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丹参肉桂醇脱氢酶基因(SmCAD)的克隆及表达分析被引量：9: 2013年; 肉桂醇脱氢酶(cinnamyl alcohol dehydrogenase,CAD)依赖于NADPH还原肉桂醛及其衍生物,是催化木质素单体生物合成途径的最后一步关键酶。通过分析丹参转录组数据库,从丹参中获得一条肉桂醇脱氢酶基因,命名为SmCAD(Genebank注册号:HQ162287)。该序列包含一个长为1083 bp的开放阅读框,有3个内含子和4个外显子,编码360个氨基酸,含有NADP(H)结合域,Zn1和Zn2锌结合位点。利用BD walking的方法获得其启动子序列1202 bp,序列分析结果表明,SmCAD启动子区包含茉莉酸甲酯(MeJA)、脱落酸(ABA)、赤霉素(GA3)响应元件以及MYB结合位点。利用实时荧光定量PCR分析表明,该基因在丹参根、茎、叶中均有表达,且其表达受到MeJA的诱导和GA3的抑制,推测该基因可能参与了丹参对外源信号的应答反应。研究结果可为进一步研究SmCAD基因在丹参中的具体功能提供理论依据。; 葛茜邝静武玉翠张媛肖娅萍王喆之; 关键词：丹参肉桂醇脱氢酶生物信息学分析基因表达

秦艽香叶醇-10羟化酶(G10H)基因的克隆及序列分析被引量：11: 2013年; 香叶醇-10羟化酶(geraniol 10-hydroxylase,G10H)是中药秦艽中龙胆苦苷等环烯醚萜苷类成分合成途径的限速酶。本研究克隆了秦艽G10H基因,并对其基因及编码蛋白序列的特征进行了生物信息学分析,结果显示:秦艽G10H基因包含一个完整的长1491bp的ORF框,编码496个氨基酸;GmG10H与长春花、川西樟牙菜等植物G10H蛋白具有很高的同源性(≥69%),无跨膜结构域、信号肽等结构,可能定位于细胞质中。定量PCR结果显示,GmG10H主要在秦艽的花和根中进行表达。; 化文平王喆之; 关键词：秦艽高通量测序

丹参普遍胁迫蛋白基因(SmUSP)的克隆及表达模式分析被引量：4: 2013年; 通过BLAST比对分析丹参EST数据库,发现一个与普遍胁迫蛋白(USP)基因家族同源性较高的基因序列,命名为SmUSP,GenBank登录号为JX416284。依据该序列,从DNA和cDNA水平克隆得到该基因全长,经分析发现该基因无内含子序列,包含一个长711bp的完整开放读码框(ORF),编码236个氨基酸残基。生物信息学分析显示,SmUSP编码蛋白的相对分子量25.5kDa,为无信号肽和跨膜结构域的疏水酸性蛋白;SmUSP具有UspA结构域和ATP结合位点,属于USP蛋白UspFG亚家族。实时荧光定量PCR分析表明,SmUSP在丹参的根、茎、叶、花中均有表达,在根中的表达量较高。同时,SmUSP表达受茉莉酸甲酯(MeJA)、水杨酸(SA)、脱落酸(ABA)以及脱水胁迫的上调诱导,推测该基因可能在丹参防御反应中发挥作用。; 邝静生华武玉翠葛茜张媛王喆之; 关键词：生物信息学分析

玉竹不同器官挥发性成分的SPME-GC-MS法比较分析被引量：2: 2013年; 分析和比较了玉竹不同器官中的挥发性成分的差异。采用固相微萃取/气相色谱/质谱(SP M E/GC/M S)联用技术对玉竹不同器官挥发性成分进行分析,利用峰面积归一化法测定各个成分的相对百分含量。从玉竹的根、茎、叶中分别分离出28、23和26种挥发性成分,主要包括酮、烷烃、烯烃、芳香烃、醇和脂类等化合物。3种器官中挥发性成分组成及相对含量差异较大,共有成分仅为香叶基丙酮。本研究为玉竹的进一步开发利用提供了理论依据。; 李封辰牛俊峰张媛王喆之; 关键词：玉竹挥发性成分固相微萃取气相色谱-质谱联用

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陕西省自然科学基金(2012JQ4013)