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Trizol提取鸡肝组织总RNA及miRNA的条件优化研究
2024年
试验旨在优化总RNA及miRNA的Trizol提取条件。试验利用Trizol提取鸡肝脏组织总RNA,在RNA的沉降阶段,将样品置于室温、4℃、-20℃和-80℃条件下分别放置10 min、30 min和60 min,另外将样品在-80℃条件下放置3 h、6 h、12 h,分别探究不同沉降温度和不同沉降时间对总RNA完整度、纯度、质量浓度以及miRNA提取量的影响。结果显示:不同沉降温度和不同沉降时间均不影响总RNA的完整性;沉降时间能显著降低RNA的A260/A280比值(P<0.05),但仍在1.90~1.95范围内;不同沉降温度和不同沉降时间均显著影响总RNA和miRNA的提取量(P<0.05)。研究表明,-20℃放置30 min是总RNA提取的适宜条件,-80℃放置3 h为miRNA提取的适宜条件,-80℃放置10 min、4℃放置30 min和-20℃放置60 min的miR⁃NA提取效果良好,适合短时间提取miRNA的相关研究。
陈紫薇张吉龙庄武超郑晓彤陈建飞
关键词:肝组织总RNAMIRNATRIZOL法
改良Trizol提取血浆游离RNA被引量:4
2020年
[目的]建立一种成本低、得率高的血浆游离RNA的提取方。[方]分别采用传统Trizol、改良Trizol、试剂盒提取200μL健康成年人血浆中游离RNA,并比较三种方所得RNA的浓度、纯度及大小片段RNA得率的差异。[结果]改良Trizol所得RNA浓度是常规Trizol的21.7倍(P<0.01),是试剂盒的6.4倍(P<0.01);三种方所得RNA纯度(A260/A280)无显著差异;采用RT-q PCR方检测血浆游离RNA大小片段的回收率,外参秀丽线虫miR-39-3p(cel-miR-39-3p)代表小片段RNA,GAPDH代表大片段RNA,改良Trizol检测Cq平均值分别为15.64和33.34,平均低于常规Trizol2.05~3.62个Cq,低于试剂盒0.32~3.34个Cq。[结论]改良Trizol提取血浆游离RNA相较于常规Trizol提高了10~20倍,增加了得率。
陈雪梅李聪丁雨吴思思
关键词:TRIZOL法RNA提取
改良的Trizol提取小鼠皮肤RNA技术被引量:3
2020年
[目的]由于皮肤组织韧性强且存在大量RNA酶,采用经典Trizol提取的RNA存在易降解质量低等不足.因此,本研究旨在通过改良的Trizol实现高质量的皮肤RNA提取.[方]采用不同处理方式(Tri:Trizol包埋;Pro:RNA样本保护液包埋;Cry:先冷冻液氮再冷冻-80℃冰箱;LNG:液氮研磨;Cut:采用剪刀剪碎组织)提取的小鼠正常皮肤RNA为实验组;脊髓组织作为参照组,并以咪喹莫特(IMQ)诱导的小鼠银屑病模型皮肤组织作为保真性验证组.我们采用紫外分光光度、琼脂凝胶电泳、定量逆转录PCR(qRT-PCR)等方来检测经典Trizol(1-Tri,Nor)和改良Trizol(2-Tri,LNG-Tri,Tri-Cut,Pro)提取的RNA浓度、纯度和完整性以及IL-1βmRNA表达的差异性情况.[结果]①与脊髓组织相比,经典Trizol(1-Tri)获得的正常皮肤组织总RNA量要低,DNA污染和5S RNA条带明显,IL-1βmRNA相对表达偏高,说明经典Trizol在皮肤组织中提取RNA存在局限性,需要进行改良.②在不同小鼠皮肤样本处理组中,改良的2-Tri和LNG-Tri获得的RNA浓度更高,同时RNA降解、DNA污染更低,IL-1βmRNA表达更接近正常水平.更重要的是,在小鼠银屑病模型中,2-Tri提取的RNA样本能真实反映出正常皮肤与银屑病变皮肤之间IL-1βmRNA的变化趋势.[结论]改良的2-Tri或LNG-Tri分离的总RNA质量好,能可靠地反映生理或病理条件下的mRNA表达模式.
林震嘉张辉揭英桃熊媖唐源谈智刘先国周利君
关键词:RNA提取小鼠皮肤TRIZOL银屑病
改进TRIzol提取不同发育时期海葵的总RNA被引量:2
2020年
获得海葵纯度高、完整性好的高质量RNA,为海葵高通量转录组测序等分子生物学的深入研究提供基础,以南海海葵为研究对象,采用改进TRIzol提取不同发育时期海葵的总RNA,并利用琼脂糖凝胶电泳、Nano Drop TM 2000分光光度计和Agilent 2100生物分析仪检测其质量。结果表明:改进TRIzol从不同发育时期的海葵中提取的RNA电泳条带清晰、海葵-大与海葵-中的RNA完整性好,海葵-小RNA完整性不合格;海葵-大、海葵-中和海葵-小的纯度(OD260/280)分别为1.981、1.983和2.071,浓度分别为335ng/μL、357ng/μL和232ng/μL。改进TRIzol可有效从海葵中提取高质量RNA。
袁琳代亚坤高炳淼
关键词:海葵发育时期RNA
一种改良Trizol提取胚乳RNA方
本发明公开了一种改良Trizol提取淀粉含量高的组织RNA方,其特征在于,是首先将冷冻后的样品研磨后通过RNA缓冲液和提取溶液进行提取后,逐步离心分离得透明沉淀,后水浴取样检测。本发明与现有的Trizol或商用提取...
