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国家自然科学基金(30570404)
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张华利
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Y-S-R基序与卟啉辅基之间的氢键网络在sGC-HNOX结构域中的作用
2009年
可溶性鸟苷酸环化酶(soluble Guanylate Cyclase,sGC)是体内非常重要的含卟啉酶,该酶可以催化三磷酸鸟苷(GTP)合成体内的第二信使分子环鸟苷一磷酸(cGMP)。
张跃斌
吕明
张华利
李正强
关键词:
分子动力学
主成份分析
Y-S-R基序与卟啉辅基之间的氢键网络在sGC-HNOX结构域中的作用
<正>可溶性鸟苷酸环化酶(soluble Guanylate Cyclase,sGC)是体内非常重要的含卟啉酶,该酶可以催化三磷酸鸟苷(GTP)合成体内的第二信使分子环鸟苷一磷酸(cGMP)。
张跃斌
吕明
张华利
李正强
关键词:
分子动力学
主成份分析
文献传递
Y-S-R基序与卟啉辅基之间的氢键网络在sGC-HNOX结构域中的作用
2010年
利用分子动力学方法研究了sGC-HNOX结构域中Y-S-R基序与卟啉丙酸基团形成的氢键网络在sGC-HNOX结构域中的作用.RMSD分析结果表明,该氢键网络的存在可以有效地稳定sGC-HNOX结构域的构象,并且这种稳定作用不影响sGC-HNOX结构域的二级结构、体积以及溶剂可及表面积.分子动力学轨迹的主成分分析及卟啉平面构象分析结果表明,Y-S-R基序与卟啉丙酸基团形成的氢键网络在sGC-HNOX结构域中的主要作用是使4-E基序稳定地结合于7-H基序,从而使sGC-HNOX结构域成为一个空间联系紧密的整体.
张跃斌
程瑛琨
吕明
张华利
李正强
关键词:
分子动力学
最小二乘法
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