黑龙江省自然科学基金(D2007-16)
- 作品数:3 被引量:21H指数:3
- 相关作者:隋虹方军凯生利健胡乃宝李金梅更多>>
- 相关机构:哈尔滨医科大学更多>>
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- 相关领域:医药卫生更多>>
- 叉生分析在复杂疾病基因-基因、基因-环境交互作用研究中的应用被引量:6
- 2011年
- 目的 探讨叉生分析在复杂疾病基因-基因、基因-环境交互作用研究中的应用及其意义.方法 应用叉生分析对病例对照研究的糖尿病数据进行基因-基因、基因-环境交互作用分析结果 交互作用的分析依赖于对相加或相乘模型的选择.本文中相加模型与相乘模型的交互作用结果均具有统计学意义,根据交互作用模型选择原则,本文结果适合应用相加模型进行解释.基于相加模型的ENPP1基因K121Q(rs1044498)与饮酒交互作用具有统计学意义(OR=4.01,S=17.22,AP=0.71,P〈0.05),与家族史交互作用也具有统计学意义(OR=5.14,S=7.43,AP=0.69,P〈0.05);174G/C与572C/G两基因交互作用具有统计学意义(OR=5.12,S=5.40,AP=0.65,P〈0.05)结论 叉生分析不仅可以分析基因-环境的交互作用,同样可以分析基因-基因的交互作用.而且叉生分析结果简单明了,通过SAS、R等统计软件都可实现叉生分析的分析过程和假设检验过程.并且可以非常直观地呈现绝大部分的流行病学中基本单元的信息,可为我们判断交互作用提供基本的理论依据因此叉生分析在复杂疾病的基因-基因、基因-环境交互作用研究中具有广阔的应用前景.
- 生利健李金梅方军凯隋虹
- 关键词:复杂疾病
- 多因子降维法分析基因与环境因素交互作用的研究被引量:4
- 2011年
- 目的探讨多因子降维法(multifactor dimensionality reduction,MDR)在筛选糖尿病的基因与环境危险因素交互作用时的用法以及MDR的优缺点,并与传统的Logistic回归做比较。方法通过模拟研究确定MDR所适用的样本量大小,实例分析采用针对糖尿病的病例对照研究数据,分别用MDR方法、Logistic回归进行分析,将两种结果进行对比进而对两种方法作出评价。结果模拟实验结果表明MDR在分析1阶交互作用时效能不如Logistic回归,但随着样本量的增大,两种检测方法效能趋于一致;在分析高阶交互作用时,MDR所表现出的效能高于Logistic回归,而且在分析2阶交互作用中,样本量200时MDR已经表现良好,当样本量为300时,MDR显示了微弱的优势。实例分析中MDR的最优模型为174G/C和是否总胆固醇和总甘油三酯同时偏高之间的交互作用,预测准确率为0.5822,交叉验证一致性为8/10,置换检验有统计学意义(P=0.021)。结论 MDR在分析小样本、高维度数据中表现良好,可有效的分析糖尿病基因与环境的交互作用。
- 方军凯生利健隋虹
- 关键词:多因子降维法糖尿病
- 聚类分析在膳食模式研究中的应用被引量:11
- 2009年
- 宋忙华隋虹汪婷婷李金梅张吉胡乃宝
- 关键词:聚类分析膳食模式聚类方法系统聚类样本数据