山东省优秀中青年科学家科研奖励基金(2006BSB14001)
- 作品数:2 被引量:1H指数:1
- 相关作者:邢晓明王丽丽李玉军杨平更多>>
- 相关机构:青岛大学医学院附属医院元码基因科技(北京)股份有限公司烟台毓璜顶医院更多>>
- 发文基金:山东省自然科学基金山东省优秀中青年科学家科研奖励基金更多>>
- 相关领域:医药卫生更多>>
- 短发夹状RNA对GRP78基因在结直肠癌RKO细胞中表达的抑制作用被引量:1
- 2010年
- 目的探讨短发夹状RNA对糖调节蛋白78(GRP78)在结直肠癌RKO细胞中表达抑制作用。方法以脂质体Lipofectamine2000介导GRP78短发卡状RNA(shRNA-GRP78)质粒表达载体转染RKO细胞,G418筛选得到稳定表达株,半定量RT-PCR和Westernblooting方法检测GRP78mRNA和蛋白水平变化。结果转染成功并筛选出稳定表达RKO细胞株。与对照组相比,shRNA-GRP78转染RKO细胞GRP78的mRNA及蛋白水平均显著下降(t=7.079、7.510,P<0.05)。结论 shRNA-GRP78能明显抑制RKO细胞GRP78mRNA及蛋白的表达,为进一步在体内外研究GRP78在结直肠癌中的作用奠定了基础。
- 王丽丽邢晓明李玉军
- 关键词:葡萄糖调节蛋白78结直肠肿瘤RNA干扰
- 基于全外显子测序技术分析胰腺导管癌体细胞突变与患者临床特征的关系
- 2020年
- 目的基于全外显子测序技术分析胰腺导管癌(PDAC)体细胞突变与患者临床特征的关系。方法收集2009—2011年青岛大学附属医院PDAC患者的肿瘤组织样本40例,均进行全外显子组测序。应用肿瘤体细胞突变目录(COSMIC)数据库中的变异单核苷酸多态性(SNP)拟合方法鉴定肿瘤组织中的致癌体细胞突变,并分析致癌体细胞突变与患者临床特征之间的关系。结果PDAC肿瘤组织样本中共检测到1446处致癌体细胞突变位点,每个样本中有25~82处致癌体细胞突变位点;其中体细胞突变类型构成比排名前3位的分别为C>A突变、C>T突变、T>A突变,分别占48%、45%、6%;PDAC肿瘤组织样本中KRAS、RLIM、TTN及BRD9是最常见的突变基因,分别占总突变的42%、33%、26%及22%;不同肿瘤分化程度患者ASTN1基因突变情况差异有显著性(χ^2=6.855,P<0.05),不同肿瘤分期患者TTN基因突变情况差异有显著性(χ^2=5.183,P<0.05)。结论通过与TCGA数据库比对,肿瘤组织样本全外显子测序得到的的致癌体细胞突变谱是较为准确的,利用该突变谱可以有效预测PDAC致癌体细胞突变与患者临床特征之间的关系,从而为PDAC的临床治疗提供指导。
- 宋瑶琳纪彬彬刘相兰杨平王博梁乐彬王爱兰杨家亮田埂邢晓明
- 关键词:胰腺肿瘤突变病理学遗传学基因检测