刘艳艳孙子奎
文献传递
改良TRIzol高效提取钉螺组织总RNA被引量:2
2018年
目的解决钉螺组织中总RNA提取难度大的问题,建立一套适合钉螺组织总RNA提取方。方采用改良TRIzol从钉螺组织中提取其总RNA,并与传统TRIzol提取结果进行比较。结果本方优于传统TRIzol,能够在钉螺组织中提取出完整性好、纯度高的总RNA,其A_(260)/A_(280)在1. 9~2. 0之间,A_(260)/A_(230)在1. 8~1. 9之间,电泳结果表明获得总RNA 28S、18S及5S条带清晰完整,无弥散现象;同时,选取β-acting基因检测,电泳结果表明所得总RNA的质量符合钉螺RT-PCR检测的实验要求。结论本方便于实施,重复性好,适合钉螺组织总RNA提取,同时为改良优化传统TRIzol提取其他医学贝类组织总RNA提供了研究思路。
管国宇尹灿灿陈鹏王逸枭周象勤姚鹏程黄文雨徐蕾孙恩涛
关键词:湖北钉螺总RNA
改良Trizol提取富含花青素马铃薯块茎的总RNA被引量:3
2018年
富含花青素的马铃薯块茎因含有大量多糖和多酚类次级代谢产物而难以大量提取高质量的总RNA。本研究以紫色和红色马铃薯为材料,利用改良Trizol实现了块茎总RNA的快速高质量提取。试验结果表明,在Trizol中添加2%(V/V)"-巯基乙醇、0. 75%(W/V)十六烷基三甲基溴化铵(CTAB)和7. 5%(W/V)醋酸钾(KOAc),可以有效去除多糖、多酚类物质,获得高产、完整的总RNA。改良Trizol提取时间短、操作方便,提取的RNA通过了actin RT-PCR和18S rRNA RT-q PCR检验,可以用于后续的分子生物学试验。
刘芳陈广侠马蕾杨煜郭晓杨晓慧董道峰杨元军
关键词:马铃薯块茎花青素RNA提取醋酸钾
TRIzol与磁珠用于丙型肝炎病毒RNA定量检测的比较被引量:4
2017年
目的比较TRIzol与磁珠对丙型肝炎病毒(HCV)RNA定量检测结果的影响。方收集117例丙型肝炎病毒感染阳性患者的血清及其基因分型信息。分别采用TRIzol与磁珠提取患者血清样本的HCV RNA,qPCR检测提取HCV RNA的病毒载量,分析两种提取方所得HCV RNA检测结果的差异。结果 qPCR结果显示TRIzol和磁珠具有良好的线性相关性:y=0.978x+0.063(R2=0.973)。Bland-Altman统计分析显示TRIzol提取的HCV RNA病毒载量对数值的平均值略低于磁珠,但差异无统计学意义(P>0.05)。基因型分析结果显示1a、1b、2a、3a和6a基因型中两种提取方差异均无统计学意义(P>0.05)。结论 TRIzol提取HCV RNA的定量检测结果和磁珠相当,且成本低廉,可在国内广泛用于试剂盒的开发和HCV RNA临床检测。
尤柳霞林晓容黄东红陶耕
关键词:丙型肝炎病毒TRIZOL法磁珠法RNA定量检测基因型
Trizol提取普通小球藻总基因组DNA
2015年
Trizol主要应用于动植物RNA提取,由于其在提取RNA的过程中将DNA有效分离到有机相中,并且在有机相中DNA未被降解,因此本研究采用Trizol提取具有细胞壁的普通小球藻的基因组DNA,发现提取得到的DNA纯度和产率高,且DNA完整性好。经检测:D260 nm/D280 nm=1.86,平均得率为977μg/g鲜质量;琼脂糖电泳检测其条带清晰,未发生降解。该方具有简单快速获得高纯度和高产率的小球藻基因组DNA的优点。
段文斌金刚代建国张丽君栾崇林于化泓
关键词:TRIZOL法普通小球藻DNA提取
常规TRIzol提取血清microRNA的条件改进
2015年
目的 对常规TRIzol提取血清中microRNA(miRNA)的方进行改进,以提高血清miRNA的提取效率.方 运用常规TRIzol和改进方,分别提取健康人血清中的miRNA.改进条件为分离血清后再分别进行超声、10% SDS(十二烷基硫酸钠)或者10% SDS联合超声进行预处理.以实时荧光定量PCR检测血清中miRNA-218和miRNA-346的含量,通过比较miRNA-218和miRNA-346的相对表达量来鉴定不同方对miRNA检测值的影响,从而反映miRNA的检出效率.结果 超声组与常规组的检出效率比较差异无统计学意义(P>0.05);SDS组与SDS联合超声组检出效率均优于常规组(P<0.05),此两组改进方可使荧光定量PCR检测中miRNA-218和miR-NA-346的相对表达量明显提高.而SDS联合超声组检出效率比单纯SDS组更好(P<0.05).结论 10%SDS联合超声预处理后,可有效提高目的血清miRNA的检出效率.
陈长选王磊赵伟单锋芝王鑫高小超
关键词:聚合酶链反应

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郭彦萃
作品数:15被引量:27H指数:3
供职机构:齐齐哈尔大学
研究主题:TRIZOL法 RNA提取 总RNA 微生物多样性 人工林土壤
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作品数:47被引量:211H指数:8
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研究主题:桑叶 川芎 化学成分 红花 基因克隆
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作品数:74被引量:276H指数:10
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研究主题:苹果 RT-PCR 苹果锈果类病毒 苹果树腐烂病 苹果树
曹克强
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