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3种花色类 型滇黄精的遗传关系研究 被引量：2 2022年 类 型,其中花被白花带紫斑为新发现类 型。为明确3种花色滇黄精的遗传关系,对3种花色滇黄精的48个植株进行ISSR分子标记分析 。结果表明,11条ISSR引物对48个植株样品进行扩增,共获得103条清晰条带,其中多态性条带有99条,多态性比率为96.1%,遗传一致度为0.89~0.91。遗传差异和UPGMA 聚类分析 显示,白花类 型(P1)、白花带紫斑类 型(P2)与紫红花类 型(P3)的滇黄精均各自独立聚 为一组,遗传距离上白花带紫斑类 型(P2)与紫红花类 型(P3)的亲缘关系较近,可知白花带紫斑类 型(P2)是紫红花类 型(P3)和白花类 型(P1)的过渡类 型或是白花类 型与紫红花类 型自然授粉所产生子代的一种杂合状态。本研究结果为滇黄精资源的遗传关系研究及分类 鉴别奠定了一定基础。关键词：滇黄精 ISSR分子标记 UPGMA聚类分析 基于30个形态性状的中国杏属(Armeniaca Scop.)植物分类 学研究 被引量：9 2016年 UPGMA 聚类分析 和主成分分析 ;在主成分分析 基础上,构建了中国杏属植物的OTU散点图;并且,结合降水量分布图绘制了中国杏属植物分布图。聚类分析 结果显示:供试杏属植物被分成2支。若包含毛叶梅(A.mume var.goethartiana Koehne),则毛叶梅、梅(A.mume Sieb.)、洪平杏(A.hongpingensis C.L.Li)以及政和杏(A.zhengheensis J.Y.Zhang et M.N.Lu)聚 为一支,其余8种2变种聚 为另一支;若不包含毛叶梅,梅则被划分在后一个分支中。主成分分析 结果显示:前3个主成分的累计贡献率仅60.318 0%,说明中国杏属植物的形态性状具有较大的遗传变异;在前3个主成分中,树高、叶片下表面被毛情况、叶长/叶柄长比值、叶长/叶宽比值、果核形状、叶宽、果核宽、叶柄长、果柄长和叶缘锯齿形状的绝对权重值均在0.7以上,表明这10个性状在中国杏属植物的分类 学研究中具有重要作用。OTU散点图显示:中国杏属植物在二维散点图上的分类 结果与其聚 类 结果基本一致,并且,其聚 类 结果中的各分支在三维散点图上也能够明显区分,说明可以采用前3个主成分中绝对权重值较高的性状对中国杏属植物进行分类 。分布图显示:杏属植物遍布中国各省(区),且主要集中分布在400和800 mm等降水量线之间的区域。结合上述研究结果及他人的研究成果,支持"将藏杏〔A.holosericea(Batal.)Kost.〕作为杏(A.vulgaris Lam.)的1个变种"以及"将政和杏作为梅的1个变种"的分类 处理,并支持"将洪平杏作为独立种"的分类 处理。此外,建议将仙居杏(A.xianjuxing J.Y.Zhang et X.Z.Wu)和华仁杏(A.cathayana D.L.Fu et al)作为杏属的栽培种。关键词：杏属 形态性状 UPGMA聚类分析 分类学修订 基于SSR标记的荷花品种遗传多样性及群体结构分析 被引量：7 2016年 UPGMA 聚类分析 、群体结构分析 和主坐标分析 （PCo A）。结果表明：采用17对SSR引物从42个荷花品种的基因组DNA中扩增出77个位点,多态性位点百分率为88.31%;每对引物可扩增出1~9个多态性位点。根据Nei’s遗传距离,供试的42个荷花品种可被分成Ⅰ和Ⅱ两组,分别包含3和39个品种;在Nei’s遗传距离0.150处,Ⅱ组被进一步分成Ⅱa、Ⅱb和Ⅱc 3个亚组,分别包含3、16和20个品种。群体结构分析 结果表明：组分概率高于等于0.80时,供试的42个荷花品种被分成Pop1、Pop2和混合群3个亚群,分别包含17、16和9个品种。PCo A分析 结果表明：在F1水平上,供试的42个荷花品种被分成2个部分;其中,Pop1亚群的品种均分布在第二和第三象限,而Pop2亚群的品种则分布在第一和第四象限。总体来看,聚类分析 、群体结构分析 和PCo A分析 的结果基本一致。综合分析 结果表明：Ⅰ组包含美洲黄莲（N.lutea Pers.）品种‘艾江南’,且与传统中国莲（N.nucifera Gaertn.）品种的亲缘关系最远,故认为该组为美洲黄莲;Ⅱ组为中国莲,其中,Ⅱc亚组以传统中国莲品种为主,而Ⅱb亚组则偏重于美洲黄莲。总体上看,供试的42个荷花品种主要被分为中国莲和美洲黄莲两组,而中美杂交莲并没有独立成组,其成因有待进一步研究。