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新疆特殊环境微生物重点实验室开放课题(XJYS0203-2007-04)
作品数:
1
被引量:7
H指数:1
相关作者:
徐建华
娄恺
曾军
李智
杨红梅
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相关机构:
新疆农业科学院
新疆大学
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发文基金:
新疆特殊环境微生物重点实验室开放课题
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相关领域:
生物学
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徐建华
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微生物学报
年份
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2010
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新疆玛纳斯热气泉免培养土壤细菌多样性分析
被引量:7
2010年
【目的】了解新疆玛纳斯热气泉土壤免培养细菌群落组成及多样性。【方法】采用免培养法直接从土壤样品中提取总DNA,利用细菌通用引物对土壤总DNA进行16S rDNA扩增,构建细菌16SrDNA文库。使用HaeⅢ限制性内切酶对阳性克隆进行限制性片段长度多态性分析(restriction fragment length polymorphism,RFLP),挑选具有不同酶切图谱的克隆进行测序、比对并构建16SrDNA系统发育树。【结果】从土壤细菌16S rDNA文库中随机挑选了170个阳性克隆,共得到29个不同的分类单元(operational taxonomic unit,OTU)。系统发育分析归为6个门:酸杆菌门(Acidobacteria)、放线菌门(Actinobacteria)、拟杆菌门(Bacteroidetes)、厚壁菌门(Firmicutes)、变形菌门(Proteobacteria)和浮霉菌门(Planctomycetes)。其中厚壁菌门(Firmicutes)为绝对优势类群,占整个细菌文库的71%。29个OTUs中有14条序列与GenBank中相关序列的相似性低于97%(序列长度约1.5kb),占序列总数的48%。【结论】热气泉土壤细菌种群多样性较低,但存在大量潜在细菌新种。
徐建华
杨红梅
曾军
李智
娄恺
关键词:
细菌多样性
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