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浙江省医药卫生科学研究基金(2013RCB003)
作品数:
2
被引量:1
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相关作者:
王炜
和艳敏
章伟
陶苏丹
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2015
1篇
2014
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HLA-DPB1基因第2和第3外显子测序方法的建立及其多态性分析
被引量:1
2015年
目的建立HLA-DPB1基因第2~3外显子测序方法,并分析其多态性。方法根据HLA-DPB1基因序列,设计位点特异性引物扩增242名浙江汉族人群HLA-DPB1第2~3外显子序列,PCR扩增产物经双酶切后对第2和3外显子进行双向测序分析,采用Assign3.5+SBT分析软件判读HLA-DPB1等位基因型。结果PCR扩增获得特异性的单一目的片段,其产物经直接测序后得到清晰的序列图。242名浙江汉族人群中共检测到18个HLADPB1等位基因,频率超过0.05的等位基因为DPB1*05:01:01/135:0l(0.4112)、DPB1*02:01:02(0.1901)、DPB1*04:01:01(0.1136)以及DPB1*02:02(0.0620),并确认1个新等位基因DPB1*168:01。在第3外显子中发现9个多态性位点,其中517A〉T为本实验新检出的1个多态性位点。结论本实验建立的HLA~DPB1第2~3外显子测序方法是可行的,HLA-DPB1第3外显子存在一定多态性。
和艳敏
陶苏丹
章伟
王炜
何吉
朱发明
吕杭军
关键词:
多态性
造血干细胞移植
用生物素标记探针和链亲和素磁珠分离HLA-A、-B、-C位点单体型
2014年
目的建立生物素标记探针和链亲和素磁珠分离人类白细胞抗原(humanleukocyteantigen,HLA)-A、-B、-C单体型的技术,以解决HLA分型过程中部分模棱两可的结果。方法根据IMGT/HLA数据库中HLA等位基因的序列信息,设计5’端生物素标记探针。将探针与104份标本基因组DNA混合杂交,然后加入链亲和素磁珠孵育,形成链亲和素磁珠一生物素探针一单链DNA复合物,通过洗涤和解析从而实施有效的分离。对分离出的单体型基因组DNA进行HLA-A、-B或-C位点扩增和测序分析。结果设计的12个HLA-A、19个HLA-B、13个HLA-C位点探针中,经测序证实分别有9个、9个、5个探针成功分离了单链DNA标本。结论建立的探针和磁珠分离HLAA、-B、-C单体型技术具有可行性,可以解决HLA测序分型中部分模棱两可结果,提高分型的准确性。
陶苏丹
和艳敏
章伟
王炜
何吉
朱发明
吕杭军
关键词:
人类白细胞抗原
生物素探针
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