关键词：荷花品种 SSR标记 UPGMA聚类分析 甘蔗黑穗病菌SCoT-PCR反应体系优化与引物筛选 被引量：3 2015年 聚 合酶和模板用量5个因素进行优化,建立优化的甘蔗黑穗病菌SCoT-PCR反应体系:DNA模板12.50ng、dNTPs 0.17mmol/L、引物0.46μmol/L、Mg2+1.7 mmol/L、r Taq DNA聚 合酶0.85U、1×Buffer(Mg2+free),总体积25μL。应用优化体系从30条SCoT引物中筛选扩增条带清晰且多态性丰富的10条引物,并利用这10条引物对10份地理来源和寄主来源不同的甘蔗黑穗病菌交配型菌株基因组DNA进行SCoT标记,结果共扩增出86条带,多态性比率为58.67%,平均每条引物扩增8.60条。UPGMA 聚类分析 结果表明:在遗传相似系数为0.75的水平上,可将10个菌株分为3类 ,聚 类 结果与菌株的地理来源有一定的相关性。关键词：甘蔗黑穗病菌 UPGMA聚类分析 滇杨优树遗传多样性的AFLP分析 被引量：11 2014年 类 外对照,采用AFLP分子标记技术进行基因组DNA水平检测。结果表明,筛选出的8对EcoRⅠ+3/MseⅠ+3引物组合对52株滇杨优树共扩增出264条带,其中多态性条带174条,多态带百分率为64.52%,检测到有效等位基因数(Ne)为1.184,基因多样度(H)为0.121,Shannon信息指数为0.201,平均遗传相似系数为0.877;对56份杨树样本共扩增出325条带,其中多态性条带共247条,多态带百分率为75.21%,检测出有效等位基因数(Ne)为1.185,基因多样度(H)为0.122,Shannon信息指数为0.209,平均遗传相似系数为0.876。UPGMA 聚类分析 结果显示,除滇杨优树QXB007与QXJ030外,其余杨树分析 样本均能够被鉴别。基于采集地和遗传相似系数的模糊聚类分析 表明,52株滇杨优树除开远采集地外,丽江采集地样本与其他采集地样本之间均有交集,说明丽江可能是滇杨的分布中心和起源中心。该研究结果为滇杨人工选择育种、遗传改良、种质资源收集与保存等提供了理论依据。关键词：AFLP 遗传相似系数 UPGMA聚类分析 不同物料堆肥细菌多样性分异评价 UPGMA 聚类分析 、香浓维纳指数分析 、测序分析 优势细菌种群结构,并结合冗余分析 来分析 环境因素与群落结构之间的关系...关键词：细菌多样性 PCR-DGGE UPGMA聚类分析 文献传递 Genetic Diversity of Tea Plant(Camellia Sinensis(L.) O.Kuntze)in Wuling Mountainous Area Revealed by ISSR Marker 被引量：2 2013年 UPGMA clustering analysis also revealed the genetic diversity and relationship of the tea germplasms of Wuling mountainous area.Besides,fingerprint of the 183 tea germplasms were constructed.关键词：ISSR标记 茶树资源 UPGMA聚类分析 ISSR-PCR 简单重复序列 药用植物乌头遗传多样性研究 关键词：乌头 AFLP UPGMA聚类分析 文献传递 HB柚有性后代的杂种鉴定和遗传多样性分析 被引量：6 2012年 UPGMA 聚类分析 法分析 后代群体和亲本的遗传关系,相似系数为0.720时,可将杂种后代分为4类 ,而与父母本聚 在一起的杂种植株占少数。关键词：HB柚 杂种鉴定 SSR UPGMA聚类分析 应用微卫星标记分析 不同桔小实蝇种群的遗传多样性 被引量：10 2011年 分析 结果表明：30个不同桔小实蝇种群的遗传相似度在0.3599~0.9153范围内。种群的Nei氏基因多样性指数平均为0.6464±0.1026,Shannon信息指数I平均为1.2845±0.2632,提示桔小实蝇种群具有较丰富的遗传多样性。UPGMA 聚类分析 显示,福建地区和海南地区分别独立一支,广东地区和台湾地区种群聚 成一支,而广西、泰国、湖南、云南、老挝、四川、重庆和贵州地区聚 为一大支系。据此提出泰国种群和老挝种群是最早入侵我国的种群,云南地区是最早的入侵地,广西地区可能为又一较早入侵地。关键词：桔小实蝇 地理种群 微卫星 UPGMA聚类分析
