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辽宁省自然科学基金(2013020210)
辽宁省自然科学基金(2013020210)
- 作品数:4 被引量:2H指数:1
- 相关作者:关琪赫天一沈书旭王亚男尚红更多>>
- 相关机构:沈阳医学院附属中心医院中国医科大学附属第一医院更多>>
- 发文基金:辽宁省自然科学基金沈阳市科技计划项目国家自然科学基金更多>>
- 相关领域:医药卫生更多>>
- 蛋白质结构限制性对HIV-1耐药相关基因分子进化规律的影响研究
- 2016年
- 目的:通过对65名HIV治疗队列中发生耐药的感染者进行较系统的前瞻性队列研究,阐明我国抗病毒治疗过程中,HIV RT蛋白耐药进化的结构限制性以及HIV耐药的发生规律。方法从2003年开始,每半年1次,连续4年对队列感染者进行随访采集静脉血样,提取病毒RNA后对RT基因进行RT-PCR扩增和测序。将所获得的序列进行系统进化、耐药位点变异和蛋白质结构分析。结果 RT酶中大部分的氨基酸位点都是保守的,而序列的变异仅发生在12.44%的位点之上。非核苷类逆转录酶抑制剂( NNRTI)高水平耐药位点多位于RT蛋白的内部,而中等水平耐药位点多位于蛋白质的表面。核苷类逆转录酶抑制剂( NRTI)高水平耐药位点均位于RT蛋白的表面,而低水平耐药位点均位于RT蛋白的内部。结论 NNRTI和NRTI类耐药突变位点在RT蛋白中截然相反的分布特征,可以为针对RT靶点的抗病毒药物的设计和开发起到一定的指导作用。
- 关琪韩晓旭赵彬张旻沈书旭王亚男姜拥军耿文清尚红
- 关键词:人类免疫缺陷病毒1型适宜性
- 我国部分地区HIV-1耐药发生和演变的队列研究
- 目的通过对70名HIV治疗队列中发生耐药的感染者进行较系统的前瞻性队列研究,阐明我国抗病毒治疗过程中,HIV-1耐药位点随时间进化和演变的群体变化趋势以及我国HIV耐药位点在人群中的组合和分布特征;从耐药突变位点的耐药评...
- 关琪
- 关键词:人类免疫缺陷病毒1型适宜性
- 文献传递
- 不同基因型耐药分析系统在HIV耐药预测中的应用被引量:2
- 2015年
- 随着高效抗逆转录病毒治疗的持续进行,部分人类免疫缺陷病毒(HIV)感染者的体内出现大量耐药毒株,产生的耐药性导致治疗效果大幅下降甚至治疗失败。生物信息学平台的基因型耐药分析技术,是预测上述HIV耐药性的有力工具,决定抗病毒治疗的成败。本文从基因型耐药分析的原理、特点等角度出发,对目前国际上流行的主要HIV基因型耐药分析系统的优缺点以及基因型耐药预测的影响因素和改进措施等方面进行综述,以期为不同基因型耐药分析系统在我国的合理应用提供借鉴。
- 赫天一关琪王礼宁
- 关键词:人类免疫缺陷病毒基因型耐药
- 4种解释系统对HIV-1基因型耐药解释相关性评价
- 2016年
- 目的:比较HIVDB(7.0.1)、ANRS(25_09/2015)、REGA(9.1.0)和HIV GRADE(12/2015)4种解释系统对HIV-1基因型耐药结果解释的一致性。方法:选取我国3种主要HIV-1流行亚型和流行重组模式(B’、CRF01_AE和CRF07_BC),每种选取200条序列,共600条序列。分别用4种解释系统进行耐药结果分析,分为耐药(R)、中度耐药(I)和敏感(S)3个水平。对4种结果进行统计学分析。结果:4种系统基因型耐药解释结果比较相关性较高(r均>0.57,P均<0.01)。针对亚型来说,CRF07_BC的解释结果相关性最高,其次为B’亚型,CRF01_AE略低。结论:对于我国主要流行的HIV来说,4种解释系统对11种常用的抗病毒治疗药物耐药结果的解释具有较好的一致性。
- 赫天一关琪
- 关键词:HIV-1耐药突变
- HIV-1逆转录酶蛋白结构的耐药变异研究进展
- 2014年
- 耐药性艾滋病病毒的出现大大增加了高效抗逆转录病毒治疗(HAART)失败的几率。为探究病毒底层耐药规律,近年来以耐药相关蛋白为切入点,利用X线晶体衍射、NMR解析和生物信息学技术中的生物建模和分子动力学等方法探究病毒耐药相关蛋白结构变异方面的研究日益成为人们关注的热点,其研究成果为理解耐药毒株的耐药机制提供了新的依据。本文就近年来利用上述方法获得的HIV-1耐药相关蛋白-逆转录酶的耐药变异情况进行简要综述,以期为临床合理用药和新药开发提供指导。
- 关琪赫天一王礼宁
- 关键词:逆转录酶耐药突变