山东省医药卫生科技发展计划项目(2011QZ013)
- 作品数：4 被引量：8H指数：2
- 相关作者：徐爱强刘尧王海岩陶泽新林小娟更多>>
- 相关机构：山东省疾病预防控制中心山东大学临沂市疾病预防控制中心更多>>
- 发文基金：山东省医药卫生科技发展计划项目山东科技发展计划项目山东省科技发展计划项目更多>>
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- 人类肠道病毒74型山东地方株的全基因组序列分析
- 2013年
- 人类肠道病毒(HEV)74型是人类肠道病毒B组(HEV-B)的新成员。为了解其进化和重组特性,本研究对2005年山东省急性弛缓性麻痹(Acute flaccid paralysis,AFP)监测系统分离到的人类肠道病毒74型山东地方株05293/SD/CHN/2005进行了全基因组序列测定和分析。与GenBank中的另2株HEV74全基因组序列比对,发现在5'NTR和3'NTR区有核苷酸缺失和插入;核苷酸序列的同源性分别为80.8%和80.6%,氨基酸同源性为96%和95.9%。山东株与原型株USA/CA75-10213间P1、P2和P3区核苷酸同源性分别为81.5%、80.0%和79.7%,氨基酸同源性分别为95.9%、96.0%和96.2%;山东株与西藏株Rikaze-136间P1、P2和P3区核苷酸同源性分别为81.9%、78.8%和79.5%,氨基酸同源性分别为95.9%、96.1%和95.7%。通过系统发生树和同源重组分析,发现该病毒可能与其他HEV-B组肠道病毒间发生重组。
- 刘晓林陶泽新王海岩刘尧宋立志纪峰王同展林小娟王素婷徐爱强
- 关键词：基因组急性弛缓性麻痹
- 人类肠道病毒74、80和87型山东地方株的鉴定及基因特征分析被引量：3
- 2012年
- 随着基于VP1序列分析的分子定型方法的推广应用,许多新型人类肠道病毒(Human enterovirus,HEV)陆续被发现。本研究通过对1989～2010年山东省急性弛缓性麻痹(Acute flaccid paralysis,AFP)监测系统分离到的非脊髓灰质炎肠道病毒进行VP1完整编码区的序列扩增及分子定型,共发现1株EV74,3株EV80和1株EV87。同源性分析显示EV74、EV80和EV87山东分离株与原型株的核苷酸同源性分别为81.4%,76.4%～81.7%以及80.3%。系统发生学分析显示山东地方株与国内外其他分离株的亲缘关系均较远。这是在中国大陆地区首次发现EV74和EV87,其中EV87山东分离株为全球第2个鉴定出的分离株。这3种新型HEV在AFP监测系统中的分离率较低,提示尚未在我国导致大规模流行。
- 陶泽新刘尧宋立志王海岩陈鹏徐爱强
- 关键词：急性弛缓性麻痹分子进化基因特征
- 山东省急性出血性结膜炎病原学鉴定及其柯萨奇A24病毒基因特征分析被引量：5
- 2012年
- 为明确2010年引起山东省青岛市、临沂市急性出血性结膜炎(Acute hemorrhagic conjunctivitis,AHC)流行的病原,采集26例患者的眼结膜拭子标本,分别采用实时荧光定量PCR(Real time-PCR)和细胞培养方法进行检测。Real time-PCR结果显示,17份标本柯萨奇病毒A组24型(Coxsackievirus A24,CVA24)阳性,阳性率为65.39%,肠道病毒70型(Enterovirus 70,EV70)和腺病毒均为阴性;使用Hep-2细胞共分离到10株病毒,通过VP1区基因扩增及核苷酸序列测定,10株病毒均鉴定为CVA24,同源性分析显示其核苷酸和氨基酸同源性分别为99.3%～100.0%和99.5%～100.0%,在系统进化树上聚集成一簇,本次分离的毒株与山东省急性弛缓性麻痹(AFP)病例中分离到的毒株序列差异较大,分别属于5个不同的进化分支。提示CVA24可能为引起两地AHC流行的病原,且属于同一传播链。
- 杨静林艺王海岩陶泽新李岩陈鹏裴耀文纪峰林小娟王显军刘尧徐爱强
- 关键词：急性出血性结膜炎分子进化
- 临沂市脑膜炎／脑炎症候群监测病例埃可病毒30型的分离及其基因特征分析
- 2011年
- 目的 调查山东省临沂市脑膜炎/脑炎症候群（AMES）病例中人类肠道病毒病原谱的构成,分析主要病原体埃可病毒30型的基因特征.方法 采集AMES病例的脑脊液、粪便和（或）咽拭子标本,所有标本经预处理后,接种RD、Hep-2细胞分离病毒,阳性分离物采用血清学和分子生物学方法鉴定型别,与GenBank检索到的其他Echo30毒株进行同源性比较,并构建VP1完整编码区系统进化树研究其遗传进化规律.结果 2010年4-12月,共采集101例病例的222份标本（脑脊液56份,咽拭子94份,粪便72份）,其中34例患者的47份标本（脑脊液4份,咽拭子18份,粪便25份）中分离到HEV,11例鉴定为Echo30.通过同源性分析,发现其核苷酸同源性与2003年山东省泰安市、章丘市及江苏省分离株最近（91.2％～95.4％）,与原型株差异较大（17.9％～19.6％）；11株临沂分离株之间核苷酸差异为0～10.2％.系统进化树分析显示,临沂分离株属于基因型6的3个不同分支,提示来自3个传播链的Echo30病毒在临沂市共同循环.结论 山东省临沂市2010年AMES病例标本的优势分离株为Echo30,与国外分离株属于不同的进化分支,具有不同的基因特征.
- 杨静张晓丽陶泽新王海岩林小娟季圣翔刘尧张玉军徐爱强
- 关键词：脑炎病毒性种系发生
