福建省自然科学基金(2008J0177)
- 作品数：3 被引量：9H指数：2
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- 相关机构：福建省妇幼保健院福建省疾病预防控制中心更多>>
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- 相关领域：医药卫生更多>>
- 福州呼吸道感染患儿中人偏肺病毒的检测被引量：2
- 2012年
- 目的了解人偏肺病毒(hMPV)在我国福州儿童呼吸道感染中的检出情况。方法收集2007年11月至2010年4月在福建省福州市妇幼保健院因呼吸道感染住院的重症监护病房的137例患儿鼻咽抽取物标本,通过逆转录聚合酶链反应RT-PCR扩增法用一对特异引物对hMPV N基因片段进行检测。结果从137份标本中发现了6份hMPV感染阳性标本。其中2份合并呼吸道合胞病毒(RSV)感染。hMPV感染的检出率为4.4%。hMPV阳性标本中,hMPV与某些呼吸道病毒,如呼吸道合胞病毒(RSV)、流感病毒(甲、乙型)等的混合感染的检出率是33.3%。通过对N基因的213bp检测片段的基因序列分析和比对,表明福州地区检出的这几株hMPV分别属于A、B两种基因型。结论 hMPV是儿童上下呼吸道感染中较为重要的一个病原,在福州地区hMPV的两种基因型同时存在。
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- 关键词：呼吸道感染人偏肺病毒基因型
- 2株WU多瘤病毒全基因组序列测定和分析被引量：1
- 2011年
- WU多瘤病毒(WUPyV)是多瘤病毒科多瘤病毒属的新成员,近来发现与人呼吸道感染等有关。本研究对2株WUPyV进行全基因组序列测定和拼接,获得这2株病毒全基因组序列,并与已上传到GenBank的国内外几株WUPyV的全基因组序列和氨基酸序列进行比对和系统进化分析。这2株WUPyV是环状、双链DNA病毒,基因组全长5 228bp,比GenBank已知WUPyV全序列少1bp。缺失的一对碱基位于位点4 536处,属于大T抗原的非编码区。病毒全基因组编码5个蛋白,分别是3个衣壳蛋白VP2、VP3、VP1与大T抗原和小T抗原。系统进化分析显示相对中国福建福州的FZ18株,另一株FZTF株与参考株-澳大利亚的B0株关系较近。
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- 关键词：WU多瘤病毒基因
- 人博卡病毒全基因组序列测定与种系分析被引量：7
- 2010年
- 目的了解福州地区人博卡病毒(HBoV)在儿童呼吸道感染中的检出情况,并对其进行全基因组序列测定和种系分析。方法收集2007年11月至2008年10月在福建省妇幼保健院因下呼吸道感染住院的重症监护病房的57例小儿鼻咽抽取物标本,用一对特异引物通过PCR扩增法对HBoV基因片段进行检测,对检测出的2例HBoV(FZ1和FZ40)用7对全序列引物进行扩增和拼接,获得这两株病毒全基因组序列,上传GenBank并与基因库中国内外其它10株HBoV的全基因组序列和各氨基酸序列进行比对,并做种系分析。结果FZ1株基因组序列全长为5299bp,与HBoV参考株st2株序列长度相同;而FZ40株的基因组序列全长少2bp。病毒全基因组编码4种蛋白,分别是非结构蛋白NS1、核蛋白NP-1和衣壳蛋白VP1、VP2。结论种系分析显示福州的FZ40株与浙江温岭的WLL-1株关系较近,而FZ1株与北京的两株及泰国的CU6株关系较近。
- 修文琼刘光华康玉兰沈晓娜谢剑锋王美爱张文清郑奎城
- 关键词：人博卡病毒全基因组
