教育部“春晖计划”(99-4-437)
- 作品数:16 被引量:69H指数:5
- 相关作者:李志良周鹏田菲菲周原梅虎更多>>
- 相关机构:重庆大学教育部湖南大学更多>>
- 发文基金:教育部“春晖计划”重庆市应用基础研究项目霍英东基金更多>>
- 相关领域:理学医药卫生农业科学环境科学与工程更多>>
- 盐酸帕洛诺司琼中有机残留溶剂的检测被引量:6
- 2007年
- 目的:建立盐酸帕洛诺司琼中有机残留溶剂的检测方法。方法:毛细管气相色谱顶空进样法。色谱条件为:DM-624(30 m×0.53 mm,膜厚度为3.0 μm)毛细管柱;柱温为80℃;顶空进样瓶的平衡温度为80℃,平衡时间为80℃下平衡30min;进样口温度250℃,分流比:10:1;检测器温度250℃;载气:氮气;恒定压力,27 cm·s^(-1)(80℃);H_2流速:40 mL·min^(-1);空气流速:400 mL·min^(-1)。结果:3批样品中的有机溶剂残留量均符合要求。建立的色谱方法对待测溶剂具有良好的分离效果,在所考察的浓度范围内线性关系良好,各回收率均得到满意结果。结论:本方法操作简单,结果准确,是控制盐酸帕洛诺司琼中有机残留溶剂的可靠方法。
- 邓婕李志良肖玉梅陈小勇
- 关键词:盐酸帕洛诺司琼毛细管气相色谱顶空进样有机溶剂残留量
- 一种基于三维原子场相互作用矢量的新型氨基酸结构信息描述子被引量:8
- 2006年
- 从分子的三维空间结构出发,按照不同类型原子之间静电和立体作用得到一种新的分子结构表达方法——三维原子场相互作用矢量(3D-VAIF).利用该矢量对20种天然氨基酸空间结构性质进行计算,通过主成分分析获得单个氨基酸的特征描述子——氨基酸结构信息得分(SSIA).分别使用58个血管紧张素转化酶抑制剂、48个苦味二肽以及31个缓激肽对SSIA的性能进行了测试,所得模型的复相关系数R2cum和交互检验复相关系数Q2LOO分别为0.789,0.773;0.856,0.837和0.838,0.815.结果表明将SSIA用于肽类似物定量序列活性建模(定量序效建模,QSAM)效果优于传统氨基酸描述子.
- 周鹏周原吴世容李波田菲菲李志良
- 关键词:定量构效关系量子化学计算
- 原子电性作用矢量用于呋喃糖核磁共振碳谱化学位移计算被引量:3
- 2006年
- 从分子二维拓扑结构出发,借助用于描述原子所处分子微观化学环境的原子电性作用矢量(AtomicElementaryElectronegativityInteractionVector,AEIV)对25种呋喃单糖中共计148个等价共振碳原子进行了表征,并以此建立起用于模拟单糖分子13CNMR化学位移的两参数多元线性回归方程,所得模型的复相关系数Rcum、交叉检验QLOO及均方根误差RMS分别达到0.907、0.901和6.757,并采用对半划分样本集交叉验证的方法来测试模型的稳定性能和预测能力.结果表明AEIV能够很好的模拟糖类物质13C化学位移值.
- 田菲菲李志良吴世容周鹏
- 关键词:原子电性作用矢量多元线性回归定量构谱关系
- 氨基酸广义疏水标度(GH-scale)用于HLA-A*0201限制性CTL表位定量预测被引量:3
- 2006年
- 将天然氨基酸149个疏水性质经主成分分析得到了一种新氨基酸描述子——氨基酸广义疏水标度(GH-scale).用GH—scale结合遗传偏最小二乘(GPLS)算法对152个HLA-A*0201限制性CTL表位进行定量构效关(QSAR)研究.所建模型拟合及交叉检验复相关系数分别为Rcum2=0.813和Q2=0.725.研究表明,疏水作用在CTL表位与HLA-A*0201结合过程中扮演极其重要角色,而锚定残基是该类作用发生最显著的部位.
- 周鹏李志良田菲菲张梦军
- 关键词:CTL表位定量构效关系
- 一种基于遗传算法的肽/蛋白质结合模式虚拟筛选建模技术被引量:4
- 2006年
- “合理”QSAR模型是指在了解配体与受体相互作用模式的前提下建立定量构效关系,这样避开了传统做法仅仅依靠样本集分子自身信息来构建预测模型的诸多弊端.本文将此思想应用于肽/蛋白质亲和活性的研究当中,借助于遗传算法作为虚拟受体结合靶点及相互作用模式的筛选手段得到了一种新的建模技术:肽/蛋白质结合模式遗传虚拟筛选(geneticvirtualscreeningofcombinativemodeforpeptide/protein,GVSC).该法成功解决了“合理”QSAR研究中的难题,即大多数情况下受体结构未知而难以了解配基与之发生的结合方式.分别使用58个血管紧张素转化酶,18个Camel抗体蛋白cAb-lys3双位点突变残基对GVSC加以检验,其结果表明GVSC能够较好地阐明配基与受体之间的作用机理,并能得到优于传统方法的QSAR模型.
