结果可为广西常规香稻品种选育和鉴定提供参考。; 唐梅唐梅何聪孙富黄鹂何聪唐忠平卢宏琮陆桂耀; 关键词：SSR荧光标记毛细管电泳

基于SSR荧光标记构建板栗品种(系)核心种质群被引量：3: 2023年; 【目的】构建中国板栗品种(系)的核心种质。【方法】以342个中国板栗品种(系)为材料,用21对SSR荧光引物进行扩增,基于等位位点数最大原则,采用分层抽样、模拟退火算法、随机搜索算法构建核心种质;对板栗品种的含水量、可溶性糖含量、直链淀粉、支链淀粉、总淀粉含量等19个表型性状进行测量后开展差异显著性分析。【结果】21对SSR引物共检测到212个等位位点,等位基因数(Na)、有效等位基因数(Ne)、观测杂合度(Ho)、期望杂合度(He)、多态信息含量(PIC)分别为10.095、3.488、0.596、0.658、0.642,表明板栗品种(系)具有丰富的遗传多样性。聚类结果显示,342个板栗品种(系)在分为南北两个群体基础上存在较多混杂,说明南北方品种存在较多基因交流。同时南北方板栗品种(系)的可溶性糖含量、直链淀粉含量、支链淀粉含量、刺苞厚、坚果厚、坚果宽呈显著性差异;总苞质量、苞质量、刺苞宽、刺苞高、苞肉厚、单粒质量呈极显著差异;含水量、总淀粉含量、出实率等其他指标无显著性差异。通过对3种方法所计算的等位位点数比较,确定基于等位基因数的模拟退火算法为最优取样策略,依次构建85份核心种质。T检验结果表明,核心种质与原始种质遗传参数无显著差异,能够充分代表原始种质的遗传多样性。【结论】确定基于等位基因数的模拟退火算法为最优取样策略,为构建板栗品种核心种质较好的方法,并得到85份核心种质,保留率为24.85%。; 刘松聂兴华李伊然刘海涛张卿王雪峰田寿乐曹庆芹秦岭邢宇; 关键词：板栗 SSR 核心种质

基于SSR荧光标记的广西天冬种质资源遗传多样性分析: 2023年; 为充分利用天门冬种质资源,采用荧光SSR分子标记毛细管电泳技术,对广西及其周边不同生态环境的25份天门冬材料进行了遗传多样性分析。结果表明,从24对引物中筛选出8对位点多态性高且重复性好的引物,共扩增出33个多态性位点,平均每对引物扩增4.1个,每个引物扩增多态位点在2~10之间,多态性位点百分率为68.75%;材料间遗传相似系数为0.084~1.00,平均值为0.44。聚类分析结果表明,25份天门冬材料可分为两个大类,不同来源地的天冬资源穿插分布,地理分化不明显。荧光SSR分子标记毛细管电泳技术适合分析天门冬的遗传多样性,广西天冬具有较丰富的遗传多样性,来自隆林的16号野生资源与多个材料的遗传差异较大。; 郑德波石前蒙平庾韦花; 关键词：SSR 毛细管电泳种质资源

应用形态特征、oligo-FISH和SSR荧光标记区分竹叶花椒品种和品系: 竹叶花椒(Zanthoxylum armatum DC.)为芸香科(Rutaceae Juss.)花椒属(Zanthoxylum L.)植物,具有食用和药用价值。四川地区保留着大量优质的竹叶花椒资源,不同的品种和品系之间...; 何周建; 关键词：荧光原位杂交核型分析微卫星标记

加载更多 ∨

相关作者

用户反馈

相关作者

用户登录

用户反馈