- 周鹏田菲菲李波吴世容李志良
- 关键词:定量构效关系遗传算法偏最小二乘回归
- 分子电性作用矢量法定量预测单质子化肽段离子迁移谱碰撞截面被引量:10
- 2006年
- 基于分子二维图形特征得到了一种新的结构参数化方法:分子电性作用矢量(MEIV)。将其应用于113个单质子化肽段样本集的结构表征及离子迁移谱碰撞截面模拟和预测当中,通过严格检验所得到3个回归模型的复相关系数Rcum及交叉验证Q分别为:0.984、0.981、0.980和0.979、0.979、0.978。结果表明MEIV对有机分子结构及其性质具有良好的表达和预测能力。
- 周鹏田菲菲王娇娜李志良
- 关键词:离子迁移谱碰撞截面定量构谱关系
- 原子电性作用矢量和杂化状态指数用于氨基酸核磁共振碳谱模拟被引量:15
- 2006年
- 提出了用于表征分子局部化学微环境及原子所处杂化状态的结构描述子:原子电性作用矢量(AEIV)和原子杂化状态指数(AHSI),将其应用于20个天然氨基酸103个碳原子13C核磁共振模拟中,取得满意结果。模型计算值、留一法(LOO-CV)交互校验预测值和新颖的留一分子法(LMO)交互校验预测值的复相关系数分别为r=0.9948、0.9940和0.9924。进一步使用4个非天然氨基酸化学位移值来测试该模型的预测能力,预测复相关系数为r=0.9940。
- 周鹏周原梅虎田菲菲李志良
- 关键词:原子电性作用矢量氨基酸
- 将潜因多元建模技术与遗传虚拟筛选模式相结合:改善定量构效关系被引量:1
- 2008年
- 提出了改进的定量构效关系(mmQSAR)研究方法,即认为在知晓配基与受体相互作用模式前提下建立一种较可靠的定量构效关系模型,从而克服了传统做法中仅根据样本集分子自身信息来构建预测模型的某些弊端.将此思路应用于功能肽/蛋白质亲和活性考察,采用遗传算法(GA)筛选虚拟受体结合靶点及相互作用模式,结合偏最小二乘(PLS)潜因多元建模技术,通过交互检验均方根误差(RMSCV)作适应度评价函数筛选变化位点和受体残基,完成种群进化以最优个体为最终确定模型,得到一种新颖QSAR方法(mmQSAR):基于功能肽/蛋白质作用模式的遗传虚拟筛选(暂称GVSPPC).该法成功解决了诸多QSAR研究难题,即大多数情况下受体结构未知而难以了解的配基与之结合方式.分别使用生物功能寡肽和多肽体系对GVSPPC加以检验,其结果表明,GVSPPC得到了优于传统方法QSAR结果(R2cu>0.75~0.91,Q2cv>0.71~0.86,ERMS为0.19~0.95)且深入阐明配基与受体间作用机理,物理意义较为明确;同时计算选中模式作用能并与样本活性建立PLS模型,以其交互检验均方根误差(ERMScv)作评价函数完成种群进化.通过大规模迭代直到规定的终止条件或到达最大繁殖代数,以该过程最优个体作为最终确定QSAR模型.
- 李志良田菲菲吴世容杨善彬杨胜喜张巧霞周原覃仁辉梅虎陈刚李根容
- 关键词:定量构效关系偏最小二乘遗传算法评价函数
- 丁烷衍生物类木脂素^(13)C NMR化学位移预测
- 2007年
- 借助原子电性作用矢量(AEIV)和原子杂化状态指数(AHSI),对39种丁烷衍生物类木脂素共计854个等价C原子进行表征,并建立用于模拟该类分子13C NMR化学位移的多元线性回归方程.所得定量结构波谱关系(QSSR)模型及留一法交互检验相关系数分别为r=0.981和q=0.962.进一步用从马尾松松针中分离所得新木脂素中20个13C NMR化学位移对模型进行外部验证,预测结果与实验值较接近.表明所建模型有良好稳定性和泛化力,可对丁烷衍生物类木脂素13C NMR谱学数据准确模拟.
- 景举华李志良
- 关键词:^13C
- 柱前衍生高效液相色谱法分离分析1-氮杂双环[2,2,2]辛-3-基胺对映异构体被引量:3
- 2006年
- 1-氮杂双环[2,2,2]辛-3-基胺是制备5-羟色胺拮抗剂药物盐酸帕洛诺司琼等的重要中间体,手性帕洛诺司琼可以通过中间体的手性分离来制备。用柱前衍生化-反相高效液相色谱法对1-氮杂双环[2,2,2]辛-3-基胺对映体进行分离并建立了检测方法。结果表明,用2,3,4,6-四-O-乙酰基-β-D-葡萄糖异硫氰酸酯(GITC)为柱前手性衍生化试剂,C18柱(300mm×4.6mm,5μm)为色谱柱,可将1-氮杂双环[2,2,2]辛-3-基胺对映体分离,其它色谱条件:流动相组成为[甲醇-乙腈-0.01mol/L四丁基溴化铵(20∶10∶75,V/V)]-(三乙胺)0·1%-(冰醋酸)0.15%,流速0.7mL/min,检测波长为266nm。在选择的测定条件下,衍生后的两非对映异构体分离度达4以上。
- 邓婕李志良肖玉梅陈小勇刘学国邓祥林刘启平周素容
- 关键词:手性分离手性拆分高效液相